logo

Genes within 1Mb (chr12:101585992:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0507 0.0426 0.246 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 3.55e-01 0.0689 0.0743 0.246 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 5.19e-02 -0.0877 0.0448 0.246 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 3.14e-01 0.0659 0.0653 0.246 B L1
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0518 0.0743 0.246 B L1
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 3.94e-01 0.0545 0.0638 0.246 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 8.20e-01 0.0117 0.0512 0.246 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 1.09e-01 0.0929 0.0577 0.246 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0399 0.0922 0.246 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0265 0.0883 0.246 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0511 0.0823 0.246 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0267 0.0675 0.246 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00456 0.0911 0.246 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 4.47e-01 -0.048 0.0631 0.246 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 7.48e-01 0.0224 0.0699 0.246 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 2.28e-01 0.0823 0.0681 0.246 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00579 0.0478 0.246 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.77e-01 0.0354 0.0848 0.246 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 7.96e-01 0.0239 0.0919 0.246 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0159 0.0603 0.246 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0612 0.0761 0.246 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0906 0.0838 0.246 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0279 0.0597 0.246 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.10e-03 0.225 0.0841 0.246 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 8.96e-02 -0.158 0.0925 0.252 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 7.62e-01 0.0259 0.0852 0.252 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 7.71e-01 0.0273 0.0937 0.252 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0602 0.1 0.252 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0435 0.104 0.252 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.03e-02 0.207 0.0883 0.252 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.81e-01 0.0206 0.0738 0.252 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 1.49e-01 0.14 0.0969 0.252 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0163 0.0808 0.246 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0644 0.0682 0.246 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 1.44e-01 0.125 0.0853 0.246 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 1.51e-01 0.137 0.0951 0.246 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 6.00e-01 0.0461 0.0879 0.246 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 3.89e-01 0.0667 0.0773 0.246 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0384 0.063 0.246 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0825 0.0841 0.247 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 6.67e-02 -0.143 0.0776 0.247 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0337 0.0567 0.247 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 7.05e-02 0.165 0.0905 0.247 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 8.37e-01 0.0173 0.0838 0.247 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0886 0.0629 0.247 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 3.77e-01 0.0794 0.0898 0.247 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 2.32e-01 0.126 0.105 0.247 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 8.16e-01 0.00748 0.0321 0.246 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.99e-01 0.0237 0.0611 0.246 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0848 0.0891 0.246 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0349 0.0644 0.246 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0465 0.101 0.246 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 4.40e-01 0.0567 0.0732 0.246 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 1.74e-01 0.0885 0.0649 0.246 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0603 0.0781 0.246 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 8.33e-01 0.0138 0.0651 0.246 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 6.07e-01 -0.039 0.0757 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0276 0.0205 0.237 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.05e-01 0.089 0.107 0.237 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 4.93e-02 -0.155 0.0781 0.237 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 2.84e-01 0.12 0.112 0.237 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0506 0.108 0.237 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 7.42e-01 -0.037 0.112 0.237 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 5.36e-01 0.0662 0.107 0.237 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.59e-01 0.0191 0.107 0.237 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 3.52e-01 0.082 0.0879 0.237 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 1.07e-01 0.143 0.088 0.237 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 2.62e-01 0.0934 0.083 0.237 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 9.89e-01 0.00057 0.0423 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.94e-01 0.0721 0.105 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 1.23e-01 -0.0871 0.0562 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0475 0.0835 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.87e-01 0.0646 0.0928 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 8.48e-01 0.0201 0.105 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 3.61e-01 0.0789 0.0862 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0726 0.0925 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 6.33e-01 0.0466 0.0974 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 7.63e-01 0.0308 0.102 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 3.24e-01 0.0966 0.0978 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 3.16e-01 0.0393 0.039 0.244 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0691 0.103 0.244 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 1.43e-02 -0.164 0.0665 0.244 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 2.01e-01 0.118 0.092 0.244 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 9.97e-01 0.000353 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 1.92e-03 0.309 0.0985 0.244 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 8.19e-01 0.0206 0.0902 0.244 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 1.25e-01 0.145 0.094 0.244 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0599 0.0972 0.244 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 5.35e-02 0.192 0.0987 0.244 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 3.22e-02 0.193 0.0896 0.244 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0219 0.0535 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 2.80e-01 0.104 0.0966 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 3.39e-02 -0.106 0.0498 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 8.52e-02 0.122 0.0707 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 2.10e-01 -0.106 0.0842 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0126 0.0943 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 8.78e-01 -0.011 0.0714 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.06e-02 0.135 0.0768 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 8.58e-01 0.0188 0.105 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0988 0.102 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 2.02e-01 -0.122 0.0954 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 8.29e-02 -0.0809 0.0465 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0262 0.0959 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0348 0.0513 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0456 0.0795 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 1.13e-01 -0.146 0.0917 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 2.13e-01 -0.126 0.101 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 5.18e-01 -0.057 0.0881 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.70e-02 0.149 0.0867 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0965 0.0917 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 2.75e-01 -0.116 0.106 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 7.43e-01 -0.03 0.0914 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0958 0.108 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0164 0.108 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0702 0.0946 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 3.97e-02 0.214 0.103 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 7.00e-01 0.0426 0.11 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 1.20e-02 0.264 0.104 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.89e-01 0.0312 0.0778 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 8.92e-01 0.0122 0.0898 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.81e-01 0.0382 0.0692 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 5.02e-01 0.0506 0.0753 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 2.01e-01 0.104 0.0814 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0683 0.0569 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0098 0.0819 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 5.46e-01 -0.057 0.0943 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 8.23e-02 -0.127 0.0726 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0737 0.0913 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 8.67e-01 0.0143 0.0856 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 4.02e-01 0.0471 0.0561 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0339 0.0965 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 9.26e-01 0.0087 0.0929 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0675 0.0894 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0319 0.0968 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 7.98e-01 0.0234 0.0915 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 1.87e-01 0.108 0.0816 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 2.58e-01 0.101 0.0894 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0636 0.0919 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0409 0.0735 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.68e-01 0.0427 0.0994 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0205 0.0984 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 1.93e-01 -0.109 0.0836 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.50e-01 0.0197 0.104 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0991 0.0957 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 8.91e-01 0.0131 0.0953 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 9.20e-01 0.00866 0.0856 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0371 0.091 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0643 0.0987 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 6.87e-01 0.0263 0.0651 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.69e-02 0.177 0.0997 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0448 0.105 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 8.06e-02 0.165 0.0937 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 6.64e-01 0.0424 0.0976 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 2.96e-01 -0.111 0.106 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 8.45e-01 0.0205 0.105 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 4.12e-01 0.0768 0.0936 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 3.83e-02 0.211 0.101 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0349 0.0992 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 9.41e-01 0.00694 0.0938 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 9.95e-01 0.000619 0.1 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 8.00e-01 0.0274 0.108 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 1.41e-01 -0.151 0.103 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 6.40e-01 0.0422 0.0901 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.91e-02 0.174 0.0986 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 8.32e-01 0.0075 0.0353 0.247 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.79e-01 0.0702 0.099 0.247 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 4.62e-01 -0.071 0.0964 0.247 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 7.88e-01 -0.023 0.0856 0.247 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.57e-01 0.0763 0.102 0.247 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 4.45e-01 0.08 0.105 0.247 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 8.93e-01 0.0117 0.087 0.247 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.60e-01 0.0175 0.0987 0.247 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0329 0.0967 0.247 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0361 0.0856 0.247 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 1.72e-01 -0.146 0.106 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 7.70e-02 -0.136 0.0766 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 1.07e-01 0.143 0.0886 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 1.75e-01 0.141 0.104 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 9.96e-01 0.000563 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0901 0.0918 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 3.68e-01 0.0872 0.0966 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0826 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 1.83e-01 -0.124 0.0926 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 1.83e-01 -0.121 0.0905 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 1.22e-01 -0.106 0.0683 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 1.61e-01 0.134 0.095 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0701 0.0922 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0596 0.079 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 5.70e-01 0.0546 0.0959 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 4.98e-02 0.211 0.107 0.246 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.44e-01 0.0754 0.0983 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0332 0.101 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.47e-01 0.0489 0.0811 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 5.87e-01 0.0577 0.106 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 5.62e-01 0.063 0.108 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.36e-01 -0.119 0.1 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0418 0.103 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 1.12e-02 0.256 0.1 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.70e-01 0.0403 0.0944 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 8.98e-02 -0.149 0.0877 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 7.24e-01 0.0237 0.0671 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.65e-01 0.0684 0.0934 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 3.99e-01 0.0794 0.0939 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 9.65e-01 0.00326 0.0741 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.33e-01 -0.033 0.0965 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 2.11e-01 -0.13 0.104 0.246 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 4.34e-01 0.0578 0.0736 0.263 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 8.34e-01 0.0208 0.0993 0.263 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 5.58e-01 0.0452 0.0769 0.263 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 3.10e-01 0.112 0.11 0.263 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.41e-01 0.0594 0.127 0.263 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 4.92e-01 0.0538 0.078 0.263 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 5.50e-01 -0.054 0.09 0.263 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 6.79e-02 0.166 0.0902 0.263 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0658 0.106 0.263 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 6.52e-01 0.044 0.0973 0.263 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 6.79e-01 0.0374 0.0901 0.263 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0247 0.0356 0.241 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 2.88e-01 0.0763 0.0716 0.241 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0806 0.095 0.241 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 5.83e-02 -0.133 0.0698 0.241 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 3.19e-02 -0.215 0.0994 0.241 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00261 0.076 0.241 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 8.23e-01 0.0185 0.0826 0.241 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0242 0.0708 0.241 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 5.94e-01 0.0351 0.0656 0.241 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0482 0.0717 0.241 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 2.57e-01 -0.114 0.1 0.246 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0534 0.105 0.246 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 4.34e-01 0.0717 0.0914 0.246 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 7.50e-01 0.0319 0.0997 0.246 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 1.43e-01 -0.151 0.103 0.246 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0589 0.0837 0.246 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 1.52e-02 -0.226 0.0923 0.249 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 8.73e-01 0.0147 0.0915 0.249 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 2.13e-01 -0.147 0.118 0.249 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0449 0.107 0.249 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 4.96e-01 0.0755 0.111 0.249 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 7.07e-02 0.188 0.103 0.249 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.88e-01 0.0219 0.0811 0.249 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0454 0.0925 0.249 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.60e-01 0.0672 0.0909 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0229 0.0686 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 1.34e-01 0.136 0.0906 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.44e-01 0.0784 0.102 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 1.66e-01 0.127 0.0913 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.28e-01 0.0954 0.0788 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 5.65e-01 0.0389 0.0674 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.71e-02 -0.194 0.0969 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 4.90e-02 -0.147 0.0743 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 4.14e-01 0.0746 0.0911 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 3.99e-01 0.0901 0.107 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0924 0.1 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.94e-01 0.0974 0.0926 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.76e-01 0.0206 0.0724 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.02e-01 0.106 0.126 0.233 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 9.78e-01 0.00321 0.118 0.233 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 9.36e-01 0.00719 0.0892 0.233 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0833 0.118 0.233 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 1.63e-01 0.172 0.123 0.233 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0183 0.115 0.233 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 9.78e-02 0.193 0.116 0.233 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 6.15e-01 0.0579 0.115 0.233 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0732 0.105 0.233 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 4.46e-01 0.0744 0.0975 0.251 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00176 0.0893 0.251 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 1.84e-01 -0.139 0.104 0.251 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.09e-01 0.0503 0.0982 0.251 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0569 0.102 0.251 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 9.94e-01 0.000725 0.0983 0.251 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0794 0.0857 0.251 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.53e-01 0.0444 0.0988 0.249 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 2.25e-01 -0.111 0.0909 0.249 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 1.52e-01 0.156 0.109 0.249 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 7.72e-01 0.0277 0.0955 0.249 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 6.17e-01 -0.046 0.0918 0.249 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0515 0.0883 0.249 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0222 0.0822 0.249 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 1.64e-01 0.163 0.117 0.257 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0953 0.102 0.257 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 4.53e-03 0.304 0.106 0.257 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.08e-01 0.0554 0.108 0.257 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0626 0.113 0.257 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.67e-02 0.218 0.0975 0.257 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0881 0.0763 0.257 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 7.31e-02 0.182 0.101 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 7.42e-01 0.0161 0.0489 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00491 0.0983 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 3.00e-02 -0.112 0.0511 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 6.13e-01 0.0412 0.0812 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 8.12e-01 0.0199 0.0837 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 1.19e-01 0.147 0.0941 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 5.48e-01 0.0425 0.0706 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.23e-01 0.019 0.0846 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 6.66e-01 0.0422 0.0975 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 1.70e-01 0.14 0.102 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 5.25e-02 0.196 0.1 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -895752 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0693 0.0565 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 5.15e-01 0.0604 0.0927 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 2.66e-01 -0.051 0.0457 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 6.32e-01 0.0314 0.0656 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 8.85e-02 -0.136 0.0798 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 4.01e-01 -0.077 0.0915 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0776 0.0684 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 3.96e-02 0.147 0.0712 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -153480 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0344 0.104 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 1.70e-01 -0.145 0.105 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -611593 sc-eQTL 1.67e-01 -0.133 0.0958 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0398 0.0845 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0769 0.0681 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 1.17e-01 0.137 0.0874 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 1.30e-01 0.157 0.103 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 5.04e-01 0.0594 0.0888 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.82e-01 0.0832 0.0772 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 8.27e-01 0.0139 0.0635 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 5.25e-01 0.0609 0.0958 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0789 0.0835 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 7.40e-01 0.0337 0.101 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 6.82e-01 0.0399 0.0975 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0692 0.0967 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0332 0.084 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 2.95e-01 -0.076 0.0723 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -534128 sc-eQTL 6.21e-01 -0.044 0.0889 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 sc-eQTL 1.70e-01 -0.119 0.0864 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -244967 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0548 0.0593 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 305887 sc-eQTL 8.97e-02 0.154 0.0906 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 178220 sc-eQTL 6.84e-01 0.0345 0.0846 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -476157 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0836 0.0683 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -291588 sc-eQTL 5.59e-01 0.0538 0.092 0.246 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -534193 sc-eQTL 9.85e-02 0.179 0.108 0.246 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -110955 eQTL 1.20e-03 -0.103 0.0317 0.0 0.0 0.193

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -338727 6.09e-07 7.58e-07 6.45e-08 3.77e-07 1.01e-07 8.4e-08 3.42e-07 6.75e-08 2.35e-07 1.37e-07 3.47e-07 2.33e-07 4.88e-07 1.72e-07 1.26e-07 9.35e-08 4.63e-08 2.43e-07 7.42e-08 4.92e-08 1.18e-07 1.89e-07 2e-07 3.67e-08 5.15e-07 1.9e-07 1.33e-07 1.28e-07 1.4e-07 1.1e-07 3.32e-07 3.68e-08 3.66e-08 9.9e-08 2.61e-07 4.6e-08 4.84e-08 5.92e-08 5.95e-08 5.12e-08 4.88e-08 4.55e-07 5.38e-08 1.85e-08 2.64e-08 9.86e-09 1.21e-07 2e-09 4.94e-08