Genes within 1Mb (chr12:101634816:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0266 0.0415 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 4.61e-01 0.0532 0.0721 0.284 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 4.14e-02 -0.0892 0.0435 0.284 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 3.09e-01 0.0646 0.0633 0.284 B L1
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.22e-01 -0.112 0.0718 0.284 B L1
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 4.60e-02 0.123 0.0615 0.284 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 1.50e-01 0.0714 0.0494 0.284 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 7.45e-01 0.0183 0.0563 0.284 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0318 0.0895 0.284 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0254 0.0857 0.284 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0712 0.0798 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0648 0.066 0.284 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 9.55e-01 0.00506 0.0893 0.284 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 2.90e-01 0.0655 0.0618 0.284 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 9.46e-01 0.00467 0.0685 0.284 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 1.65e-01 0.0929 0.0666 0.284 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 7.81e-01 -0.013 0.0469 0.284 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0247 0.081 0.284 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 8.01e-01 0.0221 0.0878 0.284 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 9.76e-02 0.0953 0.0573 0.284 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 8.82e-01 0.0108 0.0727 0.284 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0234 0.0803 0.284 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 4.43e-01 0.0438 0.0569 0.284 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 2.18e-02 0.186 0.0807 0.284 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0315 0.0933 0.288 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 2.57e-02 -0.189 0.0843 0.288 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 9.28e-02 0.157 0.0932 0.288 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 2.23e-01 0.122 0.1 0.288 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 3.11e-01 0.105 0.104 0.288 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0555 0.0895 0.288 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 5.98e-01 0.039 0.0739 0.288 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 1.00e-01 0.16 0.0969 0.288 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 7.58e-01 0.0237 0.0767 0.284 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0345 0.0649 0.284 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 8.91e-01 0.0112 0.0814 0.284 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.02e-02 0.232 0.0894 0.284 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00109 0.0836 0.284 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 4.31e-01 -0.058 0.0734 0.284 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 4.63e-01 -0.044 0.0599 0.284 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.78e-01 0.047 0.0842 0.285 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 1.68e-01 -0.108 0.0779 0.285 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 7.13e-01 0.0209 0.0567 0.285 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 6.36e-02 0.169 0.0905 0.285 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 2.53e-01 0.0958 0.0836 0.285 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0274 0.0632 0.285 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 5.75e-02 0.17 0.0892 0.285 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 1.33e-01 0.158 0.105 0.285 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 6.78e-01 -0.013 0.0313 0.284 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 2.75e-01 0.0653 0.0596 0.284 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 7.55e-02 -0.155 0.0866 0.284 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 2.57e-01 0.0713 0.0628 0.284 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0761 0.0982 0.284 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0516 0.0716 0.284 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0418 0.0637 0.284 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0166 0.0764 0.284 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0759 0.0635 0.284 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0675 0.0739 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0276 0.0201 0.291 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0837 0.105 0.291 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 6.48e-04 -0.261 0.075 0.291 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 6.99e-01 0.0427 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0626 0.107 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 9.40e-01 0.00826 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 6.69e-02 0.192 0.104 0.291 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 7.33e-01 0.036 0.105 0.291 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0768 0.0864 0.291 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0372 0.0871 0.291 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00175 0.0819 0.291 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0417 0.0409 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 1.37e-01 0.152 0.102 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 6.55e-03 -0.148 0.0538 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 1.46e-01 0.118 0.0806 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0379 0.09 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 4.28e-01 0.0803 0.101 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 2.76e-01 0.0912 0.0835 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 6.78e-01 0.0373 0.0898 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0682 0.0943 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 5.77e-01 0.0554 0.099 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0652 0.0949 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0165 0.0381 0.282 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0575 0.1 0.282 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 6.45e-03 -0.177 0.0645 0.282 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.0896 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0668 0.0986 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 3.07e-01 0.1 0.0979 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 1.25e-01 0.135 0.0873 0.282 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 6.02e-01 0.048 0.092 0.282 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0759 0.0946 0.282 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 5.19e-01 0.0625 0.0968 0.282 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 6.65e-02 0.161 0.0875 0.282 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0527 0.0521 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0945 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0547 0.049 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 6.20e-01 0.0345 0.0695 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.67e-01 -0.114 0.0822 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 6.06e-01 0.0475 0.092 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 2.63e-01 0.078 0.0695 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 6.62e-01 0.033 0.0755 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 7.83e-01 0.0283 0.103 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 9.57e-01 0.00543 0.0999 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 8.99e-01 0.0119 0.0935 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 3.56e-03 -0.131 0.0445 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.91e-01 -0.037 0.0931 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 5.61e-01 0.029 0.0498 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0304 0.0772 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0815 0.0894 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 6.32e-01 0.0472 0.0983 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 9.99e-01 0.000139 0.0857 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 7.47e-01 0.0274 0.0848 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0996 0.0891 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 3.72e-02 -0.214 0.102 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0359 0.0887 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 3.10e-01 -0.102 0.1 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0888 0.101 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0127 0.0881 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.97e-01 0.125 0.0964 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 2.99e-01 -0.107 0.102 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 1.00e-01 0.161 0.0978 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0827 0.0755 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 5.46e-01 0.0527 0.0872 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 3.05e-02 0.145 0.0666 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 2.07e-01 0.0925 0.073 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 7.27e-01 0.0277 0.0794 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0471 0.0554 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0442 0.0798 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00301 0.0921 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0419 0.0713 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 9.46e-02 -0.149 0.0886 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 1.69e-02 0.198 0.0824 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 1.95e-01 0.071 0.0546 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.72e-01 0.0405 0.0955 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0614 0.0918 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0841 0.0883 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 2.43e-01 -0.112 0.0955 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 2.68e-01 0.1 0.0902 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00494 0.081 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.20e-01 -0.055 0.0852 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0456 0.0874 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 4.45e-01 0.0535 0.0699 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 9.84e-01 0.00187 0.0946 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0604 0.0935 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0176 0.0798 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 1.97e-01 0.128 0.0989 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0172 0.0918 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 4.51e-01 0.0688 0.0911 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 1.37e-01 0.122 0.0815 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 7.15e-01 0.0319 0.0871 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00177 0.0946 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 3.50e-01 0.0583 0.0622 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 6.68e-01 0.0413 0.0962 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 9.09e-02 0.17 0.1 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 8.86e-01 0.013 0.0905 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 3.43e-01 0.0889 0.0934 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 8.80e-01 0.0154 0.102 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0747 0.1 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0447 0.0898 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 4.04e-02 0.2 0.0969 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0574 0.0974 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 4.75e-01 0.0659 0.0921 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 1.78e-01 0.133 0.0983 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0648 0.106 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 4.66e-01 0.0738 0.101 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 4.49e-01 0.0671 0.0884 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 1.37e-01 0.145 0.0971 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 4.95e-01 0.0233 0.0341 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 4.66e-01 0.0699 0.0957 0.286 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0474 0.0933 0.286 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 2.77e-01 0.09 0.0825 0.286 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 5.00e-01 -0.067 0.0991 0.286 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00412 0.101 0.286 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0781 0.084 0.286 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0704 0.0953 0.286 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 1.11e-01 -0.149 0.0929 0.286 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 5.59e-01 0.0485 0.0827 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.76e-01 0.0596 0.106 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 9.11e-01 0.00866 0.0771 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 1.74e-01 0.121 0.0887 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.92e-01 0.135 0.104 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 3.79e-01 0.0893 0.101 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 1.71e-01 -0.126 0.0914 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 1.17e-01 0.151 0.0961 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0296 0.102 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.68e-01 0.0401 0.0934 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 2.01e-01 -0.117 0.091 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 6.95e-01 0.0271 0.069 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 3.62e-01 0.0874 0.0957 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 6.94e-02 0.168 0.092 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 5.73e-01 0.0448 0.0794 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 1.01e-01 0.158 0.0959 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 3.00e-02 0.235 0.107 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 8.56e-01 0.0178 0.0981 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 7.57e-01 0.0312 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 5.99e-01 0.0425 0.0808 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 7.04e-01 0.0402 0.106 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 3.30e-01 -0.105 0.108 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 7.31e-01 0.0345 0.1 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 3.52e-01 0.0961 0.103 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 3.67e-01 0.0916 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0451 0.0936 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 8.77e-02 -0.149 0.087 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 4.22e-01 0.0534 0.0664 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 2.83e-01 0.0995 0.0925 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 3.95e-01 0.0793 0.0932 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0147 0.0735 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 2.85e-01 -0.102 0.0955 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 2.94e-01 -0.108 0.103 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 9.57e-01 0.00386 0.0721 0.293 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.59e-01 0.0429 0.0971 0.293 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0138 0.0753 0.293 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 1.84e-01 -0.144 0.107 0.293 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 6.51e-01 0.0564 0.124 0.293 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 8.24e-01 -0.017 0.0764 0.293 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 7.42e-03 -0.233 0.0854 0.293 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 6.17e-01 0.0449 0.0894 0.293 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 9.41e-02 -0.173 0.103 0.293 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0947 0.293 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0873 0.293 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 6.14e-01 0.0177 0.0351 0.278 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 3.44e-02 0.149 0.07 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 1.31e-01 -0.141 0.0933 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0584 0.0693 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0962 0.0989 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 1.67e-01 -0.103 0.0746 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 3.07e-01 0.0832 0.0813 0.278 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0785 0.0697 0.278 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 2.70e-01 0.0715 0.0646 0.278 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0188 0.0708 0.278 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.08e-01 0.0498 0.0969 0.284 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0432 0.101 0.284 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 8.56e-02 0.151 0.0875 0.284 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 5.26e-01 0.0608 0.0959 0.284 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 6.14e-01 0.0501 0.0992 0.284 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 6.83e-01 0.033 0.0806 0.284 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0188 0.0907 0.293 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 1.05e-01 -0.143 0.0879 0.293 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 7.78e-01 0.0323 0.114 0.293 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 6.62e-02 0.19 0.103 0.293 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 2.31e-01 0.128 0.107 0.293 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 4.87e-01 0.0701 0.101 0.293 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0741 0.0783 0.293 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 1.81e-01 0.12 0.0891 0.293 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00444 0.0877 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0515 0.0661 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 5.12e-01 0.0575 0.0877 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.38e-01 0.146 0.0982 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 9.16e-01 0.00937 0.0884 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0151 0.0762 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0476 0.0649 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.73e-01 0.0402 0.0953 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 1.37e-01 -0.109 0.0727 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0199 0.0889 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 4.49e-02 0.208 0.103 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0186 0.0979 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0603 0.0904 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 5.94e-01 0.0377 0.0705 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 2.93e-01 0.13 0.123 0.279 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 2.43e-01 -0.135 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 6.87e-01 0.0353 0.0873 0.279 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0399 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 1.00e-01 0.198 0.12 0.279 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 4.87e-01 0.0786 0.113 0.279 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0656 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 4.54e-02 0.224 0.111 0.279 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 2.04e-02 -0.237 0.101 0.279 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0723 0.0958 0.291 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0221 0.0877 0.291 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0202 0.103 0.291 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 3.35e-01 0.093 0.0962 0.291 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 9.88e-01 0.00151 0.0998 0.291 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 6.32e-01 0.0463 0.0964 0.291 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00336 0.0843 0.291 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 1.54e-01 0.137 0.0953 0.285 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 9.23e-01 0.00853 0.0884 0.285 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 2.88e-01 0.112 0.106 0.285 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00304 0.0926 0.285 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 1.03e-01 0.145 0.0884 0.285 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 5.14e-01 -0.056 0.0855 0.285 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 1.02e-01 -0.13 0.0792 0.285 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0672 0.115 0.294 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 9.80e-02 -0.165 0.0992 0.294 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 4.84e-04 0.363 0.102 0.294 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.71e-01 0.144 0.105 0.294 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 6.58e-01 0.0492 0.111 0.294 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0145 0.0968 0.294 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 7.93e-01 0.0197 0.0748 0.294 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 8.07e-01 0.0243 0.0993 0.294 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0303 0.048 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.92e-01 0.0519 0.0966 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 2.41e-04 -0.184 0.0492 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 1.58e-01 0.113 0.0795 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 1.31e-01 -0.124 0.0818 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 4.47e-01 0.0708 0.0929 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 1.08e-01 0.112 0.0691 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 6.62e-01 0.0365 0.0832 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0849 0.0957 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 5.82e-01 0.0553 0.1 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 4.58e-01 0.0738 0.0994 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -846928 sc-eQTL 5.27e-02 -0.107 0.0552 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0352 0.091 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0472 0.0448 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 4.45e-01 0.0492 0.0643 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 4.57e-02 -0.157 0.0781 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 8.39e-01 0.0183 0.0899 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 3.85e-01 0.0585 0.0672 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 9.33e-01 0.00596 0.0706 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -104656 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0186 0.102 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0712 0.104 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -562769 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0279 0.0944 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.68e-01 0.0346 0.0805 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0772 0.0649 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 8.68e-01 0.0139 0.0838 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 5.09e-03 0.275 0.0973 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 8.40e-01 0.0172 0.0848 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0485 0.0737 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0423 0.0604 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 6.00e-01 0.0486 0.0926 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 9.94e-01 0.000625 0.0809 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 9.17e-01 0.0103 0.0979 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 7.11e-01 0.0349 0.0942 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 1.86e-01 0.124 0.0932 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 4.98e-01 -0.055 0.0811 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0944 0.0698 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -485304 sc-eQTL 5.90e-01 0.0479 0.0889 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 sc-eQTL 1.82e-01 -0.116 0.0864 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -196143 sc-eQTL 7.66e-01 0.0177 0.0594 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 354711 sc-eQTL 9.35e-02 0.153 0.0906 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 227044 sc-eQTL 1.92e-01 0.11 0.0843 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -427333 sc-eQTL 8.28e-01 0.0149 0.0685 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -242764 sc-eQTL 5.33e-02 0.177 0.0912 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -485369 sc-eQTL 9.25e-02 0.182 0.108 0.284 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -485304 eQTL 0.00578 0.053 0.0192 0.0 0.0 0.268
ENSG00000111666 CHPT1 -62131 eQTL 1.71e-04 -0.105 0.0277 0.0 0.0 0.268


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 -485304 2.66e-07 1.11e-07 5.35e-08 1.78e-07 8.83e-08 9.3e-08 1.42e-07 5.24e-08 1.41e-07 4.23e-08 1.63e-07 7.58e-08 1.3e-07 6.21e-08 5.44e-08 7.89e-08 5.1e-08 1.1e-07 5.36e-08 3.29e-08 1.05e-07 1.26e-07 1.32e-07 4.98e-08 1.29e-07 1.09e-07 1.08e-07 8.71e-08 9.88e-08 1.12e-07 9.58e-08 3.41e-08 2.74e-08 8.25e-08 9.41e-08 4.02e-08 5.54e-08 9.2e-08 8.55e-08 3.07e-08 3.46e-08 1.36e-07 3.82e-08 1.25e-08 9.88e-08 1.83e-08 1.34e-07 4.7e-09 4.61e-08
ENSG00000120805 \N 227044 6.97e-07 8.69e-07 2.13e-07 3.96e-07 2.1e-07 2.16e-07 7.54e-07 7.12e-08 5.74e-07 1.78e-07 9.39e-07 3.08e-07 9.97e-07 2.14e-07 3.16e-07 2.83e-07 2.25e-07 3.73e-07 3.3e-07 1.08e-07 1.89e-07 5.76e-07 6.26e-07 5.01e-08 7.42e-07 2.2e-07 5.04e-07 3.78e-07 4.9e-07 8.59e-07 2.73e-07 3.26e-08 4.16e-08 1.21e-07 2.35e-07 1.46e-07 9.77e-08 6.31e-08 4.04e-08 2.59e-08 5.48e-08 7.45e-07 2.99e-08 1.55e-07 9.95e-08 7.16e-08 1.04e-07 2.85e-09 4.61e-08