logo

Genes within 1Mb (chr12:101603180:AC:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0247 0.0416 0.259 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 6.28e-01 0.0352 0.0724 0.259 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 4.62e-03 -0.124 0.0432 0.259 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 1.45e-01 0.0927 0.0634 0.259 B L1
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.42e-01 -0.106 0.0721 0.259 B L1
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 1.39e-01 0.0921 0.0619 0.259 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 5.27e-01 0.0316 0.0498 0.259 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 4.17e-01 0.0459 0.0565 0.259 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0499 0.0898 0.259 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 4.45e-01 0.0657 0.0859 0.259 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 7.81e-01 0.0223 0.0802 0.259 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0627 0.0661 0.259 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0866 0.0892 0.259 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 2.65e-01 0.0691 0.0618 0.259 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 8.94e-01 0.00913 0.0686 0.259 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 4.11e-01 0.0551 0.0669 0.259 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0145 0.0469 0.259 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0331 0.0822 0.259 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0448 0.089 0.259 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 1.38e-01 0.0867 0.0582 0.259 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0253 0.0738 0.259 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0587 0.0813 0.259 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 4.79e-01 0.0409 0.0578 0.259 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 2.26e-02 0.188 0.0819 0.259 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0843 0.0928 0.264 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 6.03e-02 -0.159 0.0842 0.264 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 9.49e-02 0.156 0.0928 0.264 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.95e-01 0.13 0.0998 0.264 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 2.83e-01 0.111 0.103 0.264 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 4.27e-01 0.0709 0.0891 0.264 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 3.03e-01 0.0759 0.0735 0.264 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 2.66e-01 0.108 0.0968 0.264 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 8.83e-01 0.0115 0.0783 0.259 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0568 0.0662 0.259 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 6.39e-01 -0.039 0.0831 0.259 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.10e-01 0.148 0.0921 0.259 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 3.41e-01 0.0812 0.0851 0.259 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0427 0.075 0.259 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0319 0.0611 0.259 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 9.81e-01 0.00201 0.0845 0.26 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.52e-02 -0.175 0.0775 0.26 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0278 0.0568 0.26 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 6.50e-01 0.0416 0.0914 0.26 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 3.00e-01 0.0871 0.0839 0.26 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 3.05e-01 -0.065 0.0632 0.26 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 3.77e-02 0.187 0.0893 0.26 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 5.23e-02 0.205 0.105 0.26 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 5.32e-01 0.0198 0.0317 0.259 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 4.87e-01 0.042 0.0604 0.259 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 5.67e-02 -0.168 0.0875 0.259 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 8.42e-01 0.0127 0.0637 0.259 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00605 0.0995 0.259 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0087 0.0725 0.259 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0441 0.0644 0.259 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 8.33e-01 0.0163 0.0773 0.259 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0471 0.0643 0.259 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0362 0.0749 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 2.15e-02 -0.0467 0.0201 0.268 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0202 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 1.09e-03 -0.252 0.076 0.268 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 1.86e-01 0.147 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.53e-01 -0.154 0.107 0.268 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 5.78e-01 0.0619 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 3.17e-01 0.106 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0163 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0838 0.0871 0.268 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0371 0.0879 0.268 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 2.78e-01 0.0897 0.0824 0.268 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0181 0.0414 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 5.26e-01 0.0655 0.103 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.39e-03 -0.167 0.0542 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 4.16e-01 0.0666 0.0818 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0996 0.0907 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 4.24e-01 0.0819 0.102 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.28e-01 0.0411 0.0846 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 5.21e-01 0.0583 0.0907 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 2.19e-01 -0.117 0.0951 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.0999 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 5.77e-01 0.0536 0.096 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0373 0.0385 0.256 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 8.79e-01 0.0155 0.102 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 1.48e-04 -0.248 0.0642 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 1.06e-01 0.147 0.0905 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 7.43e-01 0.0329 0.0999 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 1.36e-01 0.148 0.0989 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 7.33e-01 0.0304 0.0889 0.256 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 4.23e-01 0.0747 0.0931 0.256 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0538 0.0959 0.256 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 3.82e-01 0.0858 0.098 0.256 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 6.28e-02 0.166 0.0886 0.256 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0149 0.0527 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0132 0.0954 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 3.25e-02 -0.106 0.049 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 2.12e-01 0.0874 0.0699 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.14e-01 -0.131 0.0828 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 7.95e-01 0.0242 0.0929 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 1.88e-01 0.0924 0.07 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 2.58e-01 0.0862 0.076 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0727 0.103 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 3.97e-01 0.0853 0.101 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 6.49e-01 0.043 0.0943 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 1.32e-02 -0.114 0.0457 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0615 0.095 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 8.90e-01 0.00704 0.0509 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 9.86e-01 0.00142 0.0789 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.95e-01 -0.118 0.0911 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 7.68e-01 0.0296 0.1 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 9.30e-01 0.00765 0.0874 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 8.85e-01 0.0126 0.0866 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 7.69e-01 0.0268 0.0912 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 2.81e-01 -0.113 0.105 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0306 0.0906 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 3.94e-02 -0.211 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 1.65e-01 -0.143 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 6.62e-01 0.0393 0.0899 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.72e-01 0.135 0.0984 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00131 0.105 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 1.08e-01 0.161 0.0999 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0514 0.0759 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0438 0.0876 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 1.23e-02 0.168 0.0666 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.80e-01 0.0987 0.0733 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0466 0.0797 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0367 0.0557 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0461 0.0802 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.13e-01 -0.115 0.0922 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 4.95e-02 -0.14 0.071 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0891 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 3.38e-02 0.177 0.083 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 2.17e-01 0.0679 0.0549 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.59e-01 0.0296 0.0963 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 1.94e-01 -0.12 0.0923 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 7.92e-01 0.0235 0.0893 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.20e-01 -0.15 0.096 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 3.77e-01 0.0806 0.0911 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0406 0.0817 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 2.39e-01 -0.102 0.0863 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 4.37e-01 -0.069 0.0887 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 4.22e-01 0.0571 0.0709 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0598 0.096 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0622 0.0949 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0419 0.081 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 2.54e-01 0.115 0.1 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0447 0.0928 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0355 0.0922 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 1.17e-02 0.208 0.0816 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 4.16e-01 0.0717 0.088 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0302 0.0956 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 3.36e-01 0.0606 0.0629 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0969 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 6.20e-01 0.0501 0.101 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0512 0.0904 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 1.28e-01 0.142 0.0931 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0271 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0143 0.1 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 9.39e-01 0.00685 0.0898 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 8.72e-02 0.167 0.0972 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0664 0.0996 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00112 0.0943 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 2.76e-01 0.11 0.101 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 8.64e-02 -0.185 0.108 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 3.23e-01 -0.102 0.103 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.38e-01 0.0427 0.0906 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 1.88e-01 0.131 0.0995 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 5.14e-01 0.0227 0.0347 0.26 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.71e-01 0.0283 0.0973 0.26 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.62e-01 -0.106 0.0946 0.26 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 3.74e-01 0.0748 0.0839 0.26 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 6.55e-01 0.045 0.101 0.26 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000909 0.103 0.26 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0396 0.0854 0.26 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 6.28e-01 -0.047 0.0969 0.26 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0673 0.0949 0.26 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00833 0.0841 0.26 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.58e-01 0.0322 0.105 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0143 0.0756 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 4.39e-01 0.0677 0.0873 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 3.39e-01 0.0976 0.102 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 1.15e-01 0.157 0.0991 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 2.64e-01 -0.101 0.0899 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 8.02e-03 0.25 0.0932 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 8.94e-01 0.0133 0.1 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0161 0.0938 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 6.02e-03 -0.25 0.09 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0239 0.0693 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0427 0.0962 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 2.97e-01 0.0971 0.0928 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0273 0.0797 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 2.31e-01 0.116 0.0964 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 2.19e-02 0.248 0.108 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.92e-01 0.0254 0.0964 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0862 0.0987 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0148 0.0795 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 6.57e-01 0.0462 0.104 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0895 0.106 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 7.41e-01 0.0327 0.0986 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 4.11e-01 0.0834 0.101 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 7.45e-02 0.177 0.0989 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0307 0.0944 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 1.74e-01 -0.12 0.088 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 3.93e-01 0.0574 0.067 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 9.17e-01 0.00971 0.0935 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 4.20e-01 0.0759 0.094 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0433 0.0741 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0374 0.0965 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 8.73e-02 -0.178 0.104 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 6.38e-01 0.0368 0.0779 0.259 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 5.36e-01 0.0651 0.105 0.259 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 6.77e-01 0.034 0.0813 0.259 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0842 0.117 0.259 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 2.94e-01 0.141 0.134 0.259 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00649 0.0826 0.259 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 1.67e-02 -0.226 0.0929 0.259 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 1.61e-01 0.135 0.0959 0.259 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 2.39e-01 -0.132 0.112 0.259 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 6.08e-01 0.0529 0.103 0.259 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0793 0.0949 0.259 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 6.20e-01 0.0173 0.0348 0.254 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.32e-02 0.126 0.0697 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0863 0.093 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0535 0.0688 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.45e-01 -0.143 0.0979 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0363 0.0744 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 4.59e-01 0.06 0.0808 0.254 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0346 0.0693 0.254 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 5.50e-01 0.0384 0.0642 0.254 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 2.36e-01 0.0833 0.0701 0.254 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0979 0.259 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 1.95e-01 -0.133 0.102 0.259 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 2.60e-01 0.101 0.089 0.259 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00662 0.0973 0.259 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0159 0.101 0.259 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00438 0.0817 0.259 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0916 0.263 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 3.35e-02 -0.189 0.0883 0.263 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 5.62e-01 0.0669 0.115 0.263 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 4.63e-02 0.207 0.103 0.263 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 7.81e-02 0.19 0.107 0.263 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 2.99e-01 0.106 0.101 0.263 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0226 0.0793 0.263 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 9.93e-01 0.000784 0.0904 0.263 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0255 0.0887 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0522 0.0668 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 9.22e-01 0.00867 0.0888 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 3.42e-01 0.095 0.0997 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 5.40e-01 0.0548 0.0894 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 4.91e-01 0.0532 0.0771 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 3.09e-01 -0.067 0.0656 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 4.82e-01 -0.068 0.0967 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0835 0.074 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 8.37e-01 0.0186 0.0903 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 3.83e-02 0.218 0.105 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0333 0.0993 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0481 0.0918 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 4.84e-01 0.0502 0.0715 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 1.94e-01 0.155 0.119 0.252 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 7.31e-02 -0.201 0.111 0.252 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00762 0.0846 0.252 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0392 0.112 0.252 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 2.33e-01 0.14 0.117 0.252 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 3.80e-01 -0.096 0.109 0.252 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 6.22e-01 0.0549 0.111 0.252 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 2.04e-01 0.138 0.108 0.252 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 2.52e-01 -0.114 0.0994 0.252 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0551 0.0973 0.264 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.32e-01 -0.106 0.0887 0.264 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0685 0.104 0.264 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 6.88e-01 0.0393 0.0979 0.264 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 6.19e-01 0.0505 0.101 0.264 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0457 0.0979 0.264 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 8.91e-01 0.0117 0.0856 0.264 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 4.85e-02 0.189 0.0954 0.26 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0561 0.0889 0.26 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 6.97e-01 0.0415 0.107 0.26 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0429 0.0931 0.26 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 8.34e-02 0.155 0.0889 0.26 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0306 0.0861 0.26 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0815 0.08 0.26 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0301 0.116 0.26 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 8.85e-02 -0.171 0.0999 0.26 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 2.05e-03 0.325 0.104 0.26 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 5.77e-02 0.201 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 1.42e-01 0.164 0.111 0.26 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 6.52e-02 0.179 0.0965 0.26 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 4.13e-01 0.0617 0.0753 0.26 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 4.63e-01 0.0735 0.1 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0324 0.0482 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 6.63e-01 0.0424 0.0969 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 5.94e-05 -0.201 0.0491 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 8.47e-02 0.138 0.0796 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 1.82e-01 -0.11 0.0822 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 3.13e-01 0.0943 0.0932 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 7.25e-01 0.0245 0.0697 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 7.38e-01 0.028 0.0835 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 2.06e-01 -0.122 0.0959 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 2.84e-01 0.108 0.1 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 5.00e-02 0.195 0.099 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -878564 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0708 0.0555 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0142 0.0912 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0681 0.0448 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 2.21e-01 0.0789 0.0643 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 5.64e-02 -0.15 0.0783 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 8.62e-01 0.0157 0.09 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 4.00e-01 0.0567 0.0673 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 4.92e-01 0.0486 0.0706 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -136292 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0489 0.102 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 6.93e-01 0.0411 0.104 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -594405 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0284 0.0946 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0195 0.0818 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0742 0.0659 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0093 0.0851 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 2.50e-02 0.224 0.0994 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 4.91e-01 0.0593 0.086 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 7.80e-01 -0.021 0.0749 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0305 0.0614 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 9.73e-02 0.155 0.0929 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0738 0.0815 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0603 0.0988 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0393 0.095 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 1.76e-01 0.128 0.094 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0449 0.0819 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0407 0.0707 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516940 sc-eQTL 9.25e-01 0.0084 0.0896 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 sc-eQTL 2.31e-02 -0.198 0.0864 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227779 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0334 0.0598 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323075 sc-eQTL 7.03e-01 0.035 0.0918 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195408 sc-eQTL 4.04e-01 0.0711 0.0851 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458969 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0496 0.0689 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274400 sc-eQTL 1.05e-01 0.15 0.0921 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517005 sc-eQTL 6.43e-02 0.201 0.108 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -93767 eQTL 3.48e-06 -0.138 0.0297 0.0 0.0 0.234

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina