logo

Genes within 1Mb (chr12:101589605:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0594 0.0425 0.25 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 4.75e-01 0.0531 0.0742 0.25 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 4.84e-02 -0.0888 0.0447 0.25 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 4.02e-01 0.0548 0.0652 0.25 B L1
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0583 0.0742 0.25 B L1
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 3.17e-01 0.0638 0.0637 0.25 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 7.14e-01 0.0187 0.0511 0.25 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 1.57e-01 0.082 0.0577 0.25 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0419 0.092 0.25 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0392 0.0881 0.25 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0391 0.0822 0.25 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0252 0.0676 0.25 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0161 0.0912 0.25 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0561 0.0632 0.25 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.36e-01 0.0332 0.0699 0.25 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.86e-01 0.0904 0.0681 0.25 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00283 0.0479 0.25 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 6.00e-01 0.0445 0.0847 0.25 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 7.99e-01 0.0234 0.0919 0.25 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0143 0.0603 0.25 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0457 0.0761 0.25 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.48e-01 -0.121 0.0836 0.25 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0415 0.0596 0.25 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 5.80e-03 0.234 0.084 0.25 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 1.63e-01 -0.13 0.0928 0.257 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 8.95e-01 0.0112 0.0852 0.257 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 4.90e-01 0.0648 0.0936 0.257 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0655 0.1 0.257 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0328 0.104 0.257 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 2.27e-02 0.203 0.0883 0.257 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 7.17e-01 0.0268 0.0738 0.257 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 1.73e-01 0.132 0.0969 0.257 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0124 0.0808 0.25 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 3.13e-01 -0.069 0.0682 0.25 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 1.63e-01 0.12 0.0854 0.25 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 1.08e-01 0.154 0.0951 0.25 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 7.02e-01 0.0337 0.088 0.25 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 3.81e-01 0.0678 0.0773 0.25 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0254 0.0631 0.25 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0839 0.0842 0.251 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 5.99e-02 -0.147 0.0777 0.251 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0279 0.0568 0.251 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 8.89e-02 0.155 0.0907 0.251 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00373 0.084 0.251 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0989 0.0629 0.251 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 4.30e-01 0.0711 0.0899 0.251 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 2.27e-01 0.128 0.105 0.251 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 8.86e-01 0.00459 0.0321 0.25 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 9.53e-01 0.00358 0.0612 0.25 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0894 0.0892 0.25 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0346 0.0644 0.25 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0541 0.101 0.25 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 4.14e-01 0.06 0.0733 0.25 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 1.50e-01 0.0938 0.0649 0.25 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0526 0.0782 0.25 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 8.92e-01 0.00887 0.0652 0.25 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0511 0.0758 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0299 0.0206 0.242 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 4.41e-01 0.0827 0.107 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 3.42e-02 -0.167 0.0783 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 2.77e-01 0.122 0.112 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0636 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00739 0.113 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 4.31e-01 0.0845 0.107 0.242 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 8.37e-01 0.0221 0.108 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 3.29e-01 0.0864 0.0882 0.242 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 1.61e-01 0.125 0.0885 0.242 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 2.72e-01 0.0919 0.0834 0.242 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00122 0.0423 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 6.15e-01 0.053 0.105 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0858 0.0563 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0446 0.0836 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 4.95e-01 0.0635 0.0928 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 7.80e-01 0.0293 0.105 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 3.50e-01 0.0807 0.0862 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0745 0.0926 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 5.87e-01 0.053 0.0974 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 6.70e-01 0.0437 0.102 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 2.85e-01 0.105 0.0978 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 1.56e-01 0.0554 0.0389 0.248 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0742 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 1.97e-02 -0.156 0.0666 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 2.99e-01 0.0959 0.0921 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 9.74e-01 0.00336 0.101 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.51e-03 0.316 0.0984 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 8.60e-01 0.0159 0.0902 0.248 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 1.10e-01 0.151 0.094 0.248 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 6.51e-01 -0.044 0.0973 0.248 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 9.25e-02 0.167 0.0989 0.248 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 2.70e-02 0.199 0.0896 0.248 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00595 0.0536 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 2.96e-01 0.101 0.0968 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 4.67e-02 -0.1 0.05 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 9.28e-02 0.12 0.0709 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 2.27e-01 -0.102 0.0844 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0198 0.0945 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00504 0.0715 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 7.04e-02 0.14 0.0769 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0172 0.105 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 2.79e-01 -0.111 0.102 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 2.32e-01 -0.115 0.0957 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 6.82e-02 -0.0853 0.0465 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00439 0.0961 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0334 0.0514 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0459 0.0796 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 1.09e-01 -0.148 0.0918 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.81e-01 -0.136 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0563 0.0883 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 1.43e-01 0.128 0.087 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 2.67e-01 -0.102 0.0919 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0322 0.0915 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0961 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00656 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0654 0.0944 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 3.50e-02 0.218 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 6.83e-01 0.045 0.11 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 8.04e-03 0.278 0.104 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 7.54e-01 0.0245 0.0779 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.90e-01 0.00113 0.0899 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 5.31e-01 0.0434 0.0692 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 5.29e-01 0.0476 0.0754 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.57e-01 0.116 0.0814 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0685 0.057 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0148 0.0818 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0704 0.0943 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 6.11e-02 -0.136 0.0725 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0433 0.0914 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 7.85e-01 0.0234 0.0856 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 2.67e-01 0.0623 0.056 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0274 0.0968 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.27e-01 0.00857 0.0931 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0816 0.0895 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0286 0.097 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 8.45e-01 0.018 0.0917 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 1.80e-01 0.11 0.0818 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0895 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0668 0.092 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0198 0.0737 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.47e-01 0.0457 0.0996 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 5.91e-01 -0.053 0.0985 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 1.50e-01 -0.121 0.0837 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.71e-01 0.0445 0.105 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0976 0.0958 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.07e-01 0.0112 0.0954 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00706 0.0857 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0289 0.0911 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0523 0.0988 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 7.24e-01 0.023 0.0651 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 7.33e-02 0.18 0.0998 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0413 0.105 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.09e-02 0.159 0.0938 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 7.60e-01 0.0299 0.0978 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0783 0.107 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0268 0.105 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 5.98e-01 0.0496 0.0938 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.35e-02 0.189 0.101 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0211 0.0995 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 8.71e-01 0.0153 0.0941 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0114 0.101 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 7.66e-01 0.0322 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.42e-01 -0.152 0.103 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 6.43e-01 0.0419 0.0904 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 8.67e-02 0.17 0.0989 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 8.80e-01 0.00536 0.0353 0.251 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 5.69e-01 0.0565 0.099 0.251 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0735 0.0965 0.251 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0118 0.0856 0.251 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.04e-01 0.0533 0.103 0.251 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 4.29e-01 0.0828 0.105 0.251 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 7.20e-01 0.0313 0.087 0.251 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 9.19e-01 0.0101 0.0988 0.251 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0476 0.0967 0.251 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0375 0.0856 0.251 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 1.67e-01 -0.148 0.107 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 1.07e-01 -0.125 0.077 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 1.46e-01 0.13 0.0891 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 1.26e-01 0.16 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00553 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0992 0.0921 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 3.48e-01 0.0911 0.097 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0827 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 2.05e-01 -0.118 0.0928 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 1.24e-01 -0.14 0.0905 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0937 0.0685 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 1.79e-01 0.128 0.0952 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0771 0.0923 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0675 0.079 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 5.40e-01 0.059 0.096 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 3.53e-02 0.227 0.107 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 3.92e-01 0.0845 0.0984 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0454 0.101 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 6.07e-01 0.0419 0.0813 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 5.72e-01 0.0602 0.106 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 6.47e-01 0.0498 0.109 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 1.93e-01 -0.131 0.1 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0409 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 7.44e-03 0.271 0.1 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 8.98e-01 0.0122 0.0945 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.46e-02 -0.148 0.0878 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 5.78e-01 0.0374 0.0671 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.94e-01 0.0368 0.0936 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 5.31e-01 0.059 0.0941 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00474 0.0742 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0496 0.0966 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 1.05e-01 -0.169 0.104 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 4.39e-01 0.0573 0.0737 0.267 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 9.47e-01 0.00657 0.0995 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 5.96e-01 0.0409 0.077 0.267 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 3.60e-01 0.102 0.11 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 5.35e-01 0.0791 0.127 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 4.72e-01 0.0563 0.0781 0.267 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0581 0.0902 0.267 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 4.08e-02 0.186 0.09 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0836 0.106 0.267 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 6.26e-01 0.0476 0.0974 0.267 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 5.80e-01 0.0501 0.0901 0.267 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0277 0.0356 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 3.48e-01 0.0675 0.0717 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0654 0.0951 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 6.82e-02 -0.128 0.0699 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 3.42e-02 -0.212 0.0995 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 9.05e-01 0.00911 0.0761 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 8.12e-01 0.0196 0.0827 0.246 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0158 0.0709 0.246 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 5.01e-01 0.0442 0.0656 0.246 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 4.37e-01 -0.056 0.0718 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0942 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0583 0.105 0.25 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 4.72e-01 0.0659 0.0914 0.25 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 8.91e-01 0.0137 0.0997 0.25 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.22e-01 -0.159 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0939 0.0835 0.25 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 4.31e-02 -0.189 0.0927 0.254 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.54e-01 0.00528 0.0915 0.254 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 3.72e-01 -0.105 0.118 0.254 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0474 0.107 0.254 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 4.61e-01 0.0819 0.111 0.254 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 7.51e-02 0.185 0.103 0.254 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 9.04e-01 0.00979 0.0812 0.254 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0476 0.0925 0.254 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 4.38e-01 0.0706 0.0909 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0212 0.0686 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 1.25e-01 0.14 0.0906 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 3.00e-01 0.106 0.102 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0915 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 1.97e-01 0.102 0.0788 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 4.34e-01 0.0529 0.0674 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 6.51e-02 -0.18 0.0971 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 3.30e-02 -0.159 0.0743 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 4.28e-01 0.0724 0.0912 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 3.59e-01 0.0982 0.107 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0863 0.1 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 3.85e-01 0.0808 0.0928 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.78e-01 0.0302 0.0724 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 5.26e-01 0.0801 0.126 0.236 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 9.46e-01 0.00807 0.119 0.236 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 7.85e-01 0.0244 0.0893 0.236 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0816 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 1.80e-01 0.165 0.123 0.236 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0044 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 8.36e-02 0.202 0.116 0.236 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 6.38e-01 0.0542 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0906 0.105 0.236 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 5.91e-01 0.0526 0.0979 0.256 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0245 0.0896 0.256 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 1.96e-01 -0.136 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.14e-01 0.0497 0.0984 0.256 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0259 0.102 0.256 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 9.12e-01 -0.011 0.0985 0.256 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0826 0.0859 0.256 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 7.15e-01 0.0362 0.0992 0.253 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 1.91e-01 -0.12 0.0912 0.253 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 2.10e-01 0.138 0.109 0.253 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 7.89e-01 0.0257 0.0959 0.253 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0717 0.0921 0.253 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0497 0.0886 0.253 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0172 0.0825 0.253 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 1.88e-01 0.154 0.116 0.26 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0966 0.102 0.26 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 2.83e-03 0.318 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 6.97e-01 0.0418 0.107 0.26 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0304 0.113 0.26 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 3.04e-02 0.212 0.097 0.26 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0755 0.0759 0.26 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 1.01e-01 0.165 0.1 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 5.86e-01 0.0267 0.0489 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0307 0.0982 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 4.11e-02 -0.105 0.0512 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 6.71e-01 0.0346 0.0812 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 8.38e-01 0.0171 0.0837 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 9.05e-02 0.16 0.094 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 5.33e-01 0.0441 0.0706 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 8.69e-01 0.0139 0.0846 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 5.85e-01 0.0533 0.0974 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 4.81e-02 0.199 0.1 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -892139 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0544 0.0567 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 4.74e-01 0.0667 0.0929 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0473 0.0458 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 6.44e-01 0.0305 0.0657 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 8.32e-02 -0.139 0.0799 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0797 0.0917 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0733 0.0686 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 4.22e-02 0.146 0.0714 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -149867 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0669 0.104 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 1.33e-01 -0.159 0.105 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -607980 sc-eQTL 1.78e-01 -0.13 0.0961 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0285 0.0846 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0803 0.0682 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 1.26e-01 0.135 0.0876 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 8.10e-02 0.181 0.103 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 5.79e-01 0.0494 0.089 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 3.15e-01 0.0778 0.0773 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.49e-01 0.0289 0.0635 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 6.89e-01 0.0385 0.096 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0902 0.0837 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 7.93e-01 0.0267 0.102 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 7.45e-01 0.0318 0.0977 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0662 0.0969 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0316 0.0842 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0757 0.0725 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -530515 sc-eQTL 5.90e-01 -0.048 0.089 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 sc-eQTL 1.35e-01 -0.13 0.0865 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -241354 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0452 0.0595 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 309500 sc-eQTL 1.40e-01 0.135 0.0909 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 181833 sc-eQTL 8.52e-01 0.0159 0.0848 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -472544 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0971 0.0683 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -287975 sc-eQTL 6.04e-01 0.0478 0.0921 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -530580 sc-eQTL 1.07e-01 0.174 0.108 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -107342 eQTL 1.14e-03 -0.102 0.0311 0.0 0.0 0.2

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -335114 1.28e-06 9.45e-07 3.2e-07 3.38e-07 2.69e-07 4.11e-07 9.92e-07 3.28e-07 1.13e-06 3.89e-07 1.26e-06 5.86e-07 1.53e-06 2.54e-07 4.36e-07 6.89e-07 7.93e-07 5.68e-07 5.07e-07 5.57e-07 3.61e-07 9.67e-07 7.15e-07 5.84e-07 1.74e-06 3.06e-07 6.16e-07 5.44e-07 9.39e-07 1.03e-06 5.1e-07 4.97e-08 1.95e-07 4.87e-07 3.96e-07 3.91e-07 3.62e-07 1.54e-07 1.71e-07 8.93e-08 3.03e-07 1.22e-06 6.12e-08 1.22e-08 1.85e-07 7.43e-08 1.86e-07 8.58e-08 9.51e-08