logo

Genes within 1Mb (chr12:101600059:CTT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0164 0.0445 0.231 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 4.94e-01 0.053 0.0774 0.231 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 9.44e-03 -0.121 0.0464 0.231 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.60e-01 0.0768 0.068 0.231 B L1
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 4.66e-02 -0.154 0.0768 0.231 B L1
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 2.17e-01 0.0822 0.0664 0.231 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 4.95e-01 0.0364 0.0533 0.231 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.10e-01 0.0614 0.0603 0.231 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0783 0.0959 0.231 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 8.67e-01 0.0154 0.092 0.231 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00983 0.0858 0.231 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 5.72e-01 -0.04 0.0707 0.231 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0552 0.0954 0.231 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.23e-01 0.0806 0.066 0.231 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00298 0.0732 0.231 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 2.78e-01 0.0776 0.0714 0.231 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 6.31e-01 0.0241 0.0501 0.231 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0124 0.0876 0.231 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00693 0.095 0.231 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 3.62e-01 0.0568 0.0622 0.231 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0337 0.0786 0.231 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0366 0.0868 0.231 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.62e-01 0.0358 0.0616 0.231 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 5.31e-02 0.17 0.0876 0.231 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0951 0.1 0.234 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0933 0.0914 0.234 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.06e-01 0.127 0.1 0.234 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 1.90e-01 0.141 0.108 0.234 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 3.02e-01 0.115 0.111 0.234 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 2.96e-01 0.101 0.096 0.234 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 2.72e-01 0.0872 0.0792 0.234 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 9.77e-02 0.173 0.104 0.234 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.60e-01 0.00424 0.0838 0.231 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0555 0.0708 0.231 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 6.87e-01 0.0359 0.0889 0.231 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 8.75e-02 0.169 0.0985 0.231 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 8.10e-01 0.0219 0.0913 0.231 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0628 0.0802 0.231 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0608 0.0653 0.231 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.41e-01 0.0422 0.0903 0.232 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.74e-02 -0.148 0.0832 0.232 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0218 0.0608 0.232 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 5.39e-01 0.0602 0.0977 0.232 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 1.31e-01 0.135 0.0894 0.232 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0632 0.0676 0.232 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 6.96e-02 0.174 0.0956 0.232 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 2.58e-02 0.251 0.112 0.232 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 4.45e-01 0.0259 0.0339 0.231 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.11e-01 0.0329 0.0646 0.231 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0979 0.0941 0.231 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 5.94e-01 0.0363 0.068 0.231 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 9.85e-01 0.00197 0.106 0.231 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00487 0.0775 0.231 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0378 0.0688 0.231 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 9.12e-01 0.0091 0.0826 0.231 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0357 0.0688 0.231 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0279 0.08 0.231 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0193 0.0218 0.235 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.25e-01 0.0106 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.38e-03 -0.222 0.082 0.235 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 5.51e-02 0.227 0.118 0.235 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 3.04e-01 -0.118 0.115 0.235 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 6.76e-01 0.0497 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 3.16e-01 0.114 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0966 0.113 0.235 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0611 0.0932 0.235 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00919 0.094 0.235 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 2.33e-01 0.105 0.0879 0.235 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00326 0.0446 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.99e-01 0.0431 0.111 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 2.67e-04 -0.214 0.0578 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 4.50e-01 0.0667 0.0881 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 3.03e-01 -0.101 0.0978 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 9.49e-01 0.00703 0.11 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.94e-01 0.0486 0.0911 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 6.34e-01 0.0467 0.0977 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 1.35e-01 -0.154 0.102 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 2.06e-01 0.136 0.108 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 7.21e-01 0.037 0.103 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0263 0.0413 0.228 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 7.91e-01 -0.029 0.109 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 4.22e-05 -0.287 0.0685 0.228 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 8.06e-02 0.17 0.0969 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 5.65e-01 0.0617 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 4.43e-01 0.0818 0.106 0.228 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.94e-01 0.0508 0.0953 0.228 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 5.98e-01 0.0527 0.0999 0.228 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 3.05e-01 -0.105 0.103 0.228 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 5.56e-01 0.0621 0.105 0.228 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 3.35e-02 0.203 0.0948 0.228 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00966 0.0565 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 7.76e-01 0.0291 0.102 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.41e-02 -0.0947 0.0528 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.86e-01 0.0803 0.075 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 1.12e-01 -0.142 0.0888 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 5.35e-01 0.0618 0.0996 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 3.67e-01 0.068 0.0753 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 7.08e-02 0.147 0.0811 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0652 0.111 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 8.52e-01 0.0202 0.108 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 9.46e-01 0.00692 0.101 0.231 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 1.40e-02 -0.121 0.0489 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0259 0.102 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 9.29e-01 0.00484 0.0544 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0347 0.0843 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 4.56e-02 -0.195 0.0969 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00847 0.107 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.95e-01 0.0498 0.0934 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 7.33e-01 0.0316 0.0926 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 8.22e-01 -0.022 0.0975 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 1.99e-02 -0.26 0.111 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0253 0.0969 0.23 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 1.25e-01 -0.168 0.109 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 1.60e-01 -0.155 0.11 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 9.76e-01 0.00293 0.0963 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 4.65e-01 0.0775 0.106 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 5.76e-01 0.0628 0.112 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 7.39e-02 0.192 0.107 0.225 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 7.77e-01 -0.023 0.0811 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 8.73e-01 -0.015 0.0936 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.76e-02 0.158 0.0713 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 3.50e-01 0.0735 0.0784 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 7.60e-01 -0.026 0.0852 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00699 0.0595 0.231 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0597 0.0858 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0823 0.0989 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0981 0.0764 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 2.08e-01 -0.121 0.0956 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 2.73e-02 0.197 0.0888 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 1.64e-01 0.0819 0.0587 0.231 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0468 0.103 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 4.62e-01 -0.073 0.0992 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 7.27e-01 0.0335 0.0956 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 1.86e-01 -0.137 0.103 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 5.83e-02 0.184 0.0969 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0488 0.0875 0.231 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0579 0.0927 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0439 0.0951 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 5.80e-01 0.0421 0.076 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0251 0.103 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0225 0.102 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0137 0.0868 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.34e-01 0.104 0.108 0.231 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0194 0.0997 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00573 0.0991 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 6.42e-02 0.164 0.0882 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 5.22e-01 0.0606 0.0945 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 8.31e-01 -0.022 0.103 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 4.02e-01 0.0567 0.0675 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 4.07e-01 0.0867 0.104 0.231 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 5.24e-01 0.0694 0.109 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0289 0.0976 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 1.14e-01 0.159 0.1 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0946 0.11 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0255 0.108 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0511 0.0969 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 6.32e-01 0.0507 0.106 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 1.98e-01 -0.137 0.106 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.12e-01 0.0373 0.101 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 6.78e-01 0.045 0.108 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 5.05e-02 -0.226 0.115 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 1.03e-01 -0.18 0.11 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 8.85e-01 -0.014 0.097 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 2.78e-01 0.116 0.107 0.224 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 9.66e-01 0.00158 0.0368 0.232 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00441 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0767 0.101 0.232 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.57e-02 0.198 0.0882 0.232 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 4.86e-01 0.0746 0.107 0.232 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0604 0.109 0.232 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.93e-01 0.0485 0.0907 0.232 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0294 0.103 0.232 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0757 0.101 0.232 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 7.89e-01 0.0239 0.0893 0.232 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.75e-01 0.047 0.112 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0509 0.0809 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 5.52e-01 0.0556 0.0935 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 4.09e-01 0.0902 0.109 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 1.61e-01 0.15 0.106 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 1.05e-01 -0.156 0.0958 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 2.57e-02 0.225 0.1 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 8.78e-01 0.0164 0.107 0.229 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.71e-01 0.00364 0.0999 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 2.25e-02 -0.222 0.0964 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 8.28e-01 -0.016 0.0738 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.102 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 3.41e-01 0.0944 0.0989 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 9.93e-01 0.000779 0.0849 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 6.17e-02 0.192 0.102 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 1.85e-02 0.272 0.115 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0115 0.103 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0404 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 8.78e-01 0.0131 0.0853 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00853 0.112 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0115 0.114 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 8.63e-01 0.0182 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.05e-01 0.112 0.108 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 7.33e-02 0.191 0.106 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 8.38e-01 0.0207 0.101 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0869 0.0946 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 3.39e-01 0.0689 0.0718 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00342 0.1 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 2.18e-01 0.124 0.101 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0649 0.0794 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 2.05e-01 -0.142 0.111 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 6.92e-01 0.0326 0.0822 0.237 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.95e-01 0.000677 0.111 0.237 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 2.00e-01 0.11 0.0852 0.237 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 8.98e-01 0.0159 0.123 0.237 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 4.75e-01 0.101 0.141 0.237 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 9.81e-01 0.00209 0.0871 0.237 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 2.40e-02 -0.225 0.0983 0.237 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 1.72e-01 0.139 0.101 0.237 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 2.56e-01 -0.134 0.118 0.237 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 4.49e-01 0.0823 0.108 0.237 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0461 0.1 0.237 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 3.43e-01 0.0352 0.037 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 1.35e-01 0.112 0.0744 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0346 0.0991 0.226 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 1.06e-01 -0.118 0.0729 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 2.21e-01 -0.128 0.104 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0538 0.0791 0.226 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 3.05e-01 0.0883 0.0859 0.226 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0567 0.0737 0.226 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 6.38e-01 0.0322 0.0684 0.226 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 2.62e-01 0.0839 0.0746 0.226 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.105 0.231 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0542 0.11 0.231 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 2.16e-01 0.118 0.0954 0.231 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 8.49e-01 0.0198 0.104 0.231 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0956 0.108 0.231 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 8.30e-01 0.0189 0.0876 0.231 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0161 0.0977 0.237 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 1.47e-01 -0.138 0.0947 0.237 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 6.16e-01 0.0618 0.123 0.237 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 2.25e-02 0.253 0.11 0.237 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 2.22e-01 0.141 0.115 0.237 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 4.68e-01 0.0787 0.108 0.237 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 9.43e-01 0.00601 0.0845 0.237 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 5.31e-01 0.0604 0.0963 0.237 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.58e-01 0.00495 0.0949 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0414 0.0715 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 4.64e-01 0.0696 0.0948 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 3.47e-01 0.1 0.107 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 7.29e-01 0.0332 0.0957 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0369 0.0825 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0548 0.0703 0.231 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0497 0.104 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0982 0.0793 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 4.44e-01 0.0741 0.0967 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 2.08e-01 0.143 0.113 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0439 0.107 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0402 0.0985 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 9.15e-01 0.00821 0.0768 0.231 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 1.57e-01 0.186 0.13 0.215 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 1.61e-01 -0.172 0.122 0.215 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00643 0.0927 0.215 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 2.39e-01 -0.144 0.122 0.215 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 5.58e-02 0.244 0.127 0.215 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.76e-02 -0.226 0.118 0.215 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.43e-01 0.115 0.121 0.215 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 2.47e-01 0.138 0.119 0.215 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 3.19e-01 -0.109 0.109 0.215 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.04e-01 0.0542 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0846 0.0955 0.238 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0895 0.112 0.238 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 3.09e-01 0.107 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 8.19e-01 0.0249 0.109 0.238 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0454 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0156 0.0919 0.238 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.17e-02 0.19 0.101 0.235 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0815 0.0941 0.235 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 8.90e-01 0.0156 0.113 0.235 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0274 0.0987 0.235 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 3.13e-01 0.0958 0.0947 0.235 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 8.61e-01 -0.016 0.0913 0.235 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0775 0.0848 0.235 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0351 0.125 0.232 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 2.01e-01 -0.14 0.109 0.232 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 1.14e-02 0.29 0.113 0.232 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 3.54e-01 0.107 0.115 0.232 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 5.62e-02 0.23 0.12 0.232 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 2.48e-02 0.236 0.104 0.232 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.17e-01 0.0817 0.0814 0.232 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 3.06e-01 0.111 0.108 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00391 0.0518 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 9.74e-01 0.00345 0.104 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 1.35e-05 -0.233 0.0523 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 5.79e-02 0.163 0.0853 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 2.28e-01 -0.107 0.0883 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 8.11e-01 -0.024 0.1 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 4.86e-01 0.0521 0.0747 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0126 0.0896 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 9.79e-02 -0.171 0.103 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 2.23e-01 0.132 0.108 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 3.73e-02 0.222 0.106 0.231 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -881685 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0659 0.0596 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.09e-01 0.05 0.0977 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0677 0.048 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 3.61e-01 0.0631 0.069 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 2.25e-02 -0.192 0.0836 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 8.80e-01 0.0146 0.0965 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.11e-01 0.0476 0.0722 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 1.11e-01 0.121 0.0753 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -139413 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0924 0.109 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0598 0.111 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -597526 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0559 0.101 0.231 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0351 0.0876 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0717 0.0707 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 3.25e-01 0.0897 0.091 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 7.27e-02 0.193 0.107 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 6.82e-01 0.0378 0.0922 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.92e-01 -0.043 0.0802 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0533 0.0657 0.231 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 5.44e-02 0.191 0.0988 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0778 0.0869 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 3.27e-01 -0.103 0.105 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 4.91e-01 0.0698 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 5.92e-01 0.0541 0.101 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0502 0.0873 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0639 0.0752 0.233 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -520061 sc-eQTL 7.18e-01 0.0346 0.0957 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 sc-eQTL 7.41e-02 -0.166 0.0927 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -230900 sc-eQTL 6.28e-01 -0.031 0.0639 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 319954 sc-eQTL 6.44e-01 0.0454 0.0981 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 192287 sc-eQTL 3.10e-01 0.0925 0.0908 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -462090 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0399 0.0737 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -277521 sc-eQTL 9.43e-02 0.165 0.0984 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -520126 sc-eQTL 2.69e-02 0.257 0.115 0.231 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000075188 NUP37 -520061 eQTL 0.0231 0.0507 0.0223 0.0 0.0 0.193
ENSG00000111666 CHPT1 -96888 eQTL 2.46e-03 -0.0979 0.0323 0.0 0.0 0.193

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina