logo

Genes within 1Mb (chr12:101741912:ACTCAGT:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00557 0.0592 0.124 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 3.64e-01 0.0935 0.103 0.124 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.12e-02 -0.158 0.0617 0.124 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.73e-02 0.188 0.0897 0.124 B L1
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 1.41e-01 -0.151 0.102 0.124 B L1
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 4.93e-01 0.0607 0.0884 0.124 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0708 0.0707 0.124 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 8.09e-02 0.14 0.0798 0.124 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 4.81e-01 -0.09 0.128 0.124 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 3.26e-02 0.26 0.121 0.124 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 1.39e-01 -0.169 0.113 0.124 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 8.97e-01 0.0122 0.0937 0.124 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.11e-05 -0.544 0.121 0.124 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 9.19e-05 0.337 0.0846 0.124 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 3.37e-01 0.0933 0.0968 0.124 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000156 0.0949 0.124 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0971 0.0661 0.124 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 2.91e-01 0.124 0.117 0.124 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.39e-06 -0.596 0.12 0.124 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 4.88e-01 0.0578 0.0831 0.124 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 1.20e-01 0.163 0.104 0.124 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 7.92e-01 0.0306 0.116 0.124 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0531 0.0822 0.124 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0356 0.118 0.124 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 1.42e-01 -0.194 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.05e-01 -0.195 0.12 0.128 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.33e-01 -0.2 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.38e-01 -0.168 0.142 0.128 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 1.81e-01 0.197 0.147 0.128 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 6.97e-01 0.0495 0.127 0.128 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0229 0.105 0.128 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00924 0.138 0.128 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0155 0.109 0.124 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 6.72e-05 -0.362 0.089 0.124 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 9.82e-01 0.00259 0.116 0.124 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0549 0.129 0.124 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.47e-02 0.228 0.118 0.124 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.68e-01 -0.144 0.104 0.124 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0537 0.0852 0.124 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 1.92e-01 0.157 0.12 0.122 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.54e-04 -0.417 0.108 0.122 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0578 0.081 0.122 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 9.75e-02 0.216 0.13 0.122 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 9.32e-02 0.201 0.119 0.122 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 2.34e-01 -0.108 0.0901 0.122 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 1.20e-01 -0.2 0.128 0.122 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 1.66e-01 -0.209 0.15 0.122 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 3.35e-03 0.131 0.0442 0.124 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 7.16e-01 0.0313 0.0859 0.124 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 5.46e-04 -0.428 0.122 0.124 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 8.76e-01 0.0141 0.0905 0.124 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0186 0.141 0.124 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 9.92e-01 0.000976 0.103 0.124 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 2.39e-01 -0.108 0.0913 0.124 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0883 0.11 0.124 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 1.24e-01 0.14 0.091 0.124 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 9.86e-01 0.00192 0.106 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 2.41e-01 -0.035 0.0298 0.117 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 3.05e-02 0.334 0.153 0.117 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 2.04e-01 -0.145 0.114 0.117 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 8.49e-01 0.031 0.163 0.117 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.41e-01 -0.185 0.157 0.117 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 1.20e-01 0.252 0.161 0.117 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 6.12e-01 0.0786 0.155 0.117 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 9.24e-01 0.0148 0.156 0.117 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 2.60e-01 0.144 0.127 0.117 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 2.71e-01 0.142 0.128 0.117 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 6.92e-01 -0.048 0.121 0.117 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 5.94e-02 -0.111 0.0586 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0829 0.147 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.33e-01 -0.118 0.0786 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0379 0.117 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 5.57e-01 0.0764 0.13 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 9.02e-01 0.018 0.146 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.00e+00 -6.42e-05 0.121 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 4.51e-01 0.0976 0.129 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 1.63e-02 -0.325 0.134 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 6.00e-02 0.268 0.142 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 2.79e-01 -0.148 0.137 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0264 0.0541 0.125 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 8.80e-01 0.0216 0.143 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 2.95e-04 -0.333 0.0904 0.125 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 5.87e-01 0.0694 0.128 0.125 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.45e-01 -0.163 0.14 0.125 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 3.39e-01 -0.133 0.139 0.125 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 5.25e-01 0.0792 0.125 0.125 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 4.96e-01 -0.089 0.131 0.125 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 6.96e-02 -0.243 0.133 0.125 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 3.94e-01 0.117 0.137 0.125 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 3.20e-01 0.125 0.125 0.125 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0638 0.0754 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0757 0.137 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 5.15e-02 -0.138 0.0704 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 2.68e-02 0.222 0.0994 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 3.05e-01 -0.122 0.119 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 4.89e-01 0.0923 0.133 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 8.15e-02 -0.175 0.1 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 3.02e-01 0.113 0.109 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 1.71e-01 0.203 0.148 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 2.74e-01 0.158 0.144 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 2.79e-02 -0.296 0.134 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0107 0.0657 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 1.47e-01 0.195 0.134 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.26e-01 -0.11 0.0717 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 2.51e-01 0.128 0.111 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.31e-01 -0.155 0.129 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 3.95e-01 0.121 0.142 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 7.41e-01 -0.041 0.124 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 8.73e-02 0.209 0.122 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 1.89e-01 -0.169 0.129 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 8.01e-01 0.0375 0.149 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 9.49e-01 0.00825 0.128 0.124 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 4.18e-01 0.117 0.144 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 2.70e-02 -0.318 0.143 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 7.23e-01 0.0448 0.126 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 8.35e-01 0.029 0.139 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0819 0.147 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 7.70e-01 0.0414 0.141 0.123 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000821 0.109 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 5.73e-06 -0.555 0.119 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 4.69e-05 0.386 0.0929 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 4.60e-01 0.0778 0.105 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 8.72e-01 0.0183 0.114 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 9.31e-02 -0.133 0.0791 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0433 0.114 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 3.75e-04 -0.46 0.127 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 9.30e-02 0.17 0.101 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 3.92e-01 0.109 0.127 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0803 0.119 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 8.48e-01 -0.015 0.0781 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 9.41e-01 0.0101 0.135 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 4.55e-04 -0.45 0.126 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.94e-02 0.291 0.124 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 1.36e-01 -0.202 0.135 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 6.53e-01 0.0575 0.128 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.17e-01 -0.179 0.114 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 5.63e-01 0.0708 0.122 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 5.36e-04 -0.428 0.122 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.74e-01 -0.089 0.1 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.18e-01 0.167 0.135 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 4.67e-01 0.0975 0.134 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.14e-01 0.18 0.114 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 6.47e-01 0.0652 0.142 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 6.93e-01 0.0522 0.132 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 5.28e-05 -0.521 0.126 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.10e-03 0.38 0.115 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 6.68e-02 0.229 0.124 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0361 0.136 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0498 0.0896 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0504 0.138 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 4.64e-02 0.282 0.141 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 9.38e-04 -0.416 0.124 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.96e-01 0.17 0.131 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00886 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 8.91e-03 0.367 0.139 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.95e-01 -0.164 0.126 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 5.62e-01 0.08 0.138 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0217 0.139 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.96e-04 -0.483 0.127 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 8.13e-01 0.0334 0.141 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0766 0.151 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 7.21e-02 -0.26 0.144 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00869 0.127 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 4.44e-01 -0.107 0.139 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00202 0.0488 0.123 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 8.06e-01 0.0337 0.137 0.123 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 7.31e-04 -0.445 0.13 0.123 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.35e-01 0.114 0.118 0.123 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 5.54e-01 -0.084 0.142 0.123 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 3.36e-01 -0.139 0.144 0.123 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0849 0.12 0.123 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0858 0.136 0.123 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 8.69e-02 0.228 0.133 0.123 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 1.88e-01 -0.156 0.118 0.123 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 9.96e-01 0.000676 0.153 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 8.36e-02 -0.192 0.11 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0275 0.128 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 4.30e-01 -0.118 0.15 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0956 0.146 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0652 0.132 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00123 0.139 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0367 0.147 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 2.58e-01 0.15 0.133 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 3.16e-03 -0.38 0.127 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.06e-01 -0.158 0.0977 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 3.72e-02 0.283 0.135 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 8.00e-02 0.231 0.131 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0626 0.113 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0366 0.137 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 3.32e-01 -0.15 0.154 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 4.04e-01 0.117 0.14 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 4.21e-02 -0.291 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 9.59e-01 0.00596 0.115 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 6.48e-01 -0.069 0.151 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.66e-01 0.0885 0.154 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 7.33e-01 0.049 0.143 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 3.49e-02 -0.309 0.146 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 6.42e-03 -0.391 0.142 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 3.65e-01 0.122 0.134 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 9.33e-04 -0.411 0.123 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0968 0.0953 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 6.57e-01 0.0593 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 1.83e-01 0.178 0.133 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 4.26e-01 -0.084 0.105 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 3.58e-02 -0.287 0.136 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 1.37e-01 -0.22 0.148 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0824 0.108 0.119 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 5.20e-01 0.0943 0.146 0.119 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 5.89e-01 0.0614 0.113 0.119 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 5.14e-01 0.107 0.163 0.119 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.95e-01 0.196 0.186 0.119 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.55e-01 0.0681 0.115 0.119 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.73e-01 0.181 0.132 0.119 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 1.30e-01 0.204 0.133 0.119 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 7.26e-02 0.28 0.154 0.119 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 6.91e-01 0.0571 0.143 0.119 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 7.89e-01 0.0356 0.133 0.119 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 2.27e-01 0.0602 0.0497 0.122 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 6.55e-01 0.0451 0.101 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 9.26e-02 -0.224 0.132 0.122 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.94e-01 -0.128 0.0982 0.122 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.23e-01 0.172 0.14 0.122 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 9.09e-01 0.0121 0.107 0.122 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.43e-01 0.169 0.115 0.122 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 7.60e-01 0.0304 0.0993 0.122 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 5.14e-01 0.06 0.0919 0.122 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 8.74e-01 -0.016 0.101 0.122 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0256 0.137 0.124 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 5.36e-03 -0.395 0.14 0.124 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.47e-01 0.117 0.125 0.124 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 4.50e-01 0.103 0.136 0.124 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 9.18e-01 0.0145 0.141 0.124 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0869 0.114 0.124 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 3.13e-01 -0.128 0.126 0.132 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.39e-01 -0.182 0.123 0.132 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.08e-01 -0.162 0.159 0.132 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 1.40e-01 -0.213 0.143 0.132 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 3.88e-01 0.129 0.149 0.132 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0123 0.14 0.132 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 9.99e-01 0.00011 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 3.49e-01 -0.117 0.125 0.132 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 3.86e-01 -0.108 0.124 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.26e-03 -0.3 0.0916 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0624 0.125 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 3.59e-01 -0.129 0.14 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 3.16e-03 0.367 0.123 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0612 0.108 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 7.53e-01 0.0291 0.0923 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 1.57e-01 0.189 0.134 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 6.50e-03 -0.278 0.101 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.43e-02 0.264 0.124 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.16e-01 0.181 0.146 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 4.73e-01 0.0988 0.138 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 2.68e-01 -0.141 0.127 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0561 0.0992 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 4.57e-01 0.131 0.176 0.133 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.97e-01 -0.213 0.164 0.133 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.13e-01 -0.197 0.123 0.133 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0208 0.165 0.133 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.24e-01 0.11 0.172 0.133 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 6.98e-03 -0.429 0.157 0.133 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 2.70e-01 -0.18 0.163 0.133 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 4.73e-01 0.115 0.16 0.133 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0028 0.147 0.133 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 2.95e-01 0.144 0.137 0.124 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 8.68e-03 -0.328 0.124 0.124 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 3.69e-01 -0.133 0.148 0.124 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 9.31e-01 0.012 0.138 0.124 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 6.64e-01 0.0623 0.143 0.124 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 4.61e-01 -0.102 0.138 0.124 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 2.24e-01 -0.147 0.121 0.124 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0943 0.14 0.124 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 8.56e-02 -0.222 0.128 0.124 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0987 0.155 0.124 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0761 0.135 0.124 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0954 0.13 0.124 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 7.67e-01 -0.037 0.125 0.124 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 4.86e-01 0.0811 0.116 0.124 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0339 0.167 0.133 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 8.64e-01 -0.025 0.146 0.133 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 4.76e-01 0.11 0.154 0.133 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 2.18e-01 -0.189 0.153 0.133 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 3.65e-01 0.146 0.161 0.133 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 5.40e-01 0.0864 0.141 0.133 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 1.05e-01 0.176 0.108 0.133 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 8.09e-01 0.035 0.145 0.133 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 7.20e-02 -0.122 0.0677 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 4.92e-01 0.0942 0.137 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 1.96e-03 -0.221 0.0705 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 9.24e-01 0.0108 0.113 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0661 0.117 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 9.78e-01 -0.0036 0.132 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00281 0.0985 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 8.99e-01 0.015 0.118 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 6.97e-02 -0.246 0.135 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 1.37e-02 0.349 0.14 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0447 0.141 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -739832 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0655 0.0794 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 6.37e-01 0.0614 0.13 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 2.33e-02 -0.145 0.0635 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 4.49e-02 0.184 0.0911 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 1.98e-01 -0.145 0.112 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 3.78e-01 0.113 0.128 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 2.28e-01 -0.116 0.0959 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 3.89e-02 0.208 0.0998 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 2440 sc-eQTL 6.50e-01 0.0661 0.145 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 2.46e-01 0.172 0.148 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -455673 sc-eQTL 8.33e-02 -0.233 0.134 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 9.26e-01 0.0107 0.114 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 2.18e-04 -0.337 0.0895 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 8.90e-01 0.0165 0.119 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 7.67e-01 0.0417 0.141 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 7.47e-03 0.319 0.118 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 1.68e-01 -0.144 0.104 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0399 0.0858 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 9.01e-01 0.0166 0.134 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 6.14e-04 -0.394 0.113 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 1.16e-01 -0.222 0.14 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 4.47e-01 -0.103 0.136 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0864 0.135 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 3.07e-01 -0.12 0.117 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0553 0.101 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -378208 sc-eQTL 9.37e-02 0.212 0.126 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 44965 sc-eQTL 4.50e-04 -0.429 0.12 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -89047 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0464 0.0848 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 461807 sc-eQTL 4.20e-02 0.264 0.129 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 334140 sc-eQTL 1.84e-02 0.283 0.119 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0728 0.0977 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -135668 sc-eQTL 1.13e-01 -0.208 0.131 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -378273 sc-eQTL 8.68e-02 -0.264 0.153 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 44965 eQTL 4.49e-19 -0.32 0.0351 0.0 0.0 0.132
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 eQTL 4.23e-05 -0.0738 0.0179 0.0 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 44965 7.87e-05 7.84e-05 1.42e-05 7.57e-05 1.37e-05 4.3e-05 7.11e-05 2.28e-05 6.78e-05 4.18e-05 0.000121 4.13e-05 0.000163 3.48e-05 1.24e-05 5.88e-05 3.23e-05 4.64e-05 1.31e-05 1.51e-05 3.42e-05 9.73e-05 5.41e-05 5.31e-05 6.71e-05 2.79e-05 2.64e-05 4.29e-05 5.14e-05 1.99e-05 4.56e-05 1.14e-05 7.91e-06 3.93e-05 2.62e-05 1.75e-05 1.63e-05 6.6e-06 1.86e-05 3.58e-05 1.83e-05 9.67e-05 5.11e-06 1.55e-06 7.56e-06 1.96e-05 1.23e-05 8.14e-06 6.99e-06
ENSG00000120860 WASHC3 -320237 1.11e-06 9.44e-07 2.7e-07 1.36e-06 3.73e-07 5.92e-07 1.21e-06 1.76e-07 1.14e-06 3.22e-07 1.26e-06 5.39e-07 1.48e-06 2.05e-07 4.4e-07 6.22e-07 7.73e-07 5.67e-07 2.79e-07 4.48e-07 6.12e-07 8.66e-07 6.11e-07 5.84e-07 1.86e-06 3.71e-07 7.33e-07 5.44e-07 9.15e-07 9.45e-07 5.43e-07 3.99e-08 4.92e-08 5.87e-07 5.36e-07 4.28e-07 4.54e-07 1.46e-07 2.17e-07 3.45e-07 3.03e-07 1.77e-06 4.36e-08 1.64e-07 2.83e-07 1.71e-07 2.15e-07 2.25e-08 5.76e-08