logo

Genes within 1Mb (chr12:101600162:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0164 0.0445 0.231 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 4.94e-01 0.053 0.0774 0.231 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 9.44e-03 -0.121 0.0464 0.231 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.60e-01 0.0768 0.068 0.231 B L1
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 4.66e-02 -0.154 0.0768 0.231 B L1
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 2.17e-01 0.0822 0.0664 0.231 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 4.95e-01 0.0364 0.0533 0.231 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.10e-01 0.0614 0.0603 0.231 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0783 0.0959 0.231 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 8.67e-01 0.0154 0.092 0.231 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00983 0.0858 0.231 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 5.72e-01 -0.04 0.0707 0.231 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0552 0.0954 0.231 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.23e-01 0.0806 0.066 0.231 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00298 0.0732 0.231 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 2.78e-01 0.0776 0.0714 0.231 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 6.31e-01 0.0241 0.0501 0.231 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0124 0.0876 0.231 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00693 0.095 0.231 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 3.62e-01 0.0568 0.0622 0.231 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0337 0.0786 0.231 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0366 0.0868 0.231 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.62e-01 0.0358 0.0616 0.231 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 5.31e-02 0.17 0.0876 0.231 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0951 0.1 0.234 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0933 0.0914 0.234 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.06e-01 0.127 0.1 0.234 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 1.90e-01 0.141 0.108 0.234 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 3.02e-01 0.115 0.111 0.234 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 2.96e-01 0.101 0.096 0.234 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 2.72e-01 0.0872 0.0792 0.234 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 9.77e-02 0.173 0.104 0.234 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.60e-01 0.00424 0.0838 0.231 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0555 0.0708 0.231 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 6.87e-01 0.0359 0.0889 0.231 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 8.75e-02 0.169 0.0985 0.231 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 8.10e-01 0.0219 0.0913 0.231 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0628 0.0802 0.231 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0608 0.0653 0.231 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.41e-01 0.0422 0.0903 0.232 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.74e-02 -0.148 0.0832 0.232 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0218 0.0608 0.232 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 5.39e-01 0.0602 0.0977 0.232 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 1.31e-01 0.135 0.0894 0.232 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0632 0.0676 0.232 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 6.96e-02 0.174 0.0956 0.232 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 2.58e-02 0.251 0.112 0.232 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 4.45e-01 0.0259 0.0339 0.231 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.11e-01 0.0329 0.0646 0.231 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0979 0.0941 0.231 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 5.94e-01 0.0363 0.068 0.231 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 9.85e-01 0.00197 0.106 0.231 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00487 0.0775 0.231 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0378 0.0688 0.231 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 9.12e-01 0.0091 0.0826 0.231 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0357 0.0688 0.231 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0279 0.08 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0193 0.0218 0.235 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.25e-01 0.0106 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.38e-03 -0.222 0.082 0.235 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 5.51e-02 0.227 0.118 0.235 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 3.04e-01 -0.118 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 6.76e-01 0.0497 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 3.16e-01 0.114 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0966 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0611 0.0932 0.235 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00919 0.094 0.235 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 2.33e-01 0.105 0.0879 0.235 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00326 0.0446 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.99e-01 0.0431 0.111 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 2.67e-04 -0.214 0.0578 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 4.50e-01 0.0667 0.0881 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 3.03e-01 -0.101 0.0978 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 9.49e-01 0.00703 0.11 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.94e-01 0.0486 0.0911 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 6.34e-01 0.0467 0.0977 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 1.35e-01 -0.154 0.102 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 2.06e-01 0.136 0.108 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 7.21e-01 0.037 0.103 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0263 0.0413 0.228 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 7.91e-01 -0.029 0.109 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 4.22e-05 -0.287 0.0685 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 8.06e-02 0.17 0.0969 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 5.65e-01 0.0617 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 4.43e-01 0.0818 0.106 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.94e-01 0.0508 0.0953 0.228 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 5.98e-01 0.0527 0.0999 0.228 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 3.05e-01 -0.105 0.103 0.228 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 5.56e-01 0.0621 0.105 0.228 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 3.35e-02 0.203 0.0948 0.228 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00966 0.0565 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 7.76e-01 0.0291 0.102 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.41e-02 -0.0947 0.0528 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.86e-01 0.0803 0.075 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0888 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 5.35e-01 0.0618 0.0996 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 3.67e-01 0.068 0.0753 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 7.08e-02 0.147 0.0811 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0652 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 8.52e-01 0.0202 0.108 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 9.46e-01 0.00692 0.101 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 1.40e-02 -0.121 0.0489 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0259 0.102 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 9.29e-01 0.00484 0.0544 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0347 0.0843 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 4.56e-02 -0.195 0.0969 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00847 0.107 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.95e-01 0.0498 0.0934 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 7.33e-01 0.0316 0.0926 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 8.22e-01 -0.022 0.0975 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 1.99e-02 -0.26 0.111 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0253 0.0969 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 1.25e-01 -0.168 0.109 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 1.60e-01 -0.155 0.11 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 9.76e-01 0.00293 0.0963 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 4.65e-01 0.0775 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 5.76e-01 0.0628 0.112 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 7.39e-02 0.192 0.107 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 7.77e-01 -0.023 0.0811 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 8.73e-01 -0.015 0.0936 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.76e-02 0.158 0.0713 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 3.50e-01 0.0735 0.0784 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 7.60e-01 -0.026 0.0852 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00699 0.0595 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0597 0.0858 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0823 0.0989 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0981 0.0764 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 2.08e-01 -0.121 0.0956 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 2.73e-02 0.197 0.0888 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 1.64e-01 0.0819 0.0587 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0468 0.103 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 4.62e-01 -0.073 0.0992 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 7.27e-01 0.0335 0.0956 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 1.86e-01 -0.137 0.103 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 5.83e-02 0.184 0.0969 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0488 0.0875 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0579 0.0927 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0439 0.0951 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 5.80e-01 0.0421 0.076 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0251 0.103 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0225 0.102 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0137 0.0868 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.34e-01 0.104 0.108 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0194 0.0997 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00573 0.0991 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 6.42e-02 0.164 0.0882 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 5.22e-01 0.0606 0.0945 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 8.31e-01 -0.022 0.103 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 4.02e-01 0.0567 0.0675 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 4.07e-01 0.0867 0.104 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 5.24e-01 0.0694 0.109 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0289 0.0976 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 1.14e-01 0.159 0.1 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0946 0.11 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0255 0.108 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0511 0.0969 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 6.32e-01 0.0507 0.106 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 1.98e-01 -0.137 0.106 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.12e-01 0.0373 0.101 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 6.78e-01 0.045 0.108 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 5.05e-02 -0.226 0.115 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 1.03e-01 -0.18 0.11 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 8.85e-01 -0.014 0.097 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 2.78e-01 0.116 0.107 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 9.66e-01 0.00158 0.0368 0.232 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00441 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0767 0.101 0.232 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.57e-02 0.198 0.0882 0.232 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 4.86e-01 0.0746 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0604 0.109 0.232 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.93e-01 0.0485 0.0907 0.232 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0294 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0757 0.101 0.232 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 7.89e-01 0.0239 0.0893 0.232 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.75e-01 0.047 0.112 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0509 0.0809 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 5.52e-01 0.0556 0.0935 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 4.09e-01 0.0902 0.109 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 1.61e-01 0.15 0.106 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 1.05e-01 -0.156 0.0958 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 2.57e-02 0.225 0.1 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 8.78e-01 0.0164 0.107 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.71e-01 0.00364 0.0999 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 2.25e-02 -0.222 0.0964 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 8.28e-01 -0.016 0.0738 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.102 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 3.41e-01 0.0944 0.0989 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 9.93e-01 0.000779 0.0849 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 6.17e-02 0.192 0.102 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 1.85e-02 0.272 0.115 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0115 0.103 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0404 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 8.78e-01 0.0131 0.0853 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00853 0.112 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0115 0.114 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 8.63e-01 0.0182 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.05e-01 0.112 0.108 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 7.33e-02 0.191 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 8.38e-01 0.0207 0.101 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0869 0.0946 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 3.39e-01 0.0689 0.0718 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00342 0.1 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 2.18e-01 0.124 0.101 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0649 0.0794 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 2.05e-01 -0.142 0.111 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 6.92e-01 0.0326 0.0822 0.237 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.95e-01 0.000677 0.111 0.237 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 2.00e-01 0.11 0.0852 0.237 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 8.98e-01 0.0159 0.123 0.237 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 4.75e-01 0.101 0.141 0.237 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 9.81e-01 0.00209 0.0871 0.237 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 2.40e-02 -0.225 0.0983 0.237 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.101 0.237 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 2.56e-01 -0.134 0.118 0.237 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 4.49e-01 0.0823 0.108 0.237 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0461 0.1 0.237 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 3.43e-01 0.0352 0.037 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 1.35e-01 0.112 0.0744 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0346 0.0991 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 1.06e-01 -0.118 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 2.21e-01 -0.128 0.104 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0538 0.0791 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 3.05e-01 0.0883 0.0859 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0567 0.0737 0.226 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 6.38e-01 0.0322 0.0684 0.226 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 2.62e-01 0.0839 0.0746 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.105 0.231 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0542 0.11 0.231 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 2.16e-01 0.118 0.0954 0.231 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 8.49e-01 0.0198 0.104 0.231 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0956 0.108 0.231 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 8.30e-01 0.0189 0.0876 0.231 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0161 0.0977 0.237 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 1.47e-01 -0.138 0.0947 0.237 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 6.16e-01 0.0618 0.123 0.237 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 2.25e-02 0.253 0.11 0.237 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 2.22e-01 0.141 0.115 0.237 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 4.68e-01 0.0787 0.108 0.237 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 9.43e-01 0.00601 0.0845 0.237 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 5.31e-01 0.0604 0.0963 0.237 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.58e-01 0.00495 0.0949 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0414 0.0715 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 4.64e-01 0.0696 0.0948 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 3.47e-01 0.1 0.107 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 7.29e-01 0.0332 0.0957 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0369 0.0825 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0548 0.0703 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0497 0.104 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0982 0.0793 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 4.44e-01 0.0741 0.0967 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 2.08e-01 0.143 0.113 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0439 0.107 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0402 0.0985 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 9.15e-01 0.00821 0.0768 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 1.57e-01 0.186 0.13 0.215 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 1.61e-01 -0.172 0.122 0.215 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00643 0.0927 0.215 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 2.39e-01 -0.144 0.122 0.215 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 5.58e-02 0.244 0.127 0.215 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.76e-02 -0.226 0.118 0.215 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.43e-01 0.115 0.121 0.215 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 2.47e-01 0.138 0.119 0.215 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.215 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.04e-01 0.0542 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0846 0.0955 0.238 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0895 0.112 0.238 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 3.09e-01 0.107 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 8.19e-01 0.0249 0.109 0.238 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0454 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0156 0.0919 0.238 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.17e-02 0.19 0.101 0.235 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0815 0.0941 0.235 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 8.90e-01 0.0156 0.113 0.235 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0274 0.0987 0.235 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 3.13e-01 0.0958 0.0947 0.235 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 8.61e-01 -0.016 0.0913 0.235 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0775 0.0848 0.235 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0351 0.125 0.232 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 2.01e-01 -0.14 0.109 0.232 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 1.14e-02 0.29 0.113 0.232 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 3.54e-01 0.107 0.115 0.232 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 5.62e-02 0.23 0.12 0.232 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 2.48e-02 0.236 0.104 0.232 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.17e-01 0.0817 0.0814 0.232 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 3.06e-01 0.111 0.108 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00391 0.0518 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 9.74e-01 0.00345 0.104 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 1.35e-05 -0.233 0.0523 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 5.79e-02 0.163 0.0853 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 2.28e-01 -0.107 0.0883 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 8.11e-01 -0.024 0.1 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 4.86e-01 0.0521 0.0747 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0126 0.0896 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 9.79e-02 -0.171 0.103 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 2.23e-01 0.132 0.108 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 3.73e-02 0.222 0.106 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -881582 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0659 0.0596 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.09e-01 0.05 0.0977 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0677 0.048 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 3.61e-01 0.0631 0.069 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 2.25e-02 -0.192 0.0836 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 8.80e-01 0.0146 0.0965 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.11e-01 0.0476 0.0722 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 1.11e-01 0.121 0.0753 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -139310 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0924 0.109 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0598 0.111 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -597423 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0559 0.101 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0351 0.0876 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0717 0.0707 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 3.25e-01 0.0897 0.091 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 7.27e-02 0.193 0.107 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 6.82e-01 0.0378 0.0922 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.92e-01 -0.043 0.0802 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0533 0.0657 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 5.44e-02 0.191 0.0988 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0778 0.0869 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 3.27e-01 -0.103 0.105 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 4.91e-01 0.0698 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 5.92e-01 0.0541 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0502 0.0873 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0639 0.0752 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -519958 sc-eQTL 7.18e-01 0.0346 0.0957 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 sc-eQTL 7.41e-02 -0.166 0.0927 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230797 sc-eQTL 6.28e-01 -0.031 0.0639 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 320057 sc-eQTL 6.44e-01 0.0454 0.0981 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192390 sc-eQTL 3.10e-01 0.0925 0.0908 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -461987 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0399 0.0737 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277418 sc-eQTL 9.43e-02 0.165 0.0984 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -520023 sc-eQTL 2.69e-02 0.257 0.115 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -519958 eQTL 0.0236 0.0504 0.0222 0.0 0.0 0.195
ENSG00000111666 CHPT1 -96785 eQTL 1.90e-03 -0.1 0.0322 0.0 0.0 0.195

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina