logo

Genes within 1Mb (chr12:101603140:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 6.41e-01 0.0283 0.0606 0.1 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0195 0.106 0.1 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 4.75e-04 0.221 0.0623 0.1 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 2.11e-01 -0.116 0.0925 0.1 B L1
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0182 0.106 0.1 B L1
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 3.02e-01 0.0937 0.0905 0.1 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 8.32e-01 0.0154 0.0726 0.1 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 4.45e-01 -0.063 0.0823 0.1 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 3.65e-01 0.118 0.131 0.1 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 3.41e-01 -0.119 0.125 0.1 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 9.45e-02 0.195 0.116 0.1 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0433 0.0956 0.1 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.83e-04 0.476 0.125 0.1 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0922 0.0893 0.1 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0819 0.0989 0.1 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 7.13e-02 -0.174 0.0961 0.1 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 2.54e-01 0.0773 0.0676 0.1 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.28e-03 -0.306 0.117 0.1 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 7.72e-04 0.427 0.125 0.1 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 1.22e-01 -0.13 0.0839 0.1 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 2.84e-01 -0.114 0.106 0.1 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 6.64e-01 0.051 0.117 0.1 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 9.24e-02 0.14 0.0829 0.1 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00204 0.12 0.1 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 2.04e-02 -0.31 0.132 0.099 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 2.87e-01 0.131 0.122 0.099 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 7.19e-02 -0.242 0.134 0.099 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 2.48e-01 -0.167 0.144 0.099 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 6.56e-01 0.0668 0.15 0.099 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 2.91e-01 0.136 0.129 0.099 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0465 0.106 0.099 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 7.67e-01 0.0416 0.14 0.099 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 2.78e-01 -0.122 0.112 0.1 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 2.59e-01 0.107 0.0946 0.1 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 2.50e-01 0.137 0.119 0.1 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 9.00e-02 -0.225 0.132 0.1 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0791 0.122 0.1 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 9.91e-01 0.00123 0.107 0.1 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.97e-01 0.0341 0.0876 0.1 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 4.18e-02 -0.244 0.119 0.101 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 6.96e-04 0.374 0.109 0.101 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 3.31e-01 0.0787 0.0807 0.101 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 8.89e-01 0.0182 0.13 0.101 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0722 0.12 0.101 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 3.62e-01 0.0823 0.09 0.101 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0476 0.128 0.101 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 2.92e-01 -0.159 0.15 0.101 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000819 0.0461 0.1 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 8.88e-01 0.0124 0.0878 0.1 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 2.25e-02 0.291 0.127 0.1 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0685 0.0924 0.1 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 2.32e-01 0.173 0.144 0.1 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0624 0.105 0.1 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 2.61e-01 0.105 0.0934 0.1 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 1.62e-01 0.157 0.112 0.1 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 5.23e-02 -0.181 0.0927 0.1 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0443 0.109 0.1 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 5.57e-01 0.0182 0.0309 0.099 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 8.11e-01 0.0384 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0126 0.118 0.099 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 5.31e-01 -0.106 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 1.00e-01 0.267 0.161 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0102 0.168 0.099 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0181 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 9.67e-02 0.266 0.16 0.099 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 4.08e-01 0.109 0.132 0.099 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 6.09e-01 0.0681 0.133 0.099 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 3.34e-01 -0.121 0.125 0.099 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 4.28e-01 0.0482 0.0607 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.96e-01 0.000714 0.151 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 6.23e-03 0.22 0.0798 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0228 0.12 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0697 0.133 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 9.04e-03 0.389 0.148 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 3.45e-01 0.117 0.124 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.20e-01 -0.066 0.133 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 8.90e-02 0.238 0.139 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0912 0.147 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 2.68e-01 0.156 0.14 0.101 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 1.22e-01 0.0857 0.0552 0.101 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0019 0.147 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 5.29e-03 0.265 0.094 0.101 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0445 0.131 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 4.20e-01 -0.116 0.144 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 6.61e-01 0.0628 0.143 0.101 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 5.04e-02 0.25 0.127 0.101 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.55e-01 0.0601 0.134 0.101 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 6.48e-02 0.254 0.137 0.101 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0228 0.141 0.101 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 2.68e-01 0.142 0.128 0.101 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 2.24e-01 -0.093 0.0763 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 8.51e-01 0.026 0.139 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 3.96e-03 0.206 0.0706 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0487 0.102 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0327 0.121 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 1.18e-01 -0.211 0.134 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0208 0.102 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 7.55e-01 0.0345 0.111 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 9.26e-01 -0.014 0.15 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 4.86e-01 -0.102 0.146 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 1.72e-01 0.187 0.136 0.1 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0352 0.0665 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 7.05e-01 0.0516 0.136 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.15e-02 0.183 0.0718 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0241 0.113 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 6.51e-01 0.0593 0.131 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.58e-01 0.0843 0.144 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 2.30e-01 -0.15 0.125 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 2.79e-01 -0.134 0.124 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 2.49e-01 -0.151 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0758 0.151 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 3.22e-01 -0.129 0.13 0.101 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 4.45e-01 -0.113 0.147 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.74e-03 0.457 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0127 0.129 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 3.58e-01 -0.13 0.142 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 4.12e-01 0.123 0.15 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0636 0.144 0.102 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0963 0.11 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 5.39e-04 0.433 0.123 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 9.36e-02 -0.164 0.0971 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0383 0.106 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.67e-02 -0.219 0.114 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 7.80e-01 0.0225 0.0806 0.1 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0161 0.118 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.35e-04 0.51 0.131 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 2.93e-01 -0.111 0.105 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 7.23e-01 0.0466 0.131 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0702 0.123 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 1.91e-02 0.188 0.0797 0.1 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 3.80e-01 0.126 0.143 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.46e-04 0.515 0.133 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 9.07e-01 0.0155 0.133 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 1.25e-01 0.22 0.143 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 4.30e-01 -0.107 0.135 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 4.28e-01 0.0963 0.121 0.1 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 3.16e-01 -0.126 0.125 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 3.38e-03 0.374 0.126 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 8.48e-02 -0.177 0.102 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 3.33e-01 -0.135 0.139 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.16e-01 0.0896 0.138 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 1.45e-01 0.171 0.117 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 8.11e-01 -0.035 0.146 0.1 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 1.30e-02 -0.334 0.133 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.63e-02 0.321 0.133 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 1.50e-01 -0.173 0.12 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 2.90e-01 -0.136 0.128 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 2.74e-01 0.152 0.139 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 1.71e-01 0.125 0.0914 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0623 0.142 0.1 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 8.96e-01 0.0193 0.147 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.54e-02 0.317 0.13 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 4.73e-02 -0.269 0.135 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 4.97e-01 -0.101 0.148 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 7.20e-01 0.0524 0.146 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 8.47e-01 0.0253 0.131 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 4.12e-01 -0.117 0.142 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 7.87e-01 0.0396 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 4.49e-01 0.105 0.138 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 6.34e-01 0.0707 0.148 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 5.48e-01 0.0956 0.159 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 3.12e-01 0.154 0.152 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0348 0.133 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 3.95e-01 -0.125 0.146 0.1 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0646 0.0494 0.102 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0423 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 7.01e-02 0.245 0.135 0.102 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 2.13e-01 -0.15 0.12 0.102 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0698 0.144 0.102 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 6.50e-01 0.0668 0.147 0.102 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 1.93e-01 0.159 0.122 0.102 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0623 0.139 0.102 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 3.11e-01 0.138 0.136 0.102 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0867 0.12 0.102 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 2.40e-01 -0.179 0.152 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 4.46e-03 0.311 0.108 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 2.46e-01 -0.148 0.127 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 2.29e-01 -0.179 0.149 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 8.88e-01 0.0205 0.146 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0349 0.132 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 8.74e-01 0.022 0.139 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0497 0.146 0.102 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 1.58e-02 -0.318 0.131 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 2.18e-03 0.394 0.127 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 3.84e-01 0.0854 0.0979 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 2.93e-01 0.143 0.136 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 3.93e-01 -0.113 0.131 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 4.95e-01 0.0771 0.113 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0917 0.137 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0572 0.154 0.101 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00344 0.141 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.08e-01 0.232 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0863 0.116 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 8.71e-01 0.0246 0.152 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 8.05e-01 0.0385 0.155 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 3.69e-01 0.13 0.144 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0245 0.148 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 5.99e-01 0.0768 0.146 0.105 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.94e-01 0.000954 0.137 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 2.10e-04 0.467 0.124 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 1.02e-01 0.159 0.0965 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 2.38e-01 -0.16 0.135 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.44e-01 0.0828 0.136 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 1.22e-01 0.166 0.107 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0167 0.14 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0869 0.151 0.101 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 4.99e-01 0.0751 0.111 0.1 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00325 0.149 0.1 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00466 0.116 0.1 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 3.85e-02 -0.342 0.163 0.1 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0295 0.191 0.1 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 2.47e-01 -0.136 0.117 0.1 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 9.77e-01 0.00395 0.136 0.1 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.1 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 2.23e-01 0.194 0.159 0.1 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 7.22e-01 0.0521 0.146 0.1 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0704 0.135 0.1 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0655 0.05 0.102 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 6.97e-01 0.0395 0.101 0.102 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 6.37e-02 0.248 0.133 0.102 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0749 0.0991 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 4.06e-02 0.289 0.14 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.61e-01 0.0624 0.107 0.102 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 3.15e-01 -0.117 0.116 0.102 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 7.01e-01 0.0384 0.0999 0.102 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0313 0.0926 0.102 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0828 0.101 0.102 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0178 0.144 0.1 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.92e-02 0.349 0.148 0.1 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 5.13e-01 0.0855 0.131 0.1 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 1.34e-01 -0.213 0.142 0.1 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.06e-01 -0.098 0.147 0.1 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 9.24e-01 0.0115 0.12 0.1 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 4.74e-02 -0.264 0.132 0.098 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 7.76e-01 0.0372 0.13 0.098 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 1.98e-01 -0.217 0.168 0.098 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0652 0.152 0.098 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 2.02e-01 0.202 0.157 0.098 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 9.48e-01 0.00976 0.148 0.098 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0951 0.116 0.098 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 2.61e-01 0.148 0.132 0.098 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 7.99e-01 0.0326 0.127 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 4.15e-01 0.0784 0.096 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 3.07e-03 0.374 0.125 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 3.68e-01 -0.129 0.143 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 3.62e-01 -0.117 0.128 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 4.45e-01 0.0847 0.111 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 2.74e-01 0.103 0.0942 0.1 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 1.87e-02 -0.326 0.138 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.07e-01 0.172 0.106 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 2.81e-01 -0.14 0.13 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 3.05e-02 -0.328 0.151 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 9.52e-01 0.0087 0.143 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 3.25e-01 -0.13 0.132 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.03e-01 0.0536 0.103 0.1 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 8.89e-02 -0.288 0.168 0.112 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.52e-01 0.228 0.158 0.112 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 8.85e-02 -0.203 0.119 0.112 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 1.82e-01 0.211 0.157 0.112 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 2.76e-02 -0.363 0.163 0.112 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 1.10e-02 0.39 0.151 0.112 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 7.13e-02 0.283 0.155 0.112 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 1.07e-02 -0.39 0.151 0.112 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 9.05e-01 0.017 0.141 0.112 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 1.91e-02 -0.329 0.139 0.1 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 9.88e-01 0.00193 0.129 0.1 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 1.08e-01 0.243 0.151 0.1 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0596 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 1.60e-01 0.206 0.146 0.1 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 4.79e-01 0.1 0.142 0.1 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 1.98e-01 -0.159 0.123 0.1 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.97e-01 0.000497 0.141 0.104 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 7.78e-01 0.0367 0.13 0.104 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 3.25e-01 -0.153 0.155 0.104 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 5.40e-02 -0.261 0.135 0.104 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 1.73e-01 -0.178 0.13 0.104 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 6.90e-01 0.0502 0.126 0.104 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 4.67e-01 0.0852 0.117 0.104 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 2.25e-01 -0.215 0.176 0.09 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 4.44e-01 0.118 0.154 0.09 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 4.38e-01 -0.126 0.163 0.09 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 3.08e-02 -0.349 0.16 0.09 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0858 0.171 0.09 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 3.72e-01 0.133 0.149 0.09 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 3.07e-01 -0.118 0.115 0.09 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 4.28e-01 0.121 0.153 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 1.84e-01 0.0925 0.0694 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 6.40e-01 0.0656 0.14 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.33e-03 0.234 0.0719 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0722 0.116 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 9.48e-01 0.0078 0.119 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 9.57e-03 0.347 0.133 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 6.31e-02 0.187 0.0999 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 1.00e+00 4.42e-05 0.121 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 9.20e-03 0.36 0.137 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0778 0.145 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 3.59e-01 0.132 0.144 0.1 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -878604 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0786 0.081 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0458 0.133 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.61e-03 0.205 0.064 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0673 0.0938 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 8.26e-01 0.0252 0.115 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 1.94e-01 -0.17 0.131 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 5.69e-01 -0.056 0.0981 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0784 0.103 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -136332 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0916 0.148 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 5.05e-01 -0.101 0.151 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -594445 sc-eQTL 5.12e-01 0.0904 0.138 0.1 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0914 0.117 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 1.15e-01 0.148 0.0938 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 2.03e-01 0.154 0.121 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 1.29e-01 -0.217 0.143 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0736 0.123 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0692 0.107 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 2.15e-01 0.109 0.0874 0.1 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 2.31e-01 -0.161 0.134 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 7.42e-01 0.0387 0.117 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 5.40e-01 0.0871 0.142 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 1.05e-01 -0.221 0.136 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0129 0.136 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 7.67e-01 0.0349 0.118 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0346 0.102 0.101 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -516980 sc-eQTL 9.75e-02 -0.21 0.126 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 sc-eQTL 2.57e-04 0.446 0.12 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -227819 sc-eQTL 3.40e-01 0.0809 0.0846 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 323035 sc-eQTL 4.94e-01 0.089 0.13 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 195368 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0608 0.121 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -459009 sc-eQTL 2.06e-01 0.123 0.0974 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0671 0.131 0.101 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -517045 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0886 0.154 0.101 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 eQTL 6.25e-02 0.0758 0.0406 0.112 0.0 0.103
ENSG00000120800 UTP20 323035 eQTL 0.0272 -0.0406 0.0184 0.00129 0.0 0.103
ENSG00000136048 DRAM1 -274440 eQTL 0.0179 -0.0541 0.0228 0.0 0.0 0.103

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000111666 CHPT1 -93807 3.75e-06 5.1e-06 8.15e-07 2.76e-06 1.12e-06 1.19e-06 3.88e-06 1.01e-06 4.13e-06 2.07e-06 4.69e-06 3.39e-06 5.44e-06 2.04e-06 1.35e-06 2.67e-06 2.06e-06 2.4e-06 1.29e-06 1.3e-06 1.43e-06 4.13e-06 3.89e-06 1.66e-06 7.58e-06 1.26e-06 2.57e-06 1.48e-06 4.24e-06 3.32e-06 1.93e-06 3.11e-07 4.3e-07 1.59e-06 1.62e-06 9.57e-07 8.38e-07 4.89e-07 1.1e-06 7.91e-07 3.55e-07 5.76e-06 3.65e-07 4.43e-07 3.27e-07 1.06e-06 7.28e-07 2.72e-07 2.55e-07