logo

Genes within 1Mb (chr12:101659897:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000485 0.063 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 4.34e-01 0.0858 0.109 0.098 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 2.90e-01 0.0706 0.0665 0.098 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 8.67e-01 0.0161 0.0964 0.098 B L1
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 3.85e-01 0.0952 0.109 0.098 B L1
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 3.53e-03 -0.272 0.0923 0.098 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 1.03e-01 -0.123 0.075 0.098 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0423 0.0855 0.098 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0374 0.136 0.098 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 6.27e-01 0.0633 0.13 0.098 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 9.53e-01 0.00712 0.121 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.33e-01 -0.118 0.0987 0.098 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 7.84e-02 -0.235 0.133 0.098 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 7.06e-01 0.035 0.0927 0.098 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00591 0.103 0.098 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.0999 0.098 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0679 0.07 0.098 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.73e-02 0.271 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 9.59e-02 -0.222 0.133 0.098 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00601 0.0879 0.098 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 4.67e-01 -0.089 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0378 0.0869 0.098 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 8.98e-01 0.016 0.125 0.098 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.98e-01 0.116 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 1.28e-02 0.342 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 1.96e-01 0.192 0.148 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 5.98e-01 0.0809 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0703 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 3.08e-01 -0.146 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 7.33e-01 0.0398 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 3.59e-01 0.0905 0.0983 0.098 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 8.27e-01 0.0271 0.124 0.098 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 2.73e-01 0.151 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 6.82e-01 0.0521 0.127 0.098 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.87e-01 0.0607 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 2.47e-01 0.105 0.0907 0.098 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0701 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.01e-01 -0.195 0.118 0.097 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.0859 0.097 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0337 0.139 0.097 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0969 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0185 0.0963 0.097 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.136 0.097 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 2.46e-01 -0.187 0.16 0.097 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 9.17e-01 0.00491 0.0471 0.098 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.03e-01 -0.114 0.0895 0.098 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 5.32e-01 0.0821 0.131 0.098 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 5.18e-01 0.0612 0.0946 0.098 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.57e-01 0.0657 0.148 0.098 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.107 0.098 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 7.22e-01 0.0341 0.0958 0.098 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 4.01e-01 0.0966 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 9.66e-02 0.159 0.0951 0.098 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0117 0.0296 0.102 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 6.04e-01 0.0798 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.03e-02 0.289 0.111 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 4.12e-01 -0.133 0.161 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.04e-02 -0.292 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 1.24e-01 -0.248 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 3.95e-01 -0.131 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 7.10e-01 0.0472 0.127 0.102 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 5.67e-02 -0.242 0.126 0.102 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 5.91e-01 0.0645 0.12 0.102 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 3.22e-01 0.0621 0.0625 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 1.22e-01 0.241 0.155 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0834 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0405 0.124 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 9.41e-02 -0.23 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.154 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 6.29e-01 0.0618 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 3.08e-01 0.14 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 3.94e-01 -0.123 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0747 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 5.22e-01 0.0931 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0662 0.0577 0.099 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 9.97e-01 0.000565 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0666 0.0997 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0945 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 1.52e-01 0.215 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0219 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0989 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 3.89e-01 -0.124 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0927 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 7.33e-02 -0.24 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 3.75e-01 0.0699 0.0787 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.13e-01 0.117 0.0737 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0741 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 1.04e-01 0.202 0.124 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0939 0.139 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0751 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 1.00e-01 -0.187 0.113 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 7.55e-01 0.0484 0.155 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 1.51e-01 0.216 0.15 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0544 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 3.88e-01 0.0597 0.069 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 9.60e-01 0.00704 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 4.63e-01 0.0557 0.0757 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 3.36e-01 0.113 0.117 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 4.37e-01 0.106 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 8.44e-02 -0.258 0.149 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0468 0.13 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 5.98e-01 0.0681 0.129 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 9.52e-01 0.00823 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 8.37e-02 0.27 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 9.40e-01 0.0101 0.135 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.52e-01 -0.141 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 5.98e-01 -0.08 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 8.97e-04 0.434 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 5.42e-02 -0.279 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 1.15e-01 -0.242 0.153 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 4.62e-01 -0.109 0.148 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0896 0.114 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 6.81e-02 -0.24 0.131 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0454 0.102 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0563 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0621 0.12 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0198 0.084 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.56e-01 -0.196 0.138 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 8.99e-01 0.0169 0.134 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0731 0.0821 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0191 0.144 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 7.54e-03 -0.367 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 4.61e-01 0.0983 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 7.13e-02 0.26 0.143 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0722 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.98e-01 0.0644 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.91e-02 0.272 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0506 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0538 0.109 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 4.63e-01 -0.107 0.145 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0497 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 3.98e-01 -0.13 0.154 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.12e-02 0.316 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 2.15e-01 -0.17 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00136 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 5.57e-01 0.0769 0.131 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.142 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0232 0.0935 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 2.25e-01 0.175 0.144 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.33e-01 -0.18 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 9.41e-02 -0.226 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 6.12e-01 0.0709 0.14 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 4.05e-01 -0.127 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.28e-01 0.0847 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0646 0.146 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.74e-01 0.164 0.149 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.00e-01 -0.232 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 7.00e-01 0.0583 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 3.80e-01 -0.143 0.162 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 3.86e-02 -0.32 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0648 0.136 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0703 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 6.98e-01 0.02 0.0513 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 3.56e-01 0.13 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 8.24e-01 0.0277 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 4.91e-01 -0.103 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0382 0.152 0.1 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 1.99e-01 0.162 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 3.59e-01 0.132 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 5.36e-01 0.087 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 8.79e-01 0.0189 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.74e-01 0.146 0.164 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0394 0.119 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 3.91e-02 -0.282 0.136 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.16 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 7.81e-01 0.0436 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 9.46e-01 0.00956 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 7.30e-01 0.0513 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 2.22e-01 -0.192 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.85e-01 0.124 0.142 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.06e-01 -0.224 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0906 0.105 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 1.48e-01 -0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0554 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000165 0.147 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 2.51e-01 -0.189 0.165 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0616 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 4.74e-01 -0.112 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 7.40e-01 0.0417 0.126 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0233 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0248 0.168 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 6.17e-01 0.0781 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 5.02e-01 0.108 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 2.56e-01 -0.179 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 8.31e-02 -0.251 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 2.22e-01 -0.166 0.135 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0356 0.103 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0615 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 9.15e-01 0.0154 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0607 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 4.99e-02 0.29 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 6.68e-01 0.0687 0.16 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 8.96e-01 0.0166 0.127 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 1.10e-01 0.272 0.169 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.88e-01 0.175 0.132 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 2.60e-01 0.215 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.16e-01 0.11 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0441 0.135 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.33e-01 0.0971 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 2.68e-01 0.175 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 7.61e-01 0.0559 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 5.02e-01 -0.113 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 5.35e-01 0.0966 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 7.39e-01 0.0171 0.0511 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 1.92e-01 -0.134 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 6.30e-01 0.066 0.137 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 2.26e-01 0.122 0.101 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 1.53e-01 0.206 0.144 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0566 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 3.41e-01 0.097 0.102 0.1 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 8.36e-01 0.0196 0.0943 0.1 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 6.50e-01 0.0469 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 1.80e-01 -0.197 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 4.61e-01 -0.113 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 3.48e-01 -0.125 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0601 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 3.99e-01 -0.127 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0323 0.122 0.098 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00575 0.137 0.1 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 2.78e-01 -0.145 0.133 0.1 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 2.47e-02 0.385 0.17 0.1 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0299 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 9.66e-01 0.00699 0.162 0.1 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 2.16e-01 -0.188 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.1 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0717 0.135 0.1 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 6.25e-01 -0.065 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 4.90e-01 0.0692 0.1 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 7.88e-01 0.0358 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.21e-01 0.074 0.15 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.0985 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.143 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 8.14e-02 0.19 0.109 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 9.76e-01 0.00396 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 3.62e-01 0.142 0.156 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 7.55e-01 0.0458 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 1.47e-01 0.196 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00162 0.106 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0145 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0404 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 1.67e-01 0.182 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 3.79e-02 -0.36 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 1.97e-01 -0.236 0.182 0.1 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 3.45e-01 -0.161 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 9.40e-01 0.013 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 4.91e-02 0.334 0.168 0.1 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 9.88e-02 0.257 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 7.53e-01 0.0467 0.148 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0886 0.136 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0892 0.159 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 5.38e-01 0.092 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 4.98e-01 -0.101 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0351 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 1.30e-01 0.221 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0619 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 5.47e-01 0.0974 0.161 0.095 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 2.67e-02 0.311 0.139 0.095 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 8.25e-01 0.0301 0.136 0.095 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 4.71e-01 0.094 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 9.67e-02 0.201 0.121 0.095 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0701 0.184 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 3.54e-01 -0.148 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0281 0.17 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 1.20e-01 0.262 0.168 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 5.22e-01 0.114 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 1.70e-01 0.212 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0636 0.12 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 3.73e-01 -0.142 0.159 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0316 0.0725 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.11e-01 0.182 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 5.79e-01 0.0426 0.0766 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0514 0.12 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0871 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 8.04e-01 0.0312 0.125 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 1.28e-01 -0.22 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 2.68e-01 -0.168 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0854 0.15 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -821847 sc-eQTL 4.19e-01 0.0675 0.0833 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 5.18e-01 0.0884 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 1.94e-01 0.0876 0.0672 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0965 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 9.40e-02 0.197 0.117 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 1.06e-01 -0.217 0.134 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 2.98e-01 -0.105 0.101 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0903 0.106 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -79575 sc-eQTL 6.38e-01 0.0719 0.153 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 6.99e-02 0.281 0.154 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -537688 sc-eQTL 9.92e-01 0.00144 0.142 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 8.72e-01 0.0197 0.122 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 3.35e-01 0.0949 0.0982 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 9.77e-01 0.00361 0.127 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 6.86e-01 0.0606 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 6.84e-01 0.0522 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.28e-01 0.0704 0.111 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 6.33e-01 0.0437 0.0914 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 2.03e-01 0.181 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 9.17e-01 -0.013 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 7.57e-01 0.0465 0.15 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 2.93e-02 0.313 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 6.47e-01 0.0657 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 1.81e-01 0.143 0.107 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -460223 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -37050 sc-eQTL 7.80e-02 -0.232 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -171062 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0902 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 379792 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0455 0.139 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 252125 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.129 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -402252 sc-eQTL 5.99e-01 -0.055 0.104 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 sc-eQTL 1.45e-01 0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -460288 sc-eQTL 5.30e-01 -0.104 0.165 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 -217683 eQTL 0.00118 0.0786 0.0241 0.0 0.0 0.0868

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -460223 2.64e-07 1.3e-07 6.55e-08 2.05e-07 1.02e-07 9.76e-08 1.61e-07 5.37e-08 1.44e-07 5.42e-08 1.63e-07 8.36e-08 1.52e-07 7.95e-08 5.72e-08 7.3e-08 4.17e-08 1.26e-07 7.29e-08 4.45e-08 1.08e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.93e-08 1.5e-07 1.16e-07 1.12e-07 9.74e-08 1.09e-07 1.03e-07 9.92e-08 3.89e-08 3.09e-08 8.56e-08 6.67e-08 3.6e-08 3.7e-08 8.63e-08 6.62e-08 5.45e-08 4.63e-08 1.33e-07 5.2e-08 1.14e-07 4.91e-08 6.39e-09 1.21e-07 2e-09 5.02e-08