Genes within 1Mb (chr12:101659977:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000485 0.063 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 4.34e-01 0.0858 0.109 0.098 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 2.90e-01 0.0706 0.0665 0.098 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 8.67e-01 0.0161 0.0964 0.098 B L1
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 3.85e-01 0.0952 0.109 0.098 B L1
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 3.53e-03 -0.272 0.0923 0.098 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 1.03e-01 -0.123 0.075 0.098 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0423 0.0855 0.098 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0374 0.136 0.098 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 6.27e-01 0.0633 0.13 0.098 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 9.53e-01 0.00712 0.121 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.33e-01 -0.118 0.0987 0.098 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 7.84e-02 -0.235 0.133 0.098 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 7.06e-01 0.035 0.0927 0.098 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00591 0.103 0.098 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.0999 0.098 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0679 0.07 0.098 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.73e-02 0.271 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 9.59e-02 -0.222 0.133 0.098 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00601 0.0879 0.098 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 4.67e-01 -0.089 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0378 0.0869 0.098 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 8.98e-01 0.016 0.125 0.098 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.98e-01 0.116 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 1.28e-02 0.342 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 1.96e-01 0.192 0.148 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 5.98e-01 0.0809 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0703 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 3.08e-01 -0.146 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 7.33e-01 0.0398 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 3.59e-01 0.0905 0.0983 0.098 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 8.27e-01 0.0271 0.124 0.098 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 2.73e-01 0.151 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 6.82e-01 0.0521 0.127 0.098 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.87e-01 0.0607 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 2.47e-01 0.105 0.0907 0.098 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0701 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.01e-01 -0.195 0.118 0.097 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.0859 0.097 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0337 0.139 0.097 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0969 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0185 0.0963 0.097 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.136 0.097 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 2.46e-01 -0.187 0.16 0.097 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 9.17e-01 0.00491 0.0471 0.098 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.03e-01 -0.114 0.0895 0.098 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 5.32e-01 0.0821 0.131 0.098 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 5.18e-01 0.0612 0.0946 0.098 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.57e-01 0.0657 0.148 0.098 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.107 0.098 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 7.22e-01 0.0341 0.0958 0.098 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 4.01e-01 0.0966 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 9.66e-02 0.159 0.0951 0.098 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0117 0.0296 0.102 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 6.04e-01 0.0798 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.03e-02 0.289 0.111 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 4.12e-01 -0.133 0.161 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.04e-02 -0.292 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 1.24e-01 -0.248 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 3.95e-01 -0.131 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 7.10e-01 0.0472 0.127 0.102 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 5.67e-02 -0.242 0.126 0.102 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 5.91e-01 0.0645 0.12 0.102 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 3.22e-01 0.0621 0.0625 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 1.22e-01 0.241 0.155 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0834 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0405 0.124 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 9.41e-02 -0.23 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.154 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 6.29e-01 0.0618 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 3.08e-01 0.14 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 3.94e-01 -0.123 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0747 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 5.22e-01 0.0931 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0662 0.0577 0.099 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 9.97e-01 0.000565 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0666 0.0997 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0945 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 1.52e-01 0.215 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0219 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0989 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 3.89e-01 -0.124 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0927 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 7.33e-02 -0.24 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 3.75e-01 0.0699 0.0787 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.13e-01 0.117 0.0737 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0741 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 1.04e-01 0.202 0.124 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0939 0.139 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0751 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 1.00e-01 -0.187 0.113 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 7.55e-01 0.0484 0.155 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 1.51e-01 0.216 0.15 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0544 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 3.88e-01 0.0597 0.069 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 9.60e-01 0.00704 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 4.63e-01 0.0557 0.0757 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 3.36e-01 0.113 0.117 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 4.37e-01 0.106 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 8.44e-02 -0.258 0.149 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0468 0.13 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 5.98e-01 0.0681 0.129 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 9.52e-01 0.00823 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 8.37e-02 0.27 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 9.40e-01 0.0101 0.135 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.52e-01 -0.141 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 5.98e-01 -0.08 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 8.97e-04 0.434 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 5.42e-02 -0.279 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 1.15e-01 -0.242 0.153 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 4.62e-01 -0.109 0.148 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0896 0.114 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 6.81e-02 -0.24 0.131 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0454 0.102 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0563 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0621 0.12 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0198 0.084 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.56e-01 -0.196 0.138 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 8.99e-01 0.0169 0.134 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0731 0.0821 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0191 0.144 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 7.54e-03 -0.367 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 4.61e-01 0.0983 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 7.13e-02 0.26 0.143 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0722 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.98e-01 0.0644 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.91e-02 0.272 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0506 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0538 0.109 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 4.63e-01 -0.107 0.145 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0497 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 3.98e-01 -0.13 0.154 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.12e-02 0.316 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 2.15e-01 -0.17 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00136 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 5.57e-01 0.0769 0.131 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.142 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0232 0.0935 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 2.25e-01 0.175 0.144 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.33e-01 -0.18 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 9.41e-02 -0.226 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 6.12e-01 0.0709 0.14 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 4.05e-01 -0.127 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.28e-01 0.0847 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0646 0.146 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.74e-01 0.164 0.149 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.00e-01 -0.232 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 7.00e-01 0.0583 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 3.80e-01 -0.143 0.162 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 3.86e-02 -0.32 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0648 0.136 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0703 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 6.98e-01 0.02 0.0513 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 3.56e-01 0.13 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 8.24e-01 0.0277 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 4.91e-01 -0.103 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0382 0.152 0.1 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 1.99e-01 0.162 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 3.59e-01 0.132 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 5.36e-01 0.087 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 8.79e-01 0.0189 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.74e-01 0.146 0.164 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0394 0.119 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 3.91e-02 -0.282 0.136 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.16 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 7.81e-01 0.0436 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 9.46e-01 0.00956 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 7.30e-01 0.0513 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 2.22e-01 -0.192 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.85e-01 0.124 0.142 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.06e-01 -0.224 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0906 0.105 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 1.48e-01 -0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0554 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000165 0.147 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 2.51e-01 -0.189 0.165 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0616 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 4.74e-01 -0.112 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 7.40e-01 0.0417 0.126 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0233 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0248 0.168 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 6.17e-01 0.0781 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 5.02e-01 0.108 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 2.56e-01 -0.179 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 8.31e-02 -0.251 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 2.22e-01 -0.166 0.135 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0356 0.103 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0615 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 9.15e-01 0.0154 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0607 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 4.99e-02 0.29 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 6.68e-01 0.0687 0.16 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 8.96e-01 0.0166 0.127 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 1.10e-01 0.272 0.169 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.88e-01 0.175 0.132 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 2.60e-01 0.215 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.16e-01 0.11 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0441 0.135 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.33e-01 0.0971 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 2.68e-01 0.175 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 7.61e-01 0.0559 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 5.02e-01 -0.113 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 5.35e-01 0.0966 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 7.39e-01 0.0171 0.0511 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 1.92e-01 -0.134 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 6.30e-01 0.066 0.137 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 2.26e-01 0.122 0.101 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 1.53e-01 0.206 0.144 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0566 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 3.41e-01 0.097 0.102 0.1 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 8.36e-01 0.0196 0.0943 0.1 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 6.50e-01 0.0469 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 1.80e-01 -0.197 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 4.61e-01 -0.113 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 3.48e-01 -0.125 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0601 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 3.99e-01 -0.127 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0323 0.122 0.098 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00575 0.137 0.1 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 2.78e-01 -0.145 0.133 0.1 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 2.47e-02 0.385 0.17 0.1 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0299 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 9.66e-01 0.00699 0.162 0.1 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 2.16e-01 -0.188 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.1 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0717 0.135 0.1 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 6.25e-01 -0.065 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 4.90e-01 0.0692 0.1 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 7.88e-01 0.0358 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.21e-01 0.074 0.15 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.0985 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.143 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 8.14e-02 0.19 0.109 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 9.76e-01 0.00396 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 3.62e-01 0.142 0.156 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 7.55e-01 0.0458 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 1.47e-01 0.196 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00162 0.106 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0145 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0404 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 1.67e-01 0.182 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 3.79e-02 -0.36 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 1.97e-01 -0.236 0.182 0.1 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 3.45e-01 -0.161 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 9.40e-01 0.013 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 4.91e-02 0.334 0.168 0.1 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 9.88e-02 0.257 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 7.53e-01 0.0467 0.148 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0886 0.136 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0892 0.159 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 5.38e-01 0.092 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 4.98e-01 -0.101 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0351 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 1.30e-01 0.221 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0619 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 5.47e-01 0.0974 0.161 0.095 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 2.67e-02 0.311 0.139 0.095 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 8.25e-01 0.0301 0.136 0.095 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 4.71e-01 0.094 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 9.67e-02 0.201 0.121 0.095 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0701 0.184 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 3.54e-01 -0.148 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0281 0.17 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 1.20e-01 0.262 0.168 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 5.22e-01 0.114 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 1.70e-01 0.212 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0636 0.12 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 3.73e-01 -0.142 0.159 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0316 0.0725 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.11e-01 0.182 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 5.79e-01 0.0426 0.0766 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0514 0.12 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0871 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 8.04e-01 0.0312 0.125 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 1.28e-01 -0.22 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 2.68e-01 -0.168 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0854 0.15 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -821767 sc-eQTL 4.19e-01 0.0675 0.0833 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 5.18e-01 0.0884 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 1.94e-01 0.0876 0.0672 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0965 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 9.40e-02 0.197 0.117 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 1.06e-01 -0.217 0.134 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 2.98e-01 -0.105 0.101 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0903 0.106 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -79495 sc-eQTL 6.38e-01 0.0719 0.153 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 6.99e-02 0.281 0.154 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -537608 sc-eQTL 9.92e-01 0.00144 0.142 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 8.72e-01 0.0197 0.122 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 3.35e-01 0.0949 0.0982 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 9.77e-01 0.00361 0.127 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 6.86e-01 0.0606 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 6.84e-01 0.0522 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.28e-01 0.0704 0.111 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 6.33e-01 0.0437 0.0914 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 2.03e-01 0.181 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 9.17e-01 -0.013 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 7.57e-01 0.0465 0.15 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 2.93e-02 0.313 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 6.47e-01 0.0657 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 1.81e-01 0.143 0.107 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460143 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -36970 sc-eQTL 7.80e-02 -0.232 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -170982 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0902 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379872 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0455 0.139 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252205 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.129 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402172 sc-eQTL 5.99e-01 -0.055 0.104 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 sc-eQTL 1.45e-01 0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -460208 sc-eQTL 5.30e-01 -0.104 0.165 0.097 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 -217603 eQTL 0.00118 0.0786 0.0241 0.0 0.0 0.0868


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -460143 7.87e-07 5.7e-07 7.6e-08 3.96e-07 1.07e-07 2.16e-07 5.28e-07 9.78e-08 3.03e-07 1.7e-07 6.56e-07 3.68e-07 9.44e-07 1.6e-07 1.71e-07 1.46e-07 2.77e-07 3.44e-07 1.56e-07 9.01e-08 1.57e-07 2.96e-07 3.08e-07 9.01e-08 8.62e-07 2.32e-07 2.23e-07 1.97e-07 3.27e-07 5.82e-07 3.13e-07 5.22e-08 5.07e-08 1.37e-07 3.52e-07 7.56e-08 1.11e-07 5.8e-08 4.78e-08 6.07e-08 4.84e-08 6.49e-07 1.67e-08 1.99e-08 9.64e-08 8.24e-09 9.26e-08 2.99e-09 4.54e-08