Genes within 1Mb (chr12:101635014:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0205 0.0667 0.083 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 6.58e-01 0.0514 0.116 0.083 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 2.00e-01 0.0903 0.0703 0.083 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 6.15e-01 0.0514 0.102 0.083 B L1
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 1.11e-01 0.185 0.115 0.083 B L1
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 1.62e-02 -0.238 0.0984 0.083 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 6.02e-02 -0.15 0.0792 0.083 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00882 0.0906 0.083 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00369 0.144 0.083 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 7.83e-01 0.0381 0.138 0.083 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0551 0.128 0.083 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 2.73e-01 -0.115 0.104 0.083 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 6.36e-02 -0.261 0.14 0.083 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 4.50e-01 0.074 0.0978 0.083 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 8.70e-01 0.0178 0.108 0.083 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0803 0.106 0.083 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 1.63e-01 -0.103 0.0738 0.083 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 4.65e-02 0.26 0.13 0.083 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 7.73e-02 -0.25 0.141 0.083 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 9.31e-01 0.00814 0.0933 0.083 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 7.98e-01 0.0301 0.118 0.083 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0451 0.13 0.083 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0854 0.0921 0.083 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 5.26e-01 0.0839 0.132 0.083 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 3.95e-01 0.124 0.146 0.083 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.07e-01 -0.111 0.134 0.083 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 1.20e-02 0.367 0.145 0.083 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 2.29e-01 0.19 0.157 0.083 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 5.14e-01 0.107 0.163 0.083 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 9.73e-01 0.00469 0.141 0.083 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 2.96e-01 -0.121 0.116 0.083 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 2.91e-01 -0.161 0.152 0.083 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 8.14e-01 0.0291 0.123 0.083 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.89e-01 0.0722 0.104 0.083 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 4.08e-01 0.108 0.131 0.083 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 3.97e-01 0.124 0.146 0.083 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 8.73e-01 0.0215 0.134 0.083 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 7.27e-01 0.0413 0.118 0.083 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 2.72e-01 0.106 0.0961 0.083 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0576 0.135 0.082 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 3.58e-02 -0.262 0.124 0.082 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 2.56e-01 -0.103 0.0906 0.082 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 3.77e-01 0.129 0.146 0.082 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 3.02e-01 -0.139 0.134 0.082 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 3.19e-01 -0.101 0.101 0.082 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 1.20e-01 0.224 0.143 0.082 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 1.55e-01 -0.24 0.168 0.082 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 9.47e-01 0.00333 0.05 0.083 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 1.90e-01 -0.125 0.0948 0.083 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 7.16e-01 0.0506 0.139 0.083 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 2.85e-01 0.107 0.1 0.083 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 8.47e-01 0.0302 0.157 0.083 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 2.96e-01 -0.119 0.114 0.083 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 3.80e-01 0.0891 0.101 0.083 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 5.56e-01 0.0717 0.122 0.083 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 9.23e-02 0.17 0.101 0.083 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 1.53e-01 0.168 0.117 0.083 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0204 0.0308 0.089 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 4.82e-01 0.113 0.16 0.089 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 3.96e-02 0.242 0.117 0.089 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 4.28e-01 -0.133 0.168 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 5.88e-02 -0.306 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 4.50e-02 -0.335 0.166 0.089 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 2.38e-01 -0.189 0.159 0.089 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0943 0.161 0.089 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 6.45e-01 0.0609 0.132 0.089 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 1.12e-01 -0.211 0.132 0.089 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 6.17e-01 0.0625 0.125 0.089 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 8.67e-01 0.0111 0.0662 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 3.57e-01 0.152 0.165 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 2.27e-01 0.107 0.0882 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000344 0.131 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 2.61e-01 -0.163 0.145 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 4.00e-01 -0.138 0.163 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 5.24e-01 0.0862 0.135 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 6.76e-01 0.0606 0.145 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0446 0.153 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 3.82e-01 -0.14 0.16 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 8.94e-01 0.0205 0.154 0.084 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0552 0.061 0.084 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0588 0.161 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0479 0.105 0.084 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 6.98e-01 -0.056 0.144 0.084 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 8.43e-02 0.273 0.157 0.084 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 8.22e-01 0.0354 0.157 0.084 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 2.18e-01 -0.173 0.14 0.084 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0588 0.148 0.084 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 2.13e-01 -0.189 0.151 0.084 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0904 0.155 0.084 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 7.56e-02 -0.251 0.14 0.084 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 2.94e-01 0.0875 0.0832 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 4.54e-01 0.113 0.151 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 7.73e-02 0.138 0.0778 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0629 0.111 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 9.85e-02 0.217 0.131 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0579 0.147 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0801 0.111 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 2.77e-01 -0.131 0.12 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 3.52e-01 0.152 0.163 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 1.52e-01 0.228 0.159 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 2.81e-01 -0.161 0.149 0.083 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 6.42e-01 0.0342 0.0735 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 9.37e-01 0.0119 0.151 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 2.81e-01 0.087 0.0804 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 2.95e-01 0.131 0.125 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 2.36e-01 0.172 0.144 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 2.39e-02 -0.358 0.157 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 1.64e-01 -0.192 0.138 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 4.21e-01 0.111 0.137 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0954 0.144 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 2.00e-01 0.213 0.166 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0136 0.144 0.084 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 7.81e-01 0.045 0.162 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.52e-01 -0.122 0.162 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 3.52e-03 0.409 0.138 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 7.60e-02 -0.275 0.154 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 3.45e-02 -0.347 0.163 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0418 0.158 0.089 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0977 0.121 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 5.21e-02 -0.27 0.138 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0226 0.108 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0643 0.117 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00343 0.127 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0728 0.0886 0.083 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 6.84e-01 0.0518 0.127 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 1.20e-01 -0.227 0.146 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0917 0.113 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 8.22e-01 0.032 0.142 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 1.43e-01 -0.194 0.132 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 2.28e-01 -0.105 0.0868 0.083 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0153 0.152 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 8.75e-03 -0.381 0.144 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 4.61e-01 0.104 0.141 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 2.70e-02 0.336 0.151 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0887 0.144 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 4.12e-01 0.106 0.129 0.083 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 1.57e-02 0.338 0.139 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0845 0.144 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0456 0.116 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0922 0.156 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 3.39e-01 -0.148 0.154 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0872 0.132 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 8.26e-01 -0.036 0.164 0.083 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 6.13e-02 0.273 0.145 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 1.94e-01 -0.188 0.145 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0196 0.13 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 4.55e-01 0.104 0.138 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0626 0.15 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0662 0.0991 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 1.99e-01 0.196 0.152 0.083 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 3.73e-01 -0.142 0.159 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 1.44e-01 -0.208 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 7.51e-01 0.047 0.148 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 4.91e-01 -0.111 0.161 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 2.21e-01 0.194 0.158 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 7.20e-01 0.0509 0.142 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 5.08e-01 -0.102 0.155 0.088 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 1.38e-01 0.237 0.159 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 6.33e-02 -0.28 0.15 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 4.89e-01 0.112 0.162 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 4.41e-01 -0.134 0.174 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 2.18e-01 -0.205 0.166 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 3.09e-01 -0.148 0.145 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0515 0.16 0.08 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 5.20e-01 0.035 0.0544 0.084 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 4.46e-01 -0.116 0.153 0.084 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.51e-01 0.112 0.149 0.084 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 5.47e-01 0.0796 0.132 0.084 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 1.62e-01 -0.221 0.157 0.084 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0309 0.161 0.084 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 2.24e-01 0.163 0.134 0.084 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 1.83e-01 0.203 0.152 0.084 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 2.06e-01 0.188 0.149 0.084 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 9.43e-01 0.00938 0.132 0.084 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 5.14e-01 0.115 0.175 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0902 0.127 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 1.00e-01 -0.24 0.146 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00967 0.171 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0104 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0288 0.151 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 9.12e-01 0.0175 0.159 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 1.14e-01 -0.265 0.167 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 1.82e-01 0.199 0.149 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 7.92e-02 -0.256 0.145 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0841 0.11 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0392 0.154 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 5.62e-02 -0.283 0.147 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 2.87e-01 -0.135 0.127 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 6.03e-01 0.0803 0.154 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 2.90e-01 -0.184 0.173 0.082 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0245 0.161 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 3.93e-01 -0.141 0.165 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 6.84e-01 0.054 0.133 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0102 0.173 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 6.09e-01 0.0908 0.177 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0387 0.165 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00693 0.169 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 3.43e-01 -0.158 0.166 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 9.86e-02 -0.253 0.153 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 9.43e-02 -0.24 0.143 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 8.11e-01 -0.026 0.109 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 9.41e-01 0.0112 0.152 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 7.02e-01 0.0587 0.153 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0916 0.12 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 4.15e-02 0.319 0.155 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 7.77e-01 0.0482 0.17 0.082 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 6.68e-01 0.057 0.133 0.074 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 1.09e-01 0.286 0.177 0.074 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 2.21e-01 0.169 0.138 0.074 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 2.07e-01 0.251 0.198 0.074 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 4.82e-01 0.161 0.228 0.074 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0977 0.14 0.074 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 5.10e-01 0.107 0.162 0.074 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 2.62e-01 0.185 0.164 0.074 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 4.31e-01 0.151 0.191 0.074 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 5.63e-01 -0.101 0.175 0.074 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 4.66e-01 0.118 0.162 0.074 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 6.94e-01 0.0214 0.0542 0.085 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 1.88e-01 -0.144 0.109 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 8.63e-01 0.025 0.145 0.085 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 1.70e-01 0.147 0.107 0.085 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 6.85e-02 0.278 0.152 0.085 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0116 0.116 0.085 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 9.85e-01 0.00243 0.126 0.085 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 4.71e-01 0.078 0.108 0.085 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 5.50e-01 0.0599 0.1 0.085 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 4.53e-01 0.0822 0.109 0.085 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 8.27e-02 -0.27 0.155 0.083 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 2.81e-01 -0.175 0.162 0.083 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0642 0.141 0.083 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0665 0.154 0.083 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0484 0.159 0.083 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0306 0.129 0.083 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0337 0.143 0.088 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 2.95e-01 -0.146 0.139 0.088 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 2.30e-02 0.408 0.178 0.088 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 9.95e-01 0.00105 0.163 0.088 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0177 0.169 0.088 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 2.92e-01 -0.168 0.159 0.088 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 8.14e-01 0.0293 0.124 0.088 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0807 0.141 0.088 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 5.60e-01 -0.082 0.14 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 5.40e-01 0.065 0.106 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 6.60e-01 0.062 0.141 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 4.99e-01 0.107 0.158 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0047 0.142 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0471 0.122 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 7.01e-01 0.0401 0.104 0.083 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 2.54e-01 0.173 0.152 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 1.37e-01 0.174 0.116 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 5.52e-01 0.0844 0.142 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 8.90e-01 0.0231 0.166 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 4.11e-01 0.129 0.156 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 1.92e-01 0.188 0.144 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 9.01e-01 0.014 0.113 0.083 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0656 0.199 0.082 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 7.16e-01 -0.068 0.186 0.082 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 3.06e-01 0.144 0.14 0.082 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 4.21e-02 -0.375 0.183 0.082 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 6.63e-01 -0.085 0.194 0.082 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00169 0.182 0.082 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 3.78e-01 -0.163 0.184 0.082 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 3.35e-02 0.383 0.178 0.082 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 7.25e-02 0.297 0.164 0.082 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0234 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0668 0.143 0.08 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0389 0.168 0.08 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 9.38e-01 -0.0123 0.158 0.08 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 5.24e-01 0.104 0.163 0.08 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 4.60e-01 -0.117 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 2.76e-01 -0.15 0.137 0.08 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 2.29e-01 0.188 0.156 0.079 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0744 0.144 0.079 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 3.07e-01 0.177 0.172 0.079 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 1.95e-02 0.351 0.149 0.079 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0323 0.145 0.079 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 5.22e-01 0.0896 0.14 0.079 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 8.01e-02 0.227 0.129 0.079 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0285 0.197 0.076 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 2.65e-01 -0.191 0.171 0.076 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0295 0.182 0.076 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 2.87e-01 0.192 0.18 0.076 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 7.01e-01 0.0733 0.19 0.076 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 3.50e-01 0.155 0.166 0.076 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 2.63e-01 -0.144 0.128 0.076 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 2.52e-01 -0.195 0.17 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0762 0.0765 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 6.75e-01 0.0646 0.154 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.81e-01 0.0572 0.0809 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0219 0.127 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0544 0.131 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0284 0.148 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0107 0.111 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 8.68e-01 0.022 0.133 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 2.63e-01 -0.171 0.152 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 2.22e-01 -0.195 0.159 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 3.20e-01 -0.158 0.158 0.083 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -846730 sc-eQTL 4.56e-01 0.0661 0.0884 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 5.86e-01 0.079 0.145 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 1.18e-01 0.111 0.0711 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 5.92e-01 0.055 0.102 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 5.71e-02 0.238 0.124 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 8.51e-02 -0.246 0.142 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 1.18e-01 -0.167 0.107 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0391 0.112 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -104458 sc-eQTL 5.49e-01 0.0972 0.162 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 1.24e-01 0.253 0.164 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -562571 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0869 0.15 0.083 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 8.25e-01 0.0286 0.129 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.20e-01 0.0841 0.104 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 6.43e-01 0.0623 0.134 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 8.03e-01 0.0396 0.159 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 6.47e-01 0.0622 0.136 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 6.74e-01 0.0498 0.118 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 4.29e-01 0.0767 0.0968 0.083 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 4.31e-01 0.119 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0123 0.132 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 3.93e-01 0.137 0.16 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 4.68e-02 0.305 0.152 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 9.86e-01 -0.0027 0.153 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 8.68e-01 -0.022 0.133 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 4.77e-01 0.0815 0.114 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485106 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0714 0.143 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -61933 sc-eQTL 4.11e-02 -0.284 0.138 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -195945 sc-eQTL 2.53e-01 -0.109 0.0952 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354909 sc-eQTL 5.42e-01 0.0893 0.146 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227242 sc-eQTL 3.69e-01 -0.122 0.136 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427135 sc-eQTL 2.39e-01 -0.13 0.11 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 sc-eQTL 7.52e-02 0.262 0.147 0.082 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -485171 sc-eQTL 5.06e-01 -0.116 0.174 0.082 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000136048 DRAM1 -242566 eQTL 0.00411 0.0703 0.0244 0.0 0.0 0.0834


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina