logo

Genes within 1Mb (chr12:101590959:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0594 0.0425 0.25 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 4.75e-01 0.0531 0.0742 0.25 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 4.84e-02 -0.0888 0.0447 0.25 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 4.02e-01 0.0548 0.0652 0.25 B L1
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0583 0.0742 0.25 B L1
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 3.17e-01 0.0638 0.0637 0.25 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 7.14e-01 0.0187 0.0511 0.25 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 1.57e-01 0.082 0.0577 0.25 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0419 0.092 0.25 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0392 0.0881 0.25 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0391 0.0822 0.25 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0252 0.0676 0.25 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0161 0.0912 0.25 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0561 0.0632 0.25 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.36e-01 0.0332 0.0699 0.25 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.86e-01 0.0904 0.0681 0.25 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00283 0.0479 0.25 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 6.00e-01 0.0445 0.0847 0.25 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 7.99e-01 0.0234 0.0919 0.25 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0143 0.0603 0.25 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0457 0.0761 0.25 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.48e-01 -0.121 0.0836 0.25 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0415 0.0596 0.25 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 5.80e-03 0.234 0.084 0.25 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 1.63e-01 -0.13 0.0928 0.257 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 8.95e-01 0.0112 0.0852 0.257 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 4.90e-01 0.0648 0.0936 0.257 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0655 0.1 0.257 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0328 0.104 0.257 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 2.27e-02 0.203 0.0883 0.257 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 7.17e-01 0.0268 0.0738 0.257 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 1.73e-01 0.132 0.0969 0.257 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0124 0.0808 0.25 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 3.13e-01 -0.069 0.0682 0.25 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 1.63e-01 0.12 0.0854 0.25 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 1.08e-01 0.154 0.0951 0.25 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 7.02e-01 0.0337 0.088 0.25 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 3.81e-01 0.0678 0.0773 0.25 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0254 0.0631 0.25 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0839 0.0842 0.251 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 5.99e-02 -0.147 0.0777 0.251 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0279 0.0568 0.251 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 8.89e-02 0.155 0.0907 0.251 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00373 0.084 0.251 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0989 0.0629 0.251 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 4.30e-01 0.0711 0.0899 0.251 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 2.27e-01 0.128 0.105 0.251 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 8.86e-01 0.00459 0.0321 0.25 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 9.53e-01 0.00358 0.0612 0.25 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0894 0.0892 0.25 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0346 0.0644 0.25 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0541 0.101 0.25 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 4.14e-01 0.06 0.0733 0.25 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 1.50e-01 0.0938 0.0649 0.25 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0526 0.0782 0.25 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 8.92e-01 0.00887 0.0652 0.25 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0511 0.0758 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0299 0.0206 0.242 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 4.41e-01 0.0827 0.107 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 3.42e-02 -0.167 0.0783 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 2.77e-01 0.122 0.112 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0636 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00739 0.113 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 4.31e-01 0.0845 0.107 0.242 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 8.37e-01 0.0221 0.108 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 3.29e-01 0.0864 0.0882 0.242 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 1.61e-01 0.125 0.0885 0.242 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 2.72e-01 0.0919 0.0834 0.242 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00122 0.0423 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 6.15e-01 0.053 0.105 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0858 0.0563 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0446 0.0836 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 4.95e-01 0.0635 0.0928 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 7.80e-01 0.0293 0.105 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 3.50e-01 0.0807 0.0862 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0745 0.0926 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 5.87e-01 0.053 0.0974 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 6.70e-01 0.0437 0.102 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 2.85e-01 0.105 0.0978 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 1.56e-01 0.0554 0.0389 0.248 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0742 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 1.97e-02 -0.156 0.0666 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 2.99e-01 0.0959 0.0921 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 9.74e-01 0.00336 0.101 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.51e-03 0.316 0.0984 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 8.60e-01 0.0159 0.0902 0.248 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 1.10e-01 0.151 0.094 0.248 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 6.51e-01 -0.044 0.0973 0.248 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 9.25e-02 0.167 0.0989 0.248 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 2.70e-02 0.199 0.0896 0.248 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00595 0.0536 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 2.96e-01 0.101 0.0968 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 4.67e-02 -0.1 0.05 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 9.28e-02 0.12 0.0709 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 2.27e-01 -0.102 0.0844 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0198 0.0945 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00504 0.0715 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 7.04e-02 0.14 0.0769 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0172 0.105 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 2.79e-01 -0.111 0.102 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 2.32e-01 -0.115 0.0957 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 6.82e-02 -0.0853 0.0465 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00439 0.0961 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0334 0.0514 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0459 0.0796 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 1.09e-01 -0.148 0.0918 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.81e-01 -0.136 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0563 0.0883 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 1.43e-01 0.128 0.087 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 2.67e-01 -0.102 0.0919 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0322 0.0915 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0961 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00656 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0654 0.0944 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 3.50e-02 0.218 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 6.83e-01 0.045 0.11 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 8.04e-03 0.278 0.104 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 7.54e-01 0.0245 0.0779 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.90e-01 0.00113 0.0899 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 5.31e-01 0.0434 0.0692 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 5.29e-01 0.0476 0.0754 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.57e-01 0.116 0.0814 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0685 0.057 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0148 0.0818 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0704 0.0943 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 6.11e-02 -0.136 0.0725 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0433 0.0914 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 7.85e-01 0.0234 0.0856 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 2.67e-01 0.0623 0.056 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0274 0.0968 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.27e-01 0.00857 0.0931 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0816 0.0895 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0286 0.097 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 8.45e-01 0.018 0.0917 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 1.80e-01 0.11 0.0818 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0895 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0668 0.092 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0198 0.0737 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.47e-01 0.0457 0.0996 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 5.91e-01 -0.053 0.0985 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 1.50e-01 -0.121 0.0837 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.71e-01 0.0445 0.105 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0976 0.0958 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.07e-01 0.0112 0.0954 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00706 0.0857 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0289 0.0911 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0523 0.0988 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 7.24e-01 0.023 0.0651 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 7.33e-02 0.18 0.0998 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0413 0.105 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.09e-02 0.159 0.0938 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 7.60e-01 0.0299 0.0978 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0783 0.107 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0268 0.105 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 5.98e-01 0.0496 0.0938 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.35e-02 0.189 0.101 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0211 0.0995 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 8.71e-01 0.0153 0.0941 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0114 0.101 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 7.66e-01 0.0322 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.42e-01 -0.152 0.103 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 6.43e-01 0.0419 0.0904 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 8.67e-02 0.17 0.0989 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 8.80e-01 0.00536 0.0353 0.251 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 5.69e-01 0.0565 0.099 0.251 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0735 0.0965 0.251 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0118 0.0856 0.251 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.04e-01 0.0533 0.103 0.251 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 4.29e-01 0.0828 0.105 0.251 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 7.20e-01 0.0313 0.087 0.251 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 9.19e-01 0.0101 0.0988 0.251 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0476 0.0967 0.251 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0375 0.0856 0.251 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 1.67e-01 -0.148 0.107 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 1.07e-01 -0.125 0.077 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 1.46e-01 0.13 0.0891 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 1.26e-01 0.16 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00553 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0992 0.0921 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 3.48e-01 0.0911 0.097 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0827 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 2.05e-01 -0.118 0.0928 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 1.24e-01 -0.14 0.0905 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0937 0.0685 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 1.79e-01 0.128 0.0952 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0771 0.0923 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0675 0.079 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 5.40e-01 0.059 0.096 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 3.53e-02 0.227 0.107 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 3.92e-01 0.0845 0.0984 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0454 0.101 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 6.07e-01 0.0419 0.0813 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 5.72e-01 0.0602 0.106 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 6.47e-01 0.0498 0.109 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 1.93e-01 -0.131 0.1 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0409 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 7.44e-03 0.271 0.1 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 8.98e-01 0.0122 0.0945 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.46e-02 -0.148 0.0878 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 5.78e-01 0.0374 0.0671 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.94e-01 0.0368 0.0936 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 5.31e-01 0.059 0.0941 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00474 0.0742 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0496 0.0966 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 1.05e-01 -0.169 0.104 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 4.39e-01 0.0573 0.0737 0.267 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 9.47e-01 0.00657 0.0995 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 5.96e-01 0.0409 0.077 0.267 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 3.60e-01 0.102 0.11 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 5.35e-01 0.0791 0.127 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 4.72e-01 0.0563 0.0781 0.267 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0581 0.0902 0.267 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 4.08e-02 0.186 0.09 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0836 0.106 0.267 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 6.26e-01 0.0476 0.0974 0.267 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 5.80e-01 0.0501 0.0901 0.267 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0277 0.0356 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 3.48e-01 0.0675 0.0717 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0654 0.0951 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 6.82e-02 -0.128 0.0699 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 3.42e-02 -0.212 0.0995 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 9.05e-01 0.00911 0.0761 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 8.12e-01 0.0196 0.0827 0.246 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0158 0.0709 0.246 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 5.01e-01 0.0442 0.0656 0.246 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 4.37e-01 -0.056 0.0718 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0942 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0583 0.105 0.25 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 4.72e-01 0.0659 0.0914 0.25 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 8.91e-01 0.0137 0.0997 0.25 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.22e-01 -0.159 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0939 0.0835 0.25 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 4.31e-02 -0.189 0.0927 0.254 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.54e-01 0.00528 0.0915 0.254 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 3.72e-01 -0.105 0.118 0.254 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0474 0.107 0.254 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 4.61e-01 0.0819 0.111 0.254 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 7.51e-02 0.185 0.103 0.254 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 9.04e-01 0.00979 0.0812 0.254 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0476 0.0925 0.254 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 4.38e-01 0.0706 0.0909 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0212 0.0686 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 1.25e-01 0.14 0.0906 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 3.00e-01 0.106 0.102 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0915 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 1.97e-01 0.102 0.0788 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 4.34e-01 0.0529 0.0674 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 6.51e-02 -0.18 0.0971 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 3.30e-02 -0.159 0.0743 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 4.28e-01 0.0724 0.0912 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 3.59e-01 0.0982 0.107 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0863 0.1 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 3.85e-01 0.0808 0.0928 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.78e-01 0.0302 0.0724 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 5.26e-01 0.0801 0.126 0.236 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 9.46e-01 0.00807 0.119 0.236 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 7.85e-01 0.0244 0.0893 0.236 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0816 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 1.80e-01 0.165 0.123 0.236 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0044 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 8.36e-02 0.202 0.116 0.236 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 6.38e-01 0.0542 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0906 0.105 0.236 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 5.91e-01 0.0526 0.0979 0.256 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0245 0.0896 0.256 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 1.96e-01 -0.136 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.14e-01 0.0497 0.0984 0.256 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0259 0.102 0.256 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 9.12e-01 -0.011 0.0985 0.256 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0826 0.0859 0.256 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 7.15e-01 0.0362 0.0992 0.253 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 1.91e-01 -0.12 0.0912 0.253 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 2.10e-01 0.138 0.109 0.253 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 7.89e-01 0.0257 0.0959 0.253 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0717 0.0921 0.253 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0497 0.0886 0.253 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0172 0.0825 0.253 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 1.88e-01 0.154 0.116 0.26 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0966 0.102 0.26 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 2.83e-03 0.318 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 6.97e-01 0.0418 0.107 0.26 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0304 0.113 0.26 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 3.04e-02 0.212 0.097 0.26 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0755 0.0759 0.26 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 1.01e-01 0.165 0.1 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 5.86e-01 0.0267 0.0489 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0307 0.0982 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 4.11e-02 -0.105 0.0512 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 6.71e-01 0.0346 0.0812 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 8.38e-01 0.0171 0.0837 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 9.05e-02 0.16 0.094 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 5.33e-01 0.0441 0.0706 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 8.69e-01 0.0139 0.0846 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 5.85e-01 0.0533 0.0974 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 4.81e-02 0.199 0.1 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -890785 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0544 0.0567 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 4.74e-01 0.0667 0.0929 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0473 0.0458 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 6.44e-01 0.0305 0.0657 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 8.32e-02 -0.139 0.0799 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0797 0.0917 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0733 0.0686 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 4.22e-02 0.146 0.0714 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -148513 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0669 0.104 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 1.33e-01 -0.159 0.105 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -606626 sc-eQTL 1.78e-01 -0.13 0.0961 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0285 0.0846 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0803 0.0682 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 1.26e-01 0.135 0.0876 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 8.10e-02 0.181 0.103 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 5.79e-01 0.0494 0.089 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 3.15e-01 0.0778 0.0773 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.49e-01 0.0289 0.0635 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 6.89e-01 0.0385 0.096 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0902 0.0837 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 7.93e-01 0.0267 0.102 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 7.45e-01 0.0318 0.0977 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0662 0.0969 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0316 0.0842 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0757 0.0725 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -529161 sc-eQTL 5.90e-01 -0.048 0.089 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 sc-eQTL 1.35e-01 -0.13 0.0865 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -240000 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0452 0.0595 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 310854 sc-eQTL 1.40e-01 0.135 0.0909 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 183187 sc-eQTL 8.52e-01 0.0159 0.0848 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -471190 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0971 0.0683 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -286621 sc-eQTL 6.04e-01 0.0478 0.0921 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -529226 sc-eQTL 1.07e-01 0.174 0.108 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -105988 eQTL 1.34e-03 -0.1 0.0311 0.0 0.0 0.202

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -333760 2.67e-07 1.33e-07 8.99e-08 2.54e-07 1.01e-07 9.05e-08 1.81e-07 5.33e-08 1.45e-07 6.75e-08 1.57e-07 8.55e-08 1.69e-07 8.07e-08 5.98e-08 7.23e-08 3.98e-08 1.33e-07 7.76e-08 4.04e-08 1.21e-07 1.31e-07 1.64e-07 2.64e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.29e-07 1.12e-07 1.22e-07 1.03e-07 1.06e-07 3.92e-08 2.91e-08 9.3e-08 3.81e-08 2.95e-08 6.29e-08 8.57e-08 6.49e-08 8.09e-08 4.6e-08 1.48e-07 4.7e-08 1.86e-07 2.64e-08 9.86e-09 1.2e-07 1.88e-09 4.81e-08