Genes within 1Mb (chr12:101649607:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0342 0.043 0.254 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.15e-01 0.0611 0.0748 0.254 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0576 0.0454 0.254 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 2.16e-01 0.0815 0.0657 0.254 B L1
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.79e-01 -0.101 0.0746 0.254 B L1
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 2.07e-02 0.148 0.0636 0.254 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 1.18e-01 0.0805 0.0513 0.254 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 7.41e-01 0.0194 0.0585 0.254 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0129 0.0929 0.254 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0489 0.0889 0.254 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0727 0.0828 0.254 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0493 0.0687 0.254 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.82e-01 0.0999 0.0926 0.254 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 1.58e-01 0.0908 0.0641 0.254 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.76e-01 0.0399 0.0711 0.254 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 8.47e-02 0.12 0.0691 0.254 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00727 0.0487 0.254 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0229 0.0843 0.254 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.54e-01 0.104 0.0911 0.254 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 1.77e-01 0.0809 0.0597 0.254 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.08e-01 0.0501 0.0756 0.254 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0424 0.0834 0.254 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 4.34e-01 0.0464 0.0592 0.254 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 9.03e-02 0.144 0.0844 0.254 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0301 0.0976 0.257 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 4.28e-02 -0.18 0.0883 0.257 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 2.08e-01 0.123 0.0977 0.257 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 4.36e-01 0.082 0.105 0.257 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 1.61e-01 0.152 0.108 0.257 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0722 0.0935 0.257 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 5.60e-01 0.0451 0.0773 0.257 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 8.62e-02 0.174 0.101 0.257 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 6.44e-01 0.0369 0.0796 0.254 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0211 0.0674 0.254 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0364 0.0845 0.254 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.18e-02 0.183 0.0935 0.254 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 9.98e-01 0.000218 0.0868 0.254 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0872 0.0761 0.254 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0926 0.0619 0.254 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 6.27e-01 0.0427 0.0877 0.255 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0253 0.0814 0.255 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0318 0.059 0.255 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.29e-01 0.144 0.0945 0.255 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 1.92e-01 0.114 0.087 0.255 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 8.18e-01 0.0151 0.0658 0.255 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 1.72e-01 0.128 0.0933 0.255 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 5.99e-02 0.206 0.109 0.255 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00584 0.0328 0.254 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 2.69e-01 0.0691 0.0624 0.254 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0607 0.0912 0.254 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 4.46e-01 0.0503 0.0658 0.254 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 8.03e-01 0.0257 0.103 0.254 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 4.56e-01 -0.056 0.0749 0.254 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0725 0.0665 0.254 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0734 0.0798 0.254 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0747 0.0664 0.254 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0326 0.0775 0.254 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0228 0.021 0.26 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 3.25e-01 -0.108 0.109 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 1.74e-03 -0.25 0.0786 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 9.57e-01 0.00626 0.115 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0499 0.111 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 8.39e-01 0.0234 0.115 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 1.36e-01 0.163 0.109 0.26 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 9.81e-01 0.00268 0.11 0.26 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0709 0.09 0.26 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0208 0.0908 0.26 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0172 0.0853 0.26 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0145 0.0428 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 1.11e-01 0.17 0.106 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 5.81e-03 -0.157 0.0563 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 1.59e-01 0.119 0.0843 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0702 0.094 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 7.04e-01 0.0403 0.106 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 1.72e-01 0.119 0.0871 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 8.10e-01 0.0226 0.0939 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0752 0.0986 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 5.04e-01 0.0693 0.104 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0344 0.0993 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00308 0.0398 0.254 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0175 0.105 0.254 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 6.42e-02 -0.127 0.068 0.254 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 3.94e-01 0.08 0.0937 0.254 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 3.09e-01 -0.105 0.103 0.254 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 4.39e-01 0.0793 0.102 0.254 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 1.89e-01 0.12 0.0913 0.254 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 5.16e-01 0.0625 0.096 0.254 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0894 0.0987 0.254 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 4.62e-01 0.0746 0.101 0.254 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 6.83e-02 0.167 0.0914 0.254 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0288 0.0542 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0255 0.0982 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0322 0.051 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 5.00e-01 0.0488 0.0721 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0807 0.0856 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 3.69e-01 0.086 0.0955 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 1.39e-01 0.107 0.072 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 8.45e-01 0.0154 0.0785 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 6.39e-01 0.05 0.107 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0279 0.104 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 8.31e-01 0.0208 0.0972 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 9.99e-03 -0.121 0.0467 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 9.81e-01 0.00227 0.0972 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.18e-01 0.0641 0.0518 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 8.92e-01 0.011 0.0806 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0424 0.0934 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 3.34e-01 0.0991 0.102 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 8.99e-01 0.0114 0.0894 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 8.77e-01 0.0137 0.0885 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 2.23e-01 -0.113 0.0929 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 1.11e-01 -0.171 0.107 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0616 0.0925 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0158 0.106 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0915 0.106 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0872 0.0925 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 3.28e-01 0.0997 0.102 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 3.22e-01 -0.107 0.108 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.11e-01 0.105 0.103 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0642 0.0786 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 9.44e-02 0.152 0.0902 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 2.32e-02 0.158 0.0692 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.23e-01 0.118 0.0759 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 6.86e-01 0.0334 0.0826 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0301 0.0577 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 6.15e-01 -0.042 0.0834 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 3.81e-01 0.0844 0.0961 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 9.76e-01 0.00225 0.0745 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.72e-01 -0.127 0.0929 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 2.12e-03 0.266 0.0854 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.45e-01 0.0541 0.0572 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.61e-01 0.073 0.0988 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0142 0.0952 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 3.54e-01 -0.085 0.0915 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0594 0.0991 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 3.59e-01 0.0861 0.0936 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00602 0.084 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0661 0.0891 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 8.93e-01 0.0123 0.0915 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 7.12e-01 0.027 0.0731 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0363 0.0989 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0736 0.0977 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0316 0.0834 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.55e-01 0.118 0.103 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0275 0.0957 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0947 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 9.72e-02 0.141 0.0849 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 4.18e-01 0.0737 0.0907 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0579 0.0986 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 2.43e-01 0.0758 0.0648 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 9.91e-01 0.00114 0.1 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 3.12e-01 0.105 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 3.86e-01 0.0806 0.0929 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 3.55e-01 0.0892 0.0961 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.08e-01 0.0696 0.105 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0583 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 8.16e-01 0.0216 0.0924 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.91e-02 0.219 0.0995 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0674 0.0998 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 4.01e-01 0.0794 0.0944 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 6.57e-01 0.0449 0.101 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0698 0.109 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 3.12e-01 0.105 0.104 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.66e-01 0.0822 0.0906 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.86e-01 0.107 0.0998 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 3.68e-01 0.032 0.0354 0.255 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 1.11e-01 0.158 0.0989 0.255 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 8.00e-01 0.0246 0.097 0.255 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 3.16e-01 0.0863 0.0858 0.255 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 8.49e-01 0.0197 0.103 0.255 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0049 0.105 0.255 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0886 0.0872 0.255 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 9.34e-02 -0.166 0.0985 0.255 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0967 0.255 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 2.87e-01 0.0916 0.0858 0.255 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 6.01e-01 0.0578 0.11 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.77e-01 0.0869 0.0797 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 5.54e-01 0.0546 0.0923 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.10e-01 0.172 0.107 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 4.42e-01 0.0811 0.105 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0958 0.095 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 1.25e-01 0.154 0.0996 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0128 0.106 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.29e-01 0.0333 0.0961 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0316 0.0939 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0117 0.071 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 6.76e-01 0.0413 0.0985 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 1.13e-01 0.151 0.0948 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 9.61e-02 0.136 0.0812 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.36e-01 0.117 0.0988 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 1.07e-02 0.283 0.11 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0294 0.103 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 6.16e-01 0.053 0.105 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0327 0.0847 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 9.92e-01 0.0011 0.111 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0809 0.113 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0222 0.105 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.84e-01 0.116 0.108 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 6.77e-01 0.0444 0.106 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0247 0.0974 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0718 0.0911 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 9.84e-01 0.00137 0.0693 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 3.06e-01 0.0988 0.0963 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 3.65e-01 0.0881 0.097 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0291 0.0765 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 1.23e-01 -0.153 0.0991 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0183 0.108 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 9.07e-01 0.00888 0.0755 0.263 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.85e-01 0.0278 0.102 0.263 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 8.62e-01 0.0138 0.0788 0.263 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 1.64e-01 -0.157 0.112 0.263 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.94e-01 0.0694 0.13 0.263 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 9.96e-01 0.000356 0.08 0.263 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 6.48e-02 -0.17 0.0909 0.263 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 4.55e-01 0.07 0.0934 0.263 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 2.35e-01 -0.129 0.108 0.263 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 3.15e-01 0.1 0.0992 0.263 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 1.21e-01 -0.143 0.0913 0.263 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 4.74e-01 0.026 0.0363 0.252 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.55e-02 0.146 0.0726 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.77e-01 -0.106 0.0968 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0571 0.0717 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0505 0.103 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0906 0.0773 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 7.50e-01 0.0269 0.0843 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0754 0.0721 0.252 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 9.48e-02 0.112 0.0666 0.252 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 9.94e-01 0.000586 0.0733 0.252 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.75e-01 0.0288 0.101 0.254 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 7.31e-01 0.0361 0.105 0.254 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 2.09e-02 0.21 0.0903 0.254 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 8.39e-01 0.0202 0.0996 0.254 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 6.90e-01 0.0412 0.103 0.254 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 6.61e-01 0.0367 0.0837 0.254 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 8.11e-01 0.0226 0.0945 0.259 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 1.06e-01 -0.149 0.0915 0.259 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 6.08e-01 0.0611 0.119 0.259 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.03e-01 0.176 0.107 0.259 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 1.98e-01 0.144 0.111 0.259 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 6.13e-01 0.0531 0.105 0.259 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0957 0.0814 0.259 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 9.15e-02 0.157 0.0925 0.259 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.47e-01 0.0294 0.0911 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0365 0.0687 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 9.28e-01 0.00826 0.0911 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 5.25e-01 0.0653 0.102 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 8.25e-01 0.0204 0.0918 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0238 0.0792 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0985 0.0672 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 6.44e-01 0.0459 0.0991 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 1.35e-01 -0.113 0.0756 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0462 0.0924 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 8.28e-02 0.187 0.107 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0282 0.102 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 1.98e-01 -0.121 0.0937 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 7.52e-01 0.0232 0.0733 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.08e-01 0.107 0.129 0.248 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0935 0.121 0.248 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0175 0.0912 0.248 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0229 0.121 0.248 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 2.80e-02 0.276 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 6.95e-01 0.0463 0.118 0.248 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0858 0.12 0.248 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 7.87e-02 0.206 0.116 0.248 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 5.52e-02 -0.205 0.106 0.248 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 2.72e-01 -0.109 0.0993 0.26 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0332 0.0911 0.26 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0509 0.107 0.26 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 2.30e-01 0.12 0.0998 0.26 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 7.00e-01 0.0401 0.104 0.26 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 8.87e-01 0.0143 0.1 0.26 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00674 0.0876 0.26 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 2.16e-01 0.124 0.0998 0.256 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 4.56e-01 0.069 0.0924 0.256 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 1.69e-01 0.152 0.11 0.256 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 8.35e-01 0.0202 0.0969 0.256 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 1.53e-01 0.133 0.0927 0.256 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0593 0.0895 0.256 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 2.10e-02 -0.191 0.0823 0.256 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0663 0.121 0.26 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.93e-01 -0.111 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 9.05e-03 0.289 0.109 0.26 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 2.80e-01 0.12 0.111 0.26 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 6.29e-01 0.0566 0.117 0.26 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0467 0.102 0.26 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 4.35e-01 0.0616 0.0788 0.26 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 8.45e-01 0.0205 0.105 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 8.60e-01 0.00885 0.0501 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 3.77e-01 0.089 0.1 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 1.74e-03 -0.164 0.0517 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 2.46e-01 0.0966 0.0829 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.11e-01 -0.136 0.0852 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 6.85e-01 0.0394 0.0969 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 1.24e-01 0.111 0.072 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 7.41e-01 0.0286 0.0867 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0821 0.0997 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 5.03e-01 0.0701 0.104 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 3.22e-01 0.103 0.103 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -832137 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0832 0.0573 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0242 0.0942 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0165 0.0465 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 2.79e-01 0.0721 0.0665 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 1.93e-01 -0.106 0.0812 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 3.78e-01 0.0821 0.0929 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 2.88e-01 0.0741 0.0695 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0059 0.0731 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -89865 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00562 0.105 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 5.33e-01 -0.067 0.107 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -547978 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0509 0.0977 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 4.61e-01 0.0616 0.0834 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0761 0.0674 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0317 0.0869 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 4.22e-02 0.208 0.102 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 9.18e-01 0.00909 0.0879 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0745 0.0763 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0854 0.0625 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0971 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 7.25e-01 0.0299 0.0848 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 9.18e-01 0.0106 0.103 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 4.39e-01 0.0764 0.0986 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 1.32e-01 0.147 0.0975 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0751 0.085 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 4.25e-02 -0.148 0.0727 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -470513 sc-eQTL 6.74e-01 0.0389 0.0924 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0349 0.0902 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -181352 sc-eQTL 5.83e-01 -0.034 0.0617 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 369502 sc-eQTL 2.05e-01 0.12 0.0944 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 241835 sc-eQTL 1.63e-01 0.122 0.0875 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -412542 sc-eQTL 3.91e-01 0.0611 0.0711 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -227973 sc-eQTL 1.59e-01 0.135 0.0952 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -470578 sc-eQTL 4.67e-02 0.223 0.111 0.254 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -470513 eQTL 0.0261 0.0438 0.0197 0.0 0.0 0.242
ENSG00000111666 CHPT1 -47340 eQTL 7.18e-04 -0.0964 0.0284 0.0 0.0 0.242


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 -470513 4.21e-07 2.3e-07 7.16e-08 2.44e-07 1.08e-07 1.25e-07 3.25e-07 6.57e-08 1.85e-07 1.11e-07 2.07e-07 1.52e-07 3.18e-07 8.66e-08 7.79e-08 9.48e-08 6.81e-08 2.33e-07 8.68e-08 8.69e-08 1.33e-07 1.98e-07 1.89e-07 4.81e-08 3.14e-07 1.51e-07 1.33e-07 1.47e-07 1.4e-07 1.85e-07 1.35e-07 5.46e-08 4.87e-08 1.01e-07 1.33e-07 4.68e-08 5.71e-08 5.53e-08 6.08e-08 7.89e-08 4.9e-08 2.15e-07 3.02e-08 1.77e-08 5.4e-08 8.07e-09 9.1e-08 3.04e-09 4.59e-08
ENSG00000120805 \N 241835 1.27e-06 9.53e-07 3.25e-07 9.74e-07 2.46e-07 5.09e-07 1.47e-06 3.26e-07 1.14e-06 3.99e-07 1.38e-06 5.64e-07 2e-06 2.8e-07 5.08e-07 6.72e-07 8.3e-07 5.82e-07 6.4e-07 6.87e-07 4.39e-07 1.17e-06 9.29e-07 6.31e-07 2.23e-06 3.02e-07 7.33e-07 6.23e-07 1.18e-06 1.24e-06 5.62e-07 1.55e-07 2.19e-07 6.8e-07 6.02e-07 4.32e-07 4.61e-07 2.03e-07 4.94e-07 3.21e-07 2.82e-07 1.53e-06 5.53e-08 6.55e-08 1.82e-07 1.24e-07 2.41e-07 3.7e-08 1.06e-07