logo

Genes within 1Mb (chr12:101647690:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0342 0.043 0.254 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.15e-01 0.0611 0.0748 0.254 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0576 0.0454 0.254 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 2.16e-01 0.0815 0.0657 0.254 B L1
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.79e-01 -0.101 0.0746 0.254 B L1
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 2.07e-02 0.148 0.0636 0.254 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 1.18e-01 0.0805 0.0513 0.254 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 7.41e-01 0.0194 0.0585 0.254 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0129 0.0929 0.254 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0489 0.0889 0.254 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0727 0.0828 0.254 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0493 0.0687 0.254 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.82e-01 0.0999 0.0926 0.254 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 1.58e-01 0.0908 0.0641 0.254 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.76e-01 0.0399 0.0711 0.254 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 8.47e-02 0.12 0.0691 0.254 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 8.82e-01 -0.00727 0.0487 0.254 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0229 0.0843 0.254 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.54e-01 0.104 0.0911 0.254 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 1.77e-01 0.0809 0.0597 0.254 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.08e-01 0.0501 0.0756 0.254 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0424 0.0834 0.254 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 4.34e-01 0.0464 0.0592 0.254 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 9.03e-02 0.144 0.0844 0.254 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0301 0.0976 0.257 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 4.28e-02 -0.18 0.0883 0.257 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 2.08e-01 0.123 0.0977 0.257 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 4.36e-01 0.082 0.105 0.257 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 1.61e-01 0.152 0.108 0.257 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0722 0.0935 0.257 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 5.60e-01 0.0451 0.0773 0.257 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 8.62e-02 0.174 0.101 0.257 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 6.44e-01 0.0369 0.0796 0.254 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0211 0.0674 0.254 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0364 0.0845 0.254 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.18e-02 0.183 0.0935 0.254 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 9.98e-01 0.000218 0.0868 0.254 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0872 0.0761 0.254 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0926 0.0619 0.254 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 6.27e-01 0.0427 0.0877 0.255 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0253 0.0814 0.255 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0318 0.059 0.255 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.29e-01 0.144 0.0945 0.255 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 1.92e-01 0.114 0.087 0.255 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 8.18e-01 0.0151 0.0658 0.255 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 1.72e-01 0.128 0.0933 0.255 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 5.99e-02 0.206 0.109 0.255 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00584 0.0328 0.254 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 2.69e-01 0.0691 0.0624 0.254 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0607 0.0912 0.254 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 4.46e-01 0.0503 0.0658 0.254 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 8.03e-01 0.0257 0.103 0.254 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 4.56e-01 -0.056 0.0749 0.254 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0725 0.0665 0.254 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0734 0.0798 0.254 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0747 0.0664 0.254 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0326 0.0775 0.254 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0228 0.021 0.26 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 3.25e-01 -0.108 0.109 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 1.74e-03 -0.25 0.0786 0.26 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 9.57e-01 0.00626 0.115 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0499 0.111 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 8.39e-01 0.0234 0.115 0.26 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 1.36e-01 0.163 0.109 0.26 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 9.81e-01 0.00268 0.11 0.26 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0709 0.09 0.26 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0208 0.0908 0.26 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0172 0.0853 0.26 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0145 0.0428 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 1.11e-01 0.17 0.106 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 5.81e-03 -0.157 0.0563 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 1.59e-01 0.119 0.0843 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0702 0.094 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 7.04e-01 0.0403 0.106 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 1.72e-01 0.119 0.0871 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 8.10e-01 0.0226 0.0939 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0752 0.0986 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 5.04e-01 0.0693 0.104 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0344 0.0993 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00308 0.0398 0.254 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0175 0.105 0.254 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 6.42e-02 -0.127 0.068 0.254 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 3.94e-01 0.08 0.0937 0.254 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 3.09e-01 -0.105 0.103 0.254 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 4.39e-01 0.0793 0.102 0.254 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 1.89e-01 0.12 0.0913 0.254 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 5.16e-01 0.0625 0.096 0.254 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0894 0.0987 0.254 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 4.62e-01 0.0746 0.101 0.254 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 6.83e-02 0.167 0.0914 0.254 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0288 0.0542 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0255 0.0982 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0322 0.051 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 5.00e-01 0.0488 0.0721 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0807 0.0856 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 3.69e-01 0.086 0.0955 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 1.39e-01 0.107 0.072 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 8.45e-01 0.0154 0.0785 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 6.39e-01 0.05 0.107 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0279 0.104 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 8.31e-01 0.0208 0.0972 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 9.99e-03 -0.121 0.0467 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 9.81e-01 0.00227 0.0972 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.18e-01 0.0641 0.0518 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 8.92e-01 0.011 0.0806 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0424 0.0934 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 3.34e-01 0.0991 0.102 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 8.99e-01 0.0114 0.0894 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 8.77e-01 0.0137 0.0885 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 2.23e-01 -0.113 0.0929 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 1.11e-01 -0.171 0.107 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0616 0.0925 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0158 0.106 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0915 0.106 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0872 0.0925 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 3.28e-01 0.0997 0.102 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 3.22e-01 -0.107 0.108 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.11e-01 0.105 0.103 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0642 0.0786 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 9.44e-02 0.152 0.0902 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 2.32e-02 0.158 0.0692 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.23e-01 0.118 0.0759 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 6.86e-01 0.0334 0.0826 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0301 0.0577 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 6.15e-01 -0.042 0.0834 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 3.81e-01 0.0844 0.0961 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 9.76e-01 0.00225 0.0745 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.72e-01 -0.127 0.0929 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 2.12e-03 0.266 0.0854 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.45e-01 0.0541 0.0572 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.61e-01 0.073 0.0988 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0142 0.0952 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 3.54e-01 -0.085 0.0915 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0594 0.0991 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 3.59e-01 0.0861 0.0936 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00602 0.084 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0661 0.0891 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 8.93e-01 0.0123 0.0915 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 7.12e-01 0.027 0.0731 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0363 0.0989 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0736 0.0977 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0316 0.0834 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.55e-01 0.118 0.103 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0275 0.0957 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 1.70e-01 0.131 0.0947 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 9.72e-02 0.141 0.0849 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 4.18e-01 0.0737 0.0907 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0579 0.0986 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 2.43e-01 0.0758 0.0648 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 9.91e-01 0.00114 0.1 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 3.12e-01 0.105 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 3.86e-01 0.0806 0.0929 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 3.55e-01 0.0892 0.0961 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.08e-01 0.0696 0.105 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0583 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 8.16e-01 0.0216 0.0924 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.91e-02 0.219 0.0995 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0674 0.0998 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 4.01e-01 0.0794 0.0944 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 6.57e-01 0.0449 0.101 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0698 0.109 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 3.12e-01 0.105 0.104 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.66e-01 0.0822 0.0906 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.86e-01 0.107 0.0998 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 3.68e-01 0.032 0.0354 0.255 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 1.11e-01 0.158 0.0989 0.255 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 8.00e-01 0.0246 0.097 0.255 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 3.16e-01 0.0863 0.0858 0.255 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 8.49e-01 0.0197 0.103 0.255 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0049 0.105 0.255 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0886 0.0872 0.255 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 9.34e-02 -0.166 0.0985 0.255 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 1.55e-01 -0.138 0.0967 0.255 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 2.87e-01 0.0916 0.0858 0.255 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 6.01e-01 0.0578 0.11 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.77e-01 0.0869 0.0797 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 5.54e-01 0.0546 0.0923 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.10e-01 0.172 0.107 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 4.42e-01 0.0811 0.105 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0958 0.095 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 1.25e-01 0.154 0.0996 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0128 0.106 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.29e-01 0.0333 0.0961 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0316 0.0939 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0117 0.071 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 6.76e-01 0.0413 0.0985 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 1.13e-01 0.151 0.0948 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 9.61e-02 0.136 0.0812 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.36e-01 0.117 0.0988 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 1.07e-02 0.283 0.11 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0294 0.103 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 6.16e-01 0.053 0.105 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0327 0.0847 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 9.92e-01 0.0011 0.111 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0809 0.113 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0222 0.105 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.84e-01 0.116 0.108 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 6.77e-01 0.0444 0.106 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0247 0.0974 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0718 0.0911 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 9.84e-01 0.00137 0.0693 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 3.06e-01 0.0988 0.0963 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 3.65e-01 0.0881 0.097 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0291 0.0765 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 1.23e-01 -0.153 0.0991 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0183 0.108 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 9.07e-01 0.00888 0.0755 0.263 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.85e-01 0.0278 0.102 0.263 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 8.62e-01 0.0138 0.0788 0.263 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 1.64e-01 -0.157 0.112 0.263 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.94e-01 0.0694 0.13 0.263 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 9.96e-01 0.000356 0.08 0.263 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 6.48e-02 -0.17 0.0909 0.263 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 4.55e-01 0.07 0.0934 0.263 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 2.35e-01 -0.129 0.108 0.263 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 3.15e-01 0.1 0.0992 0.263 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 1.21e-01 -0.143 0.0913 0.263 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 4.74e-01 0.026 0.0363 0.252 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.55e-02 0.146 0.0726 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.77e-01 -0.106 0.0968 0.252 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0571 0.0717 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0505 0.103 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0906 0.0773 0.252 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 7.50e-01 0.0269 0.0843 0.252 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0754 0.0721 0.252 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 9.48e-02 0.112 0.0666 0.252 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 9.94e-01 0.000586 0.0733 0.252 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.75e-01 0.0288 0.101 0.254 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 7.31e-01 0.0361 0.105 0.254 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 2.09e-02 0.21 0.0903 0.254 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 8.39e-01 0.0202 0.0996 0.254 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 6.90e-01 0.0412 0.103 0.254 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 6.61e-01 0.0367 0.0837 0.254 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 8.11e-01 0.0226 0.0945 0.259 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 1.06e-01 -0.149 0.0915 0.259 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 6.08e-01 0.0611 0.119 0.259 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.03e-01 0.176 0.107 0.259 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 1.98e-01 0.144 0.111 0.259 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 6.13e-01 0.0531 0.105 0.259 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0957 0.0814 0.259 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 9.15e-02 0.157 0.0925 0.259 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.47e-01 0.0294 0.0911 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0365 0.0687 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 9.28e-01 0.00826 0.0911 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 5.25e-01 0.0653 0.102 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 8.25e-01 0.0204 0.0918 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0238 0.0792 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0985 0.0672 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 6.44e-01 0.0459 0.0991 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 1.35e-01 -0.113 0.0756 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0462 0.0924 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 8.28e-02 0.187 0.107 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0282 0.102 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 1.98e-01 -0.121 0.0937 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 7.52e-01 0.0232 0.0733 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.08e-01 0.107 0.129 0.248 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0935 0.121 0.248 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0175 0.0912 0.248 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0229 0.121 0.248 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 2.80e-02 0.276 0.124 0.248 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 6.95e-01 0.0463 0.118 0.248 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0858 0.12 0.248 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 7.87e-02 0.206 0.116 0.248 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 5.52e-02 -0.205 0.106 0.248 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 2.72e-01 -0.109 0.0993 0.26 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0332 0.0911 0.26 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0509 0.107 0.26 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 2.30e-01 0.12 0.0998 0.26 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 7.00e-01 0.0401 0.104 0.26 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 8.87e-01 0.0143 0.1 0.26 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00674 0.0876 0.26 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 2.16e-01 0.124 0.0998 0.256 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 4.56e-01 0.069 0.0924 0.256 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 1.69e-01 0.152 0.11 0.256 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 8.35e-01 0.0202 0.0969 0.256 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 1.53e-01 0.133 0.0927 0.256 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0593 0.0895 0.256 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 2.10e-02 -0.191 0.0823 0.256 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0663 0.121 0.26 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.93e-01 -0.111 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 9.05e-03 0.289 0.109 0.26 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 2.80e-01 0.12 0.111 0.26 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 6.29e-01 0.0566 0.117 0.26 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0467 0.102 0.26 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 4.35e-01 0.0616 0.0788 0.26 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 8.45e-01 0.0205 0.105 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 8.60e-01 0.00885 0.0501 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 3.77e-01 0.089 0.1 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 1.74e-03 -0.164 0.0517 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 2.46e-01 0.0966 0.0829 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.11e-01 -0.136 0.0852 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 6.85e-01 0.0394 0.0969 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 1.24e-01 0.111 0.072 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 7.41e-01 0.0286 0.0867 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0821 0.0997 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 5.03e-01 0.0701 0.104 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 3.22e-01 0.103 0.103 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -834054 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0832 0.0573 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0242 0.0942 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0165 0.0465 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 2.79e-01 0.0721 0.0665 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 1.93e-01 -0.106 0.0812 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 3.78e-01 0.0821 0.0929 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 2.88e-01 0.0741 0.0695 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0059 0.0731 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -91782 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00562 0.105 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 5.33e-01 -0.067 0.107 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -549895 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0509 0.0977 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 4.61e-01 0.0616 0.0834 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0761 0.0674 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0317 0.0869 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 4.22e-02 0.208 0.102 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 9.18e-01 0.00909 0.0879 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0745 0.0763 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0854 0.0625 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 8.46e-01 0.0188 0.0971 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 7.25e-01 0.0299 0.0848 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 9.18e-01 0.0106 0.103 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 4.39e-01 0.0764 0.0986 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 1.32e-01 0.147 0.0975 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0751 0.085 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 4.25e-02 -0.148 0.0727 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -472430 sc-eQTL 6.74e-01 0.0389 0.0924 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0349 0.0902 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -183269 sc-eQTL 5.83e-01 -0.034 0.0617 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 367585 sc-eQTL 2.05e-01 0.12 0.0944 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 239918 sc-eQTL 1.63e-01 0.122 0.0875 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -414459 sc-eQTL 3.91e-01 0.0611 0.0711 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -229890 sc-eQTL 1.59e-01 0.135 0.0952 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -472495 sc-eQTL 4.67e-02 0.223 0.111 0.254 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -472430 eQTL 0.0261 0.0438 0.0197 0.0 0.0 0.242
ENSG00000111666 CHPT1 -49257 eQTL 7.17e-04 -0.0964 0.0284 0.0 0.0 0.242

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 -472430 8.25e-07 6.65e-07 1.29e-07 4.39e-07 1.05e-07 1.26e-07 4.09e-07 5.68e-08 4.74e-07 1.5e-07 4.74e-07 2.09e-07 9.23e-07 1.59e-07 4.03e-07 1.06e-07 1.18e-07 2.56e-07 8.68e-08 8.52e-08 1.39e-07 2.3e-07 2.2e-07 3.49e-08 6.87e-07 1.39e-07 1.39e-07 1.88e-07 1.47e-07 4.61e-07 2.43e-07 3.84e-08 3.13e-08 3.55e-07 3.26e-07 3.05e-08 8.75e-08 8.63e-08 5.78e-08 6.31e-08 5.04e-08 3.73e-07 5.44e-08 2.65e-08 3.87e-08 1.78e-08 7.26e-08 1.9e-09 5.02e-08
ENSG00000120805 \N 239918 4.11e-06 4.65e-06 7.87e-07 1.99e-06 4.58e-07 7.82e-07 1.52e-06 3.65e-07 2.27e-06 7.73e-07 2.38e-06 1.45e-06 4.9e-06 1.45e-06 1.43e-06 9.77e-07 1.09e-06 1.3e-06 5.7e-07 1.43e-06 7.19e-07 2.44e-06 1.78e-06 1.02e-06 3.4e-06 8.38e-07 1e-06 1.46e-06 1.75e-06 2.22e-06 1.55e-06 3.11e-07 2.76e-07 1.75e-06 1.87e-06 6.26e-07 9.23e-07 3.21e-07 7.16e-07 2.06e-07 3.35e-07 3.38e-06 8.6e-07 1.76e-07 3.55e-07 3.48e-07 2.66e-07 1.43e-07 1.56e-07