logo

Genes within 1Mb (chr12:101597950:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 9.81e-01 0.000993 0.0418 0.28 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 6.26e-01 0.0355 0.0726 0.28 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 7.24e-02 -0.0792 0.0438 0.28 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 2.70e-01 0.0706 0.0637 0.28 B L1
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0401 0.0726 0.28 B L1
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 5.25e-01 0.0397 0.0624 0.28 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 9.86e-01 0.000869 0.05 0.28 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 2.39e-01 0.0668 0.0565 0.28 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0558 0.09 0.28 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0331 0.0863 0.28 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0833 0.0803 0.28 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00219 0.0661 0.28 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0837 0.0891 0.28 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 8.64e-01 0.0106 0.0619 0.28 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00421 0.0685 0.28 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 2.02e-01 0.0854 0.0667 0.28 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0139 0.0469 0.28 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 1.96e-01 0.106 0.0821 0.28 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0384 0.0893 0.28 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 9.20e-01 0.00586 0.0587 0.28 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00686 0.074 0.28 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 1.98e-01 -0.105 0.0814 0.28 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0607 0.0579 0.28 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 3.64e-02 0.173 0.0823 0.28 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 1.16e-01 -0.143 0.0904 0.284 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0338 0.0831 0.284 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 5.91e-01 0.0491 0.0914 0.284 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 7.40e-01 0.0325 0.098 0.284 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0278 0.101 0.284 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.71e-02 0.159 0.0866 0.284 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 8.04e-01 0.0179 0.0721 0.284 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 1.54e-01 0.135 0.0945 0.284 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00446 0.0787 0.28 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0635 0.0665 0.28 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.70e-01 0.115 0.0832 0.28 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 1.24e-01 0.143 0.0927 0.28 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0513 0.0857 0.28 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.89e-01 0.0303 0.0754 0.28 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 8.46e-01 -0.012 0.0615 0.28 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0706 0.0825 0.281 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 9.82e-03 -0.197 0.0755 0.281 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0219 0.0556 0.281 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 8.91e-02 0.152 0.0889 0.281 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 4.65e-01 0.0601 0.0821 0.281 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 1.31e-01 -0.0934 0.0617 0.281 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00864 0.0882 0.281 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 5.40e-01 0.0635 0.103 0.281 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 8.12e-01 0.00758 0.0318 0.28 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 7.09e-01 0.0226 0.0605 0.28 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 9.91e-02 -0.146 0.0879 0.28 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0201 0.0638 0.28 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 2.13e-01 -0.124 0.0993 0.28 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 3.38e-01 0.0696 0.0725 0.28 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 1.61e-01 0.0904 0.0643 0.28 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0306 0.0774 0.28 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 6.80e-01 0.0266 0.0645 0.28 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0572 0.0749 0.28 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 6.71e-01 -0.00868 0.0204 0.273 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.34e-01 0.102 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.17e-02 -0.167 0.0772 0.273 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.11e-01 0.177 0.11 0.273 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00787 0.107 0.273 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0978 0.111 0.273 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.53e-02 0.211 0.105 0.273 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 8.90e-01 0.0147 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 3.39e-01 0.0834 0.087 0.273 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 3.28e-01 0.086 0.0876 0.273 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 2.55e-01 0.0939 0.0822 0.273 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00331 0.0419 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0123 0.104 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.50e-02 -0.117 0.0554 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 5.56e-01 0.0488 0.0827 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 3.99e-01 0.0775 0.0918 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 8.13e-01 0.0245 0.103 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 1.89e-01 0.112 0.0851 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 3.89e-01 -0.079 0.0915 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 6.55e-01 0.0431 0.0964 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 3.82e-01 0.0884 0.101 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 5.66e-01 0.0557 0.097 0.277 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 2.76e-01 0.0419 0.0384 0.278 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0798 0.101 0.278 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 1.10e-02 -0.168 0.0653 0.278 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 2.43e-01 0.106 0.0905 0.278 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 7.88e-01 0.0268 0.0997 0.278 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 5.65e-03 0.272 0.0973 0.278 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0867 0.0885 0.278 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 2.28e-01 0.112 0.0926 0.278 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0711 0.0956 0.278 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 1.26e-01 0.15 0.0974 0.278 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 3.17e-02 0.191 0.0881 0.278 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0146 0.0531 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 4.04e-01 0.0802 0.096 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0809 0.0497 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.48e-01 0.102 0.0703 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 4.90e-01 -0.058 0.0838 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00597 0.0937 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0302 0.0709 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 9.02e-02 0.13 0.0763 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 9.74e-01 0.00341 0.104 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 1.92e-01 -0.132 0.101 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 1.80e-01 -0.127 0.0947 0.28 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 8.09e-02 -0.0804 0.0459 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 8.32e-01 0.0202 0.0947 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0287 0.0506 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0287 0.0785 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 4.02e-02 -0.186 0.0902 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 1.07e-01 -0.161 0.0993 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0716 0.0869 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 3.99e-01 0.0728 0.0861 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0995 0.0905 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0716 0.105 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0704 0.0901 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 2.35e-01 -0.123 0.103 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 2.08e-01 -0.13 0.103 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.69e-01 -0.125 0.0903 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 7.66e-02 0.176 0.099 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 8.85e-01 0.0153 0.106 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.48e-02 0.203 0.1 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 5.35e-01 0.0473 0.0761 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0591 0.0878 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.43e-01 0.099 0.0674 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 6.47e-01 0.0339 0.0738 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 1.97e-01 0.103 0.0797 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0604 0.0557 0.28 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 7.26e-01 0.0281 0.0801 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 8.56e-02 -0.158 0.0918 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0971 0.0712 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0756 0.0894 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 4.26e-01 0.0667 0.0837 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 7.30e-01 0.019 0.055 0.28 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0727 0.0949 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0546 0.0914 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0718 0.0879 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0744 0.0951 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 7.91e-01 0.0239 0.09 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.75e-01 0.0577 0.0805 0.28 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 2.23e-01 0.106 0.0869 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 7.66e-02 -0.158 0.0888 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0319 0.0715 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 4.32e-01 0.0761 0.0966 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0982 0.0955 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 8.90e-02 -0.139 0.0811 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 9.13e-01 0.0111 0.102 0.28 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0153 0.0935 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0395 0.0929 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 7.72e-01 0.0242 0.0834 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0203 0.0887 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0482 0.0963 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 7.47e-01 0.0205 0.0634 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 8.46e-02 0.168 0.0972 0.28 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0139 0.102 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.22e-01 0.091 0.0917 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 8.62e-01 0.0165 0.0951 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0412 0.104 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 9.31e-01 0.00887 0.102 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0371 0.0912 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 4.84e-02 0.196 0.0985 0.269 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.098 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00759 0.0927 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 8.57e-01 -0.018 0.0993 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 7.37e-01 0.0358 0.106 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 1.28e-01 -0.155 0.101 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 7.95e-01 0.0232 0.089 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 1.20e-01 0.152 0.0976 0.272 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 6.42e-01 0.0159 0.0342 0.279 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 7.91e-01 0.0255 0.0958 0.279 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 2.51e-01 -0.107 0.0931 0.279 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 9.49e-01 0.00526 0.0828 0.279 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0163 0.0993 0.279 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 7.10e-01 0.0377 0.101 0.279 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.22e-01 0.0415 0.0841 0.279 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 4.80e-01 0.0675 0.0954 0.279 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 9.15e-01 0.00994 0.0936 0.279 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0291 0.0828 0.279 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.18e-01 -0.104 0.104 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 1.19e-02 -0.189 0.0743 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 6.36e-02 0.161 0.0865 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 1.37e-01 0.151 0.101 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 6.88e-01 -0.04 0.0995 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 1.58e-01 -0.127 0.0895 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 5.15e-01 0.0617 0.0946 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 9.37e-02 -0.167 0.0993 0.28 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 2.15e-01 -0.113 0.0911 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 5.58e-02 -0.17 0.0886 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0732 0.0674 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 3.87e-01 0.0811 0.0936 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0161 0.0907 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0717 0.0776 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 4.33e-01 0.074 0.0942 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 3.96e-02 0.218 0.105 0.28 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 7.18e-01 0.0349 0.0964 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0391 0.0989 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 6.55e-01 0.0355 0.0794 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 4.10e-01 0.0857 0.104 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 9.93e-01 0.00089 0.106 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0773 0.0985 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0648 0.101 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 6.62e-03 0.268 0.0978 0.285 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 5.41e-01 0.0565 0.0922 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 1.92e-02 -0.201 0.0852 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0053 0.0655 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 6.73e-01 0.0386 0.0914 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 3.55e-01 0.085 0.0918 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.69e-01 -0.031 0.0724 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 4.23e-02 -0.191 0.0934 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 2.98e-02 -0.22 0.101 0.28 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 8.81e-02 0.127 0.074 0.311 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 9.95e-01 0.000593 0.101 0.311 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 9.78e-01 0.0022 0.0783 0.311 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 6.29e-01 0.0544 0.112 0.311 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 2.89e-01 0.137 0.129 0.311 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 9.14e-01 0.00857 0.0794 0.311 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0643 0.0914 0.311 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 6.72e-02 0.169 0.0916 0.311 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 1.53e-01 -0.154 0.107 0.311 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 2.14e-01 0.123 0.0983 0.311 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 6.44e-01 0.0424 0.0915 0.311 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 8.53e-01 0.00643 0.0347 0.276 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 1.65e-01 0.0971 0.0697 0.276 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 2.95e-01 -0.097 0.0925 0.276 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.30e-01 -0.104 0.0682 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 3.59e-02 -0.205 0.0969 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 8.46e-01 0.0144 0.0741 0.276 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 7.26e-01 0.0283 0.0805 0.276 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 5.12e-01 0.0453 0.069 0.276 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 6.81e-01 0.0264 0.064 0.276 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 4.85e-01 -0.049 0.0699 0.276 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0691 0.0978 0.28 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.12e-01 -0.103 0.102 0.28 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.42e-01 0.13 0.0885 0.28 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 9.20e-01 0.00973 0.0969 0.28 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 7.12e-02 -0.18 0.0994 0.28 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0963 0.0811 0.28 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 1.01e-01 -0.151 0.0916 0.28 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 6.49e-01 -0.041 0.09 0.28 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0849 0.116 0.28 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 5.61e-01 0.0613 0.105 0.28 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 5.34e-01 0.068 0.109 0.28 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 1.72e-01 0.14 0.102 0.28 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 5.25e-01 0.0508 0.0798 0.28 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 7.88e-01 0.0246 0.0911 0.28 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 7.93e-01 0.0233 0.0887 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0279 0.0669 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.64e-01 0.123 0.0884 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 3.41e-01 0.0951 0.0997 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 6.37e-01 0.0423 0.0894 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.96e-01 0.0525 0.0771 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 4.23e-01 0.0528 0.0657 0.28 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 2.26e-01 -0.116 0.0955 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 4.91e-02 -0.144 0.0728 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 5.36e-01 0.0554 0.0893 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 5.77e-01 0.0585 0.105 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 3.64e-02 -0.205 0.0974 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 3.17e-01 0.0911 0.0908 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 5.38e-01 0.0437 0.0709 0.28 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.31e-01 0.121 0.124 0.264 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00172 0.117 0.264 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 8.67e-01 0.0148 0.088 0.264 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0928 0.116 0.264 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 1.35e-01 0.182 0.121 0.264 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 7.99e-01 -0.029 0.114 0.264 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 3.81e-01 0.101 0.115 0.264 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 6.49e-01 0.0518 0.113 0.264 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0863 0.104 0.264 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 4.23e-01 0.0768 0.0956 0.287 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00277 0.0876 0.287 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0879 0.103 0.287 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 6.42e-01 0.0449 0.0962 0.287 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0234 0.0996 0.287 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0179 0.0963 0.287 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0395 0.0841 0.287 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.64e-01 0.0874 0.096 0.285 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0809 0.0886 0.285 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 6.47e-02 0.196 0.105 0.285 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 4.05e-01 0.0774 0.0928 0.285 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0238 0.0894 0.285 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0604 0.0859 0.285 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0379 0.08 0.285 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.61e-01 0.105 0.115 0.285 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 1.78e-01 -0.135 0.0999 0.285 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 3.59e-03 0.306 0.103 0.285 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 5.14e-01 0.0691 0.106 0.285 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 8.24e-01 0.0248 0.111 0.285 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.67e-02 0.177 0.0961 0.285 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 1.05e-01 -0.122 0.0745 0.285 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 2.79e-01 0.108 0.0994 0.285 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 5.76e-01 0.0271 0.0484 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0804 0.0971 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 9.90e-03 -0.131 0.0504 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 2.05e-01 0.102 0.0801 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 6.22e-01 0.0409 0.0828 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 2.67e-01 0.104 0.0934 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 6.22e-01 0.0345 0.0699 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 7.75e-01 0.024 0.0838 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 7.74e-01 0.0278 0.0965 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 1.20e-01 0.157 0.1 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 6.06e-02 0.187 0.0994 0.28 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -883794 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0659 0.056 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.27e-01 0.0901 0.0917 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0329 0.0453 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 6.55e-01 0.029 0.0649 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 1.36e-01 -0.118 0.0791 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0852 0.0905 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0866 0.0677 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 8.13e-02 0.124 0.0707 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -141522 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0485 0.103 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 1.40e-01 -0.154 0.104 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -599635 sc-eQTL 9.16e-02 -0.16 0.0947 0.28 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 7.16e-01 -0.03 0.0825 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 2.24e-01 -0.081 0.0665 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 1.65e-01 0.119 0.0855 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 1.75e-01 0.138 0.101 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0557 0.0868 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 4.68e-01 0.0548 0.0755 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 5.59e-01 0.0362 0.0619 0.28 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 3.29e-01 0.0912 0.0932 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0542 0.0815 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 4.26e-01 0.0787 0.0986 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 2.59e-01 0.107 0.0947 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0304 0.0943 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0486 0.0818 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0715 0.0705 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -522170 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0389 0.0874 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 sc-eQTL 3.82e-02 -0.176 0.0844 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -233009 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0525 0.0583 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 317845 sc-eQTL 1.94e-01 0.116 0.0893 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 190178 sc-eQTL 5.04e-01 0.0556 0.0831 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -464199 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0855 0.0671 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -279630 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00732 0.0905 0.28 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -522235 sc-eQTL 1.90e-01 0.139 0.106 0.28 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -98997 eQTL 8.96e-04 -0.0991 0.0297 0.0 0.0 0.224

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina