logo

Genes within 1Mb (chr12:101653694:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000485 0.063 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 4.34e-01 0.0858 0.109 0.098 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 2.90e-01 0.0706 0.0665 0.098 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 8.67e-01 0.0161 0.0964 0.098 B L1
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 3.85e-01 0.0952 0.109 0.098 B L1
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 3.53e-03 -0.272 0.0923 0.098 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 1.03e-01 -0.123 0.075 0.098 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0423 0.0855 0.098 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0374 0.136 0.098 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 6.27e-01 0.0633 0.13 0.098 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 9.53e-01 0.00712 0.121 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.33e-01 -0.118 0.0987 0.098 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 7.84e-02 -0.235 0.133 0.098 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 7.06e-01 0.035 0.0927 0.098 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00591 0.103 0.098 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.0999 0.098 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0679 0.07 0.098 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.73e-02 0.271 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 9.59e-02 -0.222 0.133 0.098 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00601 0.0879 0.098 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 4.67e-01 -0.089 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0378 0.0869 0.098 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 8.98e-01 0.016 0.125 0.098 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.98e-01 0.116 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 1.28e-02 0.342 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 1.96e-01 0.192 0.148 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 5.98e-01 0.0809 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0703 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 3.08e-01 -0.146 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 7.33e-01 0.0398 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 3.59e-01 0.0905 0.0983 0.098 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 8.27e-01 0.0271 0.124 0.098 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 2.73e-01 0.151 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 6.82e-01 0.0521 0.127 0.098 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.87e-01 0.0607 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 2.47e-01 0.105 0.0907 0.098 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0701 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.01e-01 -0.195 0.118 0.097 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.0859 0.097 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0337 0.139 0.097 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0969 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0185 0.0963 0.097 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.136 0.097 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 2.46e-01 -0.187 0.16 0.097 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 9.17e-01 0.00491 0.0471 0.098 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.03e-01 -0.114 0.0895 0.098 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 5.32e-01 0.0821 0.131 0.098 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 5.18e-01 0.0612 0.0946 0.098 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.57e-01 0.0657 0.148 0.098 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.107 0.098 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 7.22e-01 0.0341 0.0958 0.098 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 4.01e-01 0.0966 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 9.66e-02 0.159 0.0951 0.098 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0117 0.0296 0.102 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 6.04e-01 0.0798 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.03e-02 0.289 0.111 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 4.12e-01 -0.133 0.161 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.04e-02 -0.292 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 1.24e-01 -0.248 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 3.95e-01 -0.131 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 7.10e-01 0.0472 0.127 0.102 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 5.67e-02 -0.242 0.126 0.102 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 5.91e-01 0.0645 0.12 0.102 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 3.22e-01 0.0621 0.0625 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 1.22e-01 0.241 0.155 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0834 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0405 0.124 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 9.41e-02 -0.23 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.154 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 6.29e-01 0.0618 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 3.08e-01 0.14 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 3.94e-01 -0.123 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0747 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 5.22e-01 0.0931 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0662 0.0577 0.099 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 9.97e-01 0.000565 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0666 0.0997 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0945 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 1.52e-01 0.215 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0219 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0989 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 3.89e-01 -0.124 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0927 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 7.33e-02 -0.24 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 3.75e-01 0.0699 0.0787 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.13e-01 0.117 0.0737 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0741 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 1.04e-01 0.202 0.124 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0939 0.139 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0751 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 1.00e-01 -0.187 0.113 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 7.55e-01 0.0484 0.155 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 1.51e-01 0.216 0.15 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0544 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 3.88e-01 0.0597 0.069 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 9.60e-01 0.00704 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 4.63e-01 0.0557 0.0757 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 3.36e-01 0.113 0.117 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 4.37e-01 0.106 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 8.44e-02 -0.258 0.149 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0468 0.13 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 5.98e-01 0.0681 0.129 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 9.52e-01 0.00823 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 8.37e-02 0.27 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 9.40e-01 0.0101 0.135 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.52e-01 -0.141 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 5.98e-01 -0.08 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 8.97e-04 0.434 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 5.42e-02 -0.279 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 1.15e-01 -0.242 0.153 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 4.62e-01 -0.109 0.148 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0896 0.114 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 6.81e-02 -0.24 0.131 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0454 0.102 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0563 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0621 0.12 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0198 0.084 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.56e-01 -0.196 0.138 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 8.99e-01 0.0169 0.134 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0731 0.0821 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0191 0.144 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 7.54e-03 -0.367 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 4.61e-01 0.0983 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 7.13e-02 0.26 0.143 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0722 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.98e-01 0.0644 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.91e-02 0.272 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0506 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0538 0.109 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 4.63e-01 -0.107 0.145 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0497 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 3.98e-01 -0.13 0.154 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.12e-02 0.316 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 2.15e-01 -0.17 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00136 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 5.57e-01 0.0769 0.131 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.142 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0232 0.0935 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 2.25e-01 0.175 0.144 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.33e-01 -0.18 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 9.41e-02 -0.226 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 6.12e-01 0.0709 0.14 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 4.05e-01 -0.127 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.28e-01 0.0847 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0646 0.146 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.74e-01 0.164 0.149 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.00e-01 -0.232 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 7.00e-01 0.0583 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 3.80e-01 -0.143 0.162 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 3.86e-02 -0.32 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0648 0.136 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0703 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 6.98e-01 0.02 0.0513 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 3.56e-01 0.13 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 8.24e-01 0.0277 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 4.91e-01 -0.103 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0382 0.152 0.1 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 1.99e-01 0.162 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 3.59e-01 0.132 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 5.36e-01 0.087 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 8.79e-01 0.0189 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.74e-01 0.146 0.164 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0394 0.119 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 3.91e-02 -0.282 0.136 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.16 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 7.81e-01 0.0436 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 9.46e-01 0.00956 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 7.30e-01 0.0513 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 2.22e-01 -0.192 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.85e-01 0.124 0.142 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.06e-01 -0.224 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0906 0.105 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 1.48e-01 -0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0554 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000165 0.147 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 2.51e-01 -0.189 0.165 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0616 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 4.74e-01 -0.112 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 7.40e-01 0.0417 0.126 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0233 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0248 0.168 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 6.17e-01 0.0781 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 5.02e-01 0.108 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 2.56e-01 -0.179 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 8.31e-02 -0.251 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 2.22e-01 -0.166 0.135 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0356 0.103 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0615 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 9.15e-01 0.0154 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0607 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 4.99e-02 0.29 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 6.68e-01 0.0687 0.16 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 8.96e-01 0.0166 0.127 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 1.10e-01 0.272 0.169 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.88e-01 0.175 0.132 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 2.60e-01 0.215 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.16e-01 0.11 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0441 0.135 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.33e-01 0.0971 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 2.68e-01 0.175 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 7.61e-01 0.0559 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 5.02e-01 -0.113 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 5.35e-01 0.0966 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 7.39e-01 0.0171 0.0511 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 1.92e-01 -0.134 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 6.30e-01 0.066 0.137 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 2.26e-01 0.122 0.101 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 1.53e-01 0.206 0.144 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0566 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 3.41e-01 0.097 0.102 0.1 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 8.36e-01 0.0196 0.0943 0.1 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 6.50e-01 0.0469 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 1.80e-01 -0.197 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 4.61e-01 -0.113 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 3.48e-01 -0.125 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0601 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 3.99e-01 -0.127 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0323 0.122 0.098 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00575 0.137 0.1 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 2.78e-01 -0.145 0.133 0.1 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 2.47e-02 0.385 0.17 0.1 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0299 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 9.66e-01 0.00699 0.162 0.1 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 2.16e-01 -0.188 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.1 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0717 0.135 0.1 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 6.25e-01 -0.065 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 4.90e-01 0.0692 0.1 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 7.88e-01 0.0358 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.21e-01 0.074 0.15 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.0985 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.143 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 8.14e-02 0.19 0.109 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 9.76e-01 0.00396 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 3.62e-01 0.142 0.156 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 7.55e-01 0.0458 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 1.47e-01 0.196 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00162 0.106 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0145 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0404 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 1.67e-01 0.182 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 3.79e-02 -0.36 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 1.97e-01 -0.236 0.182 0.1 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 3.45e-01 -0.161 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 9.40e-01 0.013 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 4.91e-02 0.334 0.168 0.1 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 9.88e-02 0.257 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 7.53e-01 0.0467 0.148 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0886 0.136 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0892 0.159 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 5.38e-01 0.092 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 4.98e-01 -0.101 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0351 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 1.30e-01 0.221 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0619 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 5.47e-01 0.0974 0.161 0.095 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 2.67e-02 0.311 0.139 0.095 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 8.25e-01 0.0301 0.136 0.095 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 4.71e-01 0.094 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 9.67e-02 0.201 0.121 0.095 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0701 0.184 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 3.54e-01 -0.148 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0281 0.17 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 1.20e-01 0.262 0.168 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 5.22e-01 0.114 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 1.70e-01 0.212 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0636 0.12 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 3.73e-01 -0.142 0.159 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0316 0.0725 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.11e-01 0.182 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 5.79e-01 0.0426 0.0766 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0514 0.12 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0871 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 8.04e-01 0.0312 0.125 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 1.28e-01 -0.22 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 2.68e-01 -0.168 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0854 0.15 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -828050 sc-eQTL 4.19e-01 0.0675 0.0833 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 5.18e-01 0.0884 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 1.94e-01 0.0876 0.0672 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0965 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 9.40e-02 0.197 0.117 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 1.06e-01 -0.217 0.134 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 2.98e-01 -0.105 0.101 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0903 0.106 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -85778 sc-eQTL 6.38e-01 0.0719 0.153 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 6.99e-02 0.281 0.154 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -543891 sc-eQTL 9.92e-01 0.00144 0.142 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 8.72e-01 0.0197 0.122 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 3.35e-01 0.0949 0.0982 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 9.77e-01 0.00361 0.127 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 6.86e-01 0.0606 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 6.84e-01 0.0522 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.28e-01 0.0704 0.111 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 6.33e-01 0.0437 0.0914 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 2.03e-01 0.181 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 9.17e-01 -0.013 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 7.57e-01 0.0465 0.15 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 2.93e-02 0.313 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 6.47e-01 0.0657 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 1.81e-01 0.143 0.107 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -466426 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -43253 sc-eQTL 7.80e-02 -0.232 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -177265 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0902 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 373589 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0455 0.139 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 245922 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.129 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -408455 sc-eQTL 5.99e-01 -0.055 0.104 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 sc-eQTL 1.45e-01 0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -466491 sc-eQTL 5.30e-01 -0.104 0.165 0.097 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 -223886 eQTL 0.00126 0.0779 0.0241 0.0 0.0 0.0864

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -466426 3.02e-07 1.51e-07 7.16e-08 2.24e-07 1.01e-07 8.37e-08 3.57e-07 5.49e-08 1.5e-07 8.53e-08 1.67e-07 9e-08 2.38e-07 8.54e-08 5.72e-08 1.06e-07 4.09e-08 1.51e-07 7.36e-08 4.2e-08 1.22e-07 1.76e-07 2e-07 2.87e-08 2.02e-07 1.21e-07 1.31e-07 1.01e-07 1.31e-07 1.69e-07 1.08e-07 3.95e-08 3.16e-08 9.76e-08 7.36e-08 3.95e-08 5.08e-08 8.93e-08 6.28e-08 4.19e-08 4.83e-08 1.5e-07 5.24e-08 6.55e-08 4.25e-08 9.31e-09 1.19e-07 3.81e-09 5.04e-08