logo

Genes within 1Mb (chr12:101584784:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0275 0.0654 0.094 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 5.15e-01 0.0741 0.114 0.094 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 2.30e-01 0.0831 0.069 0.094 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 8.42e-01 -0.02 0.1 0.094 B L1
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0799 0.114 0.094 B L1
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.39e-01 -0.115 0.0976 0.094 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 5.76e-01 0.0439 0.0783 0.094 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.33e-02 -0.154 0.0882 0.094 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 7.31e-01 0.0486 0.141 0.094 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0939 0.135 0.094 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0883 0.126 0.094 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.094 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.32e-03 0.396 0.137 0.094 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0533 0.0969 0.094 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 1.59e-01 -0.151 0.107 0.094 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0919 0.105 0.094 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0193 0.0734 0.094 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 8.16e-01 -0.03 0.129 0.094 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.16e-03 0.396 0.137 0.094 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 2.66e-01 -0.102 0.0913 0.094 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 3.27e-01 -0.113 0.115 0.094 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 9.25e-01 0.012 0.127 0.094 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 5.47e-01 0.0546 0.0905 0.094 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 1.37e-01 0.193 0.129 0.094 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0265 0.143 0.097 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0506 0.13 0.097 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 8.00e-01 0.0364 0.143 0.097 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 9.29e-01 0.0138 0.154 0.097 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00378 0.159 0.097 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 4.56e-01 -0.102 0.137 0.097 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.22e-01 0.0254 0.113 0.097 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 1.58e-01 -0.21 0.148 0.097 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 7.64e-02 0.214 0.12 0.094 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 3.05e-01 0.105 0.102 0.094 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0771 0.129 0.094 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0188 0.144 0.094 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.56e-01 -0.15 0.132 0.094 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0443 0.116 0.094 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0111 0.0948 0.094 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 3.53e-01 0.123 0.132 0.094 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.46e-01 0.0932 0.122 0.094 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0282 0.0887 0.094 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0271 0.143 0.094 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.05e-01 -0.166 0.131 0.094 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0823 0.0987 0.094 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0118 0.141 0.094 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 3.47e-01 0.155 0.165 0.094 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 8.30e-01 0.0108 0.0504 0.094 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 2.18e-01 0.118 0.0956 0.094 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.11e-02 0.285 0.139 0.094 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 8.59e-02 -0.173 0.1 0.094 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 7.01e-01 0.0608 0.158 0.094 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 1.11e-01 -0.183 0.114 0.094 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0518 0.102 0.094 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 3.69e-01 -0.11 0.123 0.094 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 5.94e-02 0.192 0.101 0.094 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 9.55e-01 0.0067 0.119 0.094 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0257 0.0315 0.094 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0956 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 1.11e-01 0.193 0.12 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 1.64e-01 0.239 0.171 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 6.81e-02 0.303 0.165 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 5.87e-02 0.324 0.17 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 6.71e-01 0.0696 0.164 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 4.49e-02 -0.328 0.163 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 3.88e-02 0.278 0.133 0.094 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0339 0.136 0.094 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 8.15e-01 -0.03 0.128 0.094 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0694 0.0652 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 2.91e-01 0.172 0.163 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 6.69e-01 0.0374 0.0874 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 3.95e-01 0.11 0.129 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 6.19e-02 -0.267 0.142 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 4.63e-01 -0.119 0.161 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00872 0.134 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 1.63e-01 -0.2 0.143 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0353 0.151 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 3.72e-02 -0.328 0.157 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 4.93e-01 -0.104 0.151 0.094 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 7.99e-02 0.104 0.0591 0.095 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00128 0.157 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0187 0.103 0.095 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 9.66e-01 0.00597 0.141 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 1.26e-01 0.236 0.153 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 4.64e-01 0.112 0.153 0.095 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 2.89e-01 0.145 0.137 0.095 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 4.14e-01 -0.118 0.144 0.095 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0897 0.148 0.095 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 2.81e-01 -0.163 0.151 0.095 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 8.63e-01 0.0238 0.138 0.095 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 1.80e-01 0.111 0.0826 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 2.58e-01 -0.17 0.15 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 3.47e-01 0.0734 0.0779 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0383 0.11 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 2.46e-02 -0.293 0.13 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 1.46e-01 -0.212 0.146 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 8.98e-01 0.0142 0.111 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 1.42e-01 -0.176 0.119 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 1.49e-01 0.235 0.162 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 6.74e-01 0.0668 0.159 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00302 0.149 0.094 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 7.47e-01 0.0238 0.0734 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 4.66e-01 0.11 0.15 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 5.94e-02 0.151 0.0799 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 1.43e-01 -0.183 0.124 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 5.07e-01 0.0961 0.145 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0935 0.159 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0525 0.138 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0303 0.137 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 3.68e-01 -0.13 0.144 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 3.15e-01 -0.167 0.166 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0599 0.143 0.094 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0671 0.161 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.12e-01 0.133 0.161 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 4.58e-01 -0.105 0.141 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 7.74e-01 0.0448 0.155 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0657 0.165 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 4.51e-01 -0.119 0.158 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 2.45e-01 -0.139 0.119 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.08e-03 0.392 0.135 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0425 0.106 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 1.39e-01 -0.171 0.115 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 3.72e-01 -0.112 0.125 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0962 0.0873 0.094 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0286 0.124 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 3.62e-03 0.414 0.141 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0803 0.111 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0325 0.139 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0623 0.13 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 4.69e-01 0.0619 0.0853 0.094 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 9.33e-01 0.0125 0.149 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 2.06e-02 0.331 0.142 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 9.70e-02 -0.229 0.138 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 8.32e-01 0.0318 0.15 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 7.26e-01 0.0496 0.141 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 3.47e-01 0.119 0.126 0.094 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 7.80e-01 -0.039 0.139 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 1.60e-02 0.342 0.141 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 9.40e-01 0.00866 0.114 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00482 0.155 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 9.53e-01 0.00906 0.153 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 5.23e-01 0.0834 0.13 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 1.14e-01 0.256 0.161 0.094 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0172 0.144 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 2.67e-03 0.425 0.14 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 2.69e-01 -0.142 0.128 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0908 0.136 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0192 0.148 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 8.45e-01 0.0191 0.0976 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 9.10e-01 0.017 0.151 0.094 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 9.19e-02 0.26 0.154 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 7.36e-01 0.0469 0.139 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00688 0.144 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00201 0.157 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0838 0.154 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 5.34e-01 0.0856 0.138 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 4.14e-01 0.123 0.15 0.097 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 4.93e-01 -0.107 0.156 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 1.16e-01 0.232 0.147 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 3.84e-01 0.138 0.158 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 7.64e-01 0.051 0.17 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 4.68e-01 -0.118 0.163 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 4.92e-01 0.0979 0.142 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 2.62e-01 0.176 0.156 0.096 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00277 0.0546 0.095 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 6.98e-02 0.277 0.152 0.095 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 3.97e-02 0.306 0.148 0.095 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 2.58e-01 -0.15 0.132 0.095 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 1.60e-01 0.223 0.158 0.095 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0265 0.162 0.095 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0443 0.134 0.095 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 4.25e-02 -0.308 0.151 0.095 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 7.05e-01 0.0566 0.149 0.095 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00849 0.132 0.095 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 4.09e-01 0.139 0.168 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 1.09e-01 0.195 0.121 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 7.22e-01 0.0501 0.141 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 1.41e-01 -0.242 0.163 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 3.83e-01 -0.14 0.16 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 2.09e-01 -0.182 0.145 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 5.58e-02 -0.291 0.151 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 1.09e-01 0.258 0.16 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 4.33e-01 0.114 0.146 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 2.38e-01 0.168 0.142 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 1.65e-01 -0.149 0.107 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 8.60e-01 0.0264 0.15 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.63e-01 -0.162 0.144 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0231 0.124 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00323 0.15 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 3.56e-01 0.156 0.169 0.093 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0996 0.156 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 9.66e-01 0.00687 0.16 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 5.95e-01 0.0685 0.129 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0725 0.168 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.94e-01 -0.181 0.172 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 3.50e-01 -0.149 0.159 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0412 0.164 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 1.94e-01 -0.21 0.161 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 4.26e-01 0.119 0.149 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 8.21e-01 0.0317 0.14 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 1.49e-01 0.153 0.106 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 5.01e-01 0.0998 0.148 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.13e-01 -0.185 0.149 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0116 0.117 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 4.21e-01 0.123 0.153 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 4.78e-01 0.117 0.165 0.093 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0416 0.125 0.085 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 6.03e-01 0.0874 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0414 0.13 0.085 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 3.36e-01 -0.18 0.186 0.085 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 5.79e-01 0.12 0.215 0.085 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00171 0.132 0.085 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 7.64e-01 -0.046 0.152 0.085 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 4.20e-01 -0.125 0.154 0.085 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 2.48e-02 0.4 0.176 0.085 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 5.21e-01 0.106 0.164 0.085 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 3.49e-01 -0.143 0.152 0.085 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 4.19e-01 0.0441 0.0544 0.096 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 4.93e-01 0.0753 0.11 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 2.40e-01 -0.171 0.145 0.096 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 1.19e-01 -0.168 0.107 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 7.75e-01 0.044 0.154 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.76e-01 -0.127 0.116 0.096 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0296 0.126 0.096 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 1.31e-01 -0.163 0.108 0.096 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 6.94e-02 0.182 0.0997 0.096 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 1.94e-01 0.142 0.109 0.096 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0971 0.155 0.094 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 2.34e-01 0.192 0.161 0.094 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 5.27e-04 0.482 0.137 0.094 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 4.73e-01 0.11 0.153 0.094 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 7.76e-01 0.0451 0.159 0.094 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 3.40e-01 0.123 0.129 0.094 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 1.69e-01 -0.192 0.139 0.098 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 3.69e-01 -0.122 0.136 0.098 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0329 0.176 0.098 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 2.72e-01 0.175 0.159 0.098 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 3.99e-01 -0.139 0.165 0.098 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 2.37e-01 -0.183 0.154 0.098 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0303 0.121 0.098 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 7.59e-02 -0.244 0.137 0.098 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 2.83e-01 0.148 0.138 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 5.62e-01 0.0604 0.104 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 2.13e-01 -0.172 0.137 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0579 0.155 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0423 0.139 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 7.90e-02 -0.21 0.119 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0944 0.102 0.094 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 5.11e-02 0.288 0.147 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 6.46e-01 0.0523 0.114 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 9.81e-01 0.00329 0.138 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 5.96e-01 -0.086 0.162 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 7.58e-01 0.0471 0.152 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 6.45e-01 0.0649 0.141 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0196 0.11 0.094 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0244 0.198 0.091 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.24e-01 0.149 0.186 0.091 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 3.63e-02 0.292 0.138 0.091 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 2.00e-01 -0.237 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 8.66e-01 0.0328 0.194 0.091 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 7.41e-01 -0.06 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0169 0.184 0.091 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 1.38e-01 0.267 0.179 0.091 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 1.83e-01 -0.22 0.164 0.091 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 6.86e-01 0.0606 0.15 0.096 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0466 0.137 0.096 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0159 0.161 0.096 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 3.57e-01 0.139 0.15 0.096 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 2.46e-01 -0.181 0.155 0.096 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 9.47e-02 0.251 0.15 0.096 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 3.88e-01 0.114 0.131 0.096 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00106 0.156 0.093 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 1.72e-01 0.196 0.143 0.093 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 4.20e-02 0.349 0.17 0.093 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0367 0.15 0.093 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 1.94e-01 -0.188 0.144 0.093 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 1.25e-01 0.213 0.138 0.093 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0282 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 8.79e-01 0.0305 0.199 0.085 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 7.29e-01 0.0602 0.173 0.085 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 8.00e-01 0.0466 0.184 0.085 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 9.54e-01 0.0105 0.183 0.085 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 5.33e-01 0.12 0.192 0.085 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 2.40e-01 0.197 0.167 0.085 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0369 0.13 0.085 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 1.89e-01 0.226 0.171 0.085 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0356 0.0762 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 6.26e-01 0.0747 0.153 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 8.47e-01 0.0156 0.0805 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 7.51e-01 0.0402 0.127 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0553 0.13 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 3.15e-01 0.148 0.147 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 4.20e-01 0.0889 0.11 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 5.33e-02 -0.254 0.131 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0728 0.152 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 4.70e-02 -0.315 0.158 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0769 0.158 0.094 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -896960 sc-eQTL 2.36e-01 0.104 0.0878 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0412 0.144 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 7.93e-02 0.125 0.0707 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 2.97e-01 -0.106 0.102 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0971 0.125 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 5.77e-02 -0.269 0.141 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0564 0.107 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 1.39e-01 -0.165 0.111 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -154688 sc-eQTL 2.62e-01 0.181 0.161 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0224 0.164 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -612801 sc-eQTL 4.19e-01 -0.121 0.149 0.094 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 3.32e-02 0.269 0.126 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 4.33e-01 0.0807 0.103 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 3.55e-01 -0.122 0.132 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0657 0.156 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 9.67e-01 0.00548 0.134 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 3.37e-01 -0.112 0.116 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0603 0.0954 0.094 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0478 0.15 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 1.82e-01 0.175 0.131 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 6.14e-01 0.0803 0.159 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 9.56e-01 0.00837 0.153 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 6.75e-02 -0.277 0.151 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 5.66e-02 0.25 0.131 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 6.68e-01 0.0488 0.114 0.093 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -535336 sc-eQTL 4.72e-01 0.1 0.139 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -112163 sc-eQTL 3.45e-01 0.128 0.136 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -246175 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0513 0.093 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 304679 sc-eQTL 8.13e-01 0.0339 0.143 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 177012 sc-eQTL 1.45e-01 -0.193 0.132 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00514 0.107 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -292796 sc-eQTL 8.91e-01 0.0197 0.144 0.093 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -535401 sc-eQTL 4.98e-01 0.115 0.169 0.093 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120860 WASHC3 -477365 pQTL 0.0464 -0.0294 0.0147 0.0 0.0 0.109
ENSG00000139351 SYCP3 -154685 eQTL 0.0359 0.121 0.0574 0.0 0.0 0.104
ENSG00000183395 PMCH -613049 pQTL 0.0101 0.121 0.0469 0.00236 0.0 0.109

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina