Genes within 1Mb (chr12:101746272:C:CCT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0199 0.0446 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0152 0.0776 0.199 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0532 0.047 0.199 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.40e-03 0.216 0.0666 0.199 B L1
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 6.17e-01 0.0388 0.0775 0.199 B L1
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0331 0.0666 0.199 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0217 0.0533 0.199 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 2.80e-02 0.132 0.0598 0.199 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 1.10e-01 -0.153 0.0956 0.199 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 8.11e-01 -0.022 0.0921 0.199 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 5.02e-01 0.0577 0.0858 0.199 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 3.76e-02 -0.145 0.0693 0.199 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.30e-04 -0.315 0.092 0.199 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 6.52e-07 0.317 0.0618 0.199 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 7.30e-01 -0.025 0.0724 0.199 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.88e-01 0.00105 0.0708 0.199 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.02e-01 0.0632 0.0494 0.199 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 5.64e-01 0.0508 0.0879 0.199 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 3.86e-04 -0.334 0.0925 0.199 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 2.99e-01 0.065 0.0624 0.199 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 1.41e-04 -0.296 0.0763 0.199 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0514 0.0871 0.199 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00435 0.0619 0.199 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0212 0.0887 0.199 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 2.02e-01 0.125 0.0975 0.198 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00307 0.0895 0.198 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 8.59e-03 0.257 0.0967 0.198 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 1.51e-02 0.255 0.104 0.198 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 1.97e-01 -0.141 0.109 0.198 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 7.52e-01 0.0297 0.0939 0.198 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 1.67e-01 -0.107 0.0772 0.198 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 7.44e-01 0.0334 0.102 0.198 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 7.10e-03 -0.219 0.0806 0.199 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.84e-01 0.019 0.0694 0.199 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0979 0.0868 0.199 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00568 0.0971 0.199 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 4.63e-01 0.0657 0.0892 0.199 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.77e-01 0.106 0.0783 0.199 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 1.41e-02 0.156 0.0632 0.199 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.76e-01 -0.119 0.0874 0.197 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 5.62e-05 -0.322 0.0784 0.197 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 6.23e-01 0.029 0.059 0.197 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 9.55e-01 0.00537 0.095 0.197 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 3.68e-01 0.0786 0.0872 0.197 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0857 0.0656 0.197 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 6.32e-03 0.254 0.092 0.197 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 1.02e-01 0.179 0.109 0.197 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00155 0.0339 0.199 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0395 0.0646 0.199 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 3.38e-02 -0.199 0.0934 0.199 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.10e-02 0.172 0.0671 0.199 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.199 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00885 0.0775 0.199 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 4.39e-01 0.0533 0.0688 0.199 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 7.56e-01 0.0257 0.0826 0.199 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0467 0.0688 0.199 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0419 0.08 0.199 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 3.57e-01 -0.019 0.0206 0.204 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0274 0.107 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 5.11e-01 0.0522 0.0792 0.204 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 3.53e-02 0.236 0.111 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 2.70e-01 -0.12 0.109 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 6.51e-01 -0.051 0.112 0.204 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00995 0.107 0.204 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 8.19e-02 0.187 0.107 0.204 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0249 0.0884 0.204 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0839 0.0888 0.204 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 8.15e-02 0.145 0.0829 0.204 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0152 0.0441 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 4.76e-01 0.0784 0.11 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0857 0.0587 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 7.49e-02 0.155 0.0865 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 7.45e-01 0.0316 0.0968 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00964 0.109 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 7.17e-01 0.0327 0.09 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 6.00e-02 0.181 0.0958 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 1.82e-01 -0.135 0.101 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 8.76e-01 0.0166 0.107 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 2.86e-01 0.109 0.102 0.197 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 2.26e-01 -0.049 0.0403 0.198 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.18e-01 -0.167 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0765 0.0696 0.198 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 3.30e-01 0.0931 0.0953 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 5.23e-01 0.0671 0.105 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.89e-01 0.0014 0.104 0.198 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 3.77e-01 0.0825 0.0931 0.198 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00854 0.0978 0.198 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 2.48e-01 -0.116 0.1 0.198 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 5.73e-02 -0.195 0.102 0.198 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 2.04e-01 -0.119 0.0934 0.198 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 2.58e-01 0.0632 0.0557 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 9.80e-01 0.00251 0.101 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 6.08e-01 -0.027 0.0526 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.26e-01 0.114 0.074 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0549 0.0883 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0699 0.0985 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0562 0.0745 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 2.35e-01 0.0961 0.0806 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0767 0.11 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0614 0.107 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 9.26e-01 0.00925 0.1 0.199 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00575 0.0488 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0119 0.1 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0572 0.0534 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 2.69e-02 0.183 0.082 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 5.99e-01 0.0507 0.0961 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 6.27e-01 0.0513 0.106 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 7.96e-01 0.0238 0.0919 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 6.85e-02 0.165 0.0904 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0359 0.0959 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 3.61e-01 0.101 0.11 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 2.47e-01 0.11 0.095 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 2.27e-01 -0.129 0.106 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 1.48e-04 -0.4 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.01e-01 0.153 0.093 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00663 0.103 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.92e-01 0.00107 0.109 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.91e-01 0.137 0.104 0.198 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.71e-01 -0.11 0.0804 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 8.06e-04 -0.308 0.0907 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.27e-06 0.339 0.0679 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0386 0.0782 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 7.36e-01 0.0286 0.0848 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 4.07e-01 0.0491 0.0591 0.199 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 7.54e-02 -0.151 0.0843 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 4.54e-04 -0.339 0.0952 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.24e-02 0.189 0.0748 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 8.37e-01 0.0196 0.0949 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 1.91e-01 -0.116 0.0885 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 6.31e-01 -0.028 0.0583 0.199 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0544 0.101 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 3.96e-04 -0.341 0.0948 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.25e-01 0.144 0.0935 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0324 0.102 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 6.70e-01 -0.041 0.0961 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 5.81e-02 0.163 0.0853 0.199 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.21e-01 0.146 0.0936 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.61e-03 -0.256 0.0949 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 6.62e-01 0.0338 0.0772 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0818 0.104 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0559 0.103 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0886 0.0879 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 1.49e-01 -0.158 0.109 0.199 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0248 0.0974 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.79e-04 -0.321 0.0942 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 4.44e-03 0.245 0.0852 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 1.96e-01 -0.119 0.092 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 3.70e-01 -0.09 0.1 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.44e-01 0.0965 0.0657 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 4.29e-01 0.0807 0.102 0.199 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0654 0.105 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 1.53e-01 -0.135 0.094 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 6.23e-02 0.182 0.0969 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 1.98e-02 -0.247 0.105 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 4.31e-01 0.0825 0.105 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.43e-01 -0.137 0.0933 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 6.75e-01 0.0429 0.102 0.199 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 4.96e-01 0.0739 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 4.47e-02 -0.205 0.102 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.54e-02 0.265 0.108 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 2.71e-01 -0.13 0.118 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.65e-01 0.00496 0.113 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 8.30e-02 -0.17 0.0978 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0893 0.109 0.194 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 1.39e-01 0.0543 0.0365 0.197 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 2.54e-01 -0.117 0.103 0.197 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 2.35e-01 -0.119 0.1 0.197 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 4.26e-04 0.309 0.0864 0.197 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 3.37e-02 -0.225 0.106 0.197 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0824 0.109 0.197 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.61e-01 -0.102 0.0902 0.197 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 9.96e-03 0.263 0.101 0.197 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 1.72e-01 -0.137 0.1 0.197 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 4.01e-01 0.0748 0.0888 0.197 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 6.37e-01 -0.053 0.112 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.47e-02 -0.144 0.0805 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.15e-01 -0.147 0.0932 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00011 0.11 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 2.23e-01 0.13 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0594 0.0966 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 5.44e-02 0.195 0.101 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00541 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 4.73e-01 0.0693 0.0964 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 1.53e-05 -0.4 0.0902 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 6.78e-01 0.0296 0.0713 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0201 0.099 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 3.84e-01 0.0835 0.0956 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.47e-01 -0.119 0.0817 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 1.32e-02 0.245 0.0982 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 6.12e-02 0.209 0.111 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0897 0.103 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 2.71e-02 -0.233 0.105 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0291 0.085 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0558 0.111 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 3.39e-01 -0.109 0.113 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 6.63e-01 0.046 0.105 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 7.41e-03 0.288 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 2.51e-01 0.122 0.106 0.201 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 3.24e-02 -0.207 0.096 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 5.80e-03 -0.249 0.0892 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 2.16e-01 0.0853 0.0687 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0359 0.0962 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 8.64e-01 0.0166 0.0968 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0698 0.0761 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 6.49e-01 0.0453 0.0992 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00624 0.107 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 4.80e-02 -0.159 0.0794 0.215 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 3.13e-02 0.232 0.107 0.215 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.11e-01 0.0314 0.0843 0.215 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 2.44e-01 0.141 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 7.91e-01 -0.037 0.139 0.215 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 1.96e-01 0.11 0.085 0.215 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.70e-01 0.135 0.098 0.215 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 8.79e-01 0.0153 0.1 0.215 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0307 0.116 0.215 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 6.77e-01 0.0445 0.107 0.215 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 8.16e-01 0.023 0.0987 0.215 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 6.71e-01 0.0159 0.0373 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0852 0.0751 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 6.64e-02 -0.183 0.0991 0.2 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0215 0.0739 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 1.34e-01 -0.158 0.105 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.36e-01 0.0064 0.0798 0.2 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.88e-01 0.0922 0.0865 0.2 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 7.70e-01 0.0217 0.0744 0.2 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00379 0.0689 0.2 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0767 0.0752 0.2 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 2.33e-01 -0.126 0.106 0.199 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.36e-03 -0.294 0.109 0.199 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 3.67e-02 0.201 0.0954 0.199 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0548 0.105 0.199 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 9.40e-02 0.181 0.108 0.199 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 1.04e-01 0.143 0.0877 0.199 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.71e-02 0.226 0.0939 0.2 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0188 0.093 0.2 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 7.51e-03 0.318 0.118 0.2 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 3.54e-02 0.228 0.108 0.2 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0855 0.113 0.2 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.11e-01 0.132 0.105 0.2 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0656 0.0824 0.2 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00953 0.0941 0.2 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 6.54e-02 -0.172 0.0927 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.54e-01 0.0221 0.0705 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.77e-01 -0.126 0.0931 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 3.12e-01 -0.106 0.105 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 6.32e-01 0.0452 0.0942 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.98e-01 0.0846 0.081 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 9.78e-03 0.178 0.0682 0.199 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.12e-01 -0.16 0.1 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 2.52e-01 0.0885 0.0771 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 4.42e-01 0.0723 0.0939 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 5.71e-01 0.0625 0.11 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 2.94e-01 0.109 0.103 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.79e-01 0.104 0.0954 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 7.94e-02 0.131 0.0741 0.199 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 8.25e-01 0.0292 0.132 0.191 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 4.38e-02 -0.248 0.122 0.191 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 4.93e-01 0.0639 0.093 0.191 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0608 0.123 0.191 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 8.01e-01 0.0325 0.129 0.191 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0699 0.12 0.191 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 7.98e-02 -0.213 0.121 0.191 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 9.12e-02 0.202 0.119 0.191 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 9.35e-01 0.00903 0.11 0.191 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.96e-01 -0.132 0.101 0.193 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 8.95e-01 0.0123 0.0931 0.193 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 1.11e-01 -0.174 0.109 0.193 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 8.89e-01 0.0143 0.102 0.193 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0752 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.07e-01 0.129 0.102 0.193 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 3.48e-01 0.0839 0.0892 0.193 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 6.17e-01 0.0522 0.104 0.192 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0227 0.0962 0.192 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0434 0.115 0.192 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 2.48e-01 0.116 0.1 0.192 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 3.55e-01 0.0896 0.0966 0.192 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00869 0.0931 0.192 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 4.70e-02 0.171 0.0858 0.192 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 5.71e-02 -0.228 0.119 0.195 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 8.86e-01 -0.015 0.105 0.195 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 5.26e-01 0.0703 0.111 0.195 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 5.70e-01 0.0627 0.11 0.195 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0262 0.116 0.195 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 5.79e-01 0.0562 0.101 0.195 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0803 0.0779 0.195 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 6.26e-01 0.0507 0.104 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0211 0.0516 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 3.19e-01 -0.103 0.103 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0318 0.0545 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 8.30e-02 0.148 0.0851 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 6.49e-01 0.0402 0.0882 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0505 0.0997 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 5.15e-01 0.0486 0.0744 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 7.36e-02 0.159 0.0886 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 1.58e-01 -0.145 0.102 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 3.12e-01 -0.109 0.107 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 3.38e-01 0.102 0.106 0.199 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -735472 sc-eQTL 9.88e-01 0.000909 0.0591 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 9.55e-01 0.0055 0.0967 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0177 0.0478 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 2.30e-02 0.155 0.0676 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 8.67e-01 0.014 0.0837 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0616 0.0954 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 5.21e-01 -0.046 0.0715 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 5.41e-02 0.144 0.0743 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 6800 sc-eQTL 5.24e-01 -0.069 0.108 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00188 0.11 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -451313 sc-eQTL 5.55e-01 0.0592 0.1 0.199 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 3.04e-02 -0.186 0.0854 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 5.07e-01 0.0463 0.0697 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0544 0.0898 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0625 0.106 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 3.29e-01 0.0887 0.0907 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 2.21e-01 0.0967 0.0788 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 4.45e-03 0.183 0.0636 0.199 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0238 0.0986 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000481 0.0861 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0887 0.104 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 3.09e-01 0.102 0.1 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0306 0.0996 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 8.62e-01 0.0151 0.0865 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 1.35e-01 0.111 0.0742 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -373848 sc-eQTL 1.32e-01 -0.139 0.092 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 49325 sc-eQTL 9.81e-06 -0.39 0.0862 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -84687 sc-eQTL 5.68e-01 0.0353 0.0618 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 466167 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0239 0.0948 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 338500 sc-eQTL 6.77e-01 0.0368 0.088 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -315877 sc-eQTL 8.83e-02 -0.121 0.0708 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 sc-eQTL 3.58e-03 0.276 0.0938 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -373913 sc-eQTL 8.44e-02 0.194 0.112 0.196 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 49325 eQTL 1.52e-02 -0.0803 0.033 0.0 0.0 0.169
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 eQTL 7.73e-14 0.137 0.0181 0.0 0.0 0.169


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -131308 1.25e-05 1.27e-05 2.47e-06 9.77e-06 2.45e-06 6.55e-06 1.56e-05 2.11e-06 1.25e-05 6.37e-06 1.69e-05 6.46e-06 2.36e-05 4.2e-06 3.46e-06 7.09e-06 6.44e-06 1e-05 2.63e-06 2.82e-06 6.39e-06 1.21e-05 1.12e-05 3.91e-06 2.28e-05 4.49e-06 6.57e-06 4.45e-06 1.22e-05 1.03e-05 7.69e-06 1.04e-06 1.2e-06 3.29e-06 6.68e-06 2.38e-06 1.78e-06 2e-06 2.12e-06 1.34e-06 1.12e-06 1.88e-05 1.61e-06 2.36e-07 8.04e-07 1.78e-06 1.5e-06 7.39e-07 6.37e-07