logo

Genes within 1Mb (chr12:101621491:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0193 0.0415 0.282 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 4.50e-01 0.0546 0.0721 0.282 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.10e-02 -0.111 0.0432 0.282 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 2.98e-01 0.0661 0.0633 0.282 B L1
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 6.39e-02 -0.133 0.0716 0.282 B L1
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 1.52e-01 0.0888 0.0617 0.282 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 1.79e-01 0.0668 0.0495 0.282 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 8.72e-01 0.0091 0.0563 0.282 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 7.04e-01 -0.034 0.0895 0.282 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 6.80e-01 0.0354 0.0857 0.282 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00701 0.08 0.282 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0556 0.0661 0.282 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0172 0.0894 0.282 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 3.34e-01 0.0599 0.0618 0.282 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0302 0.0685 0.282 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 2.96e-01 0.07 0.0668 0.282 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0232 0.0469 0.282 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 8.67e-01 0.0137 0.0818 0.282 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 9.62e-01 0.0042 0.0887 0.282 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 1.12e-01 0.0924 0.0578 0.282 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0194 0.0734 0.282 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 4.82e-01 -0.057 0.081 0.282 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 6.76e-01 0.024 0.0575 0.282 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 2.70e-02 0.182 0.0815 0.282 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0882 0.0942 0.286 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.07e-01 -0.139 0.0857 0.286 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 1.25e-01 0.145 0.0943 0.286 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 2.16e-01 0.126 0.101 0.286 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 1.64e-01 0.146 0.105 0.286 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 6.93e-01 0.0358 0.0906 0.286 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 2.74e-01 0.0817 0.0746 0.286 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 3.26e-01 0.0968 0.0984 0.286 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.50e-01 0.0247 0.0776 0.282 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0407 0.0656 0.282 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0482 0.0823 0.282 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 3.76e-03 0.264 0.09 0.282 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 7.24e-01 0.0299 0.0845 0.282 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0503 0.0743 0.282 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0359 0.0606 0.282 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00444 0.0847 0.283 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.37e-01 -0.117 0.0782 0.283 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0172 0.057 0.283 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 3.26e-01 0.0901 0.0915 0.283 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 1.97e-01 0.109 0.0839 0.283 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0276 0.0635 0.283 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 4.59e-02 0.18 0.0895 0.283 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 8.03e-02 0.185 0.105 0.283 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 8.89e-01 0.00442 0.0316 0.282 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 2.25e-01 0.0731 0.06 0.282 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.04e-01 -0.142 0.0873 0.282 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 8.54e-01 0.0117 0.0634 0.282 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0654 0.0989 0.282 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0352 0.0722 0.282 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0699 0.064 0.282 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 8.73e-01 0.0124 0.077 0.282 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0637 0.064 0.282 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0324 0.0745 0.282 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0209 0.0204 0.283 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0433 0.106 0.283 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 7.88e-04 -0.26 0.076 0.283 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 3.58e-01 0.103 0.111 0.283 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0804 0.108 0.283 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 5.33e-01 0.0695 0.111 0.283 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 3.55e-02 0.222 0.105 0.283 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0056 0.107 0.283 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 1.68e-01 -0.121 0.0872 0.283 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 9.76e-01 0.00271 0.0882 0.283 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 3.82e-01 0.0725 0.0827 0.283 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0182 0.0414 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 2.89e-01 0.109 0.103 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.32e-03 -0.176 0.054 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 2.45e-01 0.0952 0.0816 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 1.98e-01 -0.117 0.0906 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 5.32e-01 0.064 0.102 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 3.36e-01 0.0814 0.0844 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 7.42e-01 0.0299 0.0907 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0931 0.0952 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 3.70e-01 0.0899 0.1 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 8.69e-01 0.0159 0.096 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0153 0.0381 0.28 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0347 0.101 0.28 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 2.24e-04 -0.239 0.0636 0.28 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 3.61e-01 0.0822 0.0898 0.28 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0297 0.0987 0.28 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 1.94e-01 0.127 0.0978 0.28 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 2.69e-01 0.097 0.0876 0.28 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 4.26e-01 0.0734 0.092 0.28 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0437 0.0948 0.28 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 3.91e-01 0.0833 0.0968 0.28 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 3.30e-02 0.187 0.0873 0.28 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00871 0.0525 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 9.67e-01 0.00396 0.0949 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.96e-02 -0.0836 0.049 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 4.58e-01 0.0518 0.0697 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 7.22e-02 -0.149 0.0822 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 9.31e-01 -0.008 0.0925 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 1.54e-01 0.0996 0.0697 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 6.50e-01 0.0345 0.0758 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0244 0.103 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 6.29e-01 0.0484 0.1 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 6.74e-01 0.0396 0.0939 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 1.79e-02 -0.108 0.0452 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.09e-01 -0.035 0.0938 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 9.67e-01 0.00206 0.0502 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0328 0.0778 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0994 0.09 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 4.21e-01 0.0798 0.0989 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 8.12e-01 0.0205 0.0863 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0536 0.0854 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0356 0.09 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 1.02e-01 -0.169 0.103 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0367 0.0894 0.281 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 5.04e-02 -0.199 0.101 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 2.68e-01 -0.113 0.102 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 9.56e-01 0.00494 0.0892 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 4.40e-01 0.0758 0.0979 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0619 0.104 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 2.11e-01 0.125 0.0993 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0639 0.0757 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 7.40e-01 0.029 0.0874 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 2.46e-02 0.151 0.0666 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 5.10e-01 0.0484 0.0734 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0168 0.0796 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0469 0.0555 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0377 0.0806 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0267 0.093 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 1.25e-01 -0.11 0.0716 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 6.08e-02 -0.168 0.0894 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 2.74e-02 0.185 0.0834 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 4.60e-01 0.0409 0.0553 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.48e-01 0.0309 0.096 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0702 0.0923 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0416 0.0889 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 2.96e-01 -0.101 0.096 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 7.47e-02 0.162 0.0903 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0221 0.0815 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0839 0.086 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0435 0.0884 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 5.35e-01 0.0439 0.0706 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000987 0.0956 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0386 0.0945 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0398 0.0806 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 1.65e-01 0.139 0.0999 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0285 0.0926 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 5.65e-01 0.0531 0.092 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 4.04e-02 0.169 0.0818 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 7.43e-01 0.0289 0.0879 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0664 0.0953 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 4.13e-01 0.0515 0.0628 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 2.46e-01 0.113 0.0967 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 1.05e-01 0.161 0.099 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0143 0.0894 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 6.55e-02 0.17 0.0917 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0737 0.101 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0487 0.0991 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 7.60e-01 0.0271 0.0887 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 1.89e-01 0.127 0.0963 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0482 0.0987 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.03e-01 0.0234 0.0934 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 2.05e-01 0.127 0.0996 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 3.92e-01 -0.092 0.107 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0679 0.103 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00227 0.0897 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 1.63e-01 0.138 0.0985 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 5.78e-01 0.0191 0.0342 0.284 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 6.27e-01 0.0467 0.0961 0.284 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0912 0.0935 0.284 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 3.27e-01 0.0814 0.0829 0.284 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0252 0.0996 0.284 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 9.88e-01 0.00154 0.102 0.284 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0771 0.0843 0.284 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0718 0.0957 0.284 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 1.37e-01 -0.139 0.0934 0.284 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 5.15e-01 0.0542 0.083 0.284 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 3.54e-01 0.0976 0.105 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 9.85e-01 0.00142 0.0762 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 1.65e-01 0.122 0.0877 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 3.09e-01 0.105 0.103 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 2.68e-01 0.111 0.1 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 2.03e-01 -0.116 0.0905 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 6.14e-02 0.178 0.0948 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 7.38e-01 0.0338 0.101 0.278 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00795 0.0939 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 7.57e-02 -0.163 0.0911 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0199 0.0694 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 8.60e-01 0.017 0.0963 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 2.05e-01 0.118 0.0928 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 8.17e-01 0.0185 0.0798 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 1.39e-01 0.143 0.0964 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 1.02e-02 0.279 0.107 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0264 0.0972 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0131 0.0997 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00426 0.0801 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 5.10e-01 0.0691 0.105 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0942 0.107 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 9.46e-01 0.00668 0.0994 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 1.39e-01 0.151 0.102 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 1.93e-01 0.131 0.1 0.283 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0746 0.094 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 2.26e-01 -0.106 0.0878 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 5.05e-01 0.0446 0.0668 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 7.38e-01 0.0312 0.0932 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 6.19e-01 0.0467 0.0938 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 9.34e-01 0.00613 0.0739 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00594 0.0962 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 9.22e-02 -0.175 0.103 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 3.35e-01 0.075 0.0775 0.274 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 5.82e-01 0.0578 0.105 0.274 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.72e-01 0.0131 0.0812 0.274 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 1.85e-01 -0.154 0.116 0.274 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 2.81e-01 0.145 0.133 0.274 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00274 0.0824 0.274 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 3.93e-03 -0.27 0.0916 0.274 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 5.61e-01 0.0562 0.0964 0.274 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 6.37e-02 -0.207 0.11 0.274 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 5.98e-01 0.0542 0.103 0.274 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 1.96e-01 -0.123 0.0943 0.274 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 2.91e-01 0.0367 0.0347 0.278 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 6.48e-02 0.129 0.0696 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0633 0.0929 0.278 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0471 0.0687 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 7.72e-02 -0.173 0.0975 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0682 0.0741 0.278 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 5.06e-01 0.0538 0.0806 0.278 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0241 0.0692 0.278 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 5.03e-01 0.043 0.0641 0.278 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 7.58e-01 0.0217 0.0702 0.278 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 2.17e-01 0.12 0.0972 0.282 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0322 0.101 0.282 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 2.82e-01 0.0954 0.0884 0.282 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00881 0.0966 0.282 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 8.83e-01 0.0147 0.0999 0.282 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 8.90e-01 0.0113 0.0811 0.282 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0118 0.0928 0.288 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.26e-01 -0.138 0.0899 0.288 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 7.08e-01 0.0438 0.117 0.288 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 4.21e-02 0.214 0.105 0.288 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 7.67e-02 0.194 0.109 0.288 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 1.68e-01 0.142 0.102 0.288 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0193 0.0803 0.288 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 8.93e-01 0.0123 0.0915 0.288 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 8.96e-01 0.0116 0.0888 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 4.12e-01 -0.055 0.0669 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 6.52e-01 0.0402 0.0888 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 8.14e-02 0.174 0.0992 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 8.38e-01 0.0183 0.0895 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 8.68e-01 0.0128 0.0772 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0422 0.0658 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0246 0.0964 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.56e-01 -0.105 0.0735 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0688 0.0897 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 1.48e-02 0.255 0.104 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0401 0.0989 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0818 0.0913 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 7.84e-01 0.0196 0.0713 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 5.27e-02 0.232 0.119 0.282 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.99e-01 -0.145 0.112 0.282 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0161 0.085 0.282 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.112 0.282 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 1.32e-01 0.177 0.117 0.282 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0395 0.11 0.282 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 8.28e-01 0.0243 0.112 0.282 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 1.61e-01 0.153 0.109 0.282 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 1.45e-01 -0.146 0.0996 0.282 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0447 0.097 0.289 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0151 0.0887 0.289 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 8.86e-01 -0.015 0.104 0.289 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 2.09e-01 0.123 0.0972 0.289 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 9.09e-01 0.0115 0.101 0.289 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 9.34e-01 0.00814 0.0976 0.289 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 7.34e-01 0.029 0.0853 0.289 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 1.18e-01 0.151 0.0962 0.285 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 9.93e-01 0.000758 0.0894 0.285 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 8.63e-01 0.0185 0.107 0.285 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 8.15e-01 0.022 0.0935 0.285 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 5.98e-02 0.169 0.0891 0.285 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 9.50e-01 0.00542 0.0865 0.285 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0903 0.0803 0.285 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0952 0.119 0.288 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.71e-01 -0.141 0.103 0.288 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 1.16e-03 0.35 0.106 0.288 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 8.37e-02 0.188 0.108 0.288 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 2.51e-01 0.132 0.114 0.288 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 2.59e-01 0.113 0.0995 0.288 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 5.91e-01 0.0416 0.0772 0.288 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 5.89e-01 0.0555 0.103 0.288 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00415 0.0481 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 6.99e-01 0.0374 0.0965 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.13e-05 -0.218 0.0485 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 1.41e-01 0.117 0.0794 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 6.74e-02 -0.15 0.0816 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 4.82e-01 0.0654 0.0929 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 1.67e-01 0.0958 0.0691 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 7.28e-01 0.029 0.0831 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 2.49e-01 -0.11 0.0955 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 2.85e-01 0.107 0.1 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 4.04e-02 0.203 0.0985 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -860253 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0544 0.0554 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 9.55e-01 0.00515 0.0909 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0659 0.0447 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 4.67e-01 0.0467 0.0642 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 5.23e-02 -0.152 0.078 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 9.33e-01 0.00755 0.0897 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 3.45e-01 0.0635 0.0671 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0175 0.0705 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -117981 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0249 0.102 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0103 0.104 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -576094 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0347 0.0943 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 8.18e-01 0.0188 0.0815 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0816 0.0657 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0229 0.0848 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 1.74e-03 0.311 0.098 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 8.09e-01 0.0208 0.0858 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0467 0.0746 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0433 0.0612 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 2.03e-01 0.119 0.0931 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 8.76e-01 0.0128 0.0816 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0445 0.0988 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 7.44e-01 0.031 0.095 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 1.78e-01 0.127 0.094 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 8.45e-01 -0.016 0.082 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0525 0.0706 0.284 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -498629 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0262 0.0899 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 sc-eQTL 1.51e-01 -0.126 0.0873 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -209468 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0316 0.0601 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 341386 sc-eQTL 4.01e-01 0.0775 0.0921 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 213719 sc-eQTL 3.51e-01 0.0798 0.0854 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -440658 sc-eQTL 9.12e-01 0.00768 0.0693 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -256089 sc-eQTL 3.49e-02 0.196 0.0921 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -498694 sc-eQTL 8.69e-02 0.187 0.109 0.282 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -498629 eQTL 0.0342 0.0428 0.0202 0.0 0.0 0.251
ENSG00000111666 CHPT1 -75456 eQTL 1.85e-04 -0.109 0.0291 0.0 0.0 0.251

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina