Genes within 1Mb (chr12:101651966:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000485 0.063 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 4.34e-01 0.0858 0.109 0.098 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 2.90e-01 0.0706 0.0665 0.098 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 8.67e-01 0.0161 0.0964 0.098 B L1
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 3.85e-01 0.0952 0.109 0.098 B L1
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 3.53e-03 -0.272 0.0923 0.098 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 1.03e-01 -0.123 0.075 0.098 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0423 0.0855 0.098 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0374 0.136 0.098 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 6.27e-01 0.0633 0.13 0.098 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 9.53e-01 0.00712 0.121 0.098 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.33e-01 -0.118 0.0987 0.098 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 7.84e-02 -0.235 0.133 0.098 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 7.06e-01 0.035 0.0927 0.098 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00591 0.103 0.098 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 2.81e-01 -0.108 0.0999 0.098 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0679 0.07 0.098 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.73e-02 0.271 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 9.59e-02 -0.222 0.133 0.098 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00601 0.0879 0.098 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 9.14e-01 -0.012 0.111 0.098 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 4.67e-01 -0.089 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0378 0.0869 0.098 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 8.98e-01 0.016 0.125 0.098 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.98e-01 0.116 0.137 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 3.40e-01 -0.12 0.125 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 1.28e-02 0.342 0.136 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 1.96e-01 0.192 0.148 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 5.98e-01 0.0809 0.153 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0703 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0653 0.109 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 3.08e-01 -0.146 0.143 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 7.33e-01 0.0398 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 3.59e-01 0.0905 0.0983 0.098 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 8.27e-01 0.0271 0.124 0.098 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 2.73e-01 0.151 0.137 0.098 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 6.82e-01 0.0521 0.127 0.098 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.87e-01 0.0607 0.111 0.098 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 2.47e-01 0.105 0.0907 0.098 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0701 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.01e-01 -0.195 0.118 0.097 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.0859 0.097 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0337 0.139 0.097 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0969 0.128 0.097 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0185 0.0963 0.097 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 1.76e-01 0.185 0.136 0.097 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 2.46e-01 -0.187 0.16 0.097 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 9.17e-01 0.00491 0.0471 0.098 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.03e-01 -0.114 0.0895 0.098 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 5.32e-01 0.0821 0.131 0.098 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 5.18e-01 0.0612 0.0946 0.098 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.57e-01 0.0657 0.148 0.098 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 1.94e-01 -0.14 0.107 0.098 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 7.22e-01 0.0341 0.0958 0.098 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 4.01e-01 0.0966 0.115 0.098 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 9.66e-02 0.159 0.0951 0.098 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 1.74e-01 0.151 0.111 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0117 0.0296 0.102 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 6.04e-01 0.0798 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.03e-02 0.289 0.111 0.102 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 4.12e-01 -0.133 0.161 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.04e-02 -0.292 0.155 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 1.24e-01 -0.248 0.16 0.102 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 3.50e-01 -0.144 0.153 0.102 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 3.95e-01 -0.131 0.154 0.102 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 7.10e-01 0.0472 0.127 0.102 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 5.67e-02 -0.242 0.126 0.102 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 5.91e-01 0.0645 0.12 0.102 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 3.22e-01 0.0621 0.0625 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 1.22e-01 0.241 0.155 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 2.12e-01 0.104 0.0834 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0405 0.124 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 9.41e-02 -0.23 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 2.59e-01 -0.175 0.154 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 6.29e-01 0.0618 0.128 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 3.08e-01 0.14 0.137 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 3.94e-01 -0.123 0.144 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0747 0.151 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 5.22e-01 0.0931 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0662 0.0577 0.099 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 9.97e-01 0.000565 0.153 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0666 0.0997 0.099 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0945 0.136 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 1.52e-01 0.215 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0219 0.149 0.099 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 1.61e-01 -0.187 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0989 0.14 0.099 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 3.89e-01 -0.124 0.144 0.099 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0927 0.147 0.099 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 7.33e-02 -0.24 0.133 0.099 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 3.75e-01 0.0699 0.0787 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.142 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.13e-01 0.117 0.0737 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0741 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 1.04e-01 0.202 0.124 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0939 0.139 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0751 0.105 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 1.00e-01 -0.187 0.113 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 7.55e-01 0.0484 0.155 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 1.51e-01 0.216 0.15 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0544 0.141 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 3.88e-01 0.0597 0.069 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 9.60e-01 0.00704 0.142 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 4.63e-01 0.0557 0.0757 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 3.36e-01 0.113 0.117 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 4.37e-01 0.106 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 8.44e-02 -0.258 0.149 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0468 0.13 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 5.98e-01 0.0681 0.129 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 9.52e-01 0.00823 0.136 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 8.37e-02 0.27 0.156 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 9.40e-01 0.0101 0.135 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.52e-01 -0.141 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 5.98e-01 -0.08 0.151 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 8.97e-04 0.434 0.129 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 5.42e-02 -0.279 0.144 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 1.15e-01 -0.242 0.153 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 4.62e-01 -0.109 0.148 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0896 0.114 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 6.81e-02 -0.24 0.131 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0454 0.102 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0563 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0621 0.12 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0198 0.084 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 9.51e-01 0.00733 0.12 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.56e-01 -0.196 0.138 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.106 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 8.99e-01 0.0169 0.134 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 2.57e-01 -0.142 0.125 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0731 0.0821 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0191 0.144 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 7.54e-03 -0.367 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 4.61e-01 0.0983 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 7.13e-02 0.26 0.143 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0722 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.98e-01 0.0644 0.122 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.91e-02 0.272 0.131 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0506 0.136 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0538 0.109 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 4.12e-01 -0.121 0.147 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 4.63e-01 -0.107 0.145 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0497 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 3.98e-01 -0.13 0.154 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.12e-02 0.316 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 2.15e-01 -0.17 0.136 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00136 0.123 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 5.57e-01 0.0769 0.131 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.142 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0232 0.0935 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 2.25e-01 0.175 0.144 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.33e-01 -0.18 0.15 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 9.41e-02 -0.226 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 6.12e-01 0.0709 0.14 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 4.05e-01 -0.127 0.152 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 2.09e-01 0.188 0.149 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.28e-01 0.0847 0.134 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0646 0.146 0.104 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.74e-01 0.164 0.149 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.00e-01 -0.232 0.14 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 7.00e-01 0.0583 0.151 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 3.80e-01 -0.143 0.162 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 3.86e-02 -0.32 0.154 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0648 0.136 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0703 0.15 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 6.98e-01 0.02 0.0513 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 4.07e-01 -0.119 0.144 0.1 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 3.56e-01 0.13 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 8.24e-01 0.0277 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 4.91e-01 -0.103 0.149 0.1 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0382 0.152 0.1 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 1.99e-01 0.162 0.126 0.1 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 3.59e-01 0.132 0.143 0.1 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 5.36e-01 0.087 0.14 0.1 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 8.79e-01 0.0189 0.124 0.1 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.74e-01 0.146 0.164 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0394 0.119 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 3.91e-02 -0.282 0.136 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.16 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 7.81e-01 0.0436 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 9.46e-01 0.00956 0.141 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 7.30e-01 0.0513 0.149 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 2.22e-01 -0.192 0.156 0.096 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.85e-01 0.124 0.142 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.06e-01 -0.224 0.138 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0906 0.105 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 3.49e-01 -0.137 0.146 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 1.48e-01 -0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0554 0.121 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000165 0.147 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 2.51e-01 -0.189 0.165 0.097 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0616 0.152 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 4.74e-01 -0.112 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 7.40e-01 0.0417 0.126 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0233 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0248 0.168 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 6.17e-01 0.0781 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 5.02e-01 0.108 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 2.56e-01 -0.179 0.157 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 8.31e-02 -0.251 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 2.22e-01 -0.166 0.135 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0356 0.103 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0615 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 9.15e-01 0.0154 0.144 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0607 0.114 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 4.99e-02 0.29 0.147 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 6.68e-01 0.0687 0.16 0.097 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 8.96e-01 0.0166 0.127 0.081 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 1.10e-01 0.272 0.169 0.081 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.88e-01 0.175 0.132 0.081 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 2.60e-01 0.215 0.19 0.081 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.16e-01 0.11 0.219 0.081 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0441 0.135 0.081 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.33e-01 0.0971 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 2.68e-01 0.175 0.157 0.081 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 7.61e-01 0.0559 0.183 0.081 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 5.02e-01 -0.113 0.168 0.081 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 5.35e-01 0.0966 0.155 0.081 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 7.39e-01 0.0171 0.0511 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 1.92e-01 -0.134 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 6.30e-01 0.066 0.137 0.1 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 2.26e-01 0.122 0.101 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 1.53e-01 0.206 0.144 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0293 0.109 0.1 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0566 0.119 0.1 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 3.41e-01 0.097 0.102 0.1 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 8.36e-01 0.0196 0.0943 0.1 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 6.50e-01 0.0469 0.103 0.1 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 1.80e-01 -0.197 0.146 0.098 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 4.61e-01 -0.113 0.153 0.098 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 3.48e-01 -0.125 0.133 0.098 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0601 0.145 0.098 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 3.99e-01 -0.127 0.15 0.098 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0323 0.122 0.098 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00575 0.137 0.1 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 2.78e-01 -0.145 0.133 0.1 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 2.47e-02 0.385 0.17 0.1 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0299 0.156 0.1 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 9.66e-01 0.00699 0.162 0.1 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 2.16e-01 -0.188 0.151 0.1 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 8.34e-01 0.0249 0.119 0.1 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0717 0.135 0.1 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 6.25e-01 -0.065 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 4.90e-01 0.0692 0.1 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 7.88e-01 0.0358 0.133 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.21e-01 0.074 0.15 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 8.50e-01 0.0254 0.134 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0403 0.116 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00102 0.0985 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.55e-01 0.132 0.143 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 8.14e-02 0.19 0.109 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 9.76e-01 0.00396 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 3.62e-01 0.142 0.156 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 7.55e-01 0.0458 0.147 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 1.47e-01 0.196 0.135 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00162 0.106 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0145 0.187 0.1 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0404 0.175 0.1 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 1.67e-01 0.182 0.131 0.1 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 3.79e-02 -0.36 0.172 0.1 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 1.97e-01 -0.236 0.182 0.1 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 3.45e-01 -0.161 0.17 0.1 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 9.40e-01 0.013 0.174 0.1 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 4.91e-02 0.334 0.168 0.1 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 9.88e-02 0.257 0.155 0.1 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 7.53e-01 0.0467 0.148 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0886 0.136 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0892 0.159 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 5.38e-01 0.092 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 4.24e-01 0.124 0.154 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 4.98e-01 -0.101 0.149 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0351 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 1.30e-01 0.221 0.145 0.095 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0619 0.135 0.095 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 5.47e-01 0.0974 0.161 0.095 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 2.67e-02 0.311 0.139 0.095 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 8.25e-01 0.0301 0.136 0.095 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 4.71e-01 0.094 0.13 0.095 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 9.67e-02 0.201 0.121 0.095 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0701 0.184 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 3.54e-01 -0.148 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0281 0.17 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 1.20e-01 0.262 0.168 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 5.22e-01 0.114 0.177 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 1.70e-01 0.212 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0636 0.12 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 3.73e-01 -0.142 0.159 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0316 0.0725 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.11e-01 0.182 0.145 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 5.79e-01 0.0426 0.0766 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0514 0.12 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 3.15e-01 -0.125 0.124 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0871 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 7.90e-01 -0.028 0.105 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 8.04e-01 0.0312 0.125 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 1.28e-01 -0.22 0.144 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 2.68e-01 -0.168 0.151 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0854 0.15 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -829778 sc-eQTL 4.19e-01 0.0675 0.0833 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 5.18e-01 0.0884 0.136 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 1.94e-01 0.0876 0.0672 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 8.93e-01 0.013 0.0965 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 9.40e-02 0.197 0.117 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 1.06e-01 -0.217 0.134 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 2.98e-01 -0.105 0.101 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0903 0.106 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -87506 sc-eQTL 6.38e-01 0.0719 0.153 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 6.99e-02 0.281 0.154 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -545619 sc-eQTL 9.92e-01 0.00144 0.142 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 8.72e-01 0.0197 0.122 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 3.35e-01 0.0949 0.0982 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 9.77e-01 0.00361 0.127 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 6.86e-01 0.0606 0.15 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 6.84e-01 0.0522 0.128 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.28e-01 0.0704 0.111 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 6.33e-01 0.0437 0.0914 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 2.03e-01 0.181 0.141 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 9.17e-01 -0.013 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 7.57e-01 0.0465 0.15 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 2.93e-02 0.313 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 6.47e-01 0.0657 0.143 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.124 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 1.81e-01 0.143 0.107 0.095 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -468154 sc-eQTL 3.23e-01 -0.134 0.135 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -44981 sc-eQTL 7.80e-02 -0.232 0.131 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -178993 sc-eQTL 1.74e-01 -0.123 0.0902 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 371861 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0455 0.139 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 244194 sc-eQTL 4.30e-01 -0.102 0.129 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -410183 sc-eQTL 5.99e-01 -0.055 0.104 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 sc-eQTL 1.45e-01 0.204 0.14 0.097 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -468219 sc-eQTL 5.30e-01 -0.104 0.165 0.097 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 -225614 eQTL 0.00127 0.0779 0.0241 0.0 0.0 0.0859


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -468154 9.36e-07 6.07e-07 9.89e-08 3.92e-07 1.05e-07 2.24e-07 5.76e-07 1.65e-07 5.3e-07 2.82e-07 7.67e-07 4.28e-07 8.6e-07 1.48e-07 2.35e-07 2.45e-07 3.69e-07 4.2e-07 2.12e-07 1.65e-07 2.01e-07 4.14e-07 3.84e-07 1.8e-07 8.09e-07 2.74e-07 2.71e-07 2.59e-07 4.06e-07 6.03e-07 3.49e-07 6.56e-08 4.55e-08 1.54e-07 3.34e-07 1.19e-07 8.28e-08 9.71e-08 6.01e-08 2.56e-08 8.81e-08 5.96e-07 3.55e-08 1.86e-08 1.26e-07 1.37e-08 9.95e-08 1.22e-08 6.03e-08