logo

Genes within 1Mb (chr12:101604677:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0547 0.0543 0.124 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 8.31e-01 0.0202 0.0946 0.124 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 6.23e-02 -0.107 0.0571 0.124 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 7.05e-02 0.15 0.0826 0.124 B L1
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 8.27e-01 0.0208 0.0946 0.124 B L1
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 2.24e-01 0.0988 0.0811 0.124 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 4.72e-01 0.0468 0.065 0.124 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 6.90e-01 0.0294 0.0738 0.124 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 3.51e-01 -0.109 0.117 0.124 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 1.35e-01 0.168 0.112 0.124 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0118 0.105 0.124 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0714 0.0858 0.124 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 3.58e-01 -0.107 0.116 0.124 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 2.44e-01 0.0936 0.0802 0.124 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0543 0.0889 0.124 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 8.24e-01 0.0194 0.0869 0.124 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0921 0.0605 0.124 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 8.09e-01 0.0259 0.107 0.124 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 3.67e-01 -0.105 0.116 0.124 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.65e-02 0.13 0.0755 0.124 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0639 0.0959 0.124 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 9.45e-01 0.00734 0.106 0.124 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 3.15e-01 0.0757 0.0751 0.124 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 1.65e-03 0.336 0.105 0.124 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 3.95e-01 -0.101 0.119 0.128 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.06e-01 -0.175 0.108 0.128 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.22e-03 0.313 0.117 0.128 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 4.65e-01 0.0936 0.128 0.128 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 3.68e-01 0.119 0.132 0.128 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0322 0.114 0.128 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0848 0.0939 0.128 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0214 0.124 0.128 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 4.12e-01 0.0836 0.102 0.124 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 2.18e-01 -0.106 0.0859 0.124 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0184 0.108 0.124 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 5.46e-01 0.0729 0.12 0.124 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 5.57e-02 0.212 0.11 0.124 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0976 0.124 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 5.06e-01 0.0529 0.0795 0.124 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 8.18e-01 0.0254 0.11 0.124 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 7.06e-02 -0.184 0.101 0.124 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 7.18e-01 0.0267 0.0739 0.124 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 3.77e-01 0.105 0.119 0.124 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 4.59e-01 0.0811 0.109 0.124 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.16e-01 -0.102 0.0821 0.124 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 2.75e-02 0.257 0.116 0.124 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 4.50e-01 0.104 0.137 0.124 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 8.35e-01 -0.00869 0.0418 0.124 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0198 0.0796 0.124 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.55e-01 -0.165 0.116 0.124 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0129 0.0839 0.124 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 2.50e-01 -0.151 0.131 0.124 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0422 0.0955 0.124 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00548 0.0849 0.124 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 6.92e-01 0.0404 0.102 0.124 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 9.75e-01 0.00264 0.0848 0.124 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 7.62e-02 -0.174 0.0979 0.124 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 8.89e-02 -0.0433 0.0253 0.133 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 9.95e-01 0.000782 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0754 0.0976 0.133 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.47e-01 0.0269 0.139 0.133 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 3.84e-01 -0.117 0.134 0.133 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00331 0.139 0.133 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0502 0.132 0.133 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0575 0.133 0.133 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0142 0.109 0.133 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 9.32e-01 0.00941 0.11 0.133 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 9.50e-01 0.00644 0.103 0.133 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 1.58e-01 -0.076 0.0536 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 5.50e-01 0.0801 0.134 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0302 0.072 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.33e-01 0.159 0.106 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0136 0.118 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 3.37e-02 0.282 0.132 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000617 0.11 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 6.90e-02 0.214 0.117 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 2.41e-01 -0.146 0.124 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 7.82e-01 0.0361 0.13 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0606 0.125 0.124 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 1.67e-01 -0.068 0.0491 0.123 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0239 0.13 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 9.05e-02 -0.144 0.0844 0.123 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 2.16e-01 0.144 0.116 0.123 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 5.30e-01 0.0803 0.128 0.123 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 1.11e-01 0.202 0.126 0.123 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 5.87e-01 0.0618 0.114 0.123 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 7.44e-01 0.0389 0.119 0.123 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 2.21e-01 0.15 0.122 0.123 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 2.92e-01 0.132 0.125 0.123 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 5.65e-01 0.0658 0.114 0.123 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0507 0.069 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 9.24e-01 0.012 0.125 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0867 0.0647 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 4.77e-01 0.0654 0.0918 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 2.56e-01 -0.124 0.109 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 6.34e-01 -0.058 0.122 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 1.16e-01 0.144 0.0916 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00724 0.0999 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0817 0.136 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 8.22e-02 0.229 0.131 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0232 0.124 0.124 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 5.13e-02 -0.118 0.0602 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 1.65e-02 -0.297 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0645 0.0665 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 4.82e-01 0.0727 0.103 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 5.84e-01 0.0657 0.12 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 5.01e-01 0.0886 0.131 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0566 0.114 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 9.02e-01 0.0139 0.113 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0691 0.119 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 4.26e-01 -0.11 0.137 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 8.87e-01 0.0169 0.119 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 2.77e-01 -0.143 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 8.29e-01 0.0286 0.132 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.97e-01 0.149 0.115 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 2.10e-02 0.292 0.125 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 7.78e-01 -0.038 0.135 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 1.51e-01 0.186 0.129 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0478 0.0987 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0712 0.114 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 9.35e-02 0.147 0.0873 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 7.20e-01 0.0343 0.0956 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0268 0.104 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 4.49e-02 -0.145 0.0717 0.124 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0295 0.104 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0975 0.12 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 3.89e-01 -0.08 0.0927 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 1.69e-01 -0.16 0.116 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0142 0.109 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 4.67e-01 0.0519 0.0712 0.124 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 1.83e-01 0.165 0.123 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.16e-01 -0.187 0.118 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 2.36e-01 0.136 0.114 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 1.60e-01 -0.174 0.123 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 4.80e-01 0.0828 0.117 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 5.89e-01 0.0567 0.105 0.124 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0762 0.113 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0736 0.116 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 3.57e-01 0.0854 0.0925 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 6.88e-01 0.0503 0.125 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 4.06e-01 0.103 0.124 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0494 0.106 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 5.30e-02 0.254 0.13 0.124 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00731 0.12 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0685 0.119 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 9.50e-02 0.178 0.106 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 6.22e-01 0.056 0.113 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 6.27e-01 -0.06 0.123 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 4.98e-01 0.0551 0.0811 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 4.16e-01 0.102 0.125 0.124 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 4.09e-01 0.106 0.128 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 2.11e-01 -0.143 0.114 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 2.31e-01 0.142 0.118 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0501 0.129 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 9.70e-01 0.00474 0.127 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 5.46e-01 0.0688 0.114 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 6.14e-03 0.337 0.122 0.127 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 5.74e-01 0.075 0.133 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 8.63e-01 0.0218 0.126 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.12e-01 0.214 0.134 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 2.95e-01 -0.152 0.144 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 4.12e-01 0.114 0.138 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.00e-01 0.155 0.121 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 3.65e-02 0.278 0.132 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 2.55e-02 0.101 0.0449 0.126 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00954 0.127 0.126 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0739 0.124 0.126 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 2.53e-01 -0.126 0.11 0.126 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 2.09e-01 -0.166 0.131 0.126 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 4.65e-01 0.0985 0.134 0.126 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.17e-01 -0.138 0.111 0.126 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 8.40e-01 0.0257 0.127 0.126 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0792 0.124 0.126 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 8.75e-02 -0.188 0.109 0.126 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 8.76e-01 0.0214 0.137 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0446 0.099 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 4.21e-02 0.232 0.113 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 2.87e-01 0.142 0.133 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 1.38e-01 0.193 0.13 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 4.42e-01 0.0908 0.118 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 1.80e-01 0.166 0.124 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0146 0.131 0.122 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 5.74e-01 0.0686 0.122 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.35e-01 -0.178 0.118 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0175 0.09 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 3.64e-01 -0.113 0.125 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00841 0.121 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.17e-01 -0.128 0.103 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 1.39e-01 0.186 0.125 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 3.06e-01 0.145 0.141 0.123 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0558 0.125 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 9.14e-02 -0.215 0.127 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 4.17e-01 0.0835 0.103 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 6.20e-01 0.0666 0.134 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 7.22e-01 0.0488 0.137 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0576 0.127 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 7.72e-01 0.038 0.131 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 7.09e-01 0.0481 0.129 0.123 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0693 0.122 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 9.47e-02 -0.19 0.113 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.88e-01 0.114 0.0862 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 9.09e-02 0.204 0.12 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 4.04e-01 0.101 0.121 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 9.38e-01 0.00744 0.0956 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 1.27e-01 0.19 0.124 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 3.62e-01 -0.123 0.134 0.123 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00928 0.0976 0.115 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 1.29e-01 0.199 0.13 0.115 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0134 0.102 0.115 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0198 0.146 0.115 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 4.38e-01 0.131 0.168 0.115 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0583 0.103 0.115 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.25e-01 -0.145 0.119 0.115 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0216 0.121 0.115 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 9.88e-01 0.00219 0.141 0.115 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 4.48e-01 0.0979 0.129 0.115 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 1.73e-01 -0.162 0.118 0.115 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0085 0.0458 0.124 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 4.27e-01 0.0734 0.0922 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 4.12e-02 -0.249 0.121 0.124 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 7.90e-01 0.0241 0.0905 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 1.56e-01 -0.183 0.129 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0335 0.0977 0.124 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.27e-01 0.0516 0.106 0.124 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 2.47e-01 -0.105 0.0908 0.124 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 4.84e-01 0.0591 0.0843 0.124 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 8.10e-01 0.0223 0.0924 0.124 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 3.00e-01 0.133 0.128 0.124 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.05e-01 -0.217 0.133 0.124 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00926 0.117 0.124 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0644 0.127 0.124 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 1.04e-01 0.214 0.131 0.124 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0462 0.107 0.124 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 2.92e-01 -0.122 0.116 0.127 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 2.80e-01 -0.122 0.113 0.127 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.84e-01 0.0214 0.146 0.127 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 6.75e-01 0.0555 0.132 0.127 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 2.47e-01 0.159 0.137 0.127 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 3.39e-01 0.123 0.128 0.127 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0128 0.1 0.127 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 7.43e-02 -0.204 0.113 0.127 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0298 0.116 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0941 0.087 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0504 0.116 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 5.01e-01 0.0877 0.13 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 1.51e-01 0.167 0.116 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.33e-01 0.0481 0.101 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 8.84e-01 0.0125 0.0858 0.124 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 4.23e-01 0.0993 0.124 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.16e-01 -0.149 0.0944 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.36e-01 0.172 0.115 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 4.16e-02 0.275 0.134 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 3.28e-01 0.124 0.127 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 5.54e-01 0.0697 0.117 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 6.05e-01 0.0475 0.0916 0.124 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 6.43e-01 0.0729 0.157 0.118 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 2.27e-01 -0.178 0.147 0.118 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 5.26e-01 0.0705 0.111 0.118 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 9.11e-01 0.0165 0.147 0.118 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 3.99e-01 0.13 0.153 0.118 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.09e-01 0.18 0.143 0.118 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0938 0.145 0.118 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 3.76e-02 0.296 0.141 0.118 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 2.89e-02 -0.284 0.129 0.118 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0923 0.126 0.127 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 2.49e-01 -0.133 0.115 0.127 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0262 0.136 0.127 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0368 0.127 0.127 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0873 0.132 0.127 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 3.68e-01 -0.115 0.127 0.127 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 4.40e-01 0.086 0.111 0.127 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 6.41e-01 0.0584 0.125 0.122 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.26e-01 -0.177 0.115 0.122 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 9.69e-01 0.00538 0.138 0.122 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0741 0.121 0.122 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 7.95e-02 0.203 0.115 0.122 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0685 0.112 0.122 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 3.37e-01 -0.1 0.104 0.122 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 6.79e-01 0.059 0.142 0.13 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 6.32e-02 -0.229 0.122 0.13 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.10e-04 0.495 0.125 0.13 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 3.89e-02 0.268 0.129 0.13 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 1.78e-01 0.184 0.136 0.13 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0478 0.12 0.13 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 2.63e-01 -0.103 0.0921 0.13 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 4.88e-01 0.0853 0.123 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0999 0.0619 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 8.75e-01 0.0197 0.125 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.57e-01 -0.093 0.0655 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.44e-01 0.151 0.103 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0267 0.107 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 2.87e-02 0.263 0.119 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00577 0.09 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 1.19e-01 0.168 0.107 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0862 0.124 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 5.40e-01 0.0797 0.13 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 8.99e-01 0.0164 0.129 0.124 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -877067 sc-eQTL 1.23e-01 -0.113 0.0729 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 3.12e-01 -0.121 0.12 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0894 0.0589 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 1.41e-01 0.125 0.0844 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0522 0.104 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0253 0.118 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 3.47e-01 0.0835 0.0885 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0358 0.0929 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -134795 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0798 0.134 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 4.65e-01 0.0998 0.136 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -592908 sc-eQTL 8.91e-01 -0.017 0.124 0.124 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 5.25e-01 0.0675 0.106 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.63e-01 -0.119 0.0854 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00391 0.11 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 8.31e-02 0.226 0.13 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 5.67e-02 0.212 0.111 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 9.36e-01 0.0078 0.0971 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 5.80e-01 0.0441 0.0796 0.124 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 6.79e-01 0.0501 0.121 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 9.95e-02 -0.174 0.105 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0574 0.128 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 1.37e-01 -0.183 0.122 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 4.51e-01 0.0923 0.122 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.86e-01 -0.113 0.106 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00761 0.0916 0.125 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515443 sc-eQTL 7.94e-01 0.0303 0.116 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 sc-eQTL 1.01e-01 -0.185 0.113 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226282 sc-eQTL 9.02e-01 0.00961 0.0776 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324572 sc-eQTL 3.61e-01 0.109 0.119 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196905 sc-eQTL 6.08e-01 0.0567 0.11 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457472 sc-eQTL 2.15e-01 -0.111 0.0892 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -272903 sc-eQTL 3.08e-02 0.258 0.119 0.123 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -515508 sc-eQTL 4.31e-01 0.111 0.141 0.123 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -92270 eQTL 1.77e-05 -0.154 0.0358 0.0 0.0 0.132

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina