Genes within 1Mb (chr12:101629106:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0266 0.0415 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 4.61e-01 0.0532 0.0721 0.284 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 4.14e-02 -0.0892 0.0435 0.284 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 3.09e-01 0.0646 0.0633 0.284 B L1
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.22e-01 -0.112 0.0718 0.284 B L1
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 4.60e-02 0.123 0.0615 0.284 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 1.50e-01 0.0714 0.0494 0.284 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 7.45e-01 0.0183 0.0563 0.284 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0318 0.0895 0.284 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0254 0.0857 0.284 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0712 0.0798 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0648 0.066 0.284 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 9.55e-01 0.00506 0.0893 0.284 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 2.90e-01 0.0655 0.0618 0.284 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 9.46e-01 0.00467 0.0685 0.284 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 1.65e-01 0.0929 0.0666 0.284 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 7.81e-01 -0.013 0.0469 0.284 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0247 0.081 0.284 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 8.01e-01 0.0221 0.0878 0.284 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 9.76e-02 0.0953 0.0573 0.284 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 8.82e-01 0.0108 0.0727 0.284 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0234 0.0803 0.284 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 4.43e-01 0.0438 0.0569 0.284 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 2.18e-02 0.186 0.0807 0.284 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0315 0.0933 0.288 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 2.57e-02 -0.189 0.0843 0.288 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 9.28e-02 0.157 0.0932 0.288 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 2.23e-01 0.122 0.1 0.288 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 3.11e-01 0.105 0.104 0.288 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0555 0.0895 0.288 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 5.98e-01 0.039 0.0739 0.288 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 1.00e-01 0.16 0.0969 0.288 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 7.58e-01 0.0237 0.0767 0.284 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0345 0.0649 0.284 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 8.91e-01 0.0112 0.0814 0.284 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.02e-02 0.232 0.0894 0.284 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00109 0.0836 0.284 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 4.31e-01 -0.058 0.0734 0.284 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 4.63e-01 -0.044 0.0599 0.284 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.78e-01 0.047 0.0842 0.285 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 1.68e-01 -0.108 0.0779 0.285 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 7.13e-01 0.0209 0.0567 0.285 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 6.36e-02 0.169 0.0905 0.285 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 2.53e-01 0.0958 0.0836 0.285 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0274 0.0632 0.285 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 5.75e-02 0.17 0.0892 0.285 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 1.33e-01 0.158 0.105 0.285 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 6.78e-01 -0.013 0.0313 0.284 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 2.75e-01 0.0653 0.0596 0.284 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 7.55e-02 -0.155 0.0866 0.284 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 2.57e-01 0.0713 0.0628 0.284 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0761 0.0982 0.284 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0516 0.0716 0.284 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0418 0.0637 0.284 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0166 0.0764 0.284 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0759 0.0635 0.284 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0675 0.0739 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0276 0.0201 0.291 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0837 0.105 0.291 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 6.48e-04 -0.261 0.075 0.291 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 6.99e-01 0.0427 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0626 0.107 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 9.40e-01 0.00826 0.11 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 6.69e-02 0.192 0.104 0.291 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 7.33e-01 0.036 0.105 0.291 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0768 0.0864 0.291 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0372 0.0871 0.291 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00175 0.0819 0.291 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0417 0.0409 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 1.37e-01 0.152 0.102 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 6.55e-03 -0.148 0.0538 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 1.46e-01 0.118 0.0806 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0379 0.09 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 4.28e-01 0.0803 0.101 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 2.76e-01 0.0912 0.0835 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 6.78e-01 0.0373 0.0898 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0682 0.0943 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 5.77e-01 0.0554 0.099 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0652 0.0949 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0165 0.0381 0.282 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0575 0.1 0.282 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 6.45e-03 -0.177 0.0645 0.282 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 2.15e-01 0.111 0.0896 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0668 0.0986 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 3.07e-01 0.1 0.0979 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 1.25e-01 0.135 0.0873 0.282 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 6.02e-01 0.048 0.092 0.282 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0759 0.0946 0.282 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 5.19e-01 0.0625 0.0968 0.282 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 6.65e-02 0.161 0.0875 0.282 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0527 0.0521 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0945 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0547 0.049 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 6.20e-01 0.0345 0.0695 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.67e-01 -0.114 0.0822 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 6.06e-01 0.0475 0.092 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 2.63e-01 0.078 0.0695 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 6.62e-01 0.033 0.0755 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 7.83e-01 0.0283 0.103 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 9.57e-01 0.00543 0.0999 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 8.99e-01 0.0119 0.0935 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 3.56e-03 -0.131 0.0445 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.91e-01 -0.037 0.0931 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 5.61e-01 0.029 0.0498 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0304 0.0772 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0815 0.0894 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 6.32e-01 0.0472 0.0983 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 9.99e-01 0.000139 0.0857 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 7.47e-01 0.0274 0.0848 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0996 0.0891 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 3.72e-02 -0.214 0.102 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0359 0.0887 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 3.10e-01 -0.102 0.1 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0888 0.101 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0127 0.0881 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.97e-01 0.125 0.0964 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 2.99e-01 -0.107 0.102 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 1.00e-01 0.161 0.0978 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0827 0.0755 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 5.46e-01 0.0527 0.0872 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 3.05e-02 0.145 0.0666 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 2.07e-01 0.0925 0.073 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 7.27e-01 0.0277 0.0794 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0471 0.0554 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0442 0.0798 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00301 0.0921 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0419 0.0713 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 9.46e-02 -0.149 0.0886 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 1.69e-02 0.198 0.0824 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 1.95e-01 0.071 0.0546 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.72e-01 0.0405 0.0955 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0614 0.0918 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0841 0.0883 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 2.43e-01 -0.112 0.0955 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 2.68e-01 0.1 0.0902 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00494 0.081 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.20e-01 -0.055 0.0852 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0456 0.0874 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 4.45e-01 0.0535 0.0699 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 9.84e-01 0.00187 0.0946 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0604 0.0935 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0176 0.0798 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 1.97e-01 0.128 0.0989 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0172 0.0918 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 4.51e-01 0.0688 0.0911 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 1.37e-01 0.122 0.0815 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 7.15e-01 0.0319 0.0871 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00177 0.0946 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 3.50e-01 0.0583 0.0622 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 6.68e-01 0.0413 0.0962 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 9.09e-02 0.17 0.1 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 8.86e-01 0.013 0.0905 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 3.43e-01 0.0889 0.0934 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 8.80e-01 0.0154 0.102 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0747 0.1 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0447 0.0898 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 4.04e-02 0.2 0.0969 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0574 0.0974 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 4.75e-01 0.0659 0.0921 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 1.78e-01 0.133 0.0983 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0648 0.106 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 4.66e-01 0.0738 0.101 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 4.49e-01 0.0671 0.0884 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 1.37e-01 0.145 0.0971 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 4.95e-01 0.0233 0.0341 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 4.66e-01 0.0699 0.0957 0.286 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0474 0.0933 0.286 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 2.77e-01 0.09 0.0825 0.286 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 5.00e-01 -0.067 0.0991 0.286 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00412 0.101 0.286 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0781 0.084 0.286 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0704 0.0953 0.286 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 1.11e-01 -0.149 0.0929 0.286 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 5.59e-01 0.0485 0.0827 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.76e-01 0.0596 0.106 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 9.11e-01 0.00866 0.0771 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 1.74e-01 0.121 0.0887 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.92e-01 0.135 0.104 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 3.79e-01 0.0893 0.101 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 1.71e-01 -0.126 0.0914 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 1.17e-01 0.151 0.0961 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0296 0.102 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.68e-01 0.0401 0.0934 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 2.01e-01 -0.117 0.091 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 6.95e-01 0.0271 0.069 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 3.62e-01 0.0874 0.0957 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 6.94e-02 0.168 0.092 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 5.73e-01 0.0448 0.0794 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 1.01e-01 0.158 0.0959 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 3.00e-02 0.235 0.107 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 8.56e-01 0.0178 0.0981 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 7.57e-01 0.0312 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 5.99e-01 0.0425 0.0808 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 7.04e-01 0.0402 0.106 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 3.30e-01 -0.105 0.108 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 7.31e-01 0.0345 0.1 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 3.52e-01 0.0961 0.103 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 3.67e-01 0.0916 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0451 0.0936 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 8.77e-02 -0.149 0.087 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 4.22e-01 0.0534 0.0664 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 2.83e-01 0.0995 0.0925 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 3.95e-01 0.0793 0.0932 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0147 0.0735 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 2.85e-01 -0.102 0.0955 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 2.94e-01 -0.108 0.103 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 9.57e-01 0.00386 0.0721 0.293 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.59e-01 0.0429 0.0971 0.293 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0138 0.0753 0.293 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 1.84e-01 -0.144 0.107 0.293 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 6.51e-01 0.0564 0.124 0.293 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 8.24e-01 -0.017 0.0764 0.293 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 7.42e-03 -0.233 0.0854 0.293 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 6.17e-01 0.0449 0.0894 0.293 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 9.41e-02 -0.173 0.103 0.293 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 2.41e-01 0.112 0.0947 0.293 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 1.30e-01 -0.133 0.0873 0.293 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 6.14e-01 0.0177 0.0351 0.278 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 3.44e-02 0.149 0.07 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 1.31e-01 -0.141 0.0933 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0584 0.0693 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0962 0.0989 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 1.67e-01 -0.103 0.0746 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 3.07e-01 0.0832 0.0813 0.278 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0785 0.0697 0.278 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 2.70e-01 0.0715 0.0646 0.278 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0188 0.0708 0.278 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.08e-01 0.0498 0.0969 0.284 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0432 0.101 0.284 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 8.56e-02 0.151 0.0875 0.284 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 5.26e-01 0.0608 0.0959 0.284 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 6.14e-01 0.0501 0.0992 0.284 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 6.83e-01 0.033 0.0806 0.284 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0188 0.0907 0.293 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 1.05e-01 -0.143 0.0879 0.293 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 7.78e-01 0.0323 0.114 0.293 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 6.62e-02 0.19 0.103 0.293 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 2.31e-01 0.128 0.107 0.293 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 4.87e-01 0.0701 0.101 0.293 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0741 0.0783 0.293 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 1.81e-01 0.12 0.0891 0.293 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00444 0.0877 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0515 0.0661 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 5.12e-01 0.0575 0.0877 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.38e-01 0.146 0.0982 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 9.16e-01 0.00937 0.0884 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0151 0.0762 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0476 0.0649 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.73e-01 0.0402 0.0953 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 1.37e-01 -0.109 0.0727 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0199 0.0889 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 4.49e-02 0.208 0.103 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0186 0.0979 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0603 0.0904 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 5.94e-01 0.0377 0.0705 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 2.93e-01 0.13 0.123 0.279 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 2.43e-01 -0.135 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 6.87e-01 0.0353 0.0873 0.279 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0399 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 1.00e-01 0.198 0.12 0.279 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 4.87e-01 0.0786 0.113 0.279 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0656 0.115 0.279 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 4.54e-02 0.224 0.111 0.279 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 2.04e-02 -0.237 0.101 0.279 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0723 0.0958 0.291 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0221 0.0877 0.291 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0202 0.103 0.291 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 3.35e-01 0.093 0.0962 0.291 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 9.88e-01 0.00151 0.0998 0.291 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 6.32e-01 0.0463 0.0964 0.291 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00336 0.0843 0.291 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 1.54e-01 0.137 0.0953 0.285 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 9.23e-01 0.00853 0.0884 0.285 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 2.88e-01 0.112 0.106 0.285 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00304 0.0926 0.285 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 1.03e-01 0.145 0.0884 0.285 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 5.14e-01 -0.056 0.0855 0.285 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 1.02e-01 -0.13 0.0792 0.285 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0672 0.115 0.294 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 9.80e-02 -0.165 0.0992 0.294 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 4.84e-04 0.363 0.102 0.294 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.71e-01 0.144 0.105 0.294 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 6.58e-01 0.0492 0.111 0.294 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0145 0.0968 0.294 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 7.93e-01 0.0197 0.0748 0.294 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 8.07e-01 0.0243 0.0993 0.294 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0303 0.048 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.92e-01 0.0519 0.0966 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 2.41e-04 -0.184 0.0492 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 1.58e-01 0.113 0.0795 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 1.31e-01 -0.124 0.0818 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 4.47e-01 0.0708 0.0929 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 1.08e-01 0.112 0.0691 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 6.62e-01 0.0365 0.0832 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0849 0.0957 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 5.82e-01 0.0553 0.1 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 4.58e-01 0.0738 0.0994 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -852638 sc-eQTL 5.27e-02 -0.107 0.0552 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0352 0.091 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0472 0.0448 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 4.45e-01 0.0492 0.0643 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 4.57e-02 -0.157 0.0781 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 8.39e-01 0.0183 0.0899 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 3.85e-01 0.0585 0.0672 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 9.33e-01 0.00596 0.0706 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -110366 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0186 0.102 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0712 0.104 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -568479 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0279 0.0944 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.68e-01 0.0346 0.0805 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0772 0.0649 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 8.68e-01 0.0139 0.0838 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 5.09e-03 0.275 0.0973 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 8.40e-01 0.0172 0.0848 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0485 0.0737 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0423 0.0604 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 6.00e-01 0.0486 0.0926 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 9.94e-01 0.000625 0.0809 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 9.17e-01 0.0103 0.0979 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 7.11e-01 0.0349 0.0942 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 1.86e-01 0.124 0.0932 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 4.98e-01 -0.055 0.0811 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0944 0.0698 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -491014 sc-eQTL 5.90e-01 0.0479 0.0889 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 sc-eQTL 1.82e-01 -0.116 0.0864 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -201853 sc-eQTL 7.66e-01 0.0177 0.0594 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 349001 sc-eQTL 9.35e-02 0.153 0.0906 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 221334 sc-eQTL 1.92e-01 0.11 0.0843 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -433043 sc-eQTL 8.28e-01 0.0149 0.0685 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -248474 sc-eQTL 5.33e-02 0.177 0.0912 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -491079 sc-eQTL 9.25e-02 0.182 0.108 0.284 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -491014 eQTL 0.00599 0.0532 0.0193 0.0 0.0 0.268
ENSG00000111666 CHPT1 -67841 eQTL 2.04e-04 -0.104 0.0279 0.0 0.0 0.268


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 NUP37 -491014 8.85e-07 4.78e-07 5.72e-08 3.48e-07 1.06e-07 1.57e-07 5.2e-07 7.12e-08 2.26e-07 1.05e-07 3.66e-07 1.48e-07 5.54e-07 9.15e-08 9.12e-08 9.01e-08 1.18e-07 2.75e-07 8e-08 6.58e-08 1.33e-07 2.24e-07 3.03e-07 4.81e-08 4.27e-07 1.43e-07 1.48e-07 1.36e-07 2.57e-07 2.39e-07 1.86e-07 4.32e-08 4.37e-08 9.08e-08 1.27e-07 2.79e-08 4.84e-08 7.61e-08 6.35e-08 5.96e-08 5.28e-08 2.9e-07 2.89e-08 1.54e-08 5.49e-08 1.8e-08 7.61e-08 3.78e-09 4.61e-08
ENSG00000120805 \N 221334 2.13e-06 2.58e-06 2.77e-07 1.35e-06 3.81e-07 6.47e-07 1.55e-06 3.96e-07 1.73e-06 6.29e-07 1.89e-06 8.48e-07 2.84e-06 5.4e-07 4.03e-07 8.48e-07 1.11e-06 1.05e-06 7.29e-07 5.11e-07 7.8e-07 1.96e-06 1.77e-06 5.3e-07 2.43e-06 4.79e-07 1.05e-06 7.99e-07 1.66e-06 1.39e-06 8.07e-07 1.52e-07 2.3e-07 5.53e-07 6.12e-07 4.15e-07 6.1e-07 2.23e-07 3.78e-07 2.42e-07 2.86e-07 2.01e-06 2.92e-07 1.66e-07 2.49e-07 7.64e-08 2.3e-07 4.41e-08 1.58e-07