logo

Genes within 1Mb (chr12:101615828:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0223 0.0419 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 4.42e-01 0.0561 0.0728 0.284 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.66e-02 -0.106 0.0437 0.284 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 2.10e-01 0.0803 0.0639 0.284 B L1
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 8.54e-02 -0.125 0.0724 0.284 B L1
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 1.64e-01 0.0871 0.0624 0.284 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 1.75e-01 0.068 0.0499 0.284 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 8.01e-01 0.0144 0.0569 0.284 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0139 0.0904 0.284 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 7.16e-01 0.0316 0.0865 0.284 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00711 0.0807 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0597 0.0666 0.284 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 8.77e-01 -0.014 0.0901 0.284 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 3.84e-01 0.0545 0.0624 0.284 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0269 0.0691 0.284 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 3.10e-01 0.0686 0.0674 0.284 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0162 0.0473 0.284 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 7.35e-01 0.0279 0.0824 0.284 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 8.22e-01 0.0201 0.0893 0.284 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 1.34e-01 0.0877 0.0583 0.284 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 6.65e-01 -0.032 0.074 0.284 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0374 0.0816 0.284 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 6.61e-01 0.0255 0.058 0.284 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 2.08e-02 0.191 0.0821 0.284 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 2.46e-01 -0.109 0.094 0.288 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.24e-01 -0.132 0.0857 0.288 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 1.71e-01 0.13 0.0944 0.288 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 3.14e-01 0.102 0.101 0.288 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 2.49e-01 0.121 0.105 0.288 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 5.09e-01 0.0599 0.0905 0.288 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 4.47e-01 0.0568 0.0746 0.288 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 3.64e-01 0.0895 0.0983 0.288 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 5.32e-01 0.0491 0.0783 0.284 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0413 0.0663 0.284 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 7.64e-01 -0.025 0.0832 0.284 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 1.75e-02 0.219 0.0915 0.284 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 5.96e-01 0.0453 0.0853 0.284 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0463 0.075 0.284 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0442 0.0611 0.284 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.16e-01 0.00899 0.0851 0.285 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.37e-01 -0.117 0.0786 0.285 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0142 0.0573 0.285 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 4.68e-01 0.067 0.092 0.285 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 2.11e-01 0.106 0.0844 0.285 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0504 0.0638 0.285 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 7.63e-02 0.161 0.0902 0.285 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 3.45e-02 0.224 0.105 0.285 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 7.08e-01 0.0119 0.0319 0.284 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 3.13e-01 0.0613 0.0606 0.284 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.62e-01 -0.124 0.0883 0.284 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 9.23e-01 0.00618 0.064 0.284 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 8.11e-01 -0.024 0.1 0.284 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0401 0.0728 0.284 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0659 0.0646 0.284 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 8.65e-01 0.0132 0.0777 0.284 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0507 0.0646 0.284 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0319 0.0752 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0178 0.0207 0.286 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0347 0.107 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 3.41e-03 -0.23 0.0774 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 1.69e-01 0.155 0.112 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0718 0.109 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 5.18e-01 0.0728 0.113 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.72e-02 0.183 0.106 0.286 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0511 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0947 0.0882 0.286 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0234 0.0891 0.286 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 4.01e-01 0.0704 0.0836 0.286 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0213 0.0418 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 3.14e-01 0.105 0.104 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 2.50e-03 -0.167 0.0547 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 1.63e-01 0.115 0.0823 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 1.87e-01 -0.121 0.0915 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 3.33e-01 0.1 0.103 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 3.34e-01 0.0826 0.0852 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 5.69e-01 0.0522 0.0916 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 2.23e-01 -0.117 0.096 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 3.48e-01 0.0949 0.101 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 8.12e-01 0.0231 0.097 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0226 0.0386 0.282 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0224 0.102 0.282 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.05e-04 -0.254 0.0642 0.282 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 2.80e-01 0.0984 0.0909 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0133 0.1 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 1.62e-01 0.139 0.099 0.282 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 2.02e-01 0.113 0.0887 0.282 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 5.41e-01 0.0572 0.0933 0.282 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0445 0.096 0.282 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 3.87e-01 0.085 0.0981 0.282 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 3.63e-02 0.187 0.0885 0.282 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0126 0.053 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.34e-01 0.00796 0.0959 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.26e-01 -0.0761 0.0496 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 2.72e-01 0.0775 0.0703 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 6.88e-02 -0.152 0.0831 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0385 0.0934 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 1.58e-01 0.0996 0.0704 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 6.38e-01 0.0361 0.0766 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 9.51e-01 0.0064 0.104 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 6.71e-01 0.043 0.101 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 8.74e-01 0.0151 0.0949 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 1.33e-02 -0.114 0.0456 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0326 0.0948 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 8.01e-01 0.0128 0.0508 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0444 0.0786 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 2.40e-01 -0.107 0.0909 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 5.36e-01 0.062 0.1 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.48e-01 0.0168 0.0872 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0429 0.0863 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0327 0.0909 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 8.83e-02 -0.178 0.104 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0307 0.0904 0.283 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 4.35e-02 -0.208 0.102 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 2.22e-01 -0.126 0.103 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 8.33e-01 0.0191 0.0904 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 4.77e-01 0.0707 0.0993 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0294 0.105 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 2.30e-01 0.121 0.101 0.282 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0697 0.0762 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 7.07e-01 0.0332 0.0881 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 2.98e-02 0.147 0.0672 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 5.05e-01 0.0494 0.0739 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 8.23e-01 -0.018 0.0802 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0449 0.0559 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0306 0.0813 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0287 0.0938 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 7.99e-02 -0.127 0.0721 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 6.29e-02 -0.168 0.0901 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 4.41e-02 0.171 0.0842 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 3.25e-01 0.0549 0.0557 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 7.63e-01 0.0293 0.0969 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0605 0.0932 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 8.76e-01 -0.014 0.0899 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 3.93e-01 -0.083 0.0971 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 1.13e-01 0.145 0.0913 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0173 0.0823 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0816 0.0868 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0321 0.0892 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 6.56e-01 0.0319 0.0713 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00426 0.0965 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 5.16e-01 -0.062 0.0954 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0184 0.0814 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 1.86e-01 0.134 0.101 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00918 0.0935 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 5.10e-01 0.0612 0.0928 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 5.54e-02 0.159 0.0827 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 7.62e-01 0.0268 0.0887 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0318 0.0963 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 4.26e-01 0.0505 0.0634 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 2.96e-01 0.102 0.0977 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 7.49e-02 0.18 0.1 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0102 0.0907 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 8.40e-02 0.162 0.0931 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0755 0.102 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0362 0.101 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00647 0.09 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 1.67e-01 0.135 0.0977 0.282 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0662 0.1 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 6.19e-01 0.0471 0.0946 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 3.03e-01 0.104 0.101 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 2.69e-01 -0.12 0.108 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0778 0.104 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0149 0.0909 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 1.78e-01 0.135 0.0998 0.276 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 6.03e-01 0.0181 0.0347 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 6.12e-01 0.0494 0.0972 0.286 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0755 0.0947 0.286 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 3.18e-01 0.0839 0.0839 0.286 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 8.78e-01 0.0155 0.101 0.286 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0105 0.103 0.286 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 3.86e-01 -0.074 0.0853 0.286 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 4.90e-01 -0.067 0.0968 0.286 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 2.57e-01 -0.108 0.0947 0.286 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 7.35e-01 0.0285 0.0841 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 5.20e-01 0.0677 0.105 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 9.05e-01 0.00912 0.0762 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 3.05e-01 0.0902 0.0878 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 2.71e-01 0.113 0.102 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 1.38e-01 0.149 0.0999 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0985 0.0905 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 5.85e-02 0.18 0.0947 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 8.94e-01 0.0135 0.101 0.282 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.01e-01 0.0117 0.0943 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 5.66e-02 -0.175 0.0914 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0181 0.0697 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00417 0.0968 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 2.69e-01 0.103 0.0933 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00527 0.0802 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 1.88e-01 0.128 0.097 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 7.89e-03 0.289 0.108 0.284 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0437 0.0968 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0237 0.0994 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0177 0.0799 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 5.25e-01 0.0665 0.104 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0862 0.107 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 9.25e-01 0.00938 0.0991 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 2.22e-01 0.124 0.101 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 2.10e-01 0.126 0.0998 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0432 0.0948 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0801 0.0886 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 3.76e-01 0.0597 0.0673 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00813 0.094 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 6.17e-01 0.0473 0.0945 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00593 0.0745 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0338 0.097 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 1.76e-01 -0.142 0.104 0.284 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 5.00e-01 0.0536 0.0792 0.278 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 6.25e-01 0.0524 0.107 0.278 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 6.30e-01 0.04 0.0828 0.278 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 2.21e-01 -0.146 0.118 0.278 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 1.66e-01 0.189 0.136 0.278 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 9.71e-01 0.00302 0.0841 0.278 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 4.69e-03 -0.27 0.0936 0.278 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 2.85e-01 0.105 0.098 0.278 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 1.48e-01 -0.165 0.113 0.278 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 5.90e-01 0.0566 0.105 0.278 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 2.24e-01 -0.118 0.0964 0.278 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 4.08e-01 0.029 0.035 0.28 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 1.07e-01 0.114 0.0702 0.28 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0783 0.0935 0.28 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0584 0.0692 0.28 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 1.12e-01 -0.157 0.0983 0.28 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0722 0.0747 0.28 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 3.95e-01 0.0693 0.0812 0.28 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0446 0.0697 0.28 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 3.85e-01 0.0561 0.0645 0.28 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 6.26e-01 0.0345 0.0707 0.28 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 2.54e-01 0.113 0.0985 0.284 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0332 0.103 0.284 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 2.07e-01 0.113 0.0894 0.284 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0181 0.0977 0.284 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 9.84e-01 0.00202 0.101 0.284 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.85e-01 0.0119 0.0821 0.284 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00719 0.0926 0.29 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 7.09e-02 -0.163 0.0895 0.29 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 7.84e-01 0.0319 0.116 0.29 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 5.72e-02 0.2 0.105 0.29 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 7.86e-02 0.192 0.109 0.29 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 1.68e-01 0.142 0.102 0.29 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0266 0.0801 0.29 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 9.18e-01 0.00945 0.0913 0.29 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 5.86e-01 0.049 0.0897 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0446 0.0676 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 5.94e-01 0.0478 0.0897 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 1.51e-01 0.145 0.1 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 7.26e-01 0.0318 0.0904 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 9.00e-01 0.00978 0.078 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0661 0.0663 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0489 0.0973 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.71e-01 -0.102 0.0743 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0234 0.0908 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 4.06e-02 0.217 0.105 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0427 0.0999 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0723 0.0923 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 8.49e-01 0.0137 0.072 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 5.27e-02 0.232 0.119 0.282 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.99e-01 -0.145 0.112 0.282 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0161 0.085 0.282 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0263 0.112 0.282 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 1.32e-01 0.177 0.117 0.282 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0395 0.11 0.282 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 8.28e-01 0.0243 0.112 0.282 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 1.61e-01 0.153 0.109 0.282 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 1.45e-01 -0.146 0.0996 0.282 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00587 0.0981 0.291 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0374 0.0897 0.291 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 7.12e-01 -0.039 0.105 0.291 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 1.49e-01 0.142 0.0981 0.291 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 6.11e-01 0.0519 0.102 0.291 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00385 0.0987 0.291 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 5.84e-01 0.0473 0.0862 0.291 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 1.22e-01 0.149 0.096 0.287 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00195 0.0892 0.287 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 7.86e-01 0.029 0.107 0.287 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 8.49e-01 0.0178 0.0934 0.287 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 5.38e-02 0.173 0.0889 0.287 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.72e-01 0.014 0.0863 0.287 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0753 0.0802 0.287 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 3.89e-01 -0.102 0.118 0.291 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.97e-01 -0.133 0.103 0.291 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 1.68e-03 0.339 0.106 0.291 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 1.01e-01 0.178 0.108 0.291 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 2.52e-01 0.131 0.114 0.291 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 1.99e-01 0.128 0.0994 0.291 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 5.43e-01 0.0471 0.0772 0.291 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 5.81e-01 0.0567 0.102 0.291 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0118 0.0486 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 6.20e-01 0.0484 0.0975 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.35e-05 -0.219 0.0491 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 5.73e-02 0.153 0.08 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 9.01e-02 -0.14 0.0825 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 3.00e-01 0.0974 0.0937 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 1.48e-01 0.101 0.0698 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 8.62e-01 0.0146 0.084 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 1.91e-01 -0.126 0.0964 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 3.39e-01 0.0968 0.101 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 3.30e-02 0.213 0.0994 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -865916 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0611 0.056 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.39e-01 0.00699 0.0918 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0552 0.0452 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 3.81e-01 0.0569 0.0648 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 4.65e-02 -0.158 0.0787 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0227 0.0906 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 3.65e-01 0.0615 0.0678 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 8.95e-01 -0.00938 0.0712 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -123644 sc-eQTL 9.55e-01 0.0058 0.103 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0176 0.105 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -581757 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0395 0.0952 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 6.93e-01 0.0326 0.0825 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0723 0.0665 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 9.27e-01 0.00792 0.0859 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 9.08e-03 0.263 0.0999 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 7.08e-01 0.0325 0.0868 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0483 0.0755 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0544 0.0619 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 1.14e-01 0.148 0.0933 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00176 0.082 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0609 0.0992 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 5.92e-01 0.0512 0.0954 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 1.65e-01 0.132 0.0944 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0151 0.0823 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0395 0.071 0.287 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -504292 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000161 0.0904 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 sc-eQTL 1.49e-01 -0.127 0.0877 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -215131 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0278 0.0604 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 335723 sc-eQTL 5.56e-01 0.0546 0.0926 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 208056 sc-eQTL 4.68e-01 0.0625 0.0859 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -446321 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0243 0.0696 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -261752 sc-eQTL 7.61e-02 0.165 0.0928 0.284 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -504357 sc-eQTL 3.26e-02 0.234 0.109 0.284 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -81119 eQTL 1.55e-04 -0.11 0.029 0.0 0.0 0.252

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina