logo

Genes within 1Mb (chr12:101573306:A:AT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 1.53e-01 0.061 0.0425 0.209 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 7.10e-01 0.0276 0.0743 0.209 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 1.76e-01 -0.0611 0.045 0.209 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0676 0.0652 0.209 B L1
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00701 0.0743 0.209 B L1
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 2.75e-01 0.0697 0.0637 0.209 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 1.16e-01 0.0801 0.0508 0.209 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 5.65e-01 0.0334 0.0579 0.209 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 3.00e-01 0.0955 0.0919 0.209 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 5.96e-01 0.0468 0.0882 0.209 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0132 0.0823 0.209 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 3.90e-01 0.0582 0.0675 0.209 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0373 0.0913 0.209 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0478 0.0632 0.209 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 9.25e-01 0.00662 0.07 0.209 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 7.60e-01 0.021 0.0685 0.209 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 1.42e-01 0.0702 0.0477 0.209 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 2.49e-01 0.0958 0.0829 0.209 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 3.93e-01 -0.077 0.0899 0.209 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0229 0.0591 0.209 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00535 0.0746 0.209 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 4.94e-01 0.0564 0.0823 0.209 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.72e-01 0.0642 0.0583 0.209 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 2.10e-01 -0.105 0.0835 0.209 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 3.92e-01 0.0806 0.094 0.214 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 1.38e-02 0.211 0.0848 0.214 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 6.13e-01 0.0479 0.0947 0.214 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 8.88e-01 0.0143 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0878 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 5.54e-01 0.0536 0.0903 0.214 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0751 0.0744 0.214 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 1.04e-01 -0.152 0.0932 0.214 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0252 0.0984 0.214 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 8.89e-01 0.0108 0.0773 0.209 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.89e-01 0.00913 0.0655 0.209 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 6.21e-02 -0.153 0.0814 0.209 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 1.09e-01 -0.146 0.091 0.209 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0742 0.0841 0.209 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.78e-01 0.0804 0.0739 0.209 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0259 0.0604 0.209 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 1.35e-01 0.098 0.0654 0.209 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 1.91e-01 0.111 0.0847 0.21 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 5.19e-01 0.0509 0.0789 0.21 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0583 0.0571 0.21 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0135 0.0921 0.21 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 8.89e-01 0.0118 0.0846 0.21 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 8.94e-01 0.00852 0.0638 0.21 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 1.95e-01 -0.118 0.0904 0.21 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0399 0.106 0.21 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 9.73e-01 0.0011 0.0324 0.209 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 8.01e-02 -0.108 0.0612 0.209 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 3.32e-01 0.0873 0.0898 0.209 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0471 0.0649 0.209 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 1.33e-01 -0.152 0.101 0.209 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 2.77e-02 0.162 0.0731 0.209 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 4.45e-01 0.0502 0.0656 0.209 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 6.15e-01 0.0396 0.0788 0.209 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 3.26e-01 0.0645 0.0655 0.209 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 2.58e-02 0.17 0.0755 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 6.98e-02 0.0365 0.02 0.207 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 7.08e-01 0.0393 0.105 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 7.08e-02 0.14 0.0768 0.207 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 6.57e-01 -0.049 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0272 0.106 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00616 0.11 0.207 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00377 0.105 0.207 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 8.78e-02 -0.179 0.104 0.207 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 7.81e-01 0.024 0.0864 0.207 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 3.41e-01 0.0828 0.0868 0.207 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 1.84e-01 0.109 0.0813 0.207 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 6.18e-01 0.0209 0.0418 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 7.67e-01 0.031 0.104 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0343 0.0559 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0325 0.0827 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 3.16e-01 0.0923 0.0917 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 7.92e-01 0.0273 0.103 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 8.76e-01 0.0134 0.0855 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 6.25e-01 0.0448 0.0917 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 6.56e-01 -0.043 0.0964 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 7.09e-01 0.0378 0.101 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 9.35e-01 0.0079 0.0971 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0543 0.0383 0.209 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 5.50e-01 0.0608 0.102 0.209 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0457 0.0663 0.209 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 8.41e-02 -0.157 0.0903 0.209 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0319 0.0998 0.209 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 5.99e-01 0.0522 0.0992 0.209 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 1.71e-01 -0.121 0.0884 0.209 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 2.37e-01 0.11 0.0928 0.209 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 9.20e-01 0.00966 0.0958 0.209 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 8.90e-01 0.0136 0.098 0.209 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 1.17e-01 -0.14 0.0887 0.209 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 7.39e-01 -0.018 0.0539 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0311 0.0976 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.02e-02 -0.0885 0.0503 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0107 0.0717 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 8.88e-01 -0.012 0.0852 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.66e-01 0.0411 0.095 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.86e-01 0.0767 0.0718 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 4.68e-01 0.0567 0.0779 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 9.81e-01 0.00248 0.106 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 3.98e-01 0.0871 0.103 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 2.58e-01 0.109 0.0963 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 5.71e-02 0.0893 0.0467 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0405 0.0965 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 4.07e-03 -0.147 0.0507 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 8.72e-01 0.0129 0.0801 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 5.91e-01 0.05 0.0928 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0082 0.102 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 1.72e-01 0.121 0.0884 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0687 0.0878 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 1.57e-02 0.222 0.0913 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0544 0.107 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 8.08e-01 0.0223 0.092 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 5.29e-01 0.0656 0.104 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.59e-02 0.179 0.103 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 7.40e-01 0.0303 0.0911 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 4.37e-01 -0.078 0.1 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 9.90e-01 0.00139 0.106 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.56e-01 -0.116 0.102 0.2 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 1.51e-01 0.111 0.0769 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0691 0.0889 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0605 0.0686 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 7.08e-01 0.028 0.0748 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 7.32e-01 0.0277 0.081 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 3.06e-01 0.0579 0.0565 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 1.30e-01 -0.123 0.0812 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0222 0.0942 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 4.64e-01 0.0534 0.0728 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 2.57e-01 -0.103 0.0909 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 2.44e-01 0.0994 0.0851 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 4.15e-01 0.0457 0.0559 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 6.20e-02 0.182 0.0972 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 6.03e-01 0.0491 0.0943 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 4.39e-01 0.0704 0.0907 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 9.76e-02 -0.163 0.0977 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0377 0.0929 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 7.05e-01 0.0316 0.0832 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00419 0.0885 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.91e-01 0.0125 0.0908 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 6.61e-01 0.0319 0.0726 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 3.97e-01 0.0832 0.098 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 4.30e-01 0.0767 0.097 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 6.32e-01 0.0398 0.0828 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0519 0.103 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 2.07e-02 0.215 0.0923 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0887 0.0927 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 2.79e-01 0.0903 0.0832 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0526 0.0886 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.71e-01 0.041 0.0963 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 3.38e-01 0.0607 0.0633 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 1.23e-01 -0.151 0.0974 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 8.26e-01 0.0219 0.0999 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.11e-01 0.0214 0.0895 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 9.63e-01 0.00433 0.0927 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 5.39e-01 0.0621 0.101 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 1.06e-01 0.16 0.0986 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00844 0.0889 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 8.16e-01 0.0226 0.0969 0.201 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0658 0.0994 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 1.90e-02 0.22 0.0929 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00628 0.101 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 1.85e-01 -0.143 0.108 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.103 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 8.53e-01 0.0168 0.0904 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 5.03e-01 0.0668 0.0996 0.212 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00118 0.0354 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0806 0.0991 0.203 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 5.00e-02 0.189 0.0958 0.203 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0139 0.0857 0.203 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 9.80e-02 -0.17 0.102 0.203 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 5.99e-01 0.0553 0.105 0.203 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0266 0.0871 0.203 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 7.85e-01 0.0271 0.0989 0.203 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 2.99e-01 -0.101 0.0966 0.203 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 1.17e-01 0.134 0.0853 0.203 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 5.62e-01 0.0626 0.108 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 1.95e-01 0.101 0.0777 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 9.58e-01 0.00478 0.0902 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 8.00e-01 0.0267 0.105 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 4.84e-02 0.202 0.102 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.78e-01 -0.101 0.0927 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0108 0.0979 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0138 0.103 0.209 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 1.23e-01 0.145 0.0935 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 6.43e-01 0.0427 0.0918 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00144 0.0695 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 1.67e-01 -0.133 0.096 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.75e-01 0.0392 0.0933 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0893 0.0797 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0975 0.0968 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 9.67e-02 -0.181 0.109 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 2.40e-01 -0.118 0.1 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 9.25e-01 0.00969 0.103 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 2.92e-01 0.0872 0.0826 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00591 0.108 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 2.32e-01 -0.132 0.11 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 5.15e-02 0.199 0.102 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0347 0.106 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 7.21e-01 0.0371 0.104 0.199 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 8.18e-01 0.022 0.0956 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 4.88e-01 0.062 0.0893 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0445 0.0678 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 1.98e-01 0.122 0.0943 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0167 0.0953 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.60e-01 0.0846 0.0748 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0423 0.0977 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 2.76e-01 0.115 0.105 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0603 0.0806 0.215 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 3.48e-01 0.102 0.108 0.215 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0848 0.084 0.215 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 7.61e-01 -0.037 0.121 0.215 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 8.40e-01 0.0283 0.139 0.215 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.26e-02 0.158 0.0843 0.215 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.33e-01 0.118 0.0982 0.215 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 3.35e-02 -0.211 0.0982 0.215 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 3.72e-01 -0.104 0.116 0.215 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 5.66e-01 0.0613 0.107 0.215 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0283 0.0987 0.215 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 5.77e-01 0.0195 0.0349 0.211 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0589 0.0703 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.44e-01 0.0184 0.0934 0.211 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 1.64e-01 -0.0961 0.0687 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 6.36e-01 0.0467 0.0986 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 5.34e-01 0.0464 0.0745 0.211 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 3.61e-01 0.074 0.0809 0.211 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 1.16e-01 -0.109 0.0691 0.211 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 5.77e-01 0.0359 0.0644 0.211 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 5.57e-02 0.134 0.0698 0.211 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 4.41e-01 0.0758 0.0981 0.209 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 7.21e-01 0.0365 0.102 0.209 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0193 0.0893 0.209 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 4.48e-01 0.0738 0.0971 0.209 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0838 0.1 0.209 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 3.83e-01 0.0713 0.0816 0.209 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0788 0.0889 0.222 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 5.68e-03 0.238 0.0851 0.222 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 1.54e-01 -0.16 0.112 0.222 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0892 0.101 0.222 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 1.98e-02 -0.244 0.104 0.222 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 2.09e-01 0.124 0.0985 0.222 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 1.74e-01 -0.105 0.0767 0.222 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 1.14e-01 -0.149 0.0936 0.222 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0433 0.0879 0.222 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 4.44e-01 -0.067 0.0874 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 9.81e-01 -0.0016 0.066 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0977 0.0873 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 2.00e-01 -0.126 0.0982 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 4.82e-02 -0.174 0.0875 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 6.20e-01 0.0378 0.0761 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0414 0.0648 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 1.66e-01 0.0983 0.0707 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0368 0.095 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0383 0.0728 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0891 0.0884 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0944 0.104 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.86e-01 0.0395 0.0975 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 4.09e-02 0.184 0.0893 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0886 0.07 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 7.04e-01 0.0334 0.0881 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 1.19e-01 -0.189 0.12 0.185 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0222 0.114 0.185 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 5.14e-01 0.0559 0.0855 0.185 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0642 0.113 0.185 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0672 0.118 0.185 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.185 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 1.90e-01 0.147 0.112 0.185 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0744 0.11 0.185 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0923 0.101 0.185 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 9.23e-02 0.162 0.0957 0.213 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 3.15e-01 0.0886 0.0879 0.213 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 7.32e-01 0.0355 0.103 0.213 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0391 0.0968 0.213 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 9.66e-01 0.00425 0.1 0.213 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00584 0.0969 0.213 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 9.23e-01 0.00815 0.0847 0.213 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000316 0.0938 0.213 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 7.52e-01 0.0319 0.101 0.215 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 1.34e-01 0.139 0.0924 0.215 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0799 0.111 0.215 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 2.45e-01 -0.113 0.097 0.215 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 4.51e-01 0.0706 0.0935 0.215 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 7.49e-01 0.0289 0.09 0.215 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0637 0.0837 0.215 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00717 0.0871 0.215 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 5.19e-02 0.228 0.117 0.209 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 3.48e-01 0.0964 0.102 0.209 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 5.97e-02 0.204 0.107 0.209 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 5.32e-01 0.0677 0.108 0.209 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 1.06e-01 0.184 0.113 0.209 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 1.90e-01 -0.13 0.0988 0.209 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 2.64e-01 0.0858 0.0765 0.209 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 8.61e-01 0.0161 0.0917 0.209 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0182 0.102 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00163 0.0487 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 3.01e-01 0.101 0.0976 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 7.05e-01 0.0195 0.0515 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 1.03e-01 -0.131 0.0804 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 5.17e-01 0.0541 0.0833 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.64e-01 0.041 0.0942 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0621 0.0703 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 4.22e-01 0.0678 0.0842 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0114 0.0971 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 8.27e-01 0.0223 0.102 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0916 0.101 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -908438 sc-eQTL 3.56e-01 0.0532 0.0575 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00344 0.0942 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 3.75e-02 -0.0964 0.046 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0428 0.0665 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 6.80e-01 0.0337 0.0815 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 6.35e-01 0.0442 0.0929 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 9.79e-02 0.115 0.0692 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 5.28e-01 0.0461 0.073 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -166166 sc-eQTL 3.05e-01 0.108 0.105 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 9.58e-01 0.0057 0.107 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -624279 sc-eQTL 6.30e-01 0.0471 0.0976 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0382 0.0808 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0208 0.0653 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 8.97e-02 -0.142 0.0835 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 1.15e-01 -0.157 0.0988 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 1.97e-01 -0.11 0.0847 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 1.30e-01 0.112 0.0736 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0478 0.0606 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 2.24e-01 0.0847 0.0695 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 2.70e-01 0.105 0.0945 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 2.34e-01 0.0985 0.0825 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0461 0.1 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0367 0.0964 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 7.99e-01 0.0244 0.0958 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 1.53e-01 0.119 0.0828 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00811 0.0717 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 999623 sc-eQTL 8.40e-01 0.0176 0.0875 0.211 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -546814 sc-eQTL 3.01e-01 0.0929 0.0896 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -123641 sc-eQTL 6.41e-01 0.0409 0.0876 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -257653 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0559 0.0599 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 293201 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0127 0.0921 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 165534 sc-eQTL 5.59e-01 -0.05 0.0854 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -488843 sc-eQTL 5.75e-01 0.0388 0.0692 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -304274 sc-eQTL 2.58e-01 -0.105 0.0927 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -546879 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0139 0.109 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -351413 8.7e-07 2.88e-07 1.6e-07 4.04e-07 9.87e-08 1.74e-07 3.33e-07 5.49e-08 1.5e-07 4.57e-08 2.04e-07 9.19e-08 2.24e-07 8.07e-08 5.72e-08 7.23e-08 4.31e-08 2.43e-07 7.12e-08 4.03e-08 1.21e-07 1.47e-07 2.04e-07 3.68e-08 2.74e-07 1.21e-07 1.23e-07 9.57e-08 1.36e-07 1.46e-07 1.35e-07 3.41e-08 2.74e-08 8.56e-08 6.25e-08 5.04e-08 5.31e-08 9.61e-08 7.92e-08 3.59e-08 3.77e-08 2.43e-07 3.46e-08 1.88e-08 8.16e-08 1.83e-08 1.26e-07 4.7e-09 4.72e-08