Genes within 1Mb (chr12:101606582:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 4.75e-01 0.0381 0.0532 0.141 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 5.22e-01 0.0595 0.0926 0.141 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 1.38e-01 -0.0835 0.0561 0.141 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 7.31e-01 0.0281 0.0815 0.141 B L1
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 4.39e-02 -0.186 0.0918 0.141 B L1
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 5.45e-01 0.0483 0.0796 0.141 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.26e-01 0.0224 0.0638 0.141 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 7.09e-01 0.027 0.0723 0.141 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0108 0.115 0.141 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0978 0.11 0.141 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 8.97e-01 0.0133 0.103 0.141 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0479 0.0837 0.141 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0184 0.113 0.141 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 6.19e-01 0.0391 0.0783 0.141 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.87e-01 0.0349 0.0866 0.141 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 4.35e-01 0.0661 0.0846 0.141 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.34e-01 0.0573 0.0592 0.141 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0679 0.104 0.141 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 6.56e-01 0.0502 0.112 0.141 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 9.01e-01 0.00922 0.0739 0.141 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 7.12e-01 0.0344 0.0932 0.141 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 5.34e-01 -0.064 0.103 0.141 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0192 0.0731 0.141 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0365 0.105 0.141 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0481 0.119 0.14 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0599 0.108 0.14 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0605 0.119 0.14 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 3.50e-01 0.119 0.128 0.14 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 3.97e-01 0.112 0.132 0.14 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 2.07e-01 0.143 0.113 0.14 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 1.61e-02 0.225 0.0926 0.14 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 8.55e-02 0.212 0.123 0.14 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0231 0.0981 0.141 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00617 0.0831 0.141 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000188 0.104 0.141 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 1.06e-01 0.187 0.115 0.141 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 2.92e-01 -0.113 0.107 0.141 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0917 0.0939 0.141 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0999 0.0764 0.141 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 7.08e-01 -0.04 0.107 0.142 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0805 0.0989 0.142 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0579 0.0717 0.142 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00993 0.115 0.142 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 4.83e-01 0.0746 0.106 0.142 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0166 0.08 0.142 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 8.38e-01 0.0233 0.114 0.142 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 1.02e-01 0.218 0.133 0.142 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 4.02e-01 0.0339 0.0403 0.141 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 3.30e-01 0.0749 0.0767 0.141 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0924 0.112 0.141 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 5.11e-01 0.0533 0.0809 0.141 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 2.63e-01 0.142 0.126 0.141 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00249 0.0922 0.141 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0798 0.0818 0.141 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00153 0.0983 0.141 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 2.01e-01 -0.105 0.0816 0.141 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 4.14e-01 0.0778 0.0951 0.141 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 6.74e-01 0.0108 0.0258 0.138 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 8.00e-01 -0.034 0.134 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 2.10e-03 -0.3 0.0961 0.138 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 1.08e-01 0.225 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 4.53e-01 -0.102 0.136 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 5.39e-01 0.0862 0.14 0.138 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 9.47e-02 0.223 0.133 0.138 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 8.75e-01 0.0212 0.134 0.138 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 2.64e-01 -0.123 0.11 0.138 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0465 0.111 0.138 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 1.97e-01 0.134 0.104 0.138 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 3.98e-01 0.045 0.0531 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000747 0.133 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 1.53e-04 -0.265 0.0688 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 9.07e-01 0.0124 0.105 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 3.21e-01 -0.116 0.117 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0804 0.131 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.34e-01 0.105 0.108 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 3.75e-01 -0.104 0.116 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0604 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 2.33e-01 0.153 0.128 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 4.50e-01 0.0933 0.123 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 9.14e-01 0.00532 0.0489 0.14 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 7.83e-01 0.0357 0.129 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 1.88e-03 -0.26 0.0825 0.14 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 3.80e-01 0.102 0.115 0.14 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0461 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 7.55e-01 0.0394 0.126 0.14 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 8.01e-01 0.0285 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 6.61e-01 0.0519 0.118 0.14 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 4.83e-02 -0.24 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 9.07e-01 0.0146 0.125 0.14 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 7.13e-02 0.204 0.113 0.14 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 8.51e-01 0.0128 0.0677 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 9.91e-01 0.00132 0.123 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0742 0.0635 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 3.36e-01 0.0867 0.0899 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 3.39e-01 -0.102 0.107 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 9.17e-01 0.0124 0.119 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.29e-01 0.0313 0.0903 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 2.26e-01 0.118 0.0976 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0644 0.133 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 2.69e-01 -0.143 0.129 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 5.17e-01 0.0785 0.121 0.141 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 2.00e-01 -0.076 0.0592 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 8.66e-02 0.208 0.121 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 2.66e-01 0.0725 0.065 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0657 0.101 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 4.89e-02 -0.23 0.116 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0529 0.129 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.89e-01 0.0966 0.112 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0111 0.111 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 5.45e-01 0.0707 0.117 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 2.57e-01 -0.153 0.134 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0663 0.116 0.142 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 1.07e-01 -0.215 0.133 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 5.14e-02 -0.26 0.133 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0378 0.117 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 3.88e-01 -0.111 0.129 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 9.57e-01 0.00736 0.137 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 6.49e-01 0.0597 0.131 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 5.82e-01 -0.053 0.0961 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.57e-01 0.0201 0.111 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 1.02e-01 0.14 0.085 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 4.38e-01 0.0723 0.093 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0398 0.101 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 2.71e-01 0.0775 0.0703 0.141 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0757 0.102 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0764 0.118 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 2.31e-01 -0.109 0.0911 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0631 0.114 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 9.41e-03 0.276 0.105 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 5.32e-01 0.0439 0.0702 0.141 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 2.56e-01 -0.138 0.121 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00437 0.117 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0602 0.113 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0184 0.122 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 3.10e-01 0.117 0.115 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.07e-01 -0.105 0.103 0.141 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0987 0.111 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0576 0.114 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0339 0.0909 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0736 0.123 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 1.36e-01 -0.181 0.121 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 9.61e-01 0.00503 0.104 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 5.72e-01 -0.073 0.129 0.141 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0786 0.119 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.11e-01 0.0284 0.119 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 1.15e-01 0.168 0.106 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.31e-01 0.0545 0.113 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 8.26e-01 0.0271 0.123 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.06e-01 0.0306 0.0811 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 8.04e-01 0.0311 0.125 0.141 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0296 0.133 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 4.27e-01 0.0944 0.119 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 2.51e-01 0.141 0.123 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0387 0.134 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0235 0.132 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0839 0.118 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0742 0.129 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 2.18e-01 -0.156 0.126 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.82e-01 0.0178 0.12 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0486 0.128 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 4.59e-01 -0.102 0.137 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 4.37e-02 -0.264 0.13 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 2.60e-01 -0.129 0.114 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 8.62e-01 -0.022 0.127 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0578 0.0438 0.141 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 9.01e-01 0.0153 0.123 0.141 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0855 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 2.68e-02 0.235 0.105 0.141 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 5.97e-02 0.24 0.127 0.141 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 3.49e-01 -0.122 0.13 0.141 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 5.63e-01 0.0626 0.108 0.141 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0707 0.123 0.141 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0334 0.12 0.141 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 1.10e-01 0.17 0.106 0.141 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 9.76e-01 0.00394 0.133 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.29e-01 0.0207 0.096 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 3.11e-01 -0.112 0.111 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 7.48e-01 0.0417 0.129 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 6.47e-01 0.0581 0.126 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 2.29e-02 -0.259 0.113 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 5.48e-02 0.23 0.119 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 7.65e-01 0.0381 0.127 0.14 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 3.66e-01 -0.107 0.118 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.29e-02 -0.2 0.115 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0117 0.0873 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.37e-01 0.0572 0.121 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 2.05e-01 0.148 0.117 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.84e-01 0.0876 0.1 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 9.08e-01 0.0141 0.122 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 4.36e-02 0.276 0.136 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 5.58e-01 0.0727 0.124 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 3.46e-01 0.12 0.127 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0902 0.102 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 9.22e-01 0.013 0.134 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 2.53e-01 -0.156 0.136 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 6.50e-01 0.0576 0.127 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 3.11e-01 0.132 0.13 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 7.35e-02 0.229 0.127 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 9.45e-01 0.00837 0.121 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 9.86e-01 0.00198 0.113 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 9.62e-01 0.00407 0.0857 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 8.25e-02 -0.207 0.119 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00383 0.12 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0775 0.0946 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 4.20e-02 -0.25 0.122 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 1.64e-01 -0.185 0.133 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 2.87e-01 0.0996 0.093 0.148 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 3.88e-01 -0.109 0.125 0.148 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 6.01e-01 0.0512 0.0975 0.148 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 4.75e-01 -0.1 0.14 0.148 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.34e-01 0.0768 0.161 0.148 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 7.78e-01 0.0279 0.099 0.148 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 9.39e-02 -0.191 0.113 0.148 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 9.53e-02 0.193 0.115 0.148 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 1.16e-01 -0.211 0.133 0.148 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0159 0.123 0.148 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 8.07e-01 0.0279 0.114 0.148 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 1.60e-01 0.0617 0.0437 0.137 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 1.20e-01 0.137 0.0881 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 3.65e-01 0.106 0.117 0.137 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0913 0.0867 0.137 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00555 0.124 0.137 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0319 0.0938 0.137 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 5.66e-01 0.0586 0.102 0.137 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 5.78e-01 0.0487 0.0874 0.137 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0152 0.081 0.137 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 5.19e-01 0.0572 0.0886 0.137 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 4.53e-01 0.0941 0.125 0.141 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 9.68e-01 0.00531 0.13 0.141 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 2.39e-01 0.134 0.113 0.141 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.56e-01 0.0552 0.124 0.141 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 4.62e-02 -0.255 0.127 0.141 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.84e-01 0.0285 0.104 0.141 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 3.13e-01 0.118 0.116 0.141 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 1.65e-01 -0.158 0.113 0.141 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 6.79e-01 0.0609 0.147 0.141 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 1.70e-02 0.316 0.131 0.141 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 1.55e-01 0.196 0.137 0.141 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 8.52e-01 0.0241 0.13 0.141 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 9.81e-01 0.00246 0.101 0.141 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 7.17e-02 0.207 0.114 0.141 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 6.97e-01 0.0435 0.112 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.13e-01 -0.02 0.0843 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 2.85e-01 0.12 0.112 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.14e-01 0.0635 0.126 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 3.66e-01 -0.102 0.112 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0277 0.0972 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 1.52e-01 -0.119 0.0825 0.141 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 1.66e-01 -0.169 0.122 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0134 0.0939 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 1.33e-01 -0.171 0.114 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.74e-01 0.0563 0.134 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 1.84e-01 -0.167 0.125 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 9.15e-02 -0.196 0.115 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 9.45e-01 0.00631 0.0906 0.141 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 1.19e-01 0.242 0.154 0.139 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 2.59e-01 -0.165 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0691 0.11 0.139 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0935 0.145 0.139 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 5.12e-01 0.1 0.152 0.139 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 2.04e-02 -0.327 0.139 0.139 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 3.19e-01 0.144 0.144 0.139 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0629 0.142 0.139 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 6.69e-01 0.0555 0.13 0.139 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 6.56e-01 0.0543 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0148 0.112 0.144 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0454 0.131 0.144 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 1.89e-01 0.161 0.122 0.144 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 1.58e-01 0.179 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 9.45e-01 0.00845 0.123 0.144 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0202 0.107 0.144 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 6.56e-02 0.223 0.121 0.145 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 5.98e-01 0.0592 0.112 0.145 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 4.82e-01 0.0946 0.134 0.145 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.92e-01 0.0466 0.118 0.145 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 8.46e-01 0.022 0.113 0.145 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 9.03e-01 0.0133 0.109 0.145 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0362 0.101 0.145 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 3.02e-01 -0.158 0.153 0.136 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 9.81e-01 0.00322 0.133 0.136 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 8.06e-01 0.0348 0.141 0.136 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 9.48e-01 0.00921 0.141 0.136 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 5.27e-01 0.0936 0.148 0.136 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 2.25e-03 0.389 0.125 0.136 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 1.41e-02 0.243 0.0978 0.136 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 7.26e-01 0.0464 0.132 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 2.32e-01 0.0736 0.0614 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 8.56e-01 0.0225 0.124 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 9.65e-05 -0.25 0.0628 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 2.58e-01 0.116 0.102 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 1.58e-01 -0.149 0.105 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0948 0.119 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 3.17e-01 0.089 0.0888 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0984 0.106 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 2.68e-01 -0.136 0.122 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 3.34e-01 0.124 0.128 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 1.83e-02 0.299 0.126 0.141 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -875162 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0177 0.0714 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 2.13e-01 0.145 0.116 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0236 0.0576 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 8.27e-01 0.0181 0.0825 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 6.12e-02 -0.189 0.1 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0214 0.115 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.30e-01 0.0298 0.0863 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 4.04e-01 0.0755 0.0904 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -132890 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0502 0.131 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 3.92e-01 -0.114 0.133 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -591003 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0421 0.121 0.141 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0522 0.103 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0299 0.0834 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 8.28e-01 0.0233 0.107 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 3.03e-01 0.131 0.127 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 2.35e-01 -0.129 0.108 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0993 0.0942 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 1.81e-01 -0.104 0.0771 0.141 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 8.53e-02 0.203 0.118 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 6.51e-01 0.0469 0.103 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00317 0.125 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 9.34e-02 0.202 0.12 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 4.64e-01 0.0877 0.12 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 9.88e-01 0.00152 0.104 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 5.47e-01 -0.054 0.0895 0.142 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -513538 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0423 0.113 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -90365 sc-eQTL 3.04e-01 -0.114 0.11 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -224377 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0579 0.0755 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 326477 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0415 0.116 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 198810 sc-eQTL 7.81e-01 0.03 0.108 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -455567 sc-eQTL 7.54e-01 0.0274 0.0872 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -270998 sc-eQTL 9.68e-01 0.00467 0.117 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -513603 sc-eQTL 1.19e-01 0.215 0.137 0.142 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139351 SYCP3 -132887 eQTL 0.0469 -0.116 0.0583 0.0 0.0 0.103


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -875162 2.6e-07 1.08e-07 3.62e-08 1.7e-07 9.91e-08 9.13e-08 1.39e-07 5.24e-08 1.36e-07 4.23e-08 1.61e-07 7.6e-08 1.21e-07 6.07e-08 5.14e-08 7.76e-08 5.12e-08 1.06e-07 5.22e-08 3.74e-08 1.03e-07 1.31e-07 1.31e-07 4.99e-08 1.32e-07 1.13e-07 1.11e-07 8.45e-08 1.03e-07 1.09e-07 9.5e-08 3.76e-08 2.74e-08 8.3e-08 9.02e-08 4.02e-08 5.54e-08 9.26e-08 8.42e-08 3.34e-08 3.34e-08 1.37e-07 4.01e-08 1.7e-08 8.03e-08 1.75e-08 1.37e-07 4.41e-09 4.91e-08