logo

Genes within 1Mb (chr12:101622931:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 2.10e-01 0.0762 0.0606 0.103 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0273 0.106 0.103 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.41e-03 0.203 0.0628 0.103 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0827 0.0929 0.103 B L1
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 7.87e-01 0.0285 0.106 0.103 B L1
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 3.41e-01 0.0866 0.0907 0.103 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 9.64e-01 0.00331 0.0728 0.103 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0868 0.0823 0.103 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 1.02e-01 0.214 0.13 0.103 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0896 0.125 0.103 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 2.47e-02 0.262 0.116 0.103 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 6.22e-01 0.0471 0.0956 0.103 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.20e-03 0.414 0.126 0.103 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0427 0.0895 0.103 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.17e-01 -0.155 0.0984 0.103 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 1.34e-01 -0.145 0.0963 0.103 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 1.78e-01 0.0913 0.0675 0.103 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 3.83e-02 -0.244 0.117 0.103 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 6.02e-03 0.35 0.126 0.103 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.79e-01 -0.074 0.084 0.103 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.15e-01 -0.167 0.106 0.103 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000158 0.117 0.103 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.04e-01 0.0856 0.0831 0.103 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0914 0.119 0.103 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 6.33e-02 -0.249 0.133 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 4.29e-01 0.0972 0.123 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.77e-02 -0.28 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0892 0.145 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 3.25e-01 0.148 0.149 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.17e-01 0.0468 0.129 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.52e-01 -0.099 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 7.21e-01 0.0502 0.14 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 1.23e-01 -0.173 0.112 0.103 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 6.02e-01 0.0496 0.095 0.103 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.80e-01 0.105 0.119 0.103 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 5.83e-02 -0.251 0.132 0.103 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0645 0.122 0.103 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.95e-01 -0.028 0.108 0.103 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 7.89e-01 0.0235 0.0877 0.103 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.14e-02 -0.275 0.119 0.103 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 6.78e-03 0.3 0.11 0.103 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 6.21e-01 0.0401 0.0808 0.103 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0801 0.13 0.103 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0781 0.12 0.103 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 8.29e-02 0.156 0.0895 0.103 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0553 0.128 0.103 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 2.40e-01 -0.177 0.15 0.103 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00346 0.0462 0.103 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 7.33e-01 0.0301 0.088 0.103 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.30e-02 0.317 0.127 0.103 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0699 0.0926 0.103 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.15e-01 0.228 0.144 0.103 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 7.26e-01 -0.037 0.106 0.103 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.42e-01 0.0892 0.0936 0.103 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 2.50e-01 0.129 0.112 0.103 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 4.84e-02 -0.184 0.0929 0.103 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0395 0.109 0.103 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 3.16e-01 0.0307 0.0305 0.105 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 8.45e-01 0.0309 0.159 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 6.72e-01 0.0496 0.117 0.105 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0317 0.166 0.105 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.25e-01 0.247 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 9.42e-01 -0.0121 0.166 0.105 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0473 0.158 0.105 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.22e-01 0.157 0.159 0.105 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0599 0.131 0.105 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0631 0.131 0.105 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 2.32e-01 -0.148 0.123 0.105 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 1.31e-01 0.0919 0.0605 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 4.20e-01 0.122 0.151 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.76e-03 0.252 0.0795 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0347 0.12 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 7.42e-01 0.044 0.134 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 2.52e-02 0.335 0.149 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.07e-01 0.127 0.124 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 4.34e-01 -0.104 0.133 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 2.60e-02 0.311 0.139 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 2.86e-01 -0.157 0.147 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 2.23e-01 0.172 0.141 0.103 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 1.87e-01 0.0733 0.0554 0.103 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 7.83e-01 0.0404 0.147 0.103 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.09e-02 0.243 0.0944 0.103 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0934 0.131 0.103 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0919 0.144 0.103 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 7.16e-01 0.0521 0.143 0.103 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 9.66e-02 0.213 0.127 0.103 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.75e-01 0.119 0.134 0.103 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 3.75e-02 0.287 0.137 0.103 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 3.86e-01 -0.123 0.141 0.103 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 1.22e-01 0.199 0.128 0.103 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0559 0.0767 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 8.18e-01 -0.032 0.139 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 9.48e-03 0.186 0.0711 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0257 0.102 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 7.91e-01 0.0322 0.121 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 1.80e-01 -0.182 0.135 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0541 0.102 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 9.22e-01 0.011 0.111 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 5.94e-01 0.0806 0.151 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 8.29e-01 0.0319 0.147 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 2.81e-01 0.148 0.137 0.103 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 8.42e-01 0.0133 0.0668 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 7.80e-01 0.0383 0.137 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 4.63e-02 0.145 0.0726 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 6.76e-01 0.0476 0.114 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 8.39e-01 0.0268 0.132 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 5.48e-01 0.087 0.144 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.69e-01 -0.113 0.126 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 1.64e-01 -0.173 0.124 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0489 0.131 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 5.06e-01 -0.101 0.151 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 4.17e-01 -0.106 0.13 0.103 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.03e-01 -0.186 0.146 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 4.73e-02 0.29 0.145 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0829 0.128 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 3.06e-01 -0.144 0.141 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 2.73e-01 0.164 0.149 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.14e-01 0.0527 0.143 0.105 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 9.91e-01 0.00118 0.11 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 3.70e-03 0.366 0.125 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0587 0.098 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0922 0.107 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 8.12e-02 -0.201 0.115 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.88e-01 0.0439 0.0809 0.103 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 7.07e-01 0.0439 0.117 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 7.45e-04 0.448 0.131 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0853 0.104 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 8.89e-01 0.0182 0.13 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0223 0.122 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.48e-02 0.153 0.0794 0.103 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 6.37e-01 0.067 0.142 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 2.47e-03 0.41 0.134 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 7.24e-01 0.0465 0.132 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 6.97e-01 0.0554 0.142 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 2.51e-01 -0.154 0.134 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.09e-01 0.0797 0.12 0.103 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 1.82e-01 -0.168 0.125 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.33e-02 0.317 0.127 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.01e-01 -0.107 0.103 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 2.58e-01 -0.158 0.139 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0442 0.138 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 6.38e-01 0.0555 0.118 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 1.87e-01 -0.193 0.146 0.103 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 8.49e-02 -0.232 0.134 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 4.93e-02 0.263 0.133 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 6.55e-01 -0.054 0.121 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.74e-01 -0.174 0.128 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 3.51e-01 0.13 0.139 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 4.85e-01 0.0642 0.0917 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.20e-01 -0.141 0.141 0.103 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 6.92e-01 0.0578 0.145 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 2.26e-02 0.296 0.129 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 1.09e-02 -0.341 0.133 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 3.86e-01 -0.128 0.147 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 4.55e-01 0.108 0.144 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.58e-01 0.0399 0.129 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0924 0.141 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0122 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 8.23e-01 0.0304 0.136 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 2.09e-01 0.183 0.145 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0185 0.156 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 1.99e-01 0.192 0.149 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0442 0.131 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 4.93e-01 -0.099 0.144 0.103 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0643 0.0497 0.104 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0417 0.14 0.104 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 3.78e-02 0.282 0.135 0.104 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.48e-01 -0.113 0.121 0.104 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 9.71e-01 -0.0053 0.145 0.104 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 5.22e-01 0.0947 0.148 0.104 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 1.14e-01 0.194 0.122 0.104 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0393 0.139 0.104 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 2.77e-01 0.148 0.136 0.104 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0617 0.121 0.104 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 1.38e-01 -0.225 0.151 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 3.15e-03 0.321 0.107 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 2.34e-01 -0.151 0.126 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 8.50e-02 -0.254 0.147 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 8.76e-01 0.0225 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00848 0.131 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 5.85e-01 0.0752 0.138 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 9.79e-01 0.00392 0.145 0.104 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.69e-02 -0.292 0.131 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.10e-01 0.207 0.129 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 8.18e-01 0.0225 0.098 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 7.17e-01 0.0495 0.136 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 3.35e-01 -0.127 0.131 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.44e-01 0.107 0.113 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.95e-01 -0.117 0.137 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0772 0.154 0.103 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0032 0.141 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 3.14e-01 0.146 0.144 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 1.91e-01 -0.152 0.116 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0844 0.152 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 8.82e-01 0.0231 0.155 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.07e-01 0.147 0.144 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 9.66e-01 0.00629 0.148 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 5.58e-01 0.0855 0.146 0.107 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0217 0.137 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 8.97e-04 0.421 0.125 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 2.86e-01 0.104 0.0972 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 2.42e-01 -0.159 0.135 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 5.34e-01 0.0851 0.137 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 1.74e-02 0.255 0.106 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 9.93e-01 -0.0013 0.14 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 2.91e-01 -0.16 0.151 0.103 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 4.03e-01 0.0903 0.107 0.111 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 9.04e-01 0.0176 0.145 0.111 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 5.66e-01 0.0647 0.112 0.111 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 8.74e-02 -0.275 0.16 0.111 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 4.09e-01 -0.154 0.185 0.111 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 2.50e-01 -0.131 0.114 0.111 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 6.37e-01 0.0623 0.132 0.111 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 5.68e-01 0.0765 0.134 0.111 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 1.99e-01 0.199 0.154 0.111 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 7.83e-01 0.0394 0.142 0.111 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00119 0.132 0.111 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0639 0.0501 0.104 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 9.21e-01 -0.01 0.102 0.104 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 2.54e-02 0.299 0.133 0.104 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0944 0.0993 0.104 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 2.76e-01 0.155 0.142 0.104 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 5.22e-01 0.069 0.107 0.104 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.73e-01 -0.104 0.117 0.104 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.56e-01 0.0925 0.1 0.104 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0654 0.0928 0.104 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 2.04e-01 -0.129 0.101 0.104 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0135 0.144 0.103 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 2.95e-02 0.325 0.149 0.103 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 7.21e-01 0.0468 0.131 0.103 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 2.54e-01 -0.163 0.142 0.103 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 3.31e-01 -0.144 0.147 0.103 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 6.62e-01 0.0525 0.12 0.103 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 1.19e-01 -0.207 0.132 0.098 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 9.36e-01 0.0104 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 1.89e-01 -0.22 0.167 0.098 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0301 0.152 0.098 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 8.60e-02 0.27 0.156 0.098 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0924 0.148 0.098 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0916 0.115 0.098 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 3.36e-01 0.127 0.131 0.098 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 9.49e-01 0.00824 0.128 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 7.87e-01 0.0261 0.0964 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 5.67e-03 0.351 0.126 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.77e-01 -0.194 0.143 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 2.86e-01 -0.138 0.129 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.68e-01 0.0328 0.111 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.31e-01 0.092 0.0945 0.103 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.69e-03 -0.415 0.137 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 2.94e-01 0.112 0.107 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 3.05e-01 -0.133 0.13 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 3.25e-02 -0.325 0.151 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 6.73e-01 0.0604 0.143 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.32e-01 -0.129 0.132 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 7.41e-01 0.0342 0.103 0.103 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.08e-01 -0.214 0.17 0.112 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 1.73e-01 0.218 0.159 0.112 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 1.29e-01 -0.182 0.119 0.112 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 9.79e-02 0.263 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 6.94e-02 -0.302 0.165 0.112 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 1.44e-01 0.227 0.154 0.112 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 2.77e-01 0.172 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 2.38e-02 -0.348 0.152 0.112 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 5.43e-01 0.0865 0.142 0.112 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.22e-02 -0.321 0.139 0.102 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 3.91e-01 -0.111 0.129 0.102 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 2.01e-01 0.194 0.151 0.102 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 3.67e-01 -0.128 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 4.78e-01 0.104 0.147 0.102 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 7.22e-01 0.0506 0.142 0.102 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 1.91e-01 -0.162 0.124 0.102 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 6.20e-01 0.0699 0.141 0.106 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 5.80e-01 0.072 0.13 0.106 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 2.53e-01 -0.178 0.155 0.106 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.22e-01 -0.21 0.135 0.106 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 3.71e-01 -0.117 0.131 0.106 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 8.44e-01 0.0248 0.126 0.106 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 5.82e-01 0.0645 0.117 0.106 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 3.69e-01 -0.162 0.179 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 3.50e-01 0.146 0.156 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 2.65e-01 -0.185 0.165 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.30e-01 -0.25 0.164 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 9.57e-01 0.00939 0.174 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.23e-01 0.0967 0.151 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 6.19e-02 -0.218 0.116 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 5.86e-01 0.0847 0.155 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 5.80e-02 0.132 0.0694 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.90e-01 0.149 0.14 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 6.51e-04 0.249 0.072 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0863 0.116 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 5.09e-01 0.0791 0.12 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 2.46e-02 0.303 0.134 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 1.17e-01 0.158 0.101 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0458 0.121 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 3.65e-03 0.402 0.137 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 1.45e-01 -0.212 0.145 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 1.78e-01 0.195 0.144 0.103 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -858813 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0404 0.0814 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0754 0.133 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 5.15e-03 0.183 0.0646 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0182 0.0942 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 5.74e-01 0.0649 0.115 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 3.25e-01 -0.129 0.131 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0563 0.0985 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 3.10e-01 -0.105 0.103 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -116541 sc-eQTL 7.44e-01 0.0487 0.149 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0135 0.152 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -574654 sc-eQTL 4.53e-01 0.104 0.138 0.103 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 2.06e-01 -0.148 0.117 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 3.19e-01 0.0943 0.0945 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 2.34e-01 0.145 0.122 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 6.65e-02 -0.264 0.143 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0619 0.123 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0981 0.107 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 2.42e-01 0.103 0.0877 0.103 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 3.70e-01 -0.121 0.134 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 9.59e-01 0.00603 0.118 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 5.91e-01 0.0766 0.142 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 1.22e-01 -0.211 0.136 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00767 0.136 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 9.13e-01 0.013 0.118 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0303 0.102 0.103 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -497189 sc-eQTL 8.67e-02 -0.217 0.126 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 sc-eQTL 9.25e-03 0.32 0.122 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -208028 sc-eQTL 7.09e-01 0.0316 0.0848 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 342826 sc-eQTL 9.66e-01 0.00555 0.13 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 215159 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0701 0.121 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -439218 sc-eQTL 5.06e-02 0.19 0.0969 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -254649 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0776 0.131 0.103 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -497254 sc-eQTL 3.30e-01 -0.151 0.154 0.103 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -74016 eQTL 1.73e-01 0.0534 0.0392 0.0987 0.0 0.106

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina