logo

Genes within 1Mb (chr12:101573815:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 1.53e-01 0.061 0.0425 0.209 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 7.10e-01 0.0276 0.0743 0.209 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0611 0.045 0.209 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0676 0.0652 0.209 B L1
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00701 0.0743 0.209 B L1
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 2.75e-01 0.0697 0.0637 0.209 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 1.16e-01 0.0801 0.0508 0.209 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 5.65e-01 0.0334 0.0579 0.209 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 3.00e-01 0.0955 0.0919 0.209 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 5.96e-01 0.0468 0.0882 0.209 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0132 0.0823 0.209 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 3.90e-01 0.0582 0.0675 0.209 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0373 0.0913 0.209 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0478 0.0632 0.209 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 9.25e-01 0.00662 0.07 0.209 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 7.60e-01 0.021 0.0685 0.209 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 1.42e-01 0.0702 0.0477 0.209 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 2.49e-01 0.0958 0.0829 0.209 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 3.93e-01 -0.077 0.0899 0.209 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0229 0.0591 0.209 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00535 0.0746 0.209 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 4.94e-01 0.0564 0.0823 0.209 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.72e-01 0.0642 0.0583 0.209 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 2.10e-01 -0.105 0.0835 0.209 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 3.92e-01 0.0806 0.094 0.214 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 1.38e-02 0.211 0.0848 0.214 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 6.13e-01 0.0479 0.0947 0.214 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 8.88e-01 0.0143 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0878 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 5.54e-01 0.0536 0.0903 0.214 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0751 0.0744 0.214 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0252 0.0984 0.214 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 8.89e-01 0.0108 0.0773 0.209 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.89e-01 0.00913 0.0655 0.209 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 6.21e-02 -0.153 0.0814 0.209 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 1.09e-01 -0.146 0.091 0.209 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0742 0.0841 0.209 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.78e-01 0.0804 0.0739 0.209 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0259 0.0604 0.209 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 1.91e-01 0.111 0.0847 0.21 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 5.19e-01 0.0509 0.0789 0.21 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0583 0.0571 0.21 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0135 0.0921 0.21 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 8.89e-01 0.0118 0.0846 0.21 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 8.94e-01 0.00852 0.0638 0.21 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 1.95e-01 -0.118 0.0904 0.21 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0399 0.106 0.21 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 9.73e-01 0.0011 0.0324 0.209 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 8.01e-02 -0.108 0.0612 0.209 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 3.32e-01 0.0873 0.0898 0.209 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0471 0.0649 0.209 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 1.33e-01 -0.152 0.101 0.209 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 2.77e-02 0.162 0.0731 0.209 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 4.45e-01 0.0502 0.0656 0.209 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 6.15e-01 0.0396 0.0788 0.209 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 3.26e-01 0.0645 0.0655 0.209 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 2.58e-02 0.17 0.0755 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 6.98e-02 0.0365 0.02 0.207 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 7.08e-01 0.0393 0.105 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 7.08e-02 0.14 0.0768 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 6.57e-01 -0.049 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0272 0.106 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00616 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00377 0.105 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 8.78e-02 -0.179 0.104 0.207 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 7.81e-01 0.024 0.0864 0.207 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 3.41e-01 0.0828 0.0868 0.207 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 1.84e-01 0.109 0.0813 0.207 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 6.18e-01 0.0209 0.0418 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 7.67e-01 0.031 0.104 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0343 0.0559 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0325 0.0827 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 3.16e-01 0.0923 0.0917 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 7.92e-01 0.0273 0.103 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 8.76e-01 0.0134 0.0855 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 6.25e-01 0.0448 0.0917 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 6.56e-01 -0.043 0.0964 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 7.09e-01 0.0378 0.101 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 9.35e-01 0.0079 0.0971 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0543 0.0383 0.209 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 5.50e-01 0.0608 0.102 0.209 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0457 0.0663 0.209 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 8.41e-02 -0.157 0.0903 0.209 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0319 0.0998 0.209 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 5.99e-01 0.0522 0.0992 0.209 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 1.71e-01 -0.121 0.0884 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 2.37e-01 0.11 0.0928 0.209 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 9.20e-01 0.00966 0.0958 0.209 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 8.90e-01 0.0136 0.098 0.209 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 1.17e-01 -0.14 0.0887 0.209 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 7.39e-01 -0.018 0.0539 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0311 0.0976 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.02e-02 -0.0885 0.0503 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0107 0.0717 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 8.88e-01 -0.012 0.0852 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.66e-01 0.0411 0.095 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.86e-01 0.0767 0.0718 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 4.68e-01 0.0567 0.0779 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 9.81e-01 0.00248 0.106 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 3.98e-01 0.0871 0.103 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 2.58e-01 0.109 0.0963 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 5.71e-02 0.0893 0.0467 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0405 0.0965 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 4.07e-03 -0.147 0.0507 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 8.72e-01 0.0129 0.0801 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 5.91e-01 0.05 0.0928 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0082 0.102 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 1.72e-01 0.121 0.0884 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0687 0.0878 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 1.57e-02 0.222 0.0913 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0544 0.107 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 8.08e-01 0.0223 0.092 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 5.29e-01 0.0656 0.104 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.59e-02 0.179 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 7.40e-01 0.0303 0.0911 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 4.37e-01 -0.078 0.1 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 9.90e-01 0.00139 0.106 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.56e-01 -0.116 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 1.51e-01 0.111 0.0769 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0691 0.0889 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0605 0.0686 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 7.08e-01 0.028 0.0748 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 7.32e-01 0.0277 0.081 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 3.06e-01 0.0579 0.0565 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 1.30e-01 -0.123 0.0812 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0222 0.0942 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 4.64e-01 0.0534 0.0728 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 2.57e-01 -0.103 0.0909 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 2.44e-01 0.0994 0.0851 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 4.15e-01 0.0457 0.0559 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 6.20e-02 0.182 0.0972 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 6.03e-01 0.0491 0.0943 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 4.39e-01 0.0704 0.0907 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 9.76e-02 -0.163 0.0977 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0377 0.0929 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 7.05e-01 0.0316 0.0832 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00419 0.0885 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.91e-01 0.0125 0.0908 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 6.61e-01 0.0319 0.0726 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 3.97e-01 0.0832 0.098 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 4.30e-01 0.0767 0.097 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 6.32e-01 0.0398 0.0828 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0519 0.103 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 2.07e-02 0.215 0.0923 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0887 0.0927 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 2.79e-01 0.0903 0.0832 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0526 0.0886 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.71e-01 0.041 0.0963 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 3.38e-01 0.0607 0.0633 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 1.23e-01 -0.151 0.0974 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 8.26e-01 0.0219 0.0999 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.11e-01 0.0214 0.0895 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 9.63e-01 0.00433 0.0927 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 5.39e-01 0.0621 0.101 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 1.06e-01 0.16 0.0986 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00844 0.0889 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 8.16e-01 0.0226 0.0969 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0658 0.0994 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 1.90e-02 0.22 0.0929 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00628 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 1.85e-01 -0.143 0.108 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.103 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 8.53e-01 0.0168 0.0904 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 5.03e-01 0.0668 0.0996 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00118 0.0354 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0806 0.0991 0.203 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 5.00e-02 0.189 0.0958 0.203 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0139 0.0857 0.203 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 9.80e-02 -0.17 0.102 0.203 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 5.99e-01 0.0553 0.105 0.203 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0266 0.0871 0.203 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 7.85e-01 0.0271 0.0989 0.203 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 2.99e-01 -0.101 0.0966 0.203 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 1.17e-01 0.134 0.0853 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 5.62e-01 0.0626 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 1.95e-01 0.101 0.0777 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 9.58e-01 0.00478 0.0902 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 8.00e-01 0.0267 0.105 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 4.84e-02 0.202 0.102 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.78e-01 -0.101 0.0927 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0108 0.0979 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0138 0.103 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 1.23e-01 0.145 0.0935 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 6.43e-01 0.0427 0.0918 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00144 0.0695 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 1.67e-01 -0.133 0.096 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.75e-01 0.0392 0.0933 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0893 0.0797 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0975 0.0968 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 9.67e-02 -0.181 0.109 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 2.40e-01 -0.118 0.1 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 9.25e-01 0.00969 0.103 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 2.92e-01 0.0872 0.0826 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00591 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 2.32e-01 -0.132 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 5.15e-02 0.199 0.102 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0347 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 7.21e-01 0.0371 0.104 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 8.18e-01 0.022 0.0956 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 4.88e-01 0.062 0.0893 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0445 0.0678 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 1.98e-01 0.122 0.0943 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0167 0.0953 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.60e-01 0.0846 0.0748 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0423 0.0977 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 2.76e-01 0.115 0.105 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0603 0.0806 0.215 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 3.48e-01 0.102 0.108 0.215 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0848 0.084 0.215 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 7.61e-01 -0.037 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 8.40e-01 0.0283 0.139 0.215 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.26e-02 0.158 0.0843 0.215 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.33e-01 0.118 0.0982 0.215 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 3.35e-02 -0.211 0.0982 0.215 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 3.72e-01 -0.104 0.116 0.215 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 5.66e-01 0.0613 0.107 0.215 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0283 0.0987 0.215 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 5.77e-01 0.0195 0.0349 0.211 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0589 0.0703 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.44e-01 0.0184 0.0934 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0961 0.0687 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 6.36e-01 0.0467 0.0986 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 5.34e-01 0.0464 0.0745 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 3.61e-01 0.074 0.0809 0.211 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 1.16e-01 -0.109 0.0691 0.211 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 5.77e-01 0.0359 0.0644 0.211 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 5.57e-02 0.134 0.0698 0.211 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 4.41e-01 0.0758 0.0981 0.209 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 7.21e-01 0.0365 0.102 0.209 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0193 0.0893 0.209 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 4.48e-01 0.0738 0.0971 0.209 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0838 0.1 0.209 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 3.83e-01 0.0713 0.0816 0.209 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0788 0.0889 0.222 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 5.68e-03 0.238 0.0851 0.222 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 1.54e-01 -0.16 0.112 0.222 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0892 0.101 0.222 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 1.98e-02 -0.244 0.104 0.222 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0985 0.222 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 1.74e-01 -0.105 0.0767 0.222 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0433 0.0879 0.222 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 4.44e-01 -0.067 0.0874 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0016 0.066 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0977 0.0873 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 2.00e-01 -0.126 0.0982 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 4.82e-02 -0.174 0.0875 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 6.20e-01 0.0378 0.0761 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0414 0.0648 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0368 0.095 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0383 0.0728 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0891 0.0884 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0944 0.104 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.86e-01 0.0395 0.0975 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 4.09e-02 0.184 0.0893 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0886 0.07 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 1.19e-01 -0.189 0.12 0.185 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0222 0.114 0.185 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 5.14e-01 0.0559 0.0855 0.185 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0642 0.113 0.185 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0672 0.118 0.185 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.185 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 1.90e-01 0.147 0.112 0.185 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0744 0.11 0.185 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0923 0.101 0.185 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 9.23e-02 0.162 0.0957 0.213 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 3.15e-01 0.0886 0.0879 0.213 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 7.32e-01 0.0355 0.103 0.213 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0391 0.0968 0.213 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 9.66e-01 0.00425 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00584 0.0969 0.213 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 9.23e-01 0.00815 0.0847 0.213 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 7.52e-01 0.0319 0.101 0.215 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 1.34e-01 0.139 0.0924 0.215 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0799 0.111 0.215 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 2.45e-01 -0.113 0.097 0.215 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 4.51e-01 0.0706 0.0935 0.215 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 7.49e-01 0.0289 0.09 0.215 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0637 0.0837 0.215 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 5.19e-02 0.228 0.117 0.209 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 3.48e-01 0.0964 0.102 0.209 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 5.97e-02 0.204 0.107 0.209 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 5.32e-01 0.0677 0.108 0.209 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 1.06e-01 0.184 0.113 0.209 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 1.90e-01 -0.13 0.0988 0.209 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 2.64e-01 0.0858 0.0765 0.209 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0182 0.102 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00163 0.0487 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0976 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 7.05e-01 0.0195 0.0515 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 1.03e-01 -0.131 0.0804 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 5.17e-01 0.0541 0.0833 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.64e-01 0.041 0.0942 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0621 0.0703 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 4.22e-01 0.0678 0.0842 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0114 0.0971 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 8.27e-01 0.0223 0.102 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0916 0.101 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -907929 sc-eQTL 3.56e-01 0.0532 0.0575 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00344 0.0942 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 3.75e-02 -0.0964 0.046 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0428 0.0665 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 6.80e-01 0.0337 0.0815 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 6.35e-01 0.0442 0.0929 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 9.79e-02 0.115 0.0692 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 5.28e-01 0.0461 0.073 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -165657 sc-eQTL 3.05e-01 0.108 0.105 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 9.58e-01 0.0057 0.107 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -623770 sc-eQTL 6.30e-01 0.0471 0.0976 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0382 0.0808 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0208 0.0653 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 8.97e-02 -0.142 0.0835 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 1.15e-01 -0.157 0.0988 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 1.97e-01 -0.11 0.0847 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 1.30e-01 0.112 0.0736 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0478 0.0606 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 2.70e-01 0.105 0.0945 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 2.34e-01 0.0985 0.0825 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0461 0.1 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0367 0.0964 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 7.99e-01 0.0244 0.0958 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 1.53e-01 0.119 0.0828 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00811 0.0717 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546305 sc-eQTL 3.01e-01 0.0929 0.0896 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123132 sc-eQTL 6.41e-01 0.0409 0.0876 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257144 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0559 0.0599 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293710 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0127 0.0921 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 166043 sc-eQTL 5.59e-01 -0.05 0.0854 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488334 sc-eQTL 5.75e-01 0.0388 0.0692 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -303765 sc-eQTL 2.58e-01 -0.105 0.0927 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -546370 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0139 0.109 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -350904 3.92e-07 3.11e-07 1.76e-07 3.43e-07 1.11e-07 1.64e-07 4.53e-07 6.2e-08 2.53e-07 1.89e-07 2.62e-07 1.86e-07 3.95e-07 8.85e-08 1.71e-07 1.53e-07 8.74e-08 2.66e-07 2.13e-07 8.1e-08 1.61e-07 2.63e-07 2.67e-07 1.19e-07 4.46e-07 1.65e-07 2.62e-07 1.68e-07 2.19e-07 3.93e-07 1.76e-07 4.71e-08 5.17e-08 1.24e-07 9.25e-08 4.77e-08 9.77e-08 1.1e-07 7.45e-08 2.22e-08 4.46e-08 2.74e-07 6.04e-08 1.06e-07 1.15e-07 1.61e-08 8.84e-08 3.09e-09 5.93e-08