logo

Genes within 1Mb (chr12:101750840:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0269 0.0639 0.079 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.97e-02 -0.188 0.11 0.079 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 4.14e-03 0.192 0.0662 0.079 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 9.85e-02 -0.161 0.0971 0.079 B L1
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0505 0.111 0.079 B L1
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 9.47e-02 -0.159 0.0949 0.079 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 1.38e-01 0.113 0.0761 0.079 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0611 0.0866 0.079 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 8.16e-03 0.362 0.136 0.079 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 4.12e-01 -0.108 0.132 0.079 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 2.00e-01 -0.158 0.123 0.079 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.37e-01 0.0629 0.102 0.079 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 8.90e-06 0.598 0.131 0.079 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 4.34e-07 -0.469 0.0898 0.079 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 7.59e-02 -0.187 0.105 0.079 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 1.52e-01 0.148 0.103 0.079 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 1.75e-01 0.0979 0.0719 0.079 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.55e-01 0.0738 0.125 0.079 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 4.42e-05 0.542 0.13 0.079 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 8.90e-02 -0.151 0.0882 0.079 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 9.97e-01 0.000449 0.112 0.079 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0804 0.124 0.079 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 6.00e-01 0.0461 0.0878 0.079 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 1.24e-01 0.193 0.125 0.079 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 7.15e-01 0.0507 0.139 0.081 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.15e-01 0.2 0.126 0.081 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0907 0.139 0.081 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 6.18e-02 -0.278 0.148 0.081 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 1.75e-01 -0.209 0.154 0.081 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0406 0.133 0.081 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 9.90e-01 0.00138 0.11 0.081 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0613 0.145 0.081 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 4.00e-01 0.0995 0.118 0.079 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 7.26e-03 0.267 0.0984 0.079 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.29e-01 0.0435 0.125 0.079 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 5.84e-01 0.0767 0.14 0.079 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 7.67e-01 0.0382 0.129 0.079 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 1.97e-01 0.146 0.113 0.079 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 7.09e-01 0.0346 0.0924 0.079 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.10e-01 0.0306 0.127 0.079 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 7.06e-06 0.52 0.113 0.079 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.51e-01 0.0272 0.0857 0.079 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 3.91e-01 0.118 0.138 0.079 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 2.70e-01 -0.14 0.126 0.079 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 3.06e-01 0.0978 0.0954 0.079 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 1.34e-01 0.203 0.135 0.079 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 8.47e-01 0.0308 0.16 0.079 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0297 0.0486 0.079 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 7.93e-01 0.0243 0.0927 0.079 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.73e-03 0.402 0.132 0.079 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 2.07e-01 -0.123 0.0973 0.079 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 4.47e-01 -0.116 0.152 0.079 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 6.91e-01 0.0442 0.111 0.079 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0204 0.0988 0.079 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0156 0.119 0.079 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 2.74e-01 0.108 0.0985 0.079 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 1.73e-02 0.272 0.113 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 5.71e-01 0.017 0.0299 0.082 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 3.80e-01 -0.136 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 5.36e-02 0.221 0.114 0.082 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 6.79e-02 -0.297 0.162 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 1.11e-01 0.251 0.157 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 4.73e-01 -0.117 0.163 0.082 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 2.38e-01 0.183 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0877 0.156 0.082 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 3.73e-01 0.114 0.128 0.082 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 6.93e-01 -0.051 0.129 0.082 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 7.45e-01 0.0394 0.121 0.082 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00774 0.0636 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 1.76e-01 -0.214 0.158 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 9.87e-03 0.218 0.0836 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0158 0.126 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0788 0.14 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 2.58e-03 -0.469 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000446 0.13 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 3.57e-01 -0.128 0.139 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 7.45e-01 0.0476 0.146 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0294 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 3.49e-01 -0.138 0.147 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 4.64e-01 0.0426 0.0581 0.08 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0901 0.153 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.58e-04 0.373 0.0969 0.08 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 6.99e-01 0.0532 0.137 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0894 0.151 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0664 0.15 0.08 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 6.65e-01 0.058 0.134 0.08 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 3.64e-01 -0.128 0.14 0.08 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 1.13e-01 0.229 0.144 0.08 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 3.28e-01 -0.145 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 1.85e-01 0.179 0.134 0.08 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0267 0.0799 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0785 0.145 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 3.15e-02 0.161 0.0743 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 1.23e-01 -0.164 0.106 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0832 0.126 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 1.75e-01 -0.191 0.14 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 8.55e-01 0.0194 0.107 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 6.39e-01 0.0542 0.116 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 7.55e-03 0.416 0.154 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 9.45e-01 0.0106 0.153 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00791 0.143 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0478 0.0706 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 3.14e-01 -0.146 0.145 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.31e-01 0.0929 0.0773 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0803 0.12 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000647 0.139 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 8.59e-01 0.0271 0.153 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 7.11e-01 0.0495 0.133 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 1.78e-01 -0.178 0.131 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 7.21e-01 0.0497 0.139 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 3.41e-01 -0.153 0.16 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 2.00e-01 -0.177 0.138 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0695 0.154 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.30e-02 0.35 0.153 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 8.52e-02 -0.232 0.134 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 1.05e-01 -0.241 0.148 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 3.13e-01 0.159 0.157 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 7.02e-01 0.058 0.151 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.20e-01 0.0754 0.117 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.20e-05 0.562 0.13 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 2.51e-07 -0.522 0.0979 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 9.79e-02 -0.188 0.113 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 3.35e-01 0.119 0.123 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 2.28e-01 0.103 0.0857 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0625 0.122 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 7.47e-07 0.68 0.133 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 5.71e-03 -0.3 0.107 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 2.89e-01 -0.145 0.137 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 4.23e-01 0.103 0.128 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 3.63e-01 0.0765 0.0839 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0106 0.147 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 6.86e-04 0.475 0.138 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 3.17e-01 -0.136 0.136 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 8.13e-01 0.0349 0.148 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 8.49e-01 0.0266 0.139 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 3.76e-01 0.11 0.125 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.51e-01 0.0249 0.132 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.74e-05 0.572 0.13 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0449 0.109 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 8.98e-02 0.249 0.146 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 7.78e-01 -0.041 0.145 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 3.24e-01 -0.122 0.124 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 3.74e-01 0.137 0.154 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.62e-01 0.0824 0.142 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 3.06e-05 0.577 0.135 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 4.39e-04 -0.44 0.123 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 9.63e-02 -0.224 0.134 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 4.47e-01 0.111 0.146 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 8.00e-01 0.0245 0.0964 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 9.33e-01 0.0125 0.149 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.56e-01 0.0899 0.152 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.07e-02 0.315 0.135 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 3.62e-01 -0.129 0.141 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0711 0.154 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 1.07e-03 -0.49 0.148 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 9.11e-01 0.0152 0.136 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 1.86e-01 -0.195 0.147 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.34e-01 0.0313 0.15 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 3.05e-02 0.305 0.14 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 5.40e-01 -0.093 0.151 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 2.32e-01 0.194 0.162 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 3.54e-01 0.144 0.155 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0732 0.136 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0276 0.15 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 4.12e-01 -0.044 0.0535 0.08 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.45e-01 0.0295 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.25e-02 0.333 0.145 0.08 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 8.41e-01 0.0261 0.13 0.08 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0388 0.156 0.08 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 2.55e-01 0.181 0.158 0.08 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 2.46e-01 -0.153 0.132 0.08 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 7.46e-01 0.0486 0.15 0.08 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0473 0.147 0.08 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 3.53e-01 0.121 0.13 0.08 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.63e-01 0.0279 0.161 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.44e-01 0.171 0.116 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 3.36e-01 0.13 0.135 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 2.09e-01 0.198 0.157 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0291 0.154 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 1.24e-02 0.346 0.137 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0351 0.146 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 5.44e-01 0.094 0.155 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 3.92e-01 0.121 0.141 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 3.35e-05 0.562 0.133 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.96e-01 -0.027 0.104 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 4.42e-01 -0.112 0.145 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0751 0.14 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 5.81e-01 0.0664 0.12 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 2.16e-01 0.18 0.145 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0538 0.164 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 7.02e-03 -0.379 0.139 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 6.45e-02 0.268 0.144 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00258 0.117 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 3.42e-02 0.322 0.151 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 4.08e-01 0.129 0.156 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 2.79e-01 -0.157 0.144 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 4.66e-01 -0.109 0.149 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 4.18e-01 0.119 0.146 0.084 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 3.66e-01 0.128 0.141 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.10e-04 0.503 0.128 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0282 0.1 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 9.14e-01 0.0152 0.14 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 1.08e-01 -0.226 0.14 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 4.02e-01 0.093 0.111 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 3.66e-01 0.131 0.144 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 7.59e-01 -0.048 0.156 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 6.30e-01 0.0587 0.121 0.074 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.71e-02 -0.309 0.161 0.074 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.94e-01 0.133 0.126 0.074 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.28e-01 0.0634 0.182 0.074 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 8.05e-01 0.0519 0.209 0.074 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0311 0.129 0.074 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 5.80e-01 0.0823 0.148 0.074 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0888 0.15 0.074 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 2.82e-01 -0.188 0.174 0.074 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 9.26e-01 -0.015 0.16 0.074 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 3.75e-01 0.132 0.148 0.074 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0306 0.0536 0.076 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0295 0.108 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.78e-02 0.338 0.142 0.076 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0994 0.106 0.076 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 3.34e-01 -0.146 0.151 0.076 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 3.31e-03 -0.334 0.112 0.076 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 7.16e-01 0.0454 0.125 0.076 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 9.04e-02 -0.18 0.106 0.076 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 2.46e-02 0.221 0.0978 0.076 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 5.43e-01 0.0659 0.108 0.076 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 5.61e-01 0.087 0.149 0.079 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 2.46e-03 0.467 0.152 0.079 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 3.57e-01 -0.125 0.136 0.079 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0997 0.148 0.079 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 2.79e-01 0.166 0.153 0.079 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0559 0.124 0.079 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 9.23e-01 0.0134 0.138 0.083 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 4.07e-01 0.112 0.134 0.083 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 8.82e-01 0.0259 0.174 0.083 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 2.99e-01 -0.163 0.157 0.083 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 2.83e-01 -0.175 0.163 0.083 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 7.34e-02 0.274 0.152 0.083 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0101 0.119 0.083 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 3.05e-01 -0.14 0.136 0.083 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 7.54e-02 0.24 0.135 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.85e-02 0.239 0.101 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 5.28e-01 0.0856 0.135 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 3.49e-01 0.143 0.152 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 7.62e-01 0.0415 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 8.36e-01 0.0245 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.1 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0354 0.146 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 7.20e-02 0.201 0.111 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0426 0.137 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0733 0.16 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 7.40e-01 -0.05 0.15 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 6.13e-01 0.0703 0.139 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 8.19e-01 0.0248 0.108 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 2.16e-01 0.233 0.187 0.091 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.31e-01 0.266 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 2.93e-01 0.14 0.132 0.091 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 6.05e-01 0.0911 0.176 0.091 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 1.34e-02 0.451 0.18 0.091 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 2.57e-02 0.38 0.169 0.091 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 8.28e-01 -0.038 0.175 0.091 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 4.19e-01 -0.139 0.171 0.091 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 9.69e-03 0.402 0.153 0.091 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 1.80e-01 0.196 0.145 0.08 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.47e-01 0.194 0.133 0.08 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0486 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 8.15e-01 0.0344 0.147 0.08 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0668 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 9.08e-02 0.248 0.146 0.08 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 2.48e-01 0.148 0.128 0.08 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 3.07e-01 -0.151 0.147 0.079 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.32e-02 0.335 0.134 0.079 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 8.73e-02 -0.278 0.162 0.079 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 4.07e-01 -0.118 0.142 0.079 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 6.24e-01 0.0672 0.137 0.079 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 2.18e-02 0.301 0.13 0.079 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 5.47e-01 0.074 0.123 0.079 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 7.07e-01 0.0637 0.169 0.088 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.08e-01 0.236 0.146 0.088 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 5.59e-02 -0.297 0.154 0.088 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 1.21e-01 -0.24 0.154 0.088 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 5.95e-02 -0.306 0.161 0.088 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 2.43e-02 -0.319 0.14 0.088 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 1.13e-01 0.174 0.109 0.088 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 9.64e-01 0.00663 0.146 0.088 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0112 0.0734 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 1.38e-01 -0.219 0.147 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.65e-03 0.242 0.0758 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0399 0.122 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0669 0.126 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 4.90e-02 -0.279 0.141 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 4.57e-01 0.0789 0.106 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 1.24e-01 -0.195 0.126 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 5.53e-01 0.0869 0.146 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 2.86e-01 -0.163 0.153 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 9.31e-01 0.0131 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -730904 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0189 0.0852 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 2.73e-01 -0.153 0.139 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 4.12e-02 0.14 0.0682 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 3.02e-01 -0.102 0.0983 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0434 0.121 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 2.69e-01 -0.152 0.137 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 6.06e-01 0.0533 0.103 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0124 0.108 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 11368 sc-eQTL 8.87e-03 0.405 0.153 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0668 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -446745 sc-eQTL 3.68e-01 -0.13 0.144 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 2.26e-01 0.151 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 1.83e-02 0.237 0.0997 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 5.72e-01 0.0736 0.13 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 5.60e-01 0.0897 0.154 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 9.42e-01 0.00965 0.132 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 5.02e-01 0.077 0.114 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 7.44e-01 0.0306 0.0939 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.14e-01 0.0333 0.141 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 8.70e-03 0.321 0.121 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 3.86e-01 -0.129 0.149 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0379 0.144 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0618 0.143 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 1.45e-03 0.39 0.121 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 1.47e-01 0.155 0.106 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -369280 sc-eQTL 8.95e-01 0.0178 0.134 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 53893 sc-eQTL 5.39e-06 0.583 0.125 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -80119 sc-eQTL 8.75e-01 0.0142 0.0899 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 470735 sc-eQTL 6.37e-01 0.0651 0.138 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 343068 sc-eQTL 3.30e-01 -0.125 0.128 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -311309 sc-eQTL 6.55e-01 0.0463 0.104 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -126740 sc-eQTL 3.07e-01 0.142 0.139 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -369345 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00235 0.164 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000017427 IGF1 -730904 eQTL 0.0328 0.0792 0.0371 0.0 0.0 0.0785
ENSG00000111666 CHPT1 53893 eQTL 2.74e-13 0.317 0.0428 0.0 0.0 0.0785

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 IGF1 -730904 2.74e-07 1.33e-07 5.03e-08 2.36e-07 9.24e-08 8.37e-08 2.4e-07 5.43e-08 1.71e-07 6.75e-08 1.63e-07 1.11e-07 1.71e-07 7.13e-08 5.98e-08 7.98e-08 3.93e-08 1.44e-07 7.18e-08 4.8e-08 1.25e-07 1.31e-07 1.58e-07 2.95e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 1.24e-07 1.06e-07 1.09e-07 3.98e-08 3.89e-08 8.89e-08 3.97e-08 3.95e-08 5.61e-08 8.61e-08 6.63e-08 3.86e-08 5.28e-08 1.46e-07 4.19e-08 1.84e-08 5.87e-08 1.03e-08 1.21e-07 3.89e-09 4.79e-08
ENSG00000111666 CHPT1 53893 4.97e-05 4.22e-05 8.49e-06 2.26e-05 9.44e-06 2.28e-05 6.49e-05 1.02e-05 5.54e-05 2.96e-05 7.13e-05 2.94e-05 7.79e-05 2.11e-05 1.24e-05 3.62e-05 2.88e-05 4.25e-05 1.34e-05 1.37e-05 2.75e-05 5.51e-05 4.5e-05 1.58e-05 6.88e-05 1.68e-05 2.6e-05 2.49e-05 5e-05 3.7e-05 3.73e-05 4.5e-06 6.68e-06 1.28e-05 1.91e-05 9.56e-06 6.03e-06 6.74e-06 8.89e-06 4.91e-06 2.56e-06 4.97e-05 5.29e-06 1.27e-06 5.6e-06 9.01e-06 9.13e-06 4.96e-06 3.28e-06