logo

Genes within 1Mb (chr12:101556619:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0678 0.0652 0.088 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 2.92e-01 0.12 0.113 0.088 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 5.28e-03 0.191 0.0679 0.088 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 1.79e-01 -0.134 0.0996 0.088 B L1
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 3.44e-01 0.108 0.113 0.088 B L1
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 4.12e-01 0.0803 0.0976 0.088 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0376 0.0782 0.088 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0751 0.0886 0.088 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 8.68e-01 0.0235 0.141 0.088 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 3.14e-03 -0.395 0.132 0.088 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 8.44e-02 0.217 0.125 0.088 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 4.60e-02 0.204 0.101 0.088 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.06e-02 0.282 0.137 0.088 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0304 0.0959 0.088 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 4.60e-01 0.0784 0.106 0.088 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 9.46e-02 -0.173 0.103 0.088 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 7.51e-01 0.023 0.0726 0.088 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 8.66e-02 -0.217 0.126 0.088 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 5.68e-02 0.261 0.136 0.088 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00139 0.0903 0.088 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.11e-01 0.0749 0.114 0.088 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 8.54e-01 0.0232 0.126 0.088 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 7.64e-01 0.0268 0.0893 0.088 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0903 0.128 0.088 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 4.30e-01 -0.113 0.143 0.086 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 7.12e-01 0.0485 0.131 0.086 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 3.45e-01 -0.136 0.144 0.086 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0419 0.155 0.086 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 5.42e-01 0.0977 0.16 0.086 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 8.93e-01 0.0186 0.138 0.086 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0296 0.114 0.086 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 4.19e-01 0.116 0.143 0.086 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 6.88e-01 0.0603 0.15 0.086 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 1.54e-02 -0.287 0.117 0.088 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 3.52e-02 0.211 0.0997 0.088 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0291 0.126 0.088 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0896 0.141 0.088 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0883 0.13 0.088 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0416 0.114 0.088 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 3.42e-01 0.0885 0.0928 0.088 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 6.14e-02 -0.189 0.1 0.088 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 3.62e-01 -0.12 0.131 0.086 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 3.59e-02 0.255 0.121 0.086 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 4.66e-01 0.0646 0.0885 0.086 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 7.62e-01 0.0431 0.142 0.086 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 6.04e-01 -0.068 0.131 0.086 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 9.60e-01 0.00497 0.0987 0.086 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0563 0.14 0.086 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 1.39e-01 -0.244 0.164 0.086 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0509 0.0486 0.088 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.38e-01 0.0437 0.0927 0.088 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 5.47e-01 0.0817 0.135 0.088 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 3.34e-01 0.0945 0.0976 0.088 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 1.66e-01 0.211 0.152 0.088 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 8.71e-02 -0.19 0.111 0.088 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0392 0.0989 0.088 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 1.71e-01 0.162 0.118 0.088 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 9.10e-02 -0.167 0.0982 0.088 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 4.03e-02 -0.235 0.114 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 2.93e-01 0.0325 0.0309 0.092 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 5.63e-01 0.0929 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.45e-01 0.0907 0.118 0.092 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 4.27e-01 -0.134 0.168 0.092 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 3.22e-01 0.161 0.163 0.092 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 5.73e-01 0.0949 0.168 0.092 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0919 0.16 0.092 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 4.29e-01 0.128 0.161 0.092 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 3.39e-01 -0.126 0.132 0.092 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 7.53e-01 0.0419 0.133 0.092 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 8.00e-02 -0.218 0.124 0.092 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 4.63e-01 0.0473 0.0643 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 3.78e-01 0.142 0.16 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.09e-02 0.175 0.0852 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 2.37e-01 -0.15 0.127 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.97e-01 0.00056 0.141 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 5.16e-01 0.104 0.159 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 6.65e-01 0.057 0.131 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 1.71e-01 -0.193 0.14 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 1.28e-02 0.367 0.146 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 3.02e-02 -0.336 0.154 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 6.67e-01 0.0643 0.149 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 2.33e-01 0.0693 0.0579 0.088 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 8.85e-01 0.0222 0.153 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.13e-03 0.285 0.0982 0.088 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.78e-01 0.057 0.137 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0543 0.15 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.29e-01 0.146 0.149 0.088 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 9.70e-01 -0.005 0.134 0.088 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 1.73e-01 0.191 0.14 0.088 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 4.65e-02 0.287 0.143 0.088 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 5.97e-01 0.0783 0.148 0.088 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 2.42e-01 0.157 0.134 0.088 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 2.08e-01 -0.103 0.0815 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.70e-02 0.27 0.147 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 7.90e-04 0.255 0.0749 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 3.21e-01 -0.108 0.109 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 1.00e-01 0.212 0.128 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0155 0.144 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 8.96e-01 0.0143 0.109 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0297 0.118 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 8.02e-02 -0.28 0.159 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 1.39e-01 -0.231 0.156 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 5.02e-01 0.0984 0.146 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 4.30e-01 0.0566 0.0716 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 2.81e-01 0.158 0.147 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 2.04e-02 0.181 0.0777 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 7.81e-01 0.0339 0.122 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.18e-01 0.0145 0.141 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 4.33e-01 0.122 0.155 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0732 0.135 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 5.49e-01 0.0803 0.134 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 3.27e-01 -0.138 0.141 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 6.36e-02 -0.301 0.161 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 3.03e-01 -0.144 0.14 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.44e-01 -0.072 0.156 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.95e-01 0.202 0.155 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 7.20e-01 -0.049 0.136 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0805 0.15 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.87e-01 -0.138 0.159 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 1.93e-01 0.199 0.152 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 5.01e-02 0.229 0.116 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 3.22e-02 0.288 0.134 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00367 0.104 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 1.49e-01 0.164 0.113 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0578 0.123 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 4.93e-01 0.0589 0.0858 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 9.97e-01 0.000407 0.125 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.61e-02 0.344 0.142 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 7.51e-02 -0.198 0.111 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.66e-01 -0.006 0.139 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.27e-01 -0.128 0.13 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 3.80e-01 0.0752 0.0854 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 2.02e-01 0.192 0.15 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.30e-01 0.115 0.145 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0391 0.14 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 2.63e-03 0.45 0.148 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 9.23e-01 0.0138 0.143 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 9.19e-01 0.013 0.128 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 7.16e-01 0.0485 0.133 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 7.83e-01 0.0376 0.137 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.39e-01 0.00836 0.109 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0569 0.148 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.19e-01 0.145 0.146 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 9.23e-01 -0.012 0.125 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 4.61e-02 -0.308 0.154 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 1.90e-02 -0.336 0.142 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 8.46e-02 0.246 0.142 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0623 0.128 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 7.47e-01 0.0442 0.137 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 5.26e-01 0.0942 0.148 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 9.59e-01 0.00506 0.0977 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 4.35e-01 0.118 0.151 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 1.02e-02 -0.391 0.151 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 9.20e-01 0.0138 0.138 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 3.25e-01 -0.14 0.142 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 8.75e-02 -0.265 0.154 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.47e-02 -0.321 0.151 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 3.39e-01 0.13 0.136 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 2.24e-01 -0.181 0.148 0.086 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 4.35e-01 0.118 0.151 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 6.13e-01 0.0726 0.143 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 3.64e-01 0.139 0.153 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.28e-01 0.104 0.165 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 8.02e-02 0.275 0.156 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 1.39e-01 0.203 0.137 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 3.86e-01 0.132 0.152 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0348 0.0534 0.089 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0758 0.15 0.089 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 7.90e-01 0.0391 0.146 0.089 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.85e-01 0.0526 0.13 0.089 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00523 0.155 0.089 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.62e-01 -0.145 0.158 0.089 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 7.85e-01 0.036 0.132 0.089 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 3.71e-01 -0.134 0.149 0.089 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 2.54e-01 -0.167 0.146 0.089 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0611 0.13 0.089 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0781 0.165 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.86e-01 0.157 0.119 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0638 0.138 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 4.61e-01 -0.118 0.16 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.47e-01 -0.148 0.157 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 8.55e-01 0.026 0.142 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 4.10e-01 0.123 0.149 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0162 0.158 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 1.23e-01 -0.223 0.144 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.79e-02 0.279 0.14 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.36e-01 0.0506 0.107 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.93e-02 0.279 0.147 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 9.01e-01 0.0178 0.144 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 3.70e-01 0.11 0.123 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0451 0.149 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 1.26e-01 -0.257 0.167 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0616 0.147 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 7.53e-01 0.0477 0.151 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.52e-01 0.00729 0.122 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00606 0.159 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0451 0.162 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 5.23e-01 0.0965 0.151 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 2.59e-01 0.175 0.155 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0388 0.153 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 4.37e-01 0.114 0.147 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.27e-01 0.209 0.137 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00895 0.104 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0523 0.145 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 4.00e-01 -0.123 0.146 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0783 0.115 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 3.25e-01 -0.148 0.15 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 9.36e-01 0.013 0.162 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 2.33e-01 0.127 0.106 0.1 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.77e-01 -0.06 0.143 0.1 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.52e-01 0.0838 0.111 0.1 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.98e-01 0.000314 0.16 0.1 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.68e-01 -0.0073 0.184 0.1 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 1.56e-02 -0.27 0.11 0.1 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0534 0.13 0.1 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0259 0.132 0.1 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0129 0.154 0.1 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 4.05e-01 -0.117 0.14 0.1 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0714 0.13 0.1 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0291 0.0529 0.089 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 4.85e-01 0.0746 0.107 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 6.64e-01 0.0615 0.141 0.089 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 1.76e-01 0.141 0.104 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 1.97e-01 0.193 0.149 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.69e-01 0.102 0.113 0.089 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00498 0.123 0.089 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 7.39e-01 0.0352 0.105 0.089 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0679 0.0975 0.089 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 5.16e-02 -0.207 0.106 0.089 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0314 0.152 0.088 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.33e-01 0.238 0.158 0.088 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0675 0.138 0.088 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 3.56e-01 -0.139 0.151 0.088 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 9.91e-01 0.00169 0.156 0.088 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 1.86e-01 -0.168 0.126 0.088 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.14e-01 0.0735 0.145 0.083 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 8.23e-01 0.0317 0.142 0.083 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.35e-01 0.0871 0.183 0.083 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 8.98e-01 0.0213 0.166 0.083 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 4.95e-01 0.118 0.172 0.083 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 4.89e-01 -0.112 0.161 0.083 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0843 0.126 0.083 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 7.26e-01 -0.054 0.154 0.083 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 3.74e-01 0.128 0.143 0.083 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 2.34e-01 -0.159 0.133 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.92e-02 0.234 0.0993 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 4.03e-01 0.112 0.133 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0717 0.15 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0349 0.135 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0483 0.116 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 1.81e-01 0.132 0.0985 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 6.44e-01 -0.05 0.108 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 1.11e-01 -0.235 0.147 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.43e-02 0.276 0.112 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.48e-02 -0.23 0.137 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.28e-01 -0.102 0.161 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0458 0.152 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0314 0.14 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 5.32e-01 0.0683 0.109 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 8.43e-02 -0.236 0.136 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0306 0.195 0.091 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 1.07e-01 0.294 0.181 0.091 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 7.45e-01 0.0449 0.138 0.091 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00696 0.182 0.091 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 6.23e-01 -0.094 0.191 0.091 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 9.13e-01 0.0195 0.178 0.091 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 2.33e-02 0.407 0.178 0.091 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 3.27e-01 -0.174 0.177 0.091 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0219 0.163 0.091 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0462 0.151 0.084 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 8.18e-01 0.0317 0.138 0.084 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 3.49e-01 -0.152 0.161 0.084 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 2.71e-01 -0.167 0.151 0.084 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 6.97e-01 -0.061 0.157 0.084 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 4.60e-01 -0.112 0.151 0.084 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 1.09e-01 -0.212 0.132 0.084 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 9.41e-01 0.0108 0.147 0.084 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 3.57e-01 -0.137 0.149 0.088 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 7.16e-01 0.0501 0.138 0.088 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00723 0.165 0.088 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0599 0.144 0.088 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 4.18e-01 -0.112 0.138 0.088 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 2.93e-01 -0.14 0.133 0.088 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 1.86e-02 0.29 0.122 0.088 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 4.11e-01 -0.106 0.129 0.088 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 2.39e-01 -0.211 0.179 0.076 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 7.65e-01 0.0469 0.156 0.076 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 2.25e-01 -0.201 0.165 0.076 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 9.25e-02 -0.276 0.163 0.076 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0215 0.173 0.076 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 4.01e-01 0.127 0.151 0.076 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 2.31e-01 -0.14 0.116 0.076 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 4.91e-02 0.273 0.138 0.076 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 5.52e-01 0.0924 0.155 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 6.45e-02 0.139 0.0746 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.77e-01 0.063 0.151 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 5.86e-03 0.217 0.0781 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0718 0.125 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.83e-01 0.0707 0.129 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 3.51e-01 0.136 0.145 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 7.43e-01 0.0356 0.109 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0745 0.13 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 1.19e-02 0.375 0.148 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 1.86e-01 -0.207 0.156 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 5.07e-01 0.103 0.155 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -925125 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0245 0.0881 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 3.84e-01 0.125 0.144 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 3.63e-03 0.205 0.0698 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0863 0.102 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 2.38e-01 0.147 0.124 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0649 0.142 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0325 0.107 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0377 0.112 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -182853 sc-eQTL 8.69e-02 -0.275 0.16 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 7.67e-02 -0.29 0.163 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -640966 sc-eQTL 7.17e-01 0.0543 0.149 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 2.59e-02 -0.277 0.123 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.42e-03 0.285 0.099 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00708 0.13 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0872 0.153 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0535 0.131 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0323 0.114 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 2.61e-01 0.105 0.0935 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 1.32e-01 -0.162 0.107 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0653 0.143 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 8.41e-01 0.0252 0.125 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 4.39e-01 -0.117 0.151 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 1.95e-01 -0.189 0.145 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0342 0.145 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 1.44e-01 -0.184 0.125 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 5.54e-01 0.0643 0.108 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 982936 sc-eQTL 2.13e-01 -0.165 0.132 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -563501 sc-eQTL 4.18e-01 -0.113 0.139 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 sc-eQTL 4.39e-02 0.274 0.135 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -274340 sc-eQTL 6.32e-01 0.0447 0.0933 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 276514 sc-eQTL 4.31e-01 0.113 0.143 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 148847 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0608 0.133 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -505530 sc-eQTL 8.96e-01 0.0141 0.108 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0561 0.145 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -563566 sc-eQTL 2.73e-01 -0.187 0.17 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -140328 eQTL 3.46e-02 0.0917 0.0433 0.0 0.0 0.0864
ENSG00000136048 DRAM1 -320961 eQTL 0.0499 -0.0478 0.0243 0.0 0.0 0.0864
ENSG00000258230 AC063950.1 -217136 eQTL 0.00573 0.131 0.0472 0.0 0.0 0.0864

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina