Genes within 1Mb (chr12:101571172:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 9.14e-01 0.00385 0.0356 0.528 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 9.09e-01 0.00706 0.0619 0.528 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0441 0.0375 0.528 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00787 0.0544 0.528 B L1
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 9.55e-01 0.00352 0.0619 0.528 B L1
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 2.73e-01 0.0583 0.053 0.528 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 3.46e-02 0.0896 0.0421 0.528 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 8.06e-02 0.0842 0.0479 0.528 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 1.52e-02 0.185 0.0757 0.528 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 6.03e-02 0.138 0.0729 0.528 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 8.27e-01 0.015 0.0685 0.528 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0164 0.0567 0.528 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 4.65e-01 0.056 0.0764 0.528 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0543 0.0529 0.528 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 5.09e-01 0.0388 0.0586 0.528 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 9.09e-02 0.0968 0.057 0.528 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 8.67e-01 -0.00672 0.0402 0.528 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 7.44e-03 0.184 0.0682 0.528 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00809 0.0752 0.528 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 9.52e-01 0.00296 0.0494 0.528 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0201 0.0623 0.528 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 4.37e-01 0.0535 0.0686 0.528 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 2.74e-01 0.0534 0.0487 0.528 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 8.23e-01 0.0156 0.07 0.528 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.56e-01 0.0465 0.0788 0.534 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 7.03e-02 0.13 0.0715 0.534 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0618 0.0792 0.534 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0696 0.0849 0.534 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00566 0.088 0.534 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 1.87e-01 0.0998 0.0754 0.534 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0344 0.0625 0.534 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 3.39e-02 -0.166 0.0777 0.534 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 4.81e-01 0.0581 0.0823 0.534 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00642 0.066 0.528 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 9.88e-01 0.000837 0.0559 0.528 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 1.46e-01 -0.102 0.0697 0.528 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 8.09e-01 0.0189 0.0781 0.528 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0834 0.0717 0.528 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 2.47e-01 0.0732 0.0631 0.528 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0364 0.0515 0.528 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 7.29e-01 0.0194 0.0561 0.528 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 4.98e-01 0.048 0.0706 0.528 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 3.05e-01 0.0673 0.0655 0.528 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 8.16e-01 0.0111 0.0476 0.528 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 6.58e-01 0.0339 0.0765 0.528 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0333 0.0703 0.528 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 7.17e-01 0.0192 0.053 0.528 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0544 0.0754 0.528 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 4.17e-01 0.0719 0.0884 0.528 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 3.59e-01 0.0247 0.0269 0.528 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0691 0.0512 0.528 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.27e-01 0.114 0.0747 0.528 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0386 0.0541 0.528 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0521 0.0846 0.528 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 8.36e-03 0.162 0.0607 0.528 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00612 0.0549 0.528 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0475 0.0657 0.528 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 9.70e-01 0.00203 0.0548 0.528 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 2.05e-02 0.147 0.0629 0.528 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 4.16e-01 0.0138 0.0169 0.52 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00708 0.088 0.52 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 7.33e-01 0.0222 0.065 0.52 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0146 0.0924 0.52 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0233 0.0893 0.52 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 7.84e-01 0.0253 0.0923 0.52 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 6.28e-02 0.163 0.0871 0.52 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 1.23e-01 -0.136 0.0877 0.52 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 6.01e-01 0.038 0.0725 0.52 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 1.73e-01 0.0993 0.0726 0.52 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 9.86e-02 0.113 0.0681 0.52 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0183 0.0354 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 7.73e-01 0.0255 0.0883 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0405 0.0473 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 6.22e-01 0.0346 0.07 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 3.63e-02 0.162 0.077 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0539 0.0875 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 8.36e-01 0.015 0.0724 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 8.89e-02 0.132 0.0771 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 2.18e-01 -0.1 0.0814 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 1.65e-01 0.119 0.0853 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 8.17e-01 0.019 0.0822 0.528 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0349 0.032 0.528 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0689 0.0846 0.528 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0485 0.0552 0.528 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0469 0.0757 0.528 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 9.90e-01 0.00105 0.0831 0.528 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 3.77e-01 0.0731 0.0825 0.528 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00551 0.074 0.528 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 1.57e-01 0.11 0.0772 0.528 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0173 0.0798 0.528 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 1.94e-01 0.106 0.0813 0.528 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 5.19e-01 -0.048 0.0743 0.528 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 7.35e-01 0.0152 0.0448 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0289 0.0812 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0278 0.0421 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 6.66e-01 0.0258 0.0597 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0264 0.0708 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 3.54e-01 0.0733 0.0789 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 7.33e-01 0.0204 0.0598 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 1.10e-01 0.104 0.0645 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 7.34e-02 0.157 0.0874 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 1.67e-01 0.118 0.0854 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 5.26e-01 0.051 0.0803 0.528 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 8.53e-01 -0.00736 0.0396 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0207 0.0812 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 8.01e-02 -0.0759 0.0432 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0175 0.0674 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 8.17e-01 0.0181 0.0781 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 4.41e-01 0.0662 0.0857 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 1.16e-02 0.187 0.0736 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 7.20e-01 0.0265 0.074 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 1.14e-02 0.196 0.0767 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 8.24e-01 0.02 0.0898 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00212 0.0774 0.528 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0774 0.088 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.79e-01 0.119 0.0879 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0763 0.077 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0539 0.0849 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 8.15e-01 0.0211 0.09 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0518 0.0863 0.52 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.43e-01 0.0398 0.0653 0.528 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 6.06e-01 0.0389 0.0754 0.528 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0403 0.0581 0.528 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 5.36e-01 0.0393 0.0633 0.528 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 2.50e-01 0.079 0.0684 0.528 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0283 0.0479 0.528 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0899 0.0684 0.528 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 5.95e-01 0.0421 0.0792 0.528 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0215 0.0613 0.528 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0437 0.0767 0.528 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 1.22e-02 0.179 0.0708 0.528 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 9.10e-01 0.00532 0.0471 0.528 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.73e-01 0.0458 0.0811 0.528 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 3.57e-01 0.0719 0.078 0.528 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 5.81e-01 0.0416 0.0752 0.528 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00255 0.0814 0.528 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0682 0.0768 0.528 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 1.66e-01 0.0953 0.0686 0.528 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 3.25e-01 0.0728 0.0737 0.528 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 6.13e-01 0.0384 0.0758 0.528 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0119 0.0606 0.528 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 4.56e-01 0.0611 0.0819 0.528 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 8.46e-01 0.0158 0.0811 0.528 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 1.90e-01 0.0906 0.0689 0.528 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 7.03e-01 0.0329 0.086 0.528 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 1.83e-02 0.187 0.0788 0.528 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0142 0.0794 0.528 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 1.35e-01 0.106 0.0709 0.528 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0537 0.0757 0.528 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00514 0.0823 0.528 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 5.73e-01 0.0306 0.0542 0.528 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00673 0.0837 0.528 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 2.27e-01 0.102 0.0844 0.525 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.17e-01 0.119 0.0755 0.525 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 4.81e-01 0.0555 0.0785 0.525 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 1.34e-01 0.128 0.0853 0.525 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 1.61e-01 0.118 0.0838 0.525 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 9.51e-01 0.00463 0.0754 0.525 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 6.27e-01 -0.04 0.0822 0.525 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0586 0.0833 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.16e-01 0.124 0.0784 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 1.58e-01 -0.119 0.0841 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0704 0.0905 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 7.64e-01 0.0261 0.0867 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 3.34e-01 0.0732 0.0756 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 6.84e-01 0.034 0.0835 0.53 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 8.65e-01 0.00502 0.0296 0.524 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 8.95e-01 -0.011 0.083 0.524 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 4.03e-01 0.0677 0.0808 0.524 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 4.68e-01 0.0521 0.0716 0.524 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00874 0.086 0.524 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 1.90e-01 0.115 0.0874 0.524 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0326 0.0729 0.524 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 8.60e-01 0.0146 0.0827 0.524 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 6.88e-02 -0.147 0.0804 0.524 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 3.24e-01 0.0708 0.0716 0.524 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 7.66e-01 0.0267 0.0897 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.29e-01 0.0984 0.0645 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 1.13e-02 0.189 0.0738 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 2.67e-01 0.0972 0.0873 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 6.76e-01 0.0358 0.0855 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0337 0.0773 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 8.66e-01 0.0137 0.0814 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0333 0.0859 0.533 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 2.94e-02 0.169 0.0772 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 3.47e-01 0.0718 0.0762 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 5.38e-01 0.0356 0.0577 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0318 0.0801 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 7.03e-01 0.0296 0.0775 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 4.89e-01 -0.046 0.0663 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0525 0.0806 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0208 0.0908 0.528 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0495 0.0819 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 8.58e-01 0.0151 0.0841 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 2.78e-01 0.0732 0.0674 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 3.58e-01 0.0812 0.0882 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00969 0.0903 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 9.52e-01 0.00504 0.0838 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 8.29e-01 0.0187 0.0862 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 3.32e-01 0.0822 0.0845 0.527 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0901 0.0795 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 3.94e-01 0.0636 0.0745 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 3.87e-01 -0.049 0.0566 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0235 0.079 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0442 0.0794 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 7.38e-02 0.112 0.0621 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0424 0.0815 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 6.29e-01 0.0426 0.088 0.528 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0677 0.066 0.53 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.83e-02 0.168 0.0879 0.53 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 4.35e-01 0.0541 0.0691 0.53 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00251 0.0995 0.53 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 4.95e-01 0.0782 0.114 0.53 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 2.14e-01 0.0872 0.0698 0.53 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0188 0.0811 0.53 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00568 0.0823 0.53 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 2.38e-01 -0.113 0.095 0.53 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 1.55e-02 0.21 0.0853 0.53 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 1.14e-01 0.128 0.0801 0.53 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 8.49e-01 0.00564 0.0297 0.526 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0089 0.0598 0.526 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.60e-01 0.111 0.0789 0.526 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 6.46e-01 -0.027 0.0586 0.526 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 7.13e-02 -0.151 0.0831 0.526 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 9.92e-01 0.00061 0.0634 0.526 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 3.32e-01 0.0668 0.0687 0.526 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0697 0.0589 0.526 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 1.76e-01 0.074 0.0545 0.526 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 5.68e-02 0.114 0.0593 0.526 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 3.73e-01 0.0738 0.0826 0.528 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 7.60e-02 0.152 0.0855 0.528 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 3.40e-01 0.0718 0.075 0.528 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0582 0.0818 0.528 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 7.44e-01 0.0277 0.0847 0.528 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 8.72e-01 0.0111 0.0688 0.528 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 9.98e-01 0.000231 0.077 0.539 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 9.87e-03 0.192 0.0737 0.539 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 2.15e-01 -0.12 0.0965 0.539 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 2.02e-01 -0.112 0.0874 0.539 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0425 0.091 0.539 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 2.21e-03 0.259 0.0833 0.539 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0366 0.0666 0.539 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 1.50e-01 -0.117 0.081 0.539 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0687 0.0758 0.539 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 4.64e-01 -0.055 0.0751 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000994 0.0567 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0969 0.0749 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 3.89e-01 0.0728 0.0845 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00665 0.0758 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 2.28e-01 0.0788 0.0651 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0331 0.0557 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 1.00e+00 -2.38e-05 0.061 0.528 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0452 0.0807 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0678 0.0617 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0642 0.0751 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 5.46e-01 0.0533 0.0881 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 9.40e-02 -0.138 0.0823 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 4.30e-01 0.0604 0.0765 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 3.57e-01 -0.055 0.0596 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0683 0.0747 0.528 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0106 0.108 0.515 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 7.22e-01 0.036 0.101 0.515 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0227 0.0762 0.515 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 2.10e-01 0.126 0.1 0.515 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 7.45e-02 0.188 0.104 0.515 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 8.97e-01 0.0128 0.0985 0.515 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 4.56e-01 0.0746 0.0999 0.515 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0948 0.098 0.515 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 6.17e-01 0.045 0.09 0.515 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.76e-02 0.156 0.0817 0.529 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 2.62e-01 0.0845 0.0752 0.529 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 7.69e-01 0.0261 0.0885 0.529 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 6.43e-01 0.0384 0.0828 0.529 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0133 0.0858 0.529 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0633 0.0828 0.529 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 1.26e-01 0.111 0.072 0.529 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 8.72e-01 0.0129 0.0802 0.529 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0437 0.0831 0.536 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.82e-01 0.102 0.0765 0.536 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 1.49e-01 -0.133 0.0915 0.536 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 1.06e-01 -0.13 0.0799 0.536 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 7.23e-01 0.0274 0.0773 0.536 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 7.45e-01 0.0242 0.0743 0.536 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 6.28e-02 -0.128 0.0686 0.536 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 2.35e-01 0.0855 0.0717 0.536 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 4.80e-02 0.196 0.0983 0.554 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0148 0.0866 0.554 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 3.48e-01 0.0861 0.0914 0.554 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 7.75e-01 0.0261 0.0913 0.554 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 4.12e-01 0.0788 0.0958 0.554 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 2.28e-02 -0.189 0.0823 0.554 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 6.96e-01 0.0253 0.0647 0.554 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 1.50e-01 -0.111 0.0768 0.554 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 3.22e-01 0.0852 0.0857 0.554 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0276 0.0409 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0349 0.0822 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0129 0.0432 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0206 0.0679 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 9.25e-02 0.117 0.0695 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0277 0.0791 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 6.80e-01 0.0244 0.0591 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 2.00e-01 0.0907 0.0705 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0445 0.0815 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 1.54e-01 0.122 0.085 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00357 0.0846 0.528 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -910572 sc-eQTL 6.37e-01 0.0226 0.0478 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 9.04e-01 0.00942 0.0782 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0356 0.0386 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 9.01e-01 0.0069 0.0553 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0104 0.0677 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 1.00e-01 0.127 0.0768 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 8.79e-02 0.0986 0.0575 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 1.04e-01 0.0983 0.0603 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -168300 sc-eQTL 2.39e-02 0.197 0.0865 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 3.85e-01 0.0776 0.089 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -626413 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00399 0.0812 0.528 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0389 0.0694 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0417 0.056 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 1.06e-01 -0.117 0.0718 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 3.93e-01 0.0729 0.0852 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0985 0.0727 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 2.04e-01 0.0807 0.0633 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 4.78e-01 -0.037 0.0521 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00684 0.0599 0.528 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 4.60e-01 0.0591 0.0799 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 1.75e-01 0.0945 0.0695 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0329 0.0845 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0744 0.0812 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0592 0.0807 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 3.86e-01 0.0609 0.07 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0211 0.0605 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 997489 sc-eQTL 5.20e-01 0.0476 0.0737 0.53 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -548948 sc-eQTL 4.32e-01 0.0587 0.0745 0.528 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -125775 sc-eQTL 4.35e-01 0.0569 0.0727 0.528 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 sc-eQTL 9.21e-01 0.00492 0.0498 0.528 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 291067 sc-eQTL 8.44e-01 0.0151 0.0765 0.528 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 163400 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0504 0.0709 0.528 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -490977 sc-eQTL 6.29e-01 0.0278 0.0574 0.528 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0595 0.0771 0.528 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -549013 sc-eQTL 5.71e-01 0.0515 0.0907 0.528 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111670 GNPTAB -259787 eQTL 3.29e-02 0.0287 0.0135 0.00126 0.0 0.476
ENSG00000120805 ARL1 163400 eQTL 0.0287 0.0322 0.0147 0.00106 0.0 0.476
ENSG00000136048 DRAM1 -306408 eQTL 0.0342 -0.029 0.0137 0.0 0.0 0.476
ENSG00000185480 PARPBP -549013 eQTL 0.0355 0.0465 0.0221 0.0 0.0 0.476


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina