logo

Genes within 1Mb (chr12:101588019:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0594 0.0425 0.25 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 4.75e-01 0.0531 0.0742 0.25 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 4.84e-02 -0.0888 0.0447 0.25 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 4.02e-01 0.0548 0.0652 0.25 B L1
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0583 0.0742 0.25 B L1
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 3.17e-01 0.0638 0.0637 0.25 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 7.14e-01 0.0187 0.0511 0.25 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 1.57e-01 0.082 0.0577 0.25 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0419 0.092 0.25 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0392 0.0881 0.25 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0391 0.0822 0.25 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0252 0.0676 0.25 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0161 0.0912 0.25 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0561 0.0632 0.25 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.36e-01 0.0332 0.0699 0.25 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.86e-01 0.0904 0.0681 0.25 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00283 0.0479 0.25 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 6.00e-01 0.0445 0.0847 0.25 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 7.99e-01 0.0234 0.0919 0.25 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0143 0.0603 0.25 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0457 0.0761 0.25 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.48e-01 -0.121 0.0836 0.25 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0415 0.0596 0.25 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 5.80e-03 0.234 0.084 0.25 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 1.63e-01 -0.13 0.0928 0.257 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 8.95e-01 0.0112 0.0852 0.257 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 4.90e-01 0.0648 0.0936 0.257 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0655 0.1 0.257 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0328 0.104 0.257 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 2.27e-02 0.203 0.0883 0.257 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 7.17e-01 0.0268 0.0738 0.257 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 1.73e-01 0.132 0.0969 0.257 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0124 0.0808 0.25 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 3.13e-01 -0.069 0.0682 0.25 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 1.63e-01 0.12 0.0854 0.25 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 1.08e-01 0.154 0.0951 0.25 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 7.02e-01 0.0337 0.088 0.25 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 3.81e-01 0.0678 0.0773 0.25 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0254 0.0631 0.25 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0839 0.0842 0.251 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 5.99e-02 -0.147 0.0777 0.251 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0279 0.0568 0.251 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 8.89e-02 0.155 0.0907 0.251 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00373 0.084 0.251 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 1.17e-01 -0.0989 0.0629 0.251 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 4.30e-01 0.0711 0.0899 0.251 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 2.27e-01 0.128 0.105 0.251 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 8.86e-01 0.00459 0.0321 0.25 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 9.53e-01 0.00358 0.0612 0.25 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0894 0.0892 0.25 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0346 0.0644 0.25 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0541 0.101 0.25 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 4.14e-01 0.06 0.0733 0.25 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 1.50e-01 0.0938 0.0649 0.25 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0526 0.0782 0.25 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 8.92e-01 0.00887 0.0652 0.25 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0511 0.0758 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0299 0.0206 0.242 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 4.41e-01 0.0827 0.107 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 3.42e-02 -0.167 0.0783 0.242 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 2.77e-01 0.122 0.112 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0636 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00739 0.113 0.242 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 4.31e-01 0.0845 0.107 0.242 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 8.37e-01 0.0221 0.108 0.242 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 3.29e-01 0.0864 0.0882 0.242 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 1.61e-01 0.125 0.0885 0.242 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 2.72e-01 0.0919 0.0834 0.242 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00122 0.0423 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 6.15e-01 0.053 0.105 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0858 0.0563 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0446 0.0836 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 4.95e-01 0.0635 0.0928 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 7.80e-01 0.0293 0.105 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 3.50e-01 0.0807 0.0862 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0745 0.0926 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 5.87e-01 0.053 0.0974 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 6.70e-01 0.0437 0.102 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 2.85e-01 0.105 0.0978 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 1.56e-01 0.0554 0.0389 0.248 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0742 0.103 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 1.97e-02 -0.156 0.0666 0.248 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 2.99e-01 0.0959 0.0921 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 9.74e-01 0.00336 0.101 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.51e-03 0.316 0.0984 0.248 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 8.60e-01 0.0159 0.0902 0.248 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 1.10e-01 0.151 0.094 0.248 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 6.51e-01 -0.044 0.0973 0.248 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 9.25e-02 0.167 0.0989 0.248 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 2.70e-02 0.199 0.0896 0.248 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00595 0.0536 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 2.96e-01 0.101 0.0968 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 4.67e-02 -0.1 0.05 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 9.28e-02 0.12 0.0709 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 2.27e-01 -0.102 0.0844 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0198 0.0945 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00504 0.0715 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 7.04e-02 0.14 0.0769 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0172 0.105 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 2.79e-01 -0.111 0.102 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 2.32e-01 -0.115 0.0957 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 6.82e-02 -0.0853 0.0465 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00439 0.0961 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0334 0.0514 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0459 0.0796 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 1.09e-01 -0.148 0.0918 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.81e-01 -0.136 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0563 0.0883 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 1.43e-01 0.128 0.087 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 2.67e-01 -0.102 0.0919 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 2.60e-01 -0.12 0.106 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0322 0.0915 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0961 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00656 0.108 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0654 0.0944 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 3.50e-02 0.218 0.103 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 6.83e-01 0.045 0.11 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 8.04e-03 0.278 0.104 0.245 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 7.54e-01 0.0245 0.0779 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.90e-01 0.00113 0.0899 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 5.31e-01 0.0434 0.0692 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 5.29e-01 0.0476 0.0754 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.57e-01 0.116 0.0814 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0685 0.057 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0148 0.0818 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0704 0.0943 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 6.11e-02 -0.136 0.0725 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0433 0.0914 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 7.85e-01 0.0234 0.0856 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 2.67e-01 0.0623 0.056 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0274 0.0968 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.27e-01 0.00857 0.0931 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0816 0.0895 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0286 0.097 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 8.45e-01 0.018 0.0917 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 1.80e-01 0.11 0.0818 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 2.26e-01 0.109 0.0895 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0668 0.092 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0198 0.0737 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.47e-01 0.0457 0.0996 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 5.91e-01 -0.053 0.0985 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 1.50e-01 -0.121 0.0837 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.71e-01 0.0445 0.105 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0976 0.0958 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.07e-01 0.0112 0.0954 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00706 0.0857 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0289 0.0911 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0523 0.0988 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 7.24e-01 0.023 0.0651 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 7.33e-02 0.18 0.0998 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0413 0.105 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.09e-02 0.159 0.0938 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 7.60e-01 0.0299 0.0978 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0783 0.107 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0268 0.105 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 5.98e-01 0.0496 0.0938 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.35e-02 0.189 0.101 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0211 0.0995 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 8.71e-01 0.0153 0.0941 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0114 0.101 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 7.66e-01 0.0322 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.42e-01 -0.152 0.103 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 6.43e-01 0.0419 0.0904 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 8.67e-02 0.17 0.0989 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 8.80e-01 0.00536 0.0353 0.251 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 5.69e-01 0.0565 0.099 0.251 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0735 0.0965 0.251 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0118 0.0856 0.251 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.04e-01 0.0533 0.103 0.251 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 4.29e-01 0.0828 0.105 0.251 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 7.20e-01 0.0313 0.087 0.251 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 9.19e-01 0.0101 0.0988 0.251 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0476 0.0967 0.251 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0375 0.0856 0.251 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 1.67e-01 -0.148 0.107 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 1.07e-01 -0.125 0.077 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 1.46e-01 0.13 0.0891 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 1.26e-01 0.16 0.104 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00553 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0992 0.0921 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 3.48e-01 0.0911 0.097 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0827 0.102 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 2.05e-01 -0.118 0.0928 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 1.24e-01 -0.14 0.0905 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0937 0.0685 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 1.79e-01 0.128 0.0952 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0771 0.0923 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0675 0.079 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 5.40e-01 0.059 0.096 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 3.53e-02 0.227 0.107 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 3.92e-01 0.0845 0.0984 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0454 0.101 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 6.07e-01 0.0419 0.0813 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 5.72e-01 0.0602 0.106 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 6.47e-01 0.0498 0.109 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 1.93e-01 -0.131 0.1 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0409 0.104 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 7.44e-03 0.271 0.1 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 8.98e-01 0.0122 0.0945 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.46e-02 -0.148 0.0878 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 5.78e-01 0.0374 0.0671 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.94e-01 0.0368 0.0936 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 5.31e-01 0.059 0.0941 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00474 0.0742 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0496 0.0966 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 1.05e-01 -0.169 0.104 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 4.39e-01 0.0573 0.0737 0.267 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 9.47e-01 0.00657 0.0995 0.267 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 5.96e-01 0.0409 0.077 0.267 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 3.60e-01 0.102 0.11 0.267 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 5.35e-01 0.0791 0.127 0.267 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 4.72e-01 0.0563 0.0781 0.267 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0581 0.0902 0.267 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 4.08e-02 0.186 0.09 0.267 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0836 0.106 0.267 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 6.26e-01 0.0476 0.0974 0.267 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 5.80e-01 0.0501 0.0901 0.267 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0277 0.0356 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 3.48e-01 0.0675 0.0717 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0654 0.0951 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 6.82e-02 -0.128 0.0699 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 3.42e-02 -0.212 0.0995 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 9.05e-01 0.00911 0.0761 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 8.12e-01 0.0196 0.0827 0.246 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0158 0.0709 0.246 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 5.01e-01 0.0442 0.0656 0.246 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 4.37e-01 -0.056 0.0718 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0942 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0583 0.105 0.25 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 4.72e-01 0.0659 0.0914 0.25 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 8.91e-01 0.0137 0.0997 0.25 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.22e-01 -0.159 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0939 0.0835 0.25 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 4.31e-02 -0.189 0.0927 0.254 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.54e-01 0.00528 0.0915 0.254 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 3.72e-01 -0.105 0.118 0.254 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0474 0.107 0.254 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 4.61e-01 0.0819 0.111 0.254 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 7.51e-02 0.185 0.103 0.254 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 9.04e-01 0.00979 0.0812 0.254 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0476 0.0925 0.254 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 4.38e-01 0.0706 0.0909 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0212 0.0686 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 1.25e-01 0.14 0.0906 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 3.00e-01 0.106 0.102 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0915 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 1.97e-01 0.102 0.0788 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 4.34e-01 0.0529 0.0674 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 6.51e-02 -0.18 0.0971 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 3.30e-02 -0.159 0.0743 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 4.28e-01 0.0724 0.0912 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 3.59e-01 0.0982 0.107 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0863 0.1 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 3.85e-01 0.0808 0.0928 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.78e-01 0.0302 0.0724 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 5.26e-01 0.0801 0.126 0.236 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 9.46e-01 0.00807 0.119 0.236 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 7.85e-01 0.0244 0.0893 0.236 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0816 0.118 0.236 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 1.80e-01 0.165 0.123 0.236 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0044 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 8.36e-02 0.202 0.116 0.236 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 6.38e-01 0.0542 0.115 0.236 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0906 0.105 0.236 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 5.91e-01 0.0526 0.0979 0.256 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0245 0.0896 0.256 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 1.96e-01 -0.136 0.105 0.256 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.14e-01 0.0497 0.0984 0.256 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0259 0.102 0.256 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 9.12e-01 -0.011 0.0985 0.256 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0826 0.0859 0.256 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 7.15e-01 0.0362 0.0992 0.253 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 1.91e-01 -0.12 0.0912 0.253 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 2.10e-01 0.138 0.109 0.253 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 7.89e-01 0.0257 0.0959 0.253 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0717 0.0921 0.253 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0497 0.0886 0.253 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0172 0.0825 0.253 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 1.88e-01 0.154 0.116 0.26 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0966 0.102 0.26 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 2.83e-03 0.318 0.105 0.26 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 6.97e-01 0.0418 0.107 0.26 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0304 0.113 0.26 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 3.04e-02 0.212 0.097 0.26 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0755 0.0759 0.26 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 1.01e-01 0.165 0.1 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 5.86e-01 0.0267 0.0489 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0307 0.0982 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 4.11e-02 -0.105 0.0512 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 6.71e-01 0.0346 0.0812 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 8.38e-01 0.0171 0.0837 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 9.05e-02 0.16 0.094 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 5.33e-01 0.0441 0.0706 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 8.69e-01 0.0139 0.0846 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 5.85e-01 0.0533 0.0974 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 2.06e-01 0.129 0.102 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 4.81e-02 0.199 0.1 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -893725 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0544 0.0567 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 4.74e-01 0.0667 0.0929 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0473 0.0458 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 6.44e-01 0.0305 0.0657 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 8.32e-02 -0.139 0.0799 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0797 0.0917 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0733 0.0686 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 4.22e-02 0.146 0.0714 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -151453 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0669 0.104 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 1.33e-01 -0.159 0.105 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -609566 sc-eQTL 1.78e-01 -0.13 0.0961 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0285 0.0846 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0803 0.0682 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 1.26e-01 0.135 0.0876 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 8.10e-02 0.181 0.103 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 5.79e-01 0.0494 0.089 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 3.15e-01 0.0778 0.0773 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.49e-01 0.0289 0.0635 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 6.89e-01 0.0385 0.096 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0902 0.0837 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 7.93e-01 0.0267 0.102 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 7.45e-01 0.0318 0.0977 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0662 0.0969 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0316 0.0842 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0757 0.0725 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -532101 sc-eQTL 5.90e-01 -0.048 0.089 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 sc-eQTL 1.35e-01 -0.13 0.0865 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -242940 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0452 0.0595 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 307914 sc-eQTL 1.40e-01 0.135 0.0909 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 180247 sc-eQTL 8.52e-01 0.0159 0.0848 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -474130 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0971 0.0683 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -289561 sc-eQTL 6.04e-01 0.0478 0.0921 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -532166 sc-eQTL 1.07e-01 0.174 0.108 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -108928 eQTL 2.25e-03 -0.0956 0.0312 0.0 0.0 0.198

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -336700 1.09e-06 9.07e-07 1.59e-07 4.06e-07 1.18e-07 2.64e-07 6.72e-07 1.62e-07 7.11e-07 3.1e-07 1.08e-06 5.15e-07 1.22e-06 2.1e-07 3.08e-07 3.96e-07 5.56e-07 4.4e-07 3.36e-07 1.86e-07 2.5e-07 5.49e-07 4.77e-07 2.39e-07 1.47e-06 2.54e-07 4.34e-07 4.06e-07 6.33e-07 8.47e-07 4.39e-07 6.63e-08 4.92e-08 1.9e-07 3.68e-07 1.8e-07 1.93e-07 1.1e-07 7.45e-08 2.68e-08 9.84e-08 1.23e-06 5.51e-08 5.71e-08 1.94e-07 3.92e-08 1.27e-07 4.47e-08 6.17e-08