Genes within 1Mb (chr12:101656343:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000485 0.063 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 4.34e-01 0.0858 0.109 0.098 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 2.90e-01 0.0706 0.0665 0.098 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 8.67e-01 0.0161 0.0964 0.098 B L1
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 3.85e-01 0.0952 0.109 0.098 B L1
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 3.53e-03 -0.272 0.0923 0.098 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 1.03e-01 -0.123 0.075 0.098 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0423 0.0855 0.098 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0374 0.136 0.098 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 6.27e-01 0.0633 0.13 0.098 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 9.53e-01 0.00712 0.121 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.33e-01 -0.118 0.0987 0.098 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 7.84e-02 -0.235 0.133 0.098 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 7.06e-01 0.035 0.0927 0.098 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00591 0.103 0.098 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.0999 0.098 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0679 0.07 0.098 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.73e-02 0.271 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 9.59e-02 -0.222 0.133 0.098 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00601 0.0879 0.098 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 4.67e-01 -0.089 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0378 0.0869 0.098 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 8.98e-01 0.016 0.125 0.098 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.98e-01 0.116 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 1.28e-02 0.342 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 1.96e-01 0.192 0.148 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 5.98e-01 0.0809 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0703 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 3.08e-01 -0.146 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 7.33e-01 0.0398 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 3.59e-01 0.0905 0.0983 0.098 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 8.27e-01 0.0271 0.124 0.098 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 2.73e-01 0.151 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 6.82e-01 0.0521 0.127 0.098 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.87e-01 0.0607 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 2.47e-01 0.105 0.0907 0.098 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0701 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.01e-01 -0.195 0.118 0.097 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.0859 0.097 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0337 0.139 0.097 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0969 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0185 0.0963 0.097 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.136 0.097 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 2.46e-01 -0.187 0.16 0.097 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 9.17e-01 0.00491 0.0471 0.098 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.03e-01 -0.114 0.0895 0.098 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 5.32e-01 0.0821 0.131 0.098 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 5.18e-01 0.0612 0.0946 0.098 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.57e-01 0.0657 0.148 0.098 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.107 0.098 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 7.22e-01 0.0341 0.0958 0.098 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 4.01e-01 0.0966 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 9.66e-02 0.159 0.0951 0.098 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0117 0.0296 0.102 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 6.04e-01 0.0798 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.03e-02 0.289 0.111 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 4.12e-01 -0.133 0.161 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.04e-02 -0.292 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 1.24e-01 -0.248 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 3.95e-01 -0.131 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 7.10e-01 0.0472 0.127 0.102 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 5.67e-02 -0.242 0.126 0.102 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 5.91e-01 0.0645 0.12 0.102 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 3.22e-01 0.0621 0.0625 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 1.22e-01 0.241 0.155 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0834 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0405 0.124 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 9.41e-02 -0.23 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.154 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 6.29e-01 0.0618 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 3.08e-01 0.14 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 3.94e-01 -0.123 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0747 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 5.22e-01 0.0931 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0662 0.0577 0.099 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 9.97e-01 0.000565 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0666 0.0997 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0945 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 1.52e-01 0.215 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0219 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0989 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 3.89e-01 -0.124 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0927 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 7.33e-02 -0.24 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 3.75e-01 0.0699 0.0787 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.13e-01 0.117 0.0737 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0741 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 1.04e-01 0.202 0.124 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0939 0.139 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0751 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 1.00e-01 -0.187 0.113 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 7.55e-01 0.0484 0.155 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 1.51e-01 0.216 0.15 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0544 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 3.88e-01 0.0597 0.069 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 9.60e-01 0.00704 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 4.63e-01 0.0557 0.0757 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 3.36e-01 0.113 0.117 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 4.37e-01 0.106 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 8.44e-02 -0.258 0.149 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0468 0.13 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 5.98e-01 0.0681 0.129 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 9.52e-01 0.00823 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 8.37e-02 0.27 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 9.40e-01 0.0101 0.135 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.52e-01 -0.141 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 5.98e-01 -0.08 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 8.97e-04 0.434 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 5.42e-02 -0.279 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 1.15e-01 -0.242 0.153 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 4.62e-01 -0.109 0.148 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0896 0.114 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 6.81e-02 -0.24 0.131 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0454 0.102 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0563 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0621 0.12 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0198 0.084 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.56e-01 -0.196 0.138 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 8.99e-01 0.0169 0.134 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0731 0.0821 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0191 0.144 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 7.54e-03 -0.367 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 4.61e-01 0.0983 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 7.13e-02 0.26 0.143 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0722 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.98e-01 0.0644 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.91e-02 0.272 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0506 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0538 0.109 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 4.63e-01 -0.107 0.145 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0497 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 3.98e-01 -0.13 0.154 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.12e-02 0.316 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 2.15e-01 -0.17 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00136 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 5.57e-01 0.0769 0.131 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.142 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0232 0.0935 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 2.25e-01 0.175 0.144 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.33e-01 -0.18 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 9.41e-02 -0.226 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 6.12e-01 0.0709 0.14 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 4.05e-01 -0.127 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.28e-01 0.0847 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0646 0.146 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.74e-01 0.164 0.149 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.00e-01 -0.232 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 7.00e-01 0.0583 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 3.80e-01 -0.143 0.162 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 3.86e-02 -0.32 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0648 0.136 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0703 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 6.98e-01 0.02 0.0513 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 3.56e-01 0.13 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 8.24e-01 0.0277 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 4.91e-01 -0.103 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0382 0.152 0.1 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 1.99e-01 0.162 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 3.59e-01 0.132 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 5.36e-01 0.087 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 8.79e-01 0.0189 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.74e-01 0.146 0.164 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0394 0.119 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 3.91e-02 -0.282 0.136 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.16 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 7.81e-01 0.0436 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 9.46e-01 0.00956 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 7.30e-01 0.0513 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 2.22e-01 -0.192 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.85e-01 0.124 0.142 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.06e-01 -0.224 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0906 0.105 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 1.48e-01 -0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0554 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000165 0.147 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 2.51e-01 -0.189 0.165 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0616 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 4.74e-01 -0.112 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 7.40e-01 0.0417 0.126 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0233 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0248 0.168 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 6.17e-01 0.0781 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 5.02e-01 0.108 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 2.56e-01 -0.179 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 8.31e-02 -0.251 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 2.22e-01 -0.166 0.135 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0356 0.103 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0615 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 9.15e-01 0.0154 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0607 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 4.99e-02 0.29 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 6.68e-01 0.0687 0.16 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 8.96e-01 0.0166 0.127 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 1.10e-01 0.272 0.169 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.88e-01 0.175 0.132 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 2.60e-01 0.215 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.16e-01 0.11 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0441 0.135 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.33e-01 0.0971 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 2.68e-01 0.175 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 7.61e-01 0.0559 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 5.02e-01 -0.113 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 5.35e-01 0.0966 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 7.39e-01 0.0171 0.0511 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 1.92e-01 -0.134 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 6.30e-01 0.066 0.137 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 2.26e-01 0.122 0.101 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 1.53e-01 0.206 0.144 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0566 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 3.41e-01 0.097 0.102 0.1 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 8.36e-01 0.0196 0.0943 0.1 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 6.50e-01 0.0469 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 1.80e-01 -0.197 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 4.61e-01 -0.113 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 3.48e-01 -0.125 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0601 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 3.99e-01 -0.127 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0323 0.122 0.098 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00575 0.137 0.1 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 2.78e-01 -0.145 0.133 0.1 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 2.47e-02 0.385 0.17 0.1 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0299 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 9.66e-01 0.00699 0.162 0.1 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 2.16e-01 -0.188 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.1 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0717 0.135 0.1 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 6.25e-01 -0.065 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 4.90e-01 0.0692 0.1 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 7.88e-01 0.0358 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.21e-01 0.074 0.15 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.0985 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.143 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 8.14e-02 0.19 0.109 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 9.76e-01 0.00396 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 3.62e-01 0.142 0.156 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 7.55e-01 0.0458 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 1.47e-01 0.196 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00162 0.106 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0145 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0404 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 1.67e-01 0.182 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 3.79e-02 -0.36 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 1.97e-01 -0.236 0.182 0.1 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 3.45e-01 -0.161 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 9.40e-01 0.013 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 4.91e-02 0.334 0.168 0.1 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 9.88e-02 0.257 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 7.53e-01 0.0467 0.148 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0886 0.136 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0892 0.159 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 5.38e-01 0.092 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 4.98e-01 -0.101 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0351 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 1.30e-01 0.221 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0619 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 5.47e-01 0.0974 0.161 0.095 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 2.67e-02 0.311 0.139 0.095 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 8.25e-01 0.0301 0.136 0.095 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 4.71e-01 0.094 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 9.67e-02 0.201 0.121 0.095 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0701 0.184 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 3.54e-01 -0.148 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0281 0.17 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 1.20e-01 0.262 0.168 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 5.22e-01 0.114 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 1.70e-01 0.212 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0636 0.12 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 3.73e-01 -0.142 0.159 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0316 0.0725 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.11e-01 0.182 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 5.79e-01 0.0426 0.0766 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0514 0.12 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0871 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 8.04e-01 0.0312 0.125 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 1.28e-01 -0.22 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 2.68e-01 -0.168 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0854 0.15 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -825401 sc-eQTL 4.19e-01 0.0675 0.0833 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 5.18e-01 0.0884 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 1.94e-01 0.0876 0.0672 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0965 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 9.40e-02 0.197 0.117 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 1.06e-01 -0.217 0.134 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 2.98e-01 -0.105 0.101 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0903 0.106 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -83129 sc-eQTL 6.38e-01 0.0719 0.153 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 6.99e-02 0.281 0.154 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -541242 sc-eQTL 9.92e-01 0.00144 0.142 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 8.72e-01 0.0197 0.122 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 3.35e-01 0.0949 0.0982 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 9.77e-01 0.00361 0.127 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 6.86e-01 0.0606 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 6.84e-01 0.0522 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.28e-01 0.0704 0.111 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 6.33e-01 0.0437 0.0914 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 2.03e-01 0.181 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 9.17e-01 -0.013 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 7.57e-01 0.0465 0.15 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 2.93e-02 0.313 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 6.47e-01 0.0657 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 1.81e-01 0.143 0.107 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -463777 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -40604 sc-eQTL 7.80e-02 -0.232 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -174616 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0902 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 376238 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0455 0.139 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 248571 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.129 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -405806 sc-eQTL 5.99e-01 -0.055 0.104 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 sc-eQTL 1.45e-01 0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -463842 sc-eQTL 5.30e-01 -0.104 0.165 0.097 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 -221237 eQTL 0.00124 0.0781 0.0241 0.0 0.0 0.0868


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -463777 2.64e-07 1.36e-07 6.41e-08 2.22e-07 1.02e-07 9.9e-08 1.6e-07 5.4e-08 1.44e-07 4.94e-08 1.63e-07 8.55e-08 1.45e-07 8.13e-08 5.69e-08 7.3e-08 4.24e-08 1.4e-07 7.16e-08 4.78e-08 1.21e-07 1.26e-07 1.44e-07 2.87e-08 1.46e-07 1.16e-07 1.2e-07 1.04e-07 1.09e-07 9.49e-08 1.02e-07 4.03e-08 3.3e-08 8.56e-08 3.46e-08 3.14e-08 5.02e-08 8.89e-08 6.76e-08 3.99e-08 4.27e-08 1.33e-07 3.35e-08 5.71e-08 9.64e-08 1.01e-08 1.22e-07 1.9e-09 4.81e-08