logo

Genes within 1Mb (chr12:101595565:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0179 0.0514 0.145 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0151 0.0895 0.145 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0286 0.0544 0.145 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 5.95e-02 0.148 0.078 0.145 B L1
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0995 0.0892 0.145 B L1
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.07e-01 0.051 0.0768 0.145 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0275 0.0615 0.145 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 7.30e-01 0.0241 0.0698 0.145 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 4.37e-01 0.0863 0.111 0.145 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 1.13e-01 -0.168 0.106 0.145 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 9.84e-01 0.00197 0.0991 0.145 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0422 0.0809 0.145 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0923 0.109 0.145 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.94e-01 0.0983 0.0755 0.145 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 7.04e-01 0.0319 0.0838 0.145 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.69e-02 0.156 0.0813 0.145 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.74e-01 0.0165 0.0574 0.145 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 4.32e-01 0.0789 0.1 0.145 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0178 0.109 0.145 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0424 0.0713 0.145 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 9.07e-01 0.0105 0.09 0.145 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0663 0.0992 0.145 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0493 0.0705 0.145 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0858 0.101 0.145 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 3.43e-01 -0.107 0.113 0.144 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0874 0.103 0.144 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 8.03e-01 0.0284 0.114 0.144 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 6.56e-01 0.0543 0.122 0.144 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.57e-01 0.074 0.126 0.144 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.18e-01 0.0542 0.108 0.144 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 7.13e-01 0.033 0.0895 0.144 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 3.48e-01 0.111 0.118 0.144 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 6.60e-01 0.0427 0.0969 0.145 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0084 0.0821 0.145 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 3.81e-01 0.0902 0.103 0.145 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.04e-01 0.146 0.114 0.145 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0887 0.105 0.145 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0725 0.0928 0.145 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 1.18e-01 -0.118 0.0753 0.145 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0422 0.102 0.146 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 7.68e-02 -0.166 0.0936 0.146 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000519 0.0683 0.146 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 6.37e-01 0.0519 0.11 0.146 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 3.00e-01 0.105 0.101 0.146 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0306 0.0761 0.146 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 1.75e-01 -0.147 0.108 0.146 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 6.30e-01 0.0614 0.127 0.146 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 4.06e-01 0.0324 0.039 0.145 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 4.70e-01 0.0538 0.0743 0.145 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0701 0.109 0.145 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 4.06e-01 0.0652 0.0783 0.145 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 9.16e-01 -0.013 0.122 0.145 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.05e-01 0.0595 0.0892 0.145 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 9.15e-01 0.00851 0.0793 0.145 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0312 0.0951 0.145 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0177 0.0793 0.145 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00976 0.0922 0.145 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 7.96e-01 0.00673 0.0259 0.135 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 9.93e-01 0.00121 0.135 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.55e-02 -0.221 0.098 0.135 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 2.50e-01 0.162 0.141 0.135 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0456 0.137 0.135 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0329 0.141 0.135 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 3.05e-02 0.29 0.133 0.135 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 4.21e-01 0.109 0.135 0.135 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0378 0.111 0.135 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 3.46e-01 -0.105 0.111 0.135 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 1.29e-01 0.159 0.104 0.135 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0544 0.0522 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 3.04e-01 -0.134 0.13 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 1.01e-02 -0.179 0.0688 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 6.30e-01 0.0498 0.103 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.72e-01 0.126 0.115 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0156 0.129 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 3.13e-01 0.108 0.107 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0896 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 3.67e-01 0.109 0.12 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 6.22e-02 0.235 0.125 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 3.32e-01 0.118 0.121 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00474 0.0484 0.144 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 3.76e-01 -0.113 0.128 0.144 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 5.67e-02 -0.159 0.0827 0.144 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 4.23e-01 0.0915 0.114 0.144 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.64e-01 -0.14 0.125 0.144 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 2.74e-01 0.136 0.124 0.144 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0866 0.111 0.144 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 4.55e-01 0.0875 0.117 0.144 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0503 0.12 0.144 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 4.15e-01 0.1 0.123 0.144 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 1.54e-01 0.16 0.112 0.144 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0114 0.0661 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 7.76e-01 0.0341 0.12 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 8.52e-01 0.0116 0.0622 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.75e-02 0.208 0.0868 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0444 0.104 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0224 0.117 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0253 0.0882 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 2.99e-01 0.0993 0.0954 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 4.50e-01 0.0982 0.13 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 1.05e-02 -0.321 0.124 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0806 0.118 0.145 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0486 0.0585 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 7.63e-02 0.212 0.119 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 8.33e-01 0.0136 0.0643 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.00e+00 -6.29e-07 0.0996 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.23e-01 -0.141 0.115 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 9.10e-01 0.0144 0.127 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0796 0.11 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 5.64e-01 0.0631 0.109 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 2.83e-01 0.124 0.115 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 3.00e-01 -0.137 0.132 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0684 0.114 0.146 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 3.63e-01 -0.118 0.13 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 3.62e-01 -0.119 0.13 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 2.03e-01 -0.145 0.113 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 3.34e-01 0.121 0.125 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0643 0.133 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 1.11e-01 0.203 0.127 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 9.35e-01 0.00765 0.0941 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0753 0.108 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 3.25e-02 0.178 0.0828 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.56e-01 0.104 0.0908 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 1.57e-01 0.14 0.0983 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000809 0.069 0.145 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 9.15e-01 -0.0106 0.0989 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 1.73e-01 -0.155 0.114 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0506 0.0882 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0655 0.11 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 3.10e-02 0.222 0.102 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.53e-01 0.0213 0.0678 0.145 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0952 0.116 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0686 0.112 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0647 0.108 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0813 0.117 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0581 0.11 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.31e-01 -0.034 0.0989 0.145 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 6.91e-01 0.0427 0.107 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 3.98e-01 -0.093 0.11 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0654 0.0879 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.68e-01 0.132 0.119 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 6.31e-02 -0.218 0.117 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0432 0.1 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 1.10e-01 -0.199 0.124 0.145 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0193 0.115 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0521 0.114 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 4.39e-01 0.0792 0.102 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0772 0.109 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 7.10e-01 0.044 0.118 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 8.46e-01 0.0152 0.0778 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 9.80e-01 0.00309 0.12 0.145 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 3.91e-01 -0.11 0.128 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.07e-01 0.145 0.114 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0509 0.119 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0547 0.129 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 4.64e-01 0.0932 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0252 0.114 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 1.47e-01 0.18 0.123 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0195 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0359 0.117 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 2.93e-01 -0.132 0.125 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 8.32e-01 0.0286 0.135 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 1.82e-01 -0.172 0.128 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0345 0.112 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 9.84e-01 0.00243 0.124 0.137 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 3.43e-01 0.0405 0.0426 0.143 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 6.13e-01 0.0606 0.12 0.143 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0542 0.117 0.143 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.75e-01 0.14 0.103 0.143 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 6.84e-01 0.0505 0.124 0.143 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00596 0.126 0.143 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0684 0.105 0.143 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 8.67e-01 0.02 0.119 0.143 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 7.63e-01 0.0353 0.117 0.143 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 3.82e-01 0.0905 0.103 0.143 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 4.35e-01 -0.1 0.128 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 1.90e-02 -0.217 0.0918 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 4.99e-01 0.0727 0.107 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.93e-01 0.132 0.125 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00474 0.123 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 8.46e-02 -0.191 0.11 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 3.87e-02 0.24 0.115 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 1.74e-01 -0.167 0.123 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0347 0.113 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.82e-01 -0.119 0.11 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0457 0.0836 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0153 0.116 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 8.72e-01 0.0181 0.112 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0858 0.096 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 6.16e-01 0.0586 0.117 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 8.72e-02 0.224 0.131 0.147 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 9.77e-01 0.00333 0.118 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0219 0.121 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0389 0.0969 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 5.44e-01 0.0769 0.127 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 7.00e-01 0.05 0.129 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.12 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 3.25e-01 -0.122 0.123 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 2.89e-02 0.264 0.12 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 5.16e-01 0.0748 0.115 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.29e-01 -0.13 0.107 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000102 0.0818 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.95e-01 -0.119 0.114 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 4.15e-01 0.0935 0.115 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 8.56e-01 0.0164 0.0904 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 2.38e-05 -0.487 0.113 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 1.25e-01 -0.195 0.126 0.147 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 8.79e-02 0.154 0.0892 0.174 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0403 0.122 0.174 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 6.97e-01 0.0368 0.0943 0.174 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.60e-01 0.19 0.134 0.174 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 8.77e-01 0.0242 0.156 0.174 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0597 0.0956 0.174 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 2.85e-01 -0.118 0.11 0.174 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 1.64e-02 0.266 0.109 0.174 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 1.09e-01 -0.208 0.129 0.174 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 2.35e-01 0.142 0.119 0.174 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 8.47e-01 0.0213 0.11 0.174 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 4.47e-01 0.0326 0.0427 0.143 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 5.49e-01 0.0518 0.0862 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 1.86e-01 0.151 0.114 0.143 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0947 0.0843 0.143 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 7.31e-02 -0.216 0.12 0.143 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0254 0.0913 0.143 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.43e-01 -0.046 0.0992 0.143 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 9.48e-02 0.142 0.0845 0.143 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 9.43e-01 0.00568 0.0789 0.143 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0975 0.086 0.143 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 5.45e-01 -0.073 0.12 0.145 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0546 0.125 0.145 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 5.13e-02 0.213 0.109 0.145 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 7.50e-01 -0.038 0.119 0.145 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 1.46e-01 -0.179 0.123 0.145 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0802 0.1 0.145 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 8.91e-01 0.0158 0.115 0.144 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.35e-01 -0.133 0.112 0.144 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 8.34e-01 0.0304 0.145 0.144 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 3.64e-01 0.119 0.131 0.144 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 3.42e-01 0.129 0.136 0.144 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 3.98e-01 0.108 0.128 0.144 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0382 0.0996 0.144 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 1.45e-01 0.165 0.113 0.144 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 4.91e-01 0.0758 0.11 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0295 0.083 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.37e-01 0.163 0.11 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 9.92e-01 0.00119 0.124 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0648 0.111 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 9.58e-01 0.00507 0.0957 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0177 0.0815 0.145 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0977 0.119 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0263 0.0915 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 2.83e-01 -0.119 0.111 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 9.25e-01 0.0123 0.13 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 1.25e-02 -0.304 0.121 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0552 0.113 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0326 0.0883 0.145 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 3.72e-01 0.146 0.163 0.124 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0383 0.153 0.124 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0438 0.115 0.124 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 7.27e-01 0.0533 0.152 0.124 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 4.01e-01 0.134 0.159 0.124 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 9.45e-01 -0.0103 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 7.88e-01 0.0407 0.151 0.124 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 6.18e-01 0.0741 0.148 0.124 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 9.41e-01 0.0101 0.136 0.124 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 6.78e-01 0.0493 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.83e-01 0.116 0.108 0.147 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0928 0.127 0.147 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 2.31e-01 0.143 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 2.38e-01 0.146 0.123 0.147 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.64e-01 -0.052 0.119 0.147 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 2.98e-01 -0.109 0.104 0.147 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 2.18e-01 0.148 0.119 0.149 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 4.02e-01 0.0928 0.11 0.149 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.47e-01 0.192 0.132 0.149 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 4.87e-01 0.0805 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 5.04e-01 0.0744 0.111 0.149 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 2.64e-01 -0.12 0.107 0.149 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0718 0.0996 0.149 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0654 0.144 0.15 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0574 0.126 0.15 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 3.71e-01 0.119 0.133 0.15 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0547 0.132 0.15 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 7.25e-01 0.049 0.139 0.15 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 6.79e-01 0.0504 0.121 0.15 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0462 0.0938 0.15 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0788 0.125 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0158 0.0606 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 1.15e-01 -0.192 0.121 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 1.94e-02 -0.149 0.0632 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 2.70e-01 0.111 0.1 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0152 0.104 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0546 0.117 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.09e-01 0.0327 0.0875 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0109 0.105 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 5.86e-01 0.0659 0.121 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 1.80e-01 0.169 0.126 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 1.51e-02 0.303 0.124 0.145 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -886179 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0423 0.0698 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 1.92e-01 0.149 0.114 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 5.52e-01 0.0336 0.0564 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 1.77e-01 0.109 0.0805 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0903 0.0988 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 9.52e-01 0.00679 0.113 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 3.03e-01 -0.087 0.0843 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 3.05e-01 0.0908 0.0884 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -143907 sc-eQTL 3.24e-01 0.126 0.128 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 1.34e-02 -0.32 0.128 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -602020 sc-eQTL 3.75e-01 -0.105 0.118 0.145 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 7.95e-01 0.0265 0.102 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0485 0.0824 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 5.02e-01 0.0713 0.106 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 6.98e-01 0.0487 0.125 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 8.58e-02 -0.184 0.107 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0347 0.0933 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0433 0.0766 0.145 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 3.05e-01 0.12 0.116 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.65e-01 0.114 0.102 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 3.77e-01 0.109 0.123 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 3.20e-02 0.254 0.117 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 2.54e-01 0.135 0.118 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 3.09e-01 -0.104 0.102 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 6.26e-02 -0.164 0.0876 0.147 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -524555 sc-eQTL 9.80e-01 0.00272 0.108 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -101382 sc-eQTL 2.58e-01 -0.119 0.105 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -235394 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0279 0.0722 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 315460 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00219 0.111 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 187793 sc-eQTL 4.96e-01 0.0701 0.103 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -466584 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0236 0.0832 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -282015 sc-eQTL 1.24e-01 -0.172 0.111 0.147 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -524620 sc-eQTL 3.33e-01 0.127 0.131 0.147 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000139351 SYCP3 -143904 eQTL 0.00564 -0.15 0.054 0.0 0.0 0.127

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina