logo

Genes within 1Mb (chr12:101603166:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0247 0.0416 0.259 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 6.28e-01 0.0352 0.0724 0.259 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 4.62e-03 -0.124 0.0432 0.259 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 1.45e-01 0.0927 0.0634 0.259 B L1
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.42e-01 -0.106 0.0721 0.259 B L1
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 1.39e-01 0.0921 0.0619 0.259 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 5.27e-01 0.0316 0.0498 0.259 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 4.17e-01 0.0459 0.0565 0.259 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0499 0.0898 0.259 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 4.45e-01 0.0657 0.0859 0.259 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 7.81e-01 0.0223 0.0802 0.259 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0627 0.0661 0.259 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0866 0.0892 0.259 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 2.65e-01 0.0691 0.0618 0.259 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 8.94e-01 0.00913 0.0686 0.259 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 4.11e-01 0.0551 0.0669 0.259 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0145 0.0469 0.259 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0331 0.0822 0.259 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0448 0.089 0.259 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 1.38e-01 0.0867 0.0582 0.259 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0253 0.0738 0.259 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0587 0.0813 0.259 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 4.79e-01 0.0409 0.0578 0.259 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 2.26e-02 0.188 0.0819 0.259 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0843 0.0928 0.264 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 6.03e-02 -0.159 0.0842 0.264 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 9.49e-02 0.156 0.0928 0.264 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.95e-01 0.13 0.0998 0.264 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 2.83e-01 0.111 0.103 0.264 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 4.27e-01 0.0709 0.0891 0.264 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 3.03e-01 0.0759 0.0735 0.264 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 2.66e-01 0.108 0.0968 0.264 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 8.83e-01 0.0115 0.0783 0.259 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0568 0.0662 0.259 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 6.39e-01 -0.039 0.0831 0.259 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.10e-01 0.148 0.0921 0.259 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 3.41e-01 0.0812 0.0851 0.259 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0427 0.075 0.259 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0319 0.0611 0.259 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 9.81e-01 0.00201 0.0845 0.26 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.52e-02 -0.175 0.0775 0.26 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0278 0.0568 0.26 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 6.50e-01 0.0416 0.0914 0.26 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 3.00e-01 0.0871 0.0839 0.26 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 3.05e-01 -0.065 0.0632 0.26 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 3.77e-02 0.187 0.0893 0.26 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 5.23e-02 0.205 0.105 0.26 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 5.32e-01 0.0198 0.0317 0.259 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 4.87e-01 0.042 0.0604 0.259 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 5.67e-02 -0.168 0.0875 0.259 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 8.42e-01 0.0127 0.0637 0.259 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00605 0.0995 0.259 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0087 0.0725 0.259 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0441 0.0644 0.259 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 8.33e-01 0.0163 0.0773 0.259 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0471 0.0643 0.259 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0362 0.0749 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 2.15e-02 -0.0467 0.0201 0.268 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0202 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 1.09e-03 -0.252 0.076 0.268 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 1.86e-01 0.147 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.53e-01 -0.154 0.107 0.268 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 5.78e-01 0.0619 0.111 0.268 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 3.17e-01 0.106 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0163 0.106 0.268 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0838 0.0871 0.268 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0371 0.0879 0.268 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 2.78e-01 0.0897 0.0824 0.268 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0181 0.0414 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 5.26e-01 0.0655 0.103 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.39e-03 -0.167 0.0542 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 4.16e-01 0.0666 0.0818 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0996 0.0907 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 4.24e-01 0.0819 0.102 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.28e-01 0.0411 0.0846 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 5.21e-01 0.0583 0.0907 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 2.19e-01 -0.117 0.0951 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 2.56e-01 0.114 0.0999 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 5.77e-01 0.0536 0.096 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0373 0.0385 0.256 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 8.79e-01 0.0155 0.102 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 1.48e-04 -0.248 0.0642 0.256 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 1.06e-01 0.147 0.0905 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 7.43e-01 0.0329 0.0999 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 1.36e-01 0.148 0.0989 0.256 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 7.33e-01 0.0304 0.0889 0.256 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 4.23e-01 0.0747 0.0931 0.256 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0538 0.0959 0.256 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 3.82e-01 0.0858 0.098 0.256 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 6.28e-02 0.166 0.0886 0.256 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0149 0.0527 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0132 0.0954 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 3.25e-02 -0.106 0.049 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 2.12e-01 0.0874 0.0699 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.14e-01 -0.131 0.0828 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 7.95e-01 0.0242 0.0929 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 1.88e-01 0.0924 0.07 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 2.58e-01 0.0862 0.076 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0727 0.103 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 3.97e-01 0.0853 0.101 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 6.49e-01 0.043 0.0943 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 1.32e-02 -0.114 0.0457 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0615 0.095 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 8.90e-01 0.00704 0.0509 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 9.86e-01 0.00142 0.0789 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.95e-01 -0.118 0.0911 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 7.68e-01 0.0296 0.1 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 9.30e-01 0.00765 0.0874 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 8.85e-01 0.0126 0.0866 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 7.69e-01 0.0268 0.0912 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 2.81e-01 -0.113 0.105 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0306 0.0906 0.258 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 3.94e-02 -0.211 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 1.65e-01 -0.143 0.102 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 6.62e-01 0.0393 0.0899 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.72e-01 0.135 0.0984 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00131 0.105 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 1.08e-01 0.161 0.0999 0.257 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0514 0.0759 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0438 0.0876 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 1.23e-02 0.168 0.0666 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.80e-01 0.0987 0.0733 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0466 0.0797 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0367 0.0557 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0461 0.0802 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.13e-01 -0.115 0.0922 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 4.95e-02 -0.14 0.071 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0891 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 3.38e-02 0.177 0.083 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 2.17e-01 0.0679 0.0549 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.59e-01 0.0296 0.0963 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 1.94e-01 -0.12 0.0923 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 7.92e-01 0.0235 0.0893 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.20e-01 -0.15 0.096 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 3.77e-01 0.0806 0.0911 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0406 0.0817 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 2.39e-01 -0.102 0.0863 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 4.37e-01 -0.069 0.0887 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 4.22e-01 0.0571 0.0709 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0598 0.096 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0622 0.0949 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0419 0.081 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 2.54e-01 0.115 0.1 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0447 0.0928 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0355 0.0922 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 1.17e-02 0.208 0.0816 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 4.16e-01 0.0717 0.088 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0302 0.0956 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 3.36e-01 0.0606 0.0629 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 2.51e-01 0.112 0.0969 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 6.20e-01 0.0501 0.101 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0512 0.0904 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 1.28e-01 0.142 0.0931 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0271 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0143 0.1 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 9.39e-01 0.00685 0.0898 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 8.72e-02 0.167 0.0972 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0664 0.0996 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00112 0.0943 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 2.76e-01 0.11 0.101 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 8.64e-02 -0.185 0.108 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 3.23e-01 -0.102 0.103 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.38e-01 0.0427 0.0906 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 1.88e-01 0.131 0.0995 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 5.14e-01 0.0227 0.0347 0.26 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.71e-01 0.0283 0.0973 0.26 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.62e-01 -0.106 0.0946 0.26 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 3.74e-01 0.0748 0.0839 0.26 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 6.55e-01 0.045 0.101 0.26 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000909 0.103 0.26 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0396 0.0854 0.26 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 6.28e-01 -0.047 0.0969 0.26 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0673 0.0949 0.26 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00833 0.0841 0.26 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.58e-01 0.0322 0.105 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0143 0.0756 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 4.39e-01 0.0677 0.0873 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 3.39e-01 0.0976 0.102 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 1.15e-01 0.157 0.0991 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 2.64e-01 -0.101 0.0899 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 8.02e-03 0.25 0.0932 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 8.94e-01 0.0133 0.1 0.258 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0161 0.0938 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 6.02e-03 -0.25 0.09 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0239 0.0693 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0427 0.0962 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 2.97e-01 0.0971 0.0928 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0273 0.0797 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 2.31e-01 0.116 0.0964 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 2.19e-02 0.248 0.108 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.92e-01 0.0254 0.0964 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0862 0.0987 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0148 0.0795 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 6.57e-01 0.0462 0.104 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0895 0.106 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 7.41e-01 0.0327 0.0986 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 4.11e-01 0.0834 0.101 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 7.45e-02 0.177 0.0989 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0307 0.0944 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 1.74e-01 -0.12 0.088 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 3.93e-01 0.0574 0.067 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 9.17e-01 0.00971 0.0935 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 4.20e-01 0.0759 0.094 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0433 0.0741 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0374 0.0965 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 8.73e-02 -0.178 0.104 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 6.38e-01 0.0368 0.0779 0.259 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 5.36e-01 0.0651 0.105 0.259 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 6.77e-01 0.034 0.0813 0.259 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0842 0.117 0.259 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 2.94e-01 0.141 0.134 0.259 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00649 0.0826 0.259 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 1.67e-02 -0.226 0.0929 0.259 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 1.61e-01 0.135 0.0959 0.259 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 2.39e-01 -0.132 0.112 0.259 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 6.08e-01 0.0529 0.103 0.259 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0793 0.0949 0.259 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 6.20e-01 0.0173 0.0348 0.254 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.32e-02 0.126 0.0697 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0863 0.093 0.254 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0535 0.0688 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.45e-01 -0.143 0.0979 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0363 0.0744 0.254 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 4.59e-01 0.06 0.0808 0.254 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0346 0.0693 0.254 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 5.50e-01 0.0384 0.0642 0.254 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 2.36e-01 0.0833 0.0701 0.254 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0979 0.259 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 1.95e-01 -0.133 0.102 0.259 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 2.60e-01 0.101 0.089 0.259 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00662 0.0973 0.259 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0159 0.101 0.259 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00438 0.0817 0.259 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0916 0.263 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 3.35e-02 -0.189 0.0883 0.263 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 5.62e-01 0.0669 0.115 0.263 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 4.63e-02 0.207 0.103 0.263 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 7.81e-02 0.19 0.107 0.263 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 2.99e-01 0.106 0.101 0.263 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0226 0.0793 0.263 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 9.93e-01 0.000784 0.0904 0.263 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0255 0.0887 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0522 0.0668 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 9.22e-01 0.00867 0.0888 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 3.42e-01 0.095 0.0997 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 5.40e-01 0.0548 0.0894 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 4.91e-01 0.0532 0.0771 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 3.09e-01 -0.067 0.0656 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 4.82e-01 -0.068 0.0967 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0835 0.074 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 8.37e-01 0.0186 0.0903 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 3.83e-02 0.218 0.105 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0333 0.0993 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0481 0.0918 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 4.84e-01 0.0502 0.0715 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 1.94e-01 0.155 0.119 0.252 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 7.31e-02 -0.201 0.111 0.252 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00762 0.0846 0.252 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0392 0.112 0.252 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 2.33e-01 0.14 0.117 0.252 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 3.80e-01 -0.096 0.109 0.252 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 6.22e-01 0.0549 0.111 0.252 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 2.04e-01 0.138 0.108 0.252 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 2.52e-01 -0.114 0.0994 0.252 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0551 0.0973 0.264 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.32e-01 -0.106 0.0887 0.264 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0685 0.104 0.264 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 6.88e-01 0.0393 0.0979 0.264 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 6.19e-01 0.0505 0.101 0.264 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0457 0.0979 0.264 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 8.91e-01 0.0117 0.0856 0.264 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 4.85e-02 0.189 0.0954 0.26 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0561 0.0889 0.26 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 6.97e-01 0.0415 0.107 0.26 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0429 0.0931 0.26 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 8.34e-02 0.155 0.0889 0.26 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0306 0.0861 0.26 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0815 0.08 0.26 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0301 0.116 0.26 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 8.85e-02 -0.171 0.0999 0.26 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 2.05e-03 0.325 0.104 0.26 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 5.77e-02 0.201 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 1.42e-01 0.164 0.111 0.26 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 6.52e-02 0.179 0.0965 0.26 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 4.13e-01 0.0617 0.0753 0.26 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 4.63e-01 0.0735 0.1 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0324 0.0482 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 6.63e-01 0.0424 0.0969 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 5.94e-05 -0.201 0.0491 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 8.47e-02 0.138 0.0796 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 1.82e-01 -0.11 0.0822 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 3.13e-01 0.0943 0.0932 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 7.25e-01 0.0245 0.0697 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 7.38e-01 0.028 0.0835 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 2.06e-01 -0.122 0.0959 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 2.84e-01 0.108 0.1 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 5.00e-02 0.195 0.099 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -878578 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0708 0.0555 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0142 0.0912 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0681 0.0448 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 2.21e-01 0.0789 0.0643 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 5.64e-02 -0.15 0.0783 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 8.62e-01 0.0157 0.09 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 4.00e-01 0.0567 0.0673 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 4.92e-01 0.0486 0.0706 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -136306 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0489 0.102 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 6.93e-01 0.0411 0.104 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -594419 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0284 0.0946 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0195 0.0818 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0742 0.0659 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0093 0.0851 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 2.50e-02 0.224 0.0994 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 4.91e-01 0.0593 0.086 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 7.80e-01 -0.021 0.0749 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0305 0.0614 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 9.73e-02 0.155 0.0929 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0738 0.0815 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0603 0.0988 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0393 0.095 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 1.76e-01 0.128 0.094 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0449 0.0819 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0407 0.0707 0.261 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516954 sc-eQTL 9.25e-01 0.0084 0.0896 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 sc-eQTL 2.31e-02 -0.198 0.0864 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227793 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0334 0.0598 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323061 sc-eQTL 7.03e-01 0.035 0.0918 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195394 sc-eQTL 4.04e-01 0.0711 0.0851 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -458983 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0496 0.0689 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274414 sc-eQTL 1.05e-01 0.15 0.0921 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517019 sc-eQTL 6.43e-02 0.201 0.108 0.259 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -93781 eQTL 2.09e-06 -0.141 0.0296 0.0 0.0 0.235
ENSG00000139351 SYCP3 -136303 eQTL 0.0493 -0.0836 0.0425 0.0 0.0 0.235

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina