logo

Genes within 1Mb (chr12:101668575:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0381 0.0425 0.256 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 4.94e-01 0.0508 0.074 0.256 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.13e-01 -0.056 0.0449 0.256 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 2.44e-01 0.0759 0.0649 0.256 B L1
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0962 0.0738 0.256 B L1
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 2.24e-02 0.145 0.0629 0.256 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 1.11e-01 0.081 0.0507 0.256 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 6.78e-01 0.024 0.0578 0.256 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0326 0.0918 0.256 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0481 0.0879 0.256 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0654 0.0819 0.256 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0572 0.0679 0.256 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 3.17e-01 0.0918 0.0915 0.256 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.21e-01 0.0986 0.0633 0.256 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 5.84e-01 0.0386 0.0703 0.256 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 6.81e-02 0.125 0.0683 0.256 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00282 0.0482 0.256 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 6.84e-01 -0.034 0.0833 0.256 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.62e-01 0.101 0.09 0.256 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.60e-01 0.0832 0.059 0.256 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 5.54e-01 0.0443 0.0748 0.256 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0419 0.0825 0.256 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 3.72e-01 0.0523 0.0585 0.256 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.19e-01 0.131 0.0835 0.256 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0329 0.0966 0.259 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 3.72e-02 -0.183 0.0874 0.259 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.35e-01 0.145 0.0967 0.259 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 4.43e-01 0.08 0.104 0.259 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 1.97e-01 0.139 0.107 0.259 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0736 0.0926 0.259 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 6.33e-01 0.0366 0.0766 0.259 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 9.08e-02 0.17 0.1 0.259 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.35e-01 0.0267 0.0788 0.256 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0251 0.0667 0.256 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0299 0.0836 0.256 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 6.21e-02 0.173 0.0925 0.256 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 8.22e-01 0.0193 0.0858 0.256 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0851 0.0753 0.256 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0846 0.0613 0.256 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 5.92e-01 0.0464 0.0865 0.258 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0226 0.0803 0.258 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0236 0.0582 0.258 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 1.09e-01 0.15 0.0931 0.258 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 2.05e-01 0.109 0.0858 0.258 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 7.21e-01 0.0232 0.0649 0.258 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.24e-01 0.142 0.0918 0.258 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 3.02e-02 0.234 0.107 0.258 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00422 0.0324 0.256 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 1.79e-01 0.0829 0.0615 0.256 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0614 0.0901 0.256 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 4.67e-01 0.0474 0.065 0.256 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 6.81e-01 0.0418 0.102 0.256 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0827 0.0739 0.256 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0787 0.0657 0.256 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0658 0.0789 0.256 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0923 0.0655 0.256 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0397 0.0765 0.256 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0234 0.0207 0.263 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 2.80e-01 -0.117 0.108 0.263 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.35e-03 -0.24 0.0776 0.263 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 9.57e-01 0.00608 0.113 0.263 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0708 0.109 0.263 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 7.79e-01 0.0318 0.113 0.263 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 1.44e-01 0.157 0.107 0.263 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 9.20e-01 0.011 0.108 0.263 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0763 0.0887 0.263 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0286 0.0895 0.263 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0211 0.0841 0.263 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0141 0.0424 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 1.21e-01 0.163 0.105 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 5.10e-03 -0.157 0.0556 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.66e-01 0.116 0.0834 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0691 0.093 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 7.18e-01 0.0379 0.105 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 1.79e-01 0.116 0.0862 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 7.03e-01 0.0354 0.0928 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0879 0.0975 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 5.39e-01 0.0629 0.102 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0161 0.0983 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00366 0.0393 0.256 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0183 0.104 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 9.21e-02 -0.114 0.0674 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 4.28e-01 0.0736 0.0927 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0988 0.102 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 3.93e-01 0.0866 0.101 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 1.99e-01 0.116 0.0903 0.256 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 5.88e-01 0.0516 0.095 0.256 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0785 0.0977 0.256 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 4.68e-01 0.0727 0.1 0.256 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 5.57e-02 0.174 0.0904 0.256 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0251 0.0536 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0338 0.0971 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 5.13e-01 -0.033 0.0504 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 6.03e-01 0.0372 0.0713 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0707 0.0846 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 4.04e-01 0.079 0.0944 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 1.11e-01 0.114 0.0712 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 7.20e-01 0.0279 0.0776 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 7.83e-01 0.029 0.105 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0341 0.103 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 8.56e-01 0.0174 0.0961 0.256 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 1.28e-02 -0.116 0.0462 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00891 0.0961 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 3.36e-01 0.0495 0.0513 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 8.01e-01 0.0201 0.0797 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0405 0.0924 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 3.65e-01 0.0918 0.101 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 8.90e-01 0.0122 0.0884 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00218 0.0875 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 1.78e-01 -0.124 0.0918 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 1.52e-01 -0.152 0.106 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0719 0.0915 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 9.16e-01 -0.011 0.104 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0874 0.104 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0767 0.0913 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 3.51e-01 0.0937 0.1 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0878 0.106 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 2.61e-01 0.115 0.102 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0731 0.0777 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 1.15e-01 0.141 0.0893 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.74e-02 0.164 0.0684 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 1.49e-01 0.109 0.0751 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 7.17e-01 0.0297 0.0817 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0243 0.0571 0.256 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 5.21e-01 -0.053 0.0824 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 4.10e-01 0.0784 0.095 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 8.91e-01 0.0101 0.0736 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 2.30e-01 -0.111 0.0918 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 1.98e-03 0.264 0.0843 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 4.34e-01 0.0443 0.0565 0.256 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 4.52e-01 0.0737 0.0977 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0179 0.0942 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0723 0.0906 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 5.90e-01 -0.053 0.0981 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 3.27e-01 0.0909 0.0925 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00773 0.0831 0.256 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0644 0.088 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 8.94e-01 0.012 0.0904 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 6.67e-01 0.0311 0.0723 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0421 0.0977 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0785 0.0966 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0302 0.0825 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 2.83e-01 0.11 0.102 0.256 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0462 0.0947 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.25e-01 0.114 0.0938 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 9.63e-02 0.14 0.084 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 3.87e-01 0.0779 0.0898 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0764 0.0975 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 1.54e-01 0.0915 0.064 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00658 0.0992 0.256 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 2.96e-01 0.107 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 3.84e-01 0.0802 0.0918 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 2.42e-01 0.111 0.0949 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 4.53e-01 0.078 0.104 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0312 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 8.25e-01 0.0202 0.0913 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 4.70e-02 0.197 0.0986 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0655 0.0987 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 3.91e-01 0.0802 0.0933 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 6.34e-01 0.0478 0.1 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0808 0.107 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 2.61e-01 0.115 0.102 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 4.34e-01 0.0703 0.0896 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 2.86e-01 0.106 0.0987 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 3.52e-01 0.0327 0.035 0.258 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 8.73e-02 0.168 0.0978 0.258 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 8.17e-01 0.0222 0.0959 0.258 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 3.22e-01 0.0842 0.0849 0.258 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 7.19e-01 0.0367 0.102 0.258 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0151 0.104 0.258 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 2.43e-01 -0.101 0.0862 0.258 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.26e-01 -0.15 0.0976 0.258 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 1.29e-01 -0.146 0.0956 0.258 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 3.13e-01 0.0858 0.0849 0.258 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 6.79e-01 0.0453 0.109 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 3.17e-01 0.079 0.0787 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 6.16e-01 0.0458 0.0912 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 8.71e-02 0.182 0.106 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 3.92e-01 0.0891 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0827 0.0939 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.06e-01 0.16 0.0984 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 9.51e-01 0.00648 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 6.77e-01 0.0395 0.0948 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0243 0.0926 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 9.54e-01 -0.004 0.07 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 7.07e-01 0.0366 0.0972 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 1.36e-01 0.14 0.0936 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 6.60e-02 0.148 0.08 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.51e-01 0.14 0.0974 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 5.94e-03 0.301 0.108 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0314 0.101 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 6.52e-01 0.0469 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0124 0.0834 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00577 0.109 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0791 0.111 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0342 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 2.82e-01 0.115 0.106 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 6.74e-01 0.0441 0.105 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0138 0.0961 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0558 0.0899 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 8.97e-01 0.00884 0.0683 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 2.18e-01 0.117 0.0949 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 4.63e-01 0.0704 0.0957 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0217 0.0755 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 9.11e-02 -0.166 0.0976 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 9.48e-01 0.00693 0.106 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 9.07e-01 0.00888 0.0755 0.263 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.85e-01 0.0278 0.102 0.263 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 8.62e-01 0.0138 0.0788 0.263 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.64e-01 -0.157 0.112 0.263 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 5.94e-01 0.0694 0.13 0.263 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 9.96e-01 0.000356 0.08 0.263 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 6.48e-02 -0.17 0.0909 0.263 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 4.55e-01 0.07 0.0934 0.263 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 2.35e-01 -0.129 0.108 0.263 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 3.15e-01 0.1 0.0992 0.263 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 1.21e-01 -0.143 0.0913 0.263 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 5.10e-01 0.0237 0.0359 0.254 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 5.51e-02 0.139 0.0719 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.73e-01 -0.105 0.0959 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0593 0.071 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0496 0.102 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0924 0.0766 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 7.53e-01 0.0263 0.0835 0.254 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0738 0.0714 0.254 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 1.10e-01 0.106 0.0659 0.254 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00438 0.0726 0.254 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.58e-01 0.0307 0.0996 0.256 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 7.83e-01 0.0286 0.104 0.256 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.62e-02 0.216 0.0893 0.256 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 8.55e-01 0.018 0.0986 0.256 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 6.79e-01 0.0422 0.102 0.256 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 5.65e-01 0.0477 0.0827 0.256 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 8.43e-01 0.0185 0.0934 0.261 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 9.59e-02 -0.151 0.0904 0.261 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 4.10e-01 0.097 0.117 0.261 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 9.28e-02 0.179 0.106 0.261 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 2.18e-01 0.136 0.11 0.261 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 6.36e-01 0.0491 0.104 0.261 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0946 0.0805 0.261 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 9.25e-02 0.155 0.0915 0.261 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.49e-01 0.0289 0.0901 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0399 0.0679 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 8.92e-01 0.0123 0.0901 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 6.66e-01 0.0437 0.101 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 7.83e-01 0.025 0.0908 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 7.99e-01 -0.02 0.0783 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0944 0.0665 0.256 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.18e-01 0.0354 0.0979 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 1.28e-01 -0.114 0.0747 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0256 0.0913 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 6.00e-02 0.201 0.106 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 9.79e-01 0.00266 0.101 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 2.00e-01 -0.119 0.0926 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 6.57e-01 0.0322 0.0725 0.256 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 4.08e-01 0.107 0.129 0.248 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0935 0.121 0.248 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0175 0.0912 0.248 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0229 0.121 0.248 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 2.80e-02 0.276 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 6.95e-01 0.0463 0.118 0.248 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0858 0.12 0.248 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 7.87e-02 0.206 0.116 0.248 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 5.52e-02 -0.205 0.106 0.248 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 2.46e-01 -0.114 0.0981 0.262 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0346 0.09 0.262 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0522 0.106 0.262 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 2.00e-01 0.127 0.0986 0.262 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 5.63e-01 0.0593 0.102 0.262 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 8.12e-01 0.0235 0.099 0.262 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 9.20e-01 0.00866 0.0865 0.262 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 2.56e-01 0.113 0.0988 0.258 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 5.32e-01 0.0573 0.0914 0.258 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.65e-01 0.152 0.109 0.258 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 8.53e-01 0.0178 0.0958 0.258 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 1.85e-01 0.122 0.0917 0.258 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0609 0.0885 0.258 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 2.91e-02 -0.179 0.0815 0.258 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0734 0.119 0.263 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.58e-01 -0.118 0.104 0.263 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 1.15e-02 0.276 0.108 0.263 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 3.11e-01 0.111 0.109 0.263 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 7.31e-01 0.0398 0.115 0.263 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0417 0.101 0.263 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 5.37e-01 0.0481 0.0777 0.263 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 8.62e-01 0.018 0.103 0.263 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 8.79e-01 0.00756 0.0496 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 3.99e-01 0.0841 0.0994 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.33e-03 -0.158 0.0513 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 2.60e-01 0.0928 0.0821 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 1.11e-01 -0.135 0.0843 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 6.46e-01 0.0441 0.0959 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 1.27e-01 0.109 0.0712 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 6.90e-01 0.0342 0.0857 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0853 0.0987 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 5.36e-01 0.064 0.103 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 2.54e-01 0.117 0.102 0.256 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -813169 sc-eQTL 1.66e-01 -0.0789 0.0567 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0352 0.0932 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0205 0.046 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 2.99e-01 0.0685 0.0657 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0959 0.0804 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 4.35e-01 0.0719 0.0919 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 2.62e-01 0.0772 0.0687 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 9.77e-01 0.00208 0.0723 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -70897 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0297 0.104 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0652 0.106 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -529010 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0595 0.0966 0.256 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 4.92e-01 0.0568 0.0826 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0777 0.0666 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0222 0.086 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 5.32e-02 0.196 0.101 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 7.52e-01 0.0275 0.087 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0715 0.0755 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0801 0.0619 0.256 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 9.44e-01 0.00673 0.0959 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 7.90e-01 0.0223 0.0838 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 9.07e-01 0.0118 0.101 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 4.35e-01 0.0761 0.0974 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 1.33e-01 0.145 0.0964 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0736 0.084 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 6.64e-02 -0.133 0.072 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -451545 sc-eQTL 6.09e-01 0.0467 0.0911 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 sc-eQTL 7.45e-01 -0.029 0.0889 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -162384 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0256 0.0609 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 388470 sc-eQTL 1.76e-01 0.126 0.093 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 260803 sc-eQTL 1.84e-01 0.115 0.0864 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -393574 sc-eQTL 3.43e-01 0.0667 0.0701 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -209005 sc-eQTL 1.12e-01 0.15 0.0938 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -451610 sc-eQTL 2.52e-02 0.247 0.11 0.256 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -451545 eQTL 0.0208 0.0455 0.0196 0.0 0.0 0.242
ENSG00000111666 CHPT1 -28372 eQTL 4.83e-04 -0.0994 0.0284 0.0 0.0 0.242

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 -451545 2.66e-07 1.01e-07 4.47e-08 1.82e-07 8.83e-08 9.3e-08 1.41e-07 5.35e-08 1.37e-07 4.4e-08 1.6e-07 8.02e-08 1.27e-07 6.21e-08 5.4e-08 7.89e-08 4.63e-08 1.1e-07 5.39e-08 3.88e-08 1.05e-07 1.28e-07 1.3e-07 4.26e-08 1.29e-07 1.13e-07 1.08e-07 8.71e-08 9.97e-08 1.12e-07 9.58e-08 3.95e-08 2.74e-08 8.21e-08 9.15e-08 3.93e-08 5.08e-08 9.55e-08 7.52e-08 3.8e-08 3.8e-08 1.36e-07 3.98e-08 5.93e-09 5.59e-08 1.69e-08 1.26e-07 4.14e-09 4.79e-08
ENSG00000120805 \N 260803 2.91e-07 2.5e-07 1.11e-07 3.58e-07 1.13e-07 1.25e-07 2.95e-07 7.52e-08 1.86e-07 1.6e-07 2.68e-07 1.52e-07 2.29e-07 8.55e-08 7.35e-08 1.13e-07 7.3e-08 2.33e-07 1.7e-07 6.16e-08 1.27e-07 2.15e-07 1.89e-07 7.36e-08 2.59e-07 1.51e-07 2.43e-07 1.46e-07 1.37e-07 2.26e-07 1.39e-07 3.9e-08 3.73e-08 9.98e-08 1.16e-07 3.3e-08 1.14e-07 7.62e-08 5.77e-08 2.24e-08 5.41e-08 1.68e-07 3.25e-08 1.74e-07 7.93e-08 8.59e-09 7.13e-08 0.0 4.61e-08