logo

Genes within 1Mb (chr12:101604425:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 6.41e-01 0.0283 0.0606 0.1 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0195 0.106 0.1 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 4.75e-04 0.221 0.0623 0.1 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 2.11e-01 -0.116 0.0925 0.1 B L1
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0182 0.106 0.1 B L1
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 3.02e-01 0.0937 0.0905 0.1 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 8.32e-01 0.0154 0.0726 0.1 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 4.45e-01 -0.063 0.0823 0.1 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 3.65e-01 0.118 0.131 0.1 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 3.41e-01 -0.119 0.125 0.1 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 9.45e-02 0.195 0.116 0.1 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0433 0.0956 0.1 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.83e-04 0.476 0.125 0.1 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0922 0.0893 0.1 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0819 0.0989 0.1 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 7.13e-02 -0.174 0.0961 0.1 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 2.54e-01 0.0773 0.0676 0.1 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.28e-03 -0.306 0.117 0.1 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 7.72e-04 0.427 0.125 0.1 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 1.22e-01 -0.13 0.0839 0.1 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 2.84e-01 -0.114 0.106 0.1 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 6.64e-01 0.051 0.117 0.1 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 9.24e-02 0.14 0.0829 0.1 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00204 0.12 0.1 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 2.04e-02 -0.31 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 2.87e-01 0.131 0.122 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 7.19e-02 -0.242 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 2.48e-01 -0.167 0.144 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 6.56e-01 0.0668 0.15 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 2.91e-01 0.136 0.129 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0465 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 7.67e-01 0.0416 0.14 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 2.78e-01 -0.122 0.112 0.1 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 2.59e-01 0.107 0.0946 0.1 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 2.50e-01 0.137 0.119 0.1 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 9.00e-02 -0.225 0.132 0.1 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0791 0.122 0.1 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 9.91e-01 0.00123 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.97e-01 0.0341 0.0876 0.1 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 4.18e-02 -0.244 0.119 0.101 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 6.96e-04 0.374 0.109 0.101 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 3.31e-01 0.0787 0.0807 0.101 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 8.89e-01 0.0182 0.13 0.101 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0722 0.12 0.101 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 3.62e-01 0.0823 0.09 0.101 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0476 0.128 0.101 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 2.92e-01 -0.159 0.15 0.101 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000819 0.0461 0.1 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 8.88e-01 0.0124 0.0878 0.1 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 2.25e-02 0.291 0.127 0.1 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0685 0.0924 0.1 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 2.32e-01 0.173 0.144 0.1 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0624 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 2.61e-01 0.105 0.0934 0.1 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 1.62e-01 0.157 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 5.23e-02 -0.181 0.0927 0.1 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0443 0.109 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 5.57e-01 0.0182 0.0309 0.099 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 8.11e-01 0.0384 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0126 0.118 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 5.31e-01 -0.106 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 1.00e-01 0.267 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0102 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0181 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 9.67e-02 0.266 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 4.08e-01 0.109 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 6.09e-01 0.0681 0.133 0.099 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 3.34e-01 -0.121 0.125 0.099 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 4.28e-01 0.0482 0.0607 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.96e-01 0.000714 0.151 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 6.23e-03 0.22 0.0798 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0228 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0697 0.133 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 9.04e-03 0.389 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 3.45e-01 0.117 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.20e-01 -0.066 0.133 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 8.90e-02 0.238 0.139 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0912 0.147 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 2.68e-01 0.156 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 1.22e-01 0.0857 0.0552 0.101 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0019 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 5.29e-03 0.265 0.094 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0445 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 4.20e-01 -0.116 0.144 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 6.61e-01 0.0628 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 5.04e-02 0.25 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.55e-01 0.0601 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 6.48e-02 0.254 0.137 0.101 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0228 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 2.68e-01 0.142 0.128 0.101 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 2.24e-01 -0.093 0.0763 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 8.51e-01 0.026 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 3.96e-03 0.206 0.0706 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0487 0.102 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0327 0.121 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 1.18e-01 -0.211 0.134 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0208 0.102 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 7.55e-01 0.0345 0.111 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 9.26e-01 -0.014 0.15 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 4.86e-01 -0.102 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 1.72e-01 0.187 0.136 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0352 0.0665 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 7.05e-01 0.0516 0.136 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.15e-02 0.183 0.0718 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0241 0.113 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 6.51e-01 0.0593 0.131 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.58e-01 0.0843 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 2.30e-01 -0.15 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 2.79e-01 -0.134 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 2.49e-01 -0.151 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0758 0.151 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 3.22e-01 -0.129 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 4.45e-01 -0.113 0.147 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.74e-03 0.457 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0127 0.129 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 3.58e-01 -0.13 0.142 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 4.12e-01 0.123 0.15 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0636 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0963 0.11 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 5.39e-04 0.433 0.123 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 9.36e-02 -0.164 0.0971 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0383 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.67e-02 -0.219 0.114 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 7.80e-01 0.0225 0.0806 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0161 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.35e-04 0.51 0.131 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 2.93e-01 -0.111 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 7.23e-01 0.0466 0.131 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0702 0.123 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 1.91e-02 0.188 0.0797 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 3.80e-01 0.126 0.143 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.46e-04 0.515 0.133 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.133 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 1.25e-01 0.22 0.143 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 4.30e-01 -0.107 0.135 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 4.28e-01 0.0963 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 3.16e-01 -0.126 0.125 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 3.38e-03 0.374 0.126 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 8.48e-02 -0.177 0.102 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 3.33e-01 -0.135 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.16e-01 0.0896 0.138 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 1.45e-01 0.171 0.117 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 8.11e-01 -0.035 0.146 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 1.30e-02 -0.334 0.133 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.63e-02 0.321 0.133 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 1.50e-01 -0.173 0.12 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 2.90e-01 -0.136 0.128 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 2.74e-01 0.152 0.139 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 1.71e-01 0.125 0.0914 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0623 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 8.96e-01 0.0193 0.147 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.54e-02 0.317 0.13 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 4.73e-02 -0.269 0.135 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 4.97e-01 -0.101 0.148 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 7.20e-01 0.0524 0.146 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 8.47e-01 0.0253 0.131 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 4.12e-01 -0.117 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 7.87e-01 0.0396 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 4.49e-01 0.105 0.138 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 6.34e-01 0.0707 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 5.48e-01 0.0956 0.159 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 3.12e-01 0.154 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0348 0.133 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 3.95e-01 -0.125 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0646 0.0494 0.102 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0423 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 7.01e-02 0.245 0.135 0.102 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 2.13e-01 -0.15 0.12 0.102 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0698 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 6.50e-01 0.0668 0.147 0.102 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 1.93e-01 0.159 0.122 0.102 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0623 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 3.11e-01 0.138 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0867 0.12 0.102 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 2.40e-01 -0.179 0.152 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 4.46e-03 0.311 0.108 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 2.46e-01 -0.148 0.127 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 2.29e-01 -0.179 0.149 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 8.88e-01 0.0205 0.146 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0349 0.132 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 8.74e-01 0.022 0.139 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0497 0.146 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 1.58e-02 -0.318 0.131 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 2.18e-03 0.394 0.127 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 3.84e-01 0.0854 0.0979 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 2.93e-01 0.143 0.136 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 3.93e-01 -0.113 0.131 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 4.95e-01 0.0771 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0917 0.137 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0572 0.154 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00344 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.08e-01 0.232 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0863 0.116 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 8.71e-01 0.0246 0.152 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 8.05e-01 0.0385 0.155 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 3.69e-01 0.13 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0245 0.148 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 5.99e-01 0.0768 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.94e-01 0.000954 0.137 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 2.10e-04 0.467 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 1.02e-01 0.159 0.0965 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 2.38e-01 -0.16 0.135 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.44e-01 0.0828 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 1.22e-01 0.166 0.107 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0167 0.14 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0869 0.151 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 4.99e-01 0.0751 0.111 0.1 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00325 0.149 0.1 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00466 0.116 0.1 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 3.85e-02 -0.342 0.163 0.1 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0295 0.191 0.1 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 2.47e-01 -0.136 0.117 0.1 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 9.77e-01 0.00395 0.136 0.1 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.1 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 2.23e-01 0.194 0.159 0.1 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 7.22e-01 0.0521 0.146 0.1 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0704 0.135 0.1 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0655 0.05 0.102 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 6.97e-01 0.0395 0.101 0.102 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 6.37e-02 0.248 0.133 0.102 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0749 0.0991 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 4.06e-02 0.289 0.14 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.61e-01 0.0624 0.107 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 3.15e-01 -0.117 0.116 0.102 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 7.01e-01 0.0384 0.0999 0.102 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0313 0.0926 0.102 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0828 0.101 0.102 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0178 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.92e-02 0.349 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 5.13e-01 0.0855 0.131 0.1 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 1.34e-01 -0.213 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.06e-01 -0.098 0.147 0.1 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 9.24e-01 0.0115 0.12 0.1 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 4.74e-02 -0.264 0.132 0.098 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 7.76e-01 0.0372 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 1.98e-01 -0.217 0.168 0.098 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0652 0.152 0.098 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 2.02e-01 0.202 0.157 0.098 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 9.48e-01 0.00976 0.148 0.098 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0951 0.116 0.098 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 2.61e-01 0.148 0.132 0.098 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 7.99e-01 0.0326 0.127 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 4.15e-01 0.0784 0.096 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 3.07e-03 0.374 0.125 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 3.68e-01 -0.129 0.143 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 3.62e-01 -0.117 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 4.45e-01 0.0847 0.111 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 2.74e-01 0.103 0.0942 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 1.87e-02 -0.326 0.138 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.07e-01 0.172 0.106 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 2.81e-01 -0.14 0.13 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 3.05e-02 -0.328 0.151 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 9.52e-01 0.0087 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 3.25e-01 -0.13 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.03e-01 0.0536 0.103 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 8.89e-02 -0.288 0.168 0.112 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.52e-01 0.228 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 8.85e-02 -0.203 0.119 0.112 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 1.82e-01 0.211 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 2.76e-02 -0.363 0.163 0.112 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 1.10e-02 0.39 0.151 0.112 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 7.13e-02 0.283 0.155 0.112 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 1.07e-02 -0.39 0.151 0.112 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 9.05e-01 0.017 0.141 0.112 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 1.91e-02 -0.329 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 9.88e-01 0.00193 0.129 0.1 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 1.08e-01 0.243 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0596 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 1.60e-01 0.206 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 4.79e-01 0.1 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 1.98e-01 -0.159 0.123 0.1 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.97e-01 0.000497 0.141 0.104 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 7.78e-01 0.0367 0.13 0.104 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 3.25e-01 -0.153 0.155 0.104 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 5.40e-02 -0.261 0.135 0.104 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 1.73e-01 -0.178 0.13 0.104 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 6.90e-01 0.0502 0.126 0.104 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 4.67e-01 0.0852 0.117 0.104 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 2.25e-01 -0.215 0.176 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 4.44e-01 0.118 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 4.38e-01 -0.126 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 3.08e-02 -0.349 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0858 0.171 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 3.72e-01 0.133 0.149 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 3.07e-01 -0.118 0.115 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 4.28e-01 0.121 0.153 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 1.84e-01 0.0925 0.0694 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 6.40e-01 0.0656 0.14 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.33e-03 0.234 0.0719 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0722 0.116 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 9.48e-01 0.0078 0.119 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 9.57e-03 0.347 0.133 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 6.31e-02 0.187 0.0999 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 1.00e+00 4.42e-05 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 9.20e-03 0.36 0.137 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0778 0.145 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 3.59e-01 0.132 0.144 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -877319 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0786 0.081 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0458 0.133 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.61e-03 0.205 0.064 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0673 0.0938 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 8.26e-01 0.0252 0.115 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 1.94e-01 -0.17 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 5.69e-01 -0.056 0.0981 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0784 0.103 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -135047 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0916 0.148 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 5.05e-01 -0.101 0.151 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -593160 sc-eQTL 5.12e-01 0.0904 0.138 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0914 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 1.15e-01 0.148 0.0938 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 2.03e-01 0.154 0.121 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 1.29e-01 -0.217 0.143 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0736 0.123 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0692 0.107 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 2.15e-01 0.109 0.0874 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 2.31e-01 -0.161 0.134 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 7.42e-01 0.0387 0.117 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 5.40e-01 0.0871 0.142 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 1.05e-01 -0.221 0.136 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0129 0.136 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 7.67e-01 0.0349 0.118 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0346 0.102 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -515695 sc-eQTL 9.75e-02 -0.21 0.126 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 sc-eQTL 2.57e-04 0.446 0.12 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -226534 sc-eQTL 3.40e-01 0.0809 0.0846 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 324320 sc-eQTL 4.94e-01 0.089 0.13 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 196653 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0608 0.121 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -457724 sc-eQTL 2.06e-01 0.123 0.0974 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0671 0.131 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -515760 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0886 0.154 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -92522 eQTL 6.91e-02 0.0731 0.0402 0.187 0.0 0.103
ENSG00000120800 UTP20 324320 eQTL 0.022 -0.0416 0.0181 0.00141 0.0 0.103
ENSG00000136048 DRAM1 -273155 eQTL 0.018 -0.0534 0.0225 0.0 0.0 0.103

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina