logo

Genes within 1Mb (chr12:101743378:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0256 0.0445 0.203 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0155 0.0776 0.203 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0549 0.047 0.203 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.68e-03 0.212 0.0666 0.203 B L1
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 6.19e-01 0.0386 0.0775 0.203 B L1
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0546 0.0665 0.203 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0287 0.0533 0.203 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 2.44e-02 0.136 0.0598 0.203 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 9.91e-02 -0.158 0.0955 0.203 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0387 0.0921 0.203 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 4.94e-01 0.0588 0.0858 0.203 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.74e-02 -0.154 0.0693 0.203 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 8.58e-04 -0.312 0.0921 0.203 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.02e-06 0.312 0.062 0.203 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0284 0.0725 0.203 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0108 0.0709 0.203 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.51e-01 0.057 0.0495 0.203 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 5.02e-01 0.059 0.0877 0.203 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 5.04e-04 -0.327 0.0925 0.203 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.95e-01 0.0809 0.0622 0.203 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 6.52e-05 -0.309 0.0759 0.203 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0375 0.087 0.203 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0315 0.0618 0.203 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 7.44e-01 -0.029 0.0885 0.203 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0974 0.203 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 9.96e-01 0.000401 0.0893 0.203 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.23e-02 0.244 0.0967 0.203 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 7.76e-03 0.278 0.103 0.203 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 1.40e-01 -0.16 0.108 0.203 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 7.46e-01 0.0304 0.0937 0.203 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.69e-01 -0.106 0.077 0.203 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 6.46e-01 0.0469 0.102 0.203 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 4.20e-03 -0.232 0.0803 0.203 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 6.64e-01 0.0302 0.0693 0.203 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0943 0.0867 0.203 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 7.79e-01 0.0272 0.0969 0.203 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 4.01e-01 0.075 0.0891 0.203 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.47e-01 0.0909 0.0782 0.203 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.70e-02 0.152 0.0631 0.203 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0958 0.0875 0.202 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 6.17e-05 -0.321 0.0784 0.202 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 5.79e-01 0.0328 0.059 0.202 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 9.05e-01 0.0114 0.095 0.202 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.58e-01 0.0803 0.0871 0.202 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0929 0.0655 0.202 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 8.44e-03 0.245 0.0921 0.202 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 1.57e-01 0.155 0.109 0.202 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000584 0.0338 0.203 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0402 0.0644 0.203 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 3.34e-02 -0.199 0.0931 0.203 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.68e-02 0.162 0.067 0.203 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 2.41e-01 -0.124 0.106 0.203 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00159 0.0773 0.203 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 4.56e-01 0.0512 0.0686 0.203 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 8.45e-01 0.0161 0.0824 0.203 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0475 0.0686 0.203 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0599 0.0798 0.203 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 3.34e-01 -0.02 0.0207 0.209 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0636 0.108 0.209 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 5.34e-01 0.0495 0.0795 0.209 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 4.16e-02 0.229 0.112 0.209 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 2.37e-01 -0.129 0.109 0.209 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0976 0.113 0.209 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0185 0.108 0.209 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.34e-01 0.162 0.107 0.209 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 8.13e-01 -0.021 0.0887 0.209 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 3.41e-01 -0.085 0.0891 0.209 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 8.38e-02 0.145 0.0832 0.209 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0129 0.044 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 4.52e-01 0.0824 0.109 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0888 0.0585 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 8.82e-02 0.148 0.0863 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00181 0.0966 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 8.49e-01 0.0207 0.109 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 6.26e-01 0.0438 0.0897 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 5.72e-02 0.183 0.0955 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 2.16e-01 -0.125 0.101 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 8.52e-01 0.0199 0.106 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 2.83e-01 0.109 0.102 0.202 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0508 0.0402 0.203 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 1.42e-01 -0.156 0.106 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0774 0.0694 0.203 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 3.99e-01 0.0804 0.0952 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 4.32e-01 0.0823 0.105 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.98e-01 0.000267 0.104 0.203 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 4.25e-01 0.0744 0.093 0.203 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00988 0.0976 0.203 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 1.74e-01 -0.136 0.1 0.203 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 7.70e-02 -0.181 0.102 0.203 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 1.71e-01 -0.128 0.0932 0.203 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 1.80e-01 0.0748 0.0557 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00709 0.101 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0243 0.0525 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.63e-01 0.104 0.074 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0611 0.0882 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0937 0.0983 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0605 0.0745 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.92e-01 0.105 0.0805 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0799 0.11 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 4.83e-01 -0.075 0.107 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 8.69e-01 0.0166 0.1 0.203 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 8.75e-01 0.00765 0.0488 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 9.54e-01 0.00573 0.0999 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0575 0.0534 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 3.68e-02 0.172 0.0821 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 4.75e-01 0.0687 0.096 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.39e-01 0.00802 0.106 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 9.26e-01 0.00859 0.0919 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 7.21e-02 0.163 0.0903 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0419 0.0958 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 4.53e-01 0.0829 0.11 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 2.45e-01 0.111 0.095 0.202 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 3.25e-01 -0.106 0.107 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 4.52e-04 -0.372 0.104 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 8.14e-02 0.163 0.0933 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0138 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.33e-01 0.00919 0.11 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 1.83e-01 0.14 0.105 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 1.63e-01 -0.113 0.0805 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 9.18e-04 -0.305 0.0909 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.58e-06 0.336 0.0681 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0497 0.0782 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.35e-01 0.00696 0.0849 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 5.22e-01 0.038 0.0592 0.203 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 4.75e-02 -0.167 0.0839 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 4.76e-04 -0.337 0.0949 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 2.12e-02 0.173 0.0747 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 8.52e-01 0.0177 0.0947 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 1.99e-01 -0.114 0.0882 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0227 0.0581 0.203 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0685 0.101 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 6.31e-04 -0.328 0.0946 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.15e-01 0.147 0.0931 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00296 0.101 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0652 0.0956 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 6.38e-02 0.159 0.0851 0.203 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 6.81e-02 0.171 0.0931 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 1.41e-02 -0.235 0.0949 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 4.40e-01 0.0594 0.0769 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 3.05e-01 -0.107 0.104 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0516 0.103 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.95e-01 -0.092 0.0876 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.20e-01 -0.17 0.109 0.203 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0257 0.0972 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 9.56e-04 -0.315 0.0941 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 6.40e-03 0.235 0.0852 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 1.61e-01 -0.129 0.0918 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0693 0.1 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 4.63e-01 0.0484 0.0659 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 3.76e-01 0.0902 0.102 0.203 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0463 0.105 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 1.50e-01 -0.135 0.0935 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 8.02e-02 0.17 0.0965 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 1.41e-02 -0.259 0.104 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.27e-01 0.102 0.104 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 1.94e-01 -0.121 0.0929 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 7.68e-01 0.0301 0.102 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 6.87e-01 0.0438 0.108 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 5.08e-02 -0.199 0.102 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 8.14e-03 0.288 0.108 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 2.01e-01 -0.151 0.117 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00183 0.113 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 1.06e-01 -0.159 0.0978 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0935 0.108 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 1.39e-01 0.0541 0.0365 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.76e-01 -0.112 0.103 0.201 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 2.46e-01 -0.116 0.0999 0.201 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.42e-03 0.28 0.0867 0.201 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 4.72e-02 -0.21 0.105 0.201 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0582 0.109 0.201 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.22e-01 -0.11 0.09 0.201 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.23e-02 0.255 0.101 0.201 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 2.00e-01 -0.128 0.0999 0.201 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 5.04e-01 0.0593 0.0887 0.201 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0304 0.112 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 9.71e-02 -0.135 0.0807 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.40e-01 -0.138 0.0934 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00831 0.11 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 1.91e-01 0.14 0.107 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0597 0.0968 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 5.45e-02 0.195 0.101 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0147 0.108 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 4.20e-01 0.0779 0.0965 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 3.43e-05 -0.384 0.0906 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 7.23e-01 0.0253 0.0714 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00851 0.0991 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.08e-01 0.0978 0.0956 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 1.15e-01 -0.129 0.0817 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 2.13e-02 0.229 0.0985 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 8.77e-02 0.191 0.112 0.2 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0831 0.103 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 2.28e-02 -0.239 0.104 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0228 0.0848 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0562 0.111 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.18e-01 -0.113 0.113 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 7.40e-01 0.035 0.105 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 6.92e-03 0.29 0.106 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 2.74e-01 0.116 0.106 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 5.01e-02 -0.189 0.096 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 3.94e-03 -0.259 0.0889 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 8.31e-02 0.119 0.0684 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0321 0.096 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00249 0.0966 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0796 0.0759 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 6.66e-01 0.0429 0.0991 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0149 0.107 0.2 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 4.70e-02 -0.158 0.0789 0.222 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 3.94e-02 0.221 0.106 0.222 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 8.67e-01 0.0141 0.0839 0.222 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 2.01e-01 0.154 0.12 0.222 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0335 0.138 0.222 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.87e-01 0.0737 0.0848 0.222 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 3.05e-01 0.101 0.0977 0.222 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000143 0.0997 0.222 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0165 0.116 0.222 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 6.73e-01 0.0449 0.106 0.222 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 8.13e-01 0.0233 0.0981 0.222 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 6.73e-01 0.0158 0.0373 0.204 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0855 0.0751 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 7.76e-02 -0.176 0.0991 0.204 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00878 0.0738 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 2.10e-01 -0.132 0.105 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 8.72e-01 0.0129 0.0797 0.204 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.70e-01 0.0956 0.0864 0.204 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 7.69e-01 0.0218 0.0743 0.204 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00109 0.0689 0.204 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0856 0.0751 0.204 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 1.86e-01 -0.14 0.105 0.203 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 5.94e-03 -0.301 0.108 0.203 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 4.01e-02 0.197 0.0953 0.203 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0441 0.105 0.203 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 9.38e-02 0.181 0.108 0.203 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 1.29e-01 0.134 0.0876 0.203 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.18e-02 0.217 0.0937 0.205 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00314 0.0927 0.205 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 8.22e-03 0.314 0.117 0.205 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 3.19e-02 0.231 0.107 0.205 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0967 0.112 0.205 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.02e-01 0.135 0.105 0.205 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0607 0.0821 0.205 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0122 0.0938 0.205 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 5.27e-02 -0.18 0.0926 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 6.38e-01 0.0331 0.0704 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.72e-01 -0.127 0.093 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 3.22e-01 -0.104 0.105 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 5.58e-01 0.0553 0.0941 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 4.08e-01 0.0673 0.0811 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.25e-02 0.172 0.0682 0.203 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 7.10e-02 -0.182 0.1 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 1.85e-01 0.103 0.0772 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 5.94e-01 0.0503 0.0942 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 3.97e-01 0.0936 0.11 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 2.79e-01 0.112 0.103 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.86e-01 0.102 0.0957 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.03e-01 0.122 0.0743 0.203 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 8.08e-01 0.0324 0.133 0.194 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 4.25e-02 -0.251 0.123 0.194 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 4.31e-01 0.074 0.0937 0.194 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0554 0.124 0.194 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 7.28e-01 0.0452 0.13 0.194 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0529 0.121 0.194 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 6.91e-02 -0.223 0.122 0.194 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 1.07e-01 0.194 0.12 0.194 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 9.33e-01 0.00938 0.111 0.194 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.04e-01 -0.13 0.102 0.198 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 7.95e-01 0.0243 0.0933 0.198 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 1.33e-01 -0.164 0.109 0.198 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 9.31e-01 0.00893 0.103 0.198 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0876 0.106 0.198 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 3.25e-01 0.101 0.102 0.198 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 3.88e-01 0.0774 0.0895 0.198 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 5.49e-01 0.0625 0.104 0.197 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0255 0.0961 0.197 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 9.66e-01 0.00494 0.115 0.197 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 1.33e-01 0.151 0.1 0.197 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 3.43e-01 0.0917 0.0966 0.197 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0441 0.093 0.197 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 3.38e-02 0.183 0.0857 0.197 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 5.07e-02 -0.233 0.118 0.201 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0331 0.104 0.201 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 6.88e-01 0.0443 0.11 0.201 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 4.23e-01 0.0881 0.11 0.201 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0547 0.115 0.201 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 7.05e-01 0.0382 0.101 0.201 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0759 0.0777 0.201 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 5.29e-01 0.0653 0.103 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0214 0.0515 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 3.03e-01 -0.106 0.103 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 5.20e-01 -0.035 0.0544 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 8.88e-02 0.145 0.0849 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 8.40e-01 0.0178 0.088 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0335 0.0995 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 4.86e-01 0.0519 0.0743 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 8.52e-02 0.153 0.0884 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 1.71e-01 -0.14 0.102 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0964 0.107 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 3.65e-01 0.0965 0.106 0.203 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -738366 sc-eQTL 8.54e-01 0.0109 0.0591 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 9.48e-01 0.00634 0.0967 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 7.38e-01 -0.016 0.0478 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 3.05e-02 0.147 0.0677 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 8.43e-01 0.0166 0.0837 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 2.91e-01 -0.101 0.0953 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0547 0.0715 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 4.47e-02 0.15 0.0743 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 3906 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0774 0.108 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0195 0.11 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -454207 sc-eQTL 5.28e-01 0.0634 0.1 0.203 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 1.62e-02 -0.206 0.0851 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 4.25e-01 0.0557 0.0696 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0592 0.0897 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0318 0.106 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 2.61e-01 0.102 0.0905 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 2.72e-01 0.0867 0.0788 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 8.38e-03 0.17 0.0637 0.203 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0121 0.0985 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 9.47e-01 0.00571 0.086 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 5.85e-01 -0.057 0.104 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 2.15e-01 0.124 0.0998 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0306 0.0995 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0106 0.0864 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 1.09e-01 0.119 0.0741 0.2 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -376742 sc-eQTL 2.20e-01 -0.113 0.0922 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 46431 sc-eQTL 1.23e-05 -0.386 0.0862 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -87581 sc-eQTL 5.28e-01 0.039 0.0617 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 463273 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0169 0.0948 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 335606 sc-eQTL 7.01e-01 0.0338 0.088 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -318771 sc-eQTL 6.18e-02 -0.133 0.0707 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 sc-eQTL 5.16e-03 0.266 0.0939 0.2 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -376807 sc-eQTL 1.27e-01 0.171 0.112 0.2 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 46431 eQTL 1.96e-02 -0.0767 0.0328 0.0 0.0 0.171
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 eQTL 8.49e-13 0.13 0.018 0.0 0.0 0.171

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000136048 DRAM1 -134202 5.87e-06 9.28e-06 1.23e-06 6.16e-06 1.67e-06 3.11e-06 9.48e-06 1.75e-06 7.74e-06 4.26e-06 1.05e-05 5.02e-06 1.32e-05 3.85e-06 1.81e-06 5.79e-06 3.72e-06 5.1e-06 2.02e-06 2.91e-06 3.73e-06 7.62e-06 5.73e-06 2.32e-06 1.02e-05 2.38e-06 4.07e-06 3.37e-06 7.08e-06 7.22e-06 4.12e-06 9.97e-07 8.75e-07 2.78e-06 4.23e-06 2.12e-06 1.57e-06 1.09e-06 1.62e-06 9.8e-07 8.2e-07 1.07e-05 1.39e-06 1.6e-07 7.68e-07 1.04e-06 8.85e-07 6.7e-07 4.53e-07