logo

Genes within 1Mb (chr12:101649926:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 4.93e-03 0.172 0.0606 0.09 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.12e-01 0.0882 0.107 0.09 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 4.91e-01 -0.045 0.0652 0.09 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0681 0.0944 0.09 B L1
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 3.34e-01 0.104 0.107 0.09 B L1
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0276 0.0923 0.09 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0869 0.0737 0.09 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0867 0.0836 0.09 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 5.03e-01 0.0892 0.133 0.09 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 7.71e-01 0.0372 0.128 0.09 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 8.14e-01 0.0281 0.119 0.09 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 1.86e-01 0.129 0.0974 0.09 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 5.67e-01 0.0757 0.132 0.09 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0401 0.0915 0.09 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0089 0.101 0.09 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0196 0.099 0.09 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00656 0.0693 0.09 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0687 0.121 0.09 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 5.24e-01 0.0836 0.131 0.09 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00212 0.0861 0.09 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0582 0.109 0.09 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 7.54e-01 0.0376 0.12 0.09 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0362 0.0852 0.09 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.03e-01 -0.126 0.122 0.09 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0684 0.137 0.086 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 2.25e-01 0.152 0.125 0.086 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 3.74e-01 -0.122 0.137 0.086 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 1.11e-01 -0.234 0.146 0.086 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 9.77e-01 0.00445 0.152 0.086 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0741 0.131 0.086 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0307 0.108 0.086 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 9.45e-01 0.0099 0.143 0.086 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0192 0.115 0.09 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 4.87e-01 0.0675 0.0969 0.09 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 1.96e-01 -0.157 0.121 0.09 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 4.47e-01 -0.103 0.135 0.09 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0588 0.125 0.09 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0732 0.11 0.09 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0111 0.0895 0.09 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 5.77e-01 0.0695 0.124 0.09 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 8.04e-01 0.0286 0.115 0.09 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 9.40e-01 0.00631 0.0837 0.09 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 7.53e-02 -0.239 0.134 0.09 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 6.81e-01 0.0509 0.124 0.09 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.65e-01 -0.104 0.0931 0.09 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.49e-01 -0.125 0.133 0.09 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 2.28e-01 0.188 0.155 0.09 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0186 0.0473 0.09 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 2.58e-01 0.102 0.0899 0.09 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 5.03e-01 0.0883 0.132 0.09 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0409 0.095 0.09 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 1.69e-01 0.204 0.148 0.09 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 6.48e-01 0.0494 0.108 0.09 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 6.20e-01 0.0477 0.0961 0.09 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 6.30e-01 0.0556 0.115 0.09 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 4.99e-01 0.065 0.096 0.09 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0843 0.112 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0074 0.0309 0.089 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.79e-01 0.114 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0489 0.118 0.089 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 5.60e-01 0.0982 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0336 0.163 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 1.66e-01 0.233 0.167 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 3.06e-01 -0.164 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 4.18e-01 -0.13 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00581 0.132 0.089 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 3.60e-01 0.122 0.133 0.089 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00537 0.125 0.089 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 5.92e-01 0.0329 0.0613 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 9.00e-01 0.0192 0.153 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 5.59e-02 -0.156 0.0812 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0431 0.121 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 2.02e-01 0.172 0.134 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0879 0.151 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 3.14e-01 -0.126 0.125 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 9.65e-02 -0.223 0.133 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0214 0.141 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 9.14e-01 -0.016 0.148 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 9.47e-01 0.00949 0.142 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 8.94e-01 0.0074 0.0554 0.091 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0519 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 9.01e-01 0.0119 0.0956 0.091 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 7.17e-01 0.0475 0.131 0.091 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 5.73e-02 0.272 0.142 0.091 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 8.60e-01 0.0252 0.143 0.091 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 3.25e-01 -0.126 0.128 0.091 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.87e-01 0.116 0.134 0.091 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0862 0.138 0.091 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0481 0.141 0.091 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 8.11e-01 0.0307 0.128 0.091 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 9.78e-01 0.00216 0.0786 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 6.66e-01 0.0614 0.142 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0745 0.0737 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0953 0.104 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0761 0.124 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 5.39e-01 0.0852 0.138 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0472 0.105 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 2.96e-01 -0.119 0.113 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0862 0.154 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0413 0.15 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 3.76e-01 0.125 0.14 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 2.51e-01 0.0785 0.0682 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.22e-01 0.113 0.14 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0814 0.0748 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0018 0.116 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 2.64e-01 0.151 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 4.67e-01 -0.108 0.148 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 4.23e-01 -0.103 0.129 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 7.64e-01 0.0384 0.128 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 3.41e-02 0.284 0.133 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0848 0.155 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 9.44e-01 0.00937 0.134 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.47e-01 0.12 0.157 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 2.62e-01 0.177 0.157 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 1.65e-01 -0.191 0.137 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 1.14e-01 0.24 0.151 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 7.18e-02 -0.289 0.16 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.10e-01 -0.194 0.154 0.086 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 6.19e-01 0.0562 0.113 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 7.45e-01 0.0424 0.13 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 8.96e-01 0.0132 0.1 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0717 0.109 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00918 0.118 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0108 0.0827 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 6.36e-02 0.222 0.119 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 5.70e-01 0.0788 0.138 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000203 0.107 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 4.17e-01 0.109 0.134 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 9.34e-01 0.0105 0.126 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0337 0.0824 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 3.98e-01 0.117 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 7.73e-02 0.236 0.133 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0468 0.129 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0389 0.139 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 8.01e-01 0.0331 0.132 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 1.52e-01 -0.169 0.117 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 7.33e-01 0.0444 0.13 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 1.46e-01 0.193 0.132 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 4.31e-01 0.084 0.106 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 3.43e-01 -0.137 0.144 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 5.68e-01 0.0815 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 9.72e-01 0.00423 0.121 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0422 0.151 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0603 0.136 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 4.42e-01 0.104 0.135 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 3.69e-01 -0.109 0.121 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 3.76e-01 0.114 0.129 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 4.13e-01 0.115 0.14 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 1.53e-01 -0.132 0.0918 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0739 0.142 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 1.14e-01 -0.231 0.145 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 3.89e-01 0.113 0.131 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 4.57e-01 -0.101 0.135 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0128 0.148 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 9.79e-01 0.00376 0.145 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.88e-02 0.283 0.129 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0154 0.142 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.01e-02 -0.307 0.149 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 4.19e-02 0.288 0.141 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 4.15e-01 -0.124 0.152 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0542 0.163 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 1.86e-01 -0.206 0.155 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 3.53e-01 0.127 0.136 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 7.35e-01 0.0509 0.15 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 6.71e-01 0.0224 0.0528 0.089 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 3.31e-01 0.144 0.148 0.089 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 9.52e-01 0.00869 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0241 0.128 0.089 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 1.13e-01 0.243 0.152 0.089 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 8.09e-01 0.0378 0.156 0.089 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 3.15e-01 0.131 0.13 0.089 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 2.48e-01 0.17 0.147 0.089 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 2.16e-01 0.179 0.144 0.089 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00299 0.128 0.089 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 1.16e-01 -0.245 0.155 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 7.11e-01 0.042 0.113 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0468 0.131 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 2.99e-01 -0.159 0.152 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 6.91e-01 0.0594 0.149 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.59e-01 0.152 0.134 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 1.32e-02 -0.35 0.14 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 4.84e-03 0.419 0.147 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 5.92e-01 0.0738 0.138 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 1.00e+00 -2.91e-05 0.134 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0236 0.102 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0394 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 8.84e-01 0.0199 0.137 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 1.21e-01 -0.181 0.116 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0611 0.142 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0417 0.16 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 6.40e-02 0.259 0.139 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 4.27e-01 -0.115 0.144 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 3.24e-01 -0.114 0.116 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 6.77e-02 -0.276 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 2.00e-01 0.198 0.154 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0784 0.144 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.63e-01 -0.134 0.147 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 5.72e-01 0.0822 0.145 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 6.36e-01 0.0662 0.14 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 4.48e-01 0.0992 0.131 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 8.11e-01 0.0237 0.0992 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 3.98e-01 -0.117 0.138 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0231 0.139 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0252 0.11 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 5.30e-01 0.0897 0.143 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 8.46e-01 0.03 0.154 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 2.86e-01 0.118 0.11 0.089 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.55e-01 -0.111 0.148 0.089 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00967 0.115 0.089 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 7.21e-01 0.0592 0.165 0.089 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 5.13e-01 0.124 0.189 0.089 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0073 0.117 0.089 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0729 0.134 0.089 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0661 0.136 0.089 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 6.30e-01 0.0766 0.158 0.089 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 8.58e-01 0.0261 0.145 0.089 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 9.25e-01 0.0126 0.135 0.089 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 4.76e-01 -0.037 0.0517 0.089 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 7.65e-01 0.0312 0.104 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 1.70e-01 0.19 0.138 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0885 0.102 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 6.80e-01 0.0603 0.146 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 6.69e-01 0.0474 0.111 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0575 0.12 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 1.06e-01 0.166 0.102 0.089 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0771 0.0954 0.089 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0896 0.104 0.089 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 5.48e-01 0.0878 0.146 0.09 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 7.10e-01 0.0565 0.152 0.09 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 2.89e-01 -0.141 0.132 0.09 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 6.94e-01 0.0569 0.145 0.09 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 3.31e-01 -0.145 0.149 0.09 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 5.26e-01 0.0771 0.121 0.09 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.90e-01 -0.09 0.13 0.09 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 7.86e-01 0.0345 0.127 0.09 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 5.88e-01 -0.089 0.164 0.09 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 3.82e-01 -0.13 0.148 0.09 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0158 0.154 0.09 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.29e-01 -0.174 0.144 0.09 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 5.97e-01 0.0598 0.113 0.09 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0481 0.129 0.09 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 4.31e-01 0.103 0.131 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 7.37e-01 0.0332 0.0987 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 1.11e-01 -0.208 0.13 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0474 0.147 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 1.90e-01 -0.173 0.131 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 9.70e-01 0.00424 0.114 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 1.89e-01 0.127 0.0966 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 9.21e-01 0.0141 0.142 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 8.33e-01 0.0229 0.109 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.132 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 7.31e-01 0.0533 0.155 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 7.52e-01 0.046 0.146 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 1.05e-01 -0.218 0.134 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.17e-01 -0.105 0.105 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 3.93e-01 0.158 0.185 0.085 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 2.74e-02 0.381 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 7.51e-01 0.0416 0.131 0.085 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 6.11e-01 -0.088 0.173 0.085 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0513 0.181 0.085 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 4.96e-01 -0.115 0.169 0.085 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.45e-01 -0.162 0.171 0.085 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 4.78e-01 -0.12 0.169 0.085 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 8.87e-01 0.022 0.155 0.085 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00146 0.147 0.089 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 5.26e-01 0.0852 0.134 0.089 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 1.05e-01 -0.255 0.157 0.089 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 2.67e-01 -0.164 0.147 0.089 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 3.76e-01 0.135 0.152 0.089 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 6.71e-01 0.0627 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0248 0.129 0.089 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 1.67e-01 -0.203 0.146 0.09 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 2.57e-01 0.154 0.135 0.09 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 5.72e-01 0.0918 0.162 0.09 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 7.82e-01 0.0393 0.142 0.09 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 1.89e-01 0.179 0.136 0.09 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.37e-01 -0.155 0.131 0.09 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 9.33e-02 -0.204 0.121 0.09 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 5.30e-01 0.11 0.175 0.085 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 2.71e-01 0.168 0.152 0.085 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 4.32e-01 -0.127 0.161 0.085 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 1.94e-01 -0.208 0.16 0.085 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 5.73e-01 0.0952 0.169 0.085 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 8.69e-01 0.0243 0.147 0.085 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.22e-01 -0.113 0.114 0.085 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 4.67e-01 0.11 0.151 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00665 0.0704 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 9.46e-01 0.00967 0.142 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0707 0.0743 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 9.58e-01 0.00624 0.117 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 9.77e-02 0.199 0.12 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00687 0.136 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 2.73e-01 -0.112 0.101 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 3.71e-01 -0.109 0.122 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0827 0.14 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 5.82e-01 -0.081 0.147 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0247 0.146 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -831818 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0175 0.0831 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 3.00e-01 0.141 0.136 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0781 0.067 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0697 0.0961 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 6.61e-01 0.0516 0.118 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 6.66e-01 0.0579 0.134 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 5.44e-01 -0.061 0.101 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0672 0.105 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -89546 sc-eQTL 5.09e-01 0.101 0.152 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0357 0.155 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -547659 sc-eQTL 6.91e-01 0.0561 0.141 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 9.77e-01 0.00352 0.12 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 6.21e-01 0.0481 0.0971 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 3.99e-01 -0.106 0.125 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0912 0.148 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 3.90e-01 -0.109 0.126 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0481 0.11 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 6.25e-01 0.0442 0.0902 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 1.20e-01 -0.218 0.14 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 1.45e-01 0.179 0.122 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 1.27e-01 -0.227 0.148 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0894 0.143 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 2.10e-01 0.178 0.141 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0851 0.123 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 2.30e-01 -0.128 0.106 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470194 sc-eQTL 1.82e-01 0.175 0.131 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 sc-eQTL 8.05e-01 0.0317 0.128 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181033 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00893 0.0878 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369821 sc-eQTL 1.24e-01 -0.207 0.134 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 242154 sc-eQTL 7.66e-01 0.0373 0.125 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412223 sc-eQTL 1.60e-01 -0.142 0.101 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227654 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0994 0.136 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -470259 sc-eQTL 7.06e-01 0.0603 0.16 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 eQTL 5.60e-08 0.222 0.0406 0.0 0.0 0.111
ENSG00000139351 SYCP3 -89543 eQTL 0.0321 0.125 0.0584 0.0 0.0 0.111

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 -47021 7.14e-06 1.04e-05 1.35e-06 6.07e-06 1.98e-06 3.41e-06 1.09e-05 1.76e-06 1.01e-05 5.39e-06 1.25e-05 5.74e-06 1.36e-05 4.03e-06 2.18e-06 6.63e-06 4.86e-06 7.27e-06 2.66e-06 2.53e-06 4.74e-06 8.85e-06 8.88e-06 3.15e-06 1.7e-05 2.8e-06 4.87e-06 3.91e-06 1.15e-05 7.86e-06 5.04e-06 7.85e-07 1.02e-06 2.85e-06 2.96e-06 2.14e-06 1.21e-06 1.84e-06 2.02e-06 1.03e-06 6.35e-07 1.3e-05 1.04e-06 4.09e-07 7.68e-07 1.81e-06 1.75e-06 6.88e-07 5.27e-07