logo

Genes within 1Mb (chr12:101616011:GT:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0315 0.0426 0.274 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 5.93e-01 0.0397 0.0741 0.274 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 9.01e-03 -0.117 0.0444 0.274 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 2.26e-01 0.0789 0.065 0.274 B L1
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 5.41e-02 -0.142 0.0735 0.274 B L1
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 1.00e-01 0.105 0.0633 0.274 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 2.59e-01 0.0576 0.0509 0.274 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 6.92e-01 0.0229 0.0579 0.274 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00775 0.092 0.274 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 5.00e-01 0.0595 0.088 0.274 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 8.76e-01 0.0128 0.0821 0.274 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0726 0.0677 0.274 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00872 0.0916 0.274 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 5.58e-01 0.0373 0.0635 0.274 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 8.32e-01 -0.015 0.0703 0.274 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 3.46e-01 0.0648 0.0686 0.274 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0185 0.0481 0.274 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.95e-01 0.0111 0.0841 0.274 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 7.69e-01 0.0268 0.0911 0.274 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 8.06e-02 0.104 0.0594 0.274 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 6.72e-01 -0.032 0.0754 0.274 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0518 0.0832 0.274 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 5.10e-01 0.039 0.0591 0.274 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 5.56e-03 0.233 0.0832 0.274 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0758 0.096 0.279 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.88e-02 -0.16 0.0872 0.279 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 1.86e-01 0.128 0.0963 0.279 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 3.00e-01 0.107 0.103 0.279 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 3.03e-01 0.11 0.107 0.279 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 4.39e-01 0.0714 0.0922 0.279 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 3.80e-01 0.0669 0.0761 0.279 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 3.51e-01 0.0937 0.1 0.279 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 6.19e-01 0.0398 0.08 0.274 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0282 0.0677 0.274 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0744 0.0848 0.274 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 1.41e-02 0.231 0.0934 0.274 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 3.36e-01 0.084 0.087 0.274 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0172 0.0767 0.274 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0431 0.0625 0.274 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 7.92e-01 0.023 0.0868 0.275 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 1.03e-01 -0.131 0.08 0.275 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 9.62e-01 0.00276 0.0584 0.275 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 5.10e-01 0.0619 0.0938 0.275 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 4.49e-01 0.0654 0.0862 0.275 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0544 0.065 0.275 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 5.15e-02 0.18 0.0918 0.275 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 1.91e-02 0.253 0.107 0.275 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 9.00e-01 0.00407 0.0324 0.274 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 3.84e-01 0.0538 0.0617 0.274 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 1.44e-01 -0.132 0.0898 0.274 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00444 0.0651 0.274 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0405 0.102 0.274 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0404 0.0741 0.274 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0337 0.0659 0.274 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 6.42e-01 0.0368 0.079 0.274 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 3.78e-01 -0.058 0.0657 0.274 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 9.39e-01 0.00588 0.0766 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 9.66e-02 -0.0348 0.0208 0.276 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0134 0.109 0.276 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 2.67e-03 -0.239 0.0785 0.276 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 2.20e-01 0.14 0.114 0.276 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 6.26e-01 -0.054 0.111 0.276 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 5.31e-01 0.0717 0.114 0.276 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 3.96e-02 0.223 0.108 0.276 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0265 0.109 0.276 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0788 0.0896 0.276 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0467 0.0904 0.276 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 5.47e-01 0.0513 0.0849 0.276 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0188 0.0425 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 2.32e-01 0.127 0.106 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 2.84e-03 -0.168 0.0556 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 9.23e-02 0.141 0.0834 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 1.23e-01 -0.144 0.0928 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 2.29e-01 0.126 0.105 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 3.76e-01 0.0769 0.0866 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 6.08e-01 0.0478 0.0931 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 2.26e-01 -0.118 0.0976 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 3.86e-01 0.0891 0.103 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 5.94e-01 0.0525 0.0985 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0223 0.0394 0.272 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0108 0.104 0.272 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 1.80e-04 -0.251 0.0657 0.272 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 3.31e-01 0.0905 0.0928 0.272 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0439 0.102 0.272 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 1.78e-01 0.137 0.101 0.272 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 4.84e-01 0.0636 0.0907 0.272 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 4.61e-01 0.0703 0.0951 0.272 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0542 0.098 0.272 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 4.25e-01 0.08 0.1 0.272 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 5.21e-02 0.177 0.0905 0.272 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0278 0.054 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00685 0.0979 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0761 0.0506 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 4.09e-01 0.0594 0.0718 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 4.16e-02 -0.173 0.0846 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 9.33e-01 0.00802 0.0953 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 1.66e-01 0.0997 0.0718 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 5.30e-01 0.0491 0.0781 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0201 0.106 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 3.59e-01 0.0949 0.103 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 7.38e-01 0.0325 0.0968 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 1.11e-02 -0.119 0.0466 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0552 0.0969 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 9.90e-01 0.000631 0.0519 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0471 0.0804 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 2.18e-01 -0.115 0.093 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 4.62e-01 0.0754 0.102 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 9.66e-01 0.00375 0.0892 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0322 0.0883 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00819 0.093 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 1.67e-01 -0.148 0.107 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0351 0.0924 0.273 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 2.63e-02 -0.233 0.104 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 2.40e-01 -0.124 0.105 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 7.58e-01 0.0285 0.0923 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 4.55e-01 0.0759 0.101 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0155 0.108 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 2.86e-01 0.11 0.103 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0854 0.0776 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.65e-01 0.0389 0.0898 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 6.55e-02 0.127 0.0687 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 3.61e-01 0.0688 0.0753 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0332 0.0817 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0467 0.057 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0161 0.0823 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0245 0.0949 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 5.23e-02 -0.142 0.0728 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 7.55e-02 -0.163 0.0913 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 4.01e-02 0.176 0.0852 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 3.42e-01 0.0537 0.0564 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 7.11e-01 0.0366 0.0985 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0579 0.0947 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0184 0.0913 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0963 0.0986 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 3.17e-01 0.0935 0.0931 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0261 0.0836 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 2.50e-01 -0.102 0.0884 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0133 0.0909 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 4.05e-01 0.0606 0.0726 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0108 0.0984 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0763 0.0971 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0433 0.0829 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 1.40e-01 0.152 0.103 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 9.29e-01 0.00847 0.0949 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 5.02e-01 0.0633 0.0942 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 6.75e-02 0.154 0.084 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 5.31e-01 0.0564 0.0899 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0292 0.0977 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 2.18e-01 0.0792 0.0641 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 1.30e-01 0.15 0.0988 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.86e-02 0.175 0.102 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0118 0.0924 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 1.11e-01 0.152 0.095 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0477 0.104 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0327 0.102 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 9.86e-01 0.00163 0.0917 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 1.19e-01 0.156 0.0993 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0607 0.102 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.41e-01 0.0451 0.0967 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 1.68e-01 0.143 0.103 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 1.91e-01 -0.145 0.111 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0803 0.106 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 9.49e-01 0.00601 0.0929 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 9.58e-02 0.17 0.102 0.265 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 6.06e-01 0.0183 0.0354 0.275 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 7.47e-01 0.0322 0.0995 0.275 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0682 0.0968 0.275 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 4.05e-01 0.0717 0.0858 0.275 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00925 0.103 0.275 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00101 0.105 0.275 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0543 0.0873 0.275 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0513 0.0991 0.275 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 1.52e-01 -0.139 0.0966 0.275 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 5.26e-01 0.0545 0.0859 0.275 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 5.17e-01 0.0695 0.107 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000293 0.0776 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 2.04e-01 0.114 0.0893 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 2.64e-01 0.117 0.104 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 1.16e-01 0.161 0.102 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 2.19e-01 -0.114 0.0922 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 5.18e-02 0.189 0.0964 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 8.60e-01 0.0181 0.103 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 7.05e-01 0.0365 0.0962 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 3.63e-02 -0.196 0.0931 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 9.20e-01 0.00719 0.0711 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0122 0.0988 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 3.95e-01 0.0813 0.0954 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00402 0.0819 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.099 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 9.76e-03 0.287 0.11 0.274 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0222 0.0992 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0425 0.102 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00989 0.0818 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 4.23e-01 0.0857 0.107 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 2.31e-01 -0.131 0.109 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 7.47e-01 0.0328 0.101 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 2.48e-01 0.12 0.104 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 1.54e-01 0.146 0.102 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 4.64e-01 -0.071 0.0966 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0857 0.0903 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 2.27e-01 0.083 0.0685 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 9.18e-01 0.00984 0.0958 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 5.10e-01 0.0636 0.0963 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0152 0.0759 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 5.85e-01 -0.054 0.0988 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 2.64e-01 -0.119 0.107 0.274 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 7.65e-01 0.0238 0.0795 0.27 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 5.16e-01 0.0696 0.107 0.27 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.25e-01 0.0407 0.0829 0.27 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 1.55e-01 -0.169 0.118 0.27 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 1.43e-01 0.2 0.136 0.27 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 9.90e-01 0.00104 0.0842 0.27 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 3.17e-03 -0.282 0.0935 0.27 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 1.54e-01 0.14 0.0978 0.27 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 1.79e-01 -0.154 0.114 0.27 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 4.95e-01 0.0717 0.105 0.27 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0992 0.0967 0.27 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 6.95e-01 0.014 0.0358 0.272 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.19e-02 0.125 0.0717 0.272 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 2.20e-01 -0.117 0.0953 0.272 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0695 0.0706 0.272 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 8.18e-02 -0.175 0.1 0.272 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0948 0.0761 0.272 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 1.94e-01 0.108 0.0827 0.272 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0523 0.0711 0.272 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 2.31e-01 0.079 0.0658 0.272 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 3.79e-01 0.0635 0.0721 0.272 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 4.02e-01 0.0844 0.1 0.274 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0445 0.105 0.274 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 8.63e-02 0.156 0.0908 0.274 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0376 0.0996 0.274 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 7.72e-01 0.0298 0.103 0.274 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 8.26e-01 0.0184 0.0837 0.274 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.77e-01 0.0147 0.0948 0.28 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 3.93e-02 -0.19 0.0914 0.28 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 7.56e-01 0.0372 0.119 0.28 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 9.36e-02 0.181 0.107 0.28 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 1.04e-01 0.182 0.111 0.28 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 1.55e-01 0.149 0.105 0.28 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 7.70e-01 -0.024 0.082 0.28 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 9.46e-01 0.00631 0.0935 0.28 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 6.35e-01 0.0435 0.0914 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0332 0.0689 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00185 0.0915 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 1.10e-01 0.164 0.102 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 5.02e-01 0.0619 0.0921 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 5.70e-01 0.0452 0.0794 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0556 0.0677 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0883 0.0993 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0895 0.076 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0492 0.0927 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 3.02e-02 0.235 0.107 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0316 0.102 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0587 0.0944 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 7.11e-01 0.0273 0.0736 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 6.08e-02 0.231 0.122 0.27 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 3.25e-01 -0.114 0.116 0.27 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 6.03e-01 0.0455 0.0874 0.27 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0608 0.115 0.27 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 1.25e-01 0.185 0.12 0.27 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0343 0.113 0.27 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 6.91e-01 0.0457 0.115 0.27 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 1.75e-01 0.153 0.112 0.27 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 2.21e-01 -0.126 0.103 0.27 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0359 0.1 0.28 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0356 0.0916 0.28 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0455 0.108 0.28 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 1.73e-01 0.137 0.1 0.28 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 6.77e-01 0.0435 0.104 0.28 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 9.49e-01 0.0065 0.101 0.28 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 8.16e-01 0.0205 0.0881 0.28 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 7.87e-02 0.173 0.0981 0.276 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 6.90e-01 0.0365 0.0913 0.276 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 7.54e-01 0.0343 0.109 0.276 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 8.51e-01 0.0179 0.0956 0.276 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 3.63e-02 0.192 0.0909 0.276 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 7.93e-01 0.0233 0.0884 0.276 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 2.15e-01 -0.102 0.082 0.276 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0471 0.12 0.282 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 1.03e-01 -0.17 0.103 0.282 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 1.18e-03 0.352 0.107 0.282 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 4.94e-02 0.215 0.109 0.282 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 3.22e-01 0.114 0.115 0.282 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 1.66e-01 0.139 0.1 0.282 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 5.21e-01 0.0501 0.0778 0.282 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 6.38e-01 0.0488 0.103 0.282 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0265 0.0495 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 5.02e-01 0.0669 0.0993 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 4.28e-05 -0.21 0.0503 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 3.96e-02 0.169 0.0814 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 5.34e-02 -0.163 0.0839 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 1.51e-01 0.137 0.0953 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 3.14e-01 0.072 0.0713 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 9.01e-01 0.0107 0.0856 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 2.12e-01 -0.123 0.0983 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 4.96e-01 0.0704 0.103 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 5.52e-02 0.196 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -865733 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0731 0.057 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0277 0.0936 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0575 0.046 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 5.01e-01 0.0446 0.0661 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 3.36e-02 -0.171 0.0801 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 7.79e-01 0.0259 0.0924 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 3.27e-01 0.0678 0.0691 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 8.45e-01 0.0142 0.0725 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -123461 sc-eQTL 9.49e-01 0.00671 0.105 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 7.58e-01 0.0329 0.107 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -581574 sc-eQTL 7.89e-01 -0.026 0.0971 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.02e-01 0.0211 0.0842 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0616 0.068 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0474 0.0876 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 6.60e-03 0.279 0.102 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 4.90e-01 0.0612 0.0886 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0251 0.0771 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0383 0.0632 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 1.03e-01 0.156 0.0952 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 7.71e-01 0.0244 0.0837 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0609 0.101 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 7.49e-01 0.0312 0.0974 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 1.27e-01 0.147 0.0963 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 9.58e-01 0.0044 0.084 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0633 0.0724 0.276 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504109 sc-eQTL 8.46e-01 0.0179 0.092 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 sc-eQTL 1.08e-01 -0.144 0.0892 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -214948 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000113 0.0615 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335906 sc-eQTL 5.30e-01 0.0593 0.0942 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208239 sc-eQTL 5.91e-01 0.0471 0.0875 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446138 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0324 0.0708 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261569 sc-eQTL 9.79e-02 0.157 0.0946 0.274 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -504174 sc-eQTL 2.33e-02 0.253 0.111 0.274 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -504109 eQTL 0.0382 0.042 0.0203 0.0 0.0 0.248
ENSG00000111666 CHPT1 -80936 eQTL 1.22e-04 -0.113 0.0292 0.0 0.0 0.248

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina