logo

Genes within 1Mb (chr12:101551411:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 2.02e-01 0.097 0.0758 0.064 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 2.81e-01 0.143 0.132 0.064 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 9.99e-01 0.000105 0.0805 0.064 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 3.93e-03 -0.333 0.114 0.064 B L1
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 3.24e-01 -0.131 0.132 0.064 B L1
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 7.44e-02 0.203 0.113 0.064 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 1.75e-01 0.123 0.0907 0.064 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 3.83e-02 -0.213 0.102 0.064 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 4.55e-01 0.123 0.164 0.064 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 5.88e-01 0.0853 0.157 0.064 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 9.12e-01 0.0161 0.147 0.064 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 3.69e-01 0.109 0.121 0.064 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 1.15e-01 0.259 0.163 0.064 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 6.14e-03 -0.31 0.112 0.064 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 9.19e-01 0.0129 0.126 0.064 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 8.02e-01 0.0309 0.123 0.064 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 4.01e-01 0.0724 0.0861 0.064 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0123 0.153 0.064 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 3.45e-01 0.157 0.166 0.064 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0636 0.109 0.064 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.65e-01 0.1 0.137 0.064 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0568 0.152 0.064 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 1.30e-02 0.266 0.106 0.064 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0591 0.154 0.064 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 1.09e-01 0.262 0.162 0.068 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 3.82e-01 0.131 0.149 0.068 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 5.46e-01 0.0993 0.164 0.068 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0723 0.176 0.068 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 4.43e-01 0.14 0.182 0.068 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0575 0.157 0.068 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00358 0.129 0.068 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 6.38e-01 0.0766 0.163 0.068 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 6.65e-01 0.074 0.171 0.068 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0314 0.142 0.064 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 5.65e-01 0.0691 0.12 0.064 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0604 0.15 0.064 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 2.13e-01 -0.208 0.167 0.064 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 2.35e-01 -0.183 0.154 0.064 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 6.42e-01 0.0632 0.136 0.064 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0326 0.111 0.064 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 1.52e-01 0.172 0.12 0.064 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 4.28e-01 0.122 0.154 0.064 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 8.88e-03 0.373 0.141 0.064 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 8.48e-01 -0.02 0.104 0.064 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 8.63e-01 -0.029 0.167 0.064 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 9.59e-01 0.00795 0.154 0.064 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0578 0.116 0.064 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0512 0.165 0.064 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 6.23e-01 0.0952 0.193 0.064 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 1.45e-01 0.0859 0.0587 0.064 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 7.35e-01 0.0381 0.112 0.064 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 8.81e-02 0.279 0.163 0.064 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 3.62e-01 -0.108 0.118 0.064 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 8.80e-01 -0.028 0.185 0.064 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 8.64e-01 0.0232 0.135 0.064 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00506 0.12 0.064 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 5.52e-01 0.0855 0.144 0.064 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 7.53e-01 0.0377 0.12 0.064 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 3.23e-01 0.138 0.139 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 4.09e-01 0.0294 0.0355 0.069 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 9.18e-01 0.0191 0.185 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 5.86e-02 0.257 0.135 0.069 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0722 0.194 0.069 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 2.62e-01 -0.21 0.187 0.069 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 7.49e-01 0.0621 0.193 0.069 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 8.63e-01 0.032 0.184 0.069 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 8.88e-03 -0.48 0.182 0.069 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 2.62e-01 -0.171 0.152 0.069 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 3.11e-01 -0.155 0.153 0.069 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0385 0.144 0.069 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 8.11e-01 0.0181 0.0755 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 3.15e-01 0.189 0.188 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 9.08e-01 0.0117 0.101 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0552 0.149 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 7.18e-01 0.06 0.166 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0308 0.187 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 6.04e-01 -0.08 0.154 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 3.27e-01 -0.162 0.165 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0529 0.174 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 6.80e-01 0.0753 0.183 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00351 0.175 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 2.44e-01 -0.0799 0.0683 0.065 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 2.86e-01 0.193 0.181 0.065 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00238 0.118 0.065 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 2.20e-02 -0.369 0.16 0.065 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 1.00e+00 6.73e-05 0.178 0.065 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 9.82e-01 0.00397 0.177 0.065 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 2.47e-01 -0.183 0.158 0.065 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 5.17e-01 -0.108 0.166 0.065 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0959 0.17 0.065 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 1.41e-01 0.257 0.174 0.065 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0241 0.159 0.065 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 2.06e-01 -0.122 0.0964 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 5.13e-01 0.115 0.175 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0176 0.0911 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 1.09e-01 -0.206 0.128 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.20e-01 -0.123 0.153 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 2.07e-01 0.215 0.17 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 6.57e-01 0.0575 0.129 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 3.15e-01 -0.141 0.14 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 7.93e-01 0.0499 0.19 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 1.94e-01 0.24 0.184 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 2.94e-01 0.182 0.173 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0377 0.0836 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0442 0.171 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0258 0.0918 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 1.83e-01 -0.189 0.142 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0402 0.165 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 5.00e-01 0.122 0.181 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 5.05e-02 0.307 0.156 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 1.23e-01 -0.24 0.155 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 1.85e-01 0.218 0.164 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0401 0.19 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 1.12e-01 -0.259 0.162 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 9.41e-01 0.0138 0.185 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 6.14e-01 0.0934 0.185 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 2.07e-01 0.204 0.161 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 7.92e-01 -0.047 0.178 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 3.50e-01 -0.176 0.188 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 2.67e-02 -0.399 0.179 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 7.83e-01 0.0385 0.139 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 1.41e-01 0.236 0.16 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 1.16e-02 -0.311 0.122 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.56e-01 0.101 0.135 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 9.71e-01 0.0054 0.146 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 2.20e-01 0.125 0.102 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0393 0.148 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 5.22e-02 0.331 0.17 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 3.79e-01 -0.117 0.132 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 2.44e-01 -0.193 0.165 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 4.61e-02 0.308 0.154 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 4.55e-01 0.0761 0.102 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 5.83e-02 0.337 0.177 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 2.38e-02 0.387 0.17 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 8.50e-01 0.0314 0.165 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 1.47e-01 -0.259 0.178 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 4.91e-01 -0.116 0.169 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 2.08e-01 -0.191 0.151 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 8.80e-01 0.0244 0.161 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 3.80e-01 0.145 0.165 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 7.85e-01 0.036 0.132 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0117 0.179 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 4.74e-01 0.127 0.177 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 2.82e-02 0.329 0.149 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 4.10e-01 0.155 0.187 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 6.45e-02 0.314 0.169 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 2.45e-01 0.196 0.169 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 9.53e-01 0.00889 0.152 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.31e-01 0.127 0.161 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0112 0.175 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 6.66e-01 0.0499 0.115 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 1.63e-01 -0.248 0.177 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 8.53e-01 0.0341 0.184 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 4.50e-01 0.125 0.165 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 5.73e-01 0.0964 0.171 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 2.92e-01 0.197 0.186 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 4.76e-01 0.131 0.183 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 4.89e-02 0.322 0.162 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 3.97e-01 0.151 0.178 0.065 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 6.33e-03 -0.466 0.169 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 1.26e-02 0.403 0.16 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0806 0.174 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 3.69e-01 -0.168 0.187 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 8.87e-01 0.0255 0.179 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 4.86e-01 0.109 0.156 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 3.37e-01 0.166 0.172 0.068 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0458 0.0624 0.065 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 6.28e-01 0.0851 0.175 0.065 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 6.43e-03 0.462 0.168 0.065 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0969 0.151 0.065 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 7.25e-01 0.064 0.182 0.065 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 7.57e-01 0.0575 0.185 0.065 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 4.97e-01 0.105 0.154 0.065 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 7.96e-02 -0.306 0.173 0.065 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 6.83e-02 -0.311 0.17 0.065 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 9.03e-01 0.0186 0.152 0.065 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 1.34e-01 0.28 0.186 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 3.33e-03 0.394 0.133 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 6.49e-01 0.0712 0.156 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.29e-01 0.144 0.182 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 5.26e-01 0.113 0.178 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 4.42e-01 -0.124 0.161 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 3.16e-01 0.17 0.169 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 5.55e-01 -0.106 0.179 0.064 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 8.99e-01 0.0213 0.168 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 8.20e-02 0.286 0.163 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 7.25e-01 0.0438 0.124 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0595 0.173 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 1.08e-01 0.268 0.166 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0572 0.143 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 4.23e-01 -0.139 0.174 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0489 0.196 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0425 0.191 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 1.43e-01 0.286 0.195 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 9.18e-01 0.0163 0.157 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 3.39e-01 -0.197 0.205 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 2.63e-01 -0.235 0.21 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 9.75e-02 0.323 0.194 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 9.26e-01 0.0186 0.201 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 2.65e-01 0.22 0.197 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 6.67e-01 0.073 0.17 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 1.39e-02 0.388 0.157 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 3.98e-01 0.102 0.12 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 8.15e-01 0.0395 0.168 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 6.66e-01 -0.073 0.169 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0659 0.133 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 4.05e-01 -0.145 0.173 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 7.62e-01 0.0569 0.187 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0195 0.149 0.059 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 1.25e-01 0.306 0.198 0.059 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 3.84e-01 -0.135 0.155 0.059 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 2.75e-02 -0.488 0.218 0.059 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 5.00e-01 -0.173 0.256 0.059 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0389 0.158 0.059 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 8.40e-01 0.0368 0.182 0.059 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0806 0.184 0.059 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0556 0.214 0.059 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0944 0.196 0.059 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 8.82e-01 0.0271 0.182 0.059 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 6.41e-01 0.0298 0.0639 0.063 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 6.01e-01 0.0676 0.129 0.063 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0253 0.171 0.063 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 2.10e-01 -0.158 0.126 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 5.74e-02 0.342 0.179 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0303 0.137 0.063 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 1.34e-01 -0.222 0.148 0.063 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0091 0.127 0.063 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 5.26e-01 0.0747 0.118 0.063 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 3.77e-02 0.267 0.128 0.063 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 5.39e-01 0.107 0.174 0.064 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 1.60e-01 0.254 0.18 0.064 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0964 0.158 0.064 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 6.61e-01 0.0755 0.172 0.064 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 1.51e-01 -0.255 0.177 0.064 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 8.99e-01 0.0184 0.145 0.064 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 9.30e-01 0.0137 0.156 0.071 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 2.03e-01 0.194 0.152 0.071 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 9.22e-01 0.0192 0.197 0.071 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 5.35e-02 -0.343 0.176 0.071 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 2.47e-01 -0.214 0.184 0.071 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 9.39e-01 0.0133 0.173 0.071 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 5.90e-01 -0.073 0.135 0.071 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 8.24e-01 0.0368 0.165 0.071 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 9.18e-01 0.0158 0.154 0.071 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0514 0.159 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 9.04e-01 0.0145 0.12 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0694 0.159 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 2.31e-01 -0.215 0.179 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 9.35e-02 -0.269 0.16 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0139 0.139 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0518 0.118 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 1.26e-02 0.321 0.127 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0967 0.171 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00473 0.131 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00396 0.159 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 5.45e-01 -0.113 0.187 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0378 0.175 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 5.68e-01 0.0928 0.162 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 2.58e-01 -0.143 0.126 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 2.98e-01 -0.165 0.158 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 4.15e-01 -0.196 0.239 0.055 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 8.51e-01 0.0423 0.225 0.055 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 4.99e-01 0.115 0.169 0.055 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.82e-01 -0.157 0.224 0.055 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 3.44e-02 -0.494 0.231 0.055 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 1.94e-01 -0.284 0.218 0.055 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 4.35e-03 0.627 0.216 0.055 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 1.06e-01 -0.353 0.217 0.055 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 8.93e-02 -0.339 0.198 0.055 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 4.63e-01 0.124 0.169 0.067 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 7.94e-01 0.0403 0.154 0.067 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 9.65e-01 0.00805 0.181 0.067 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 7.48e-01 0.0547 0.17 0.067 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 6.16e-02 0.328 0.174 0.067 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 4.37e-01 0.132 0.17 0.067 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0928 0.148 0.067 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0918 0.164 0.067 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 2.85e-01 0.183 0.171 0.068 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 2.93e-01 0.167 0.158 0.068 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 5.50e-01 0.114 0.19 0.068 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 7.88e-01 0.0446 0.166 0.068 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0879 0.159 0.068 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0556 0.153 0.068 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0358 0.143 0.068 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 2.72e-01 0.163 0.148 0.068 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 1.57e-01 0.299 0.21 0.059 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 4.89e-01 -0.128 0.184 0.059 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 3.14e-01 0.196 0.194 0.059 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.05e-02 0.396 0.191 0.059 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 4.23e-02 0.413 0.201 0.059 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00617 0.178 0.059 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 6.38e-01 0.0649 0.138 0.059 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 3.64e-01 0.149 0.164 0.059 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 2.47e-01 0.212 0.182 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0312 0.087 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 8.49e-02 0.301 0.174 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 5.94e-01 0.0491 0.0919 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 6.94e-02 -0.262 0.143 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0746 0.149 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 9.33e-01 0.0141 0.168 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 3.12e-01 -0.127 0.125 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 8.91e-02 -0.255 0.15 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0822 0.173 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 6.88e-01 0.073 0.182 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0219 0.18 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -930333 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0714 0.102 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 6.80e-01 0.0691 0.167 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0364 0.0826 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 1.32e-02 -0.291 0.117 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.47e-01 -0.11 0.145 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 1.12e-01 0.262 0.164 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 8.28e-02 0.214 0.123 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 1.27e-01 -0.198 0.129 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -188061 sc-eQTL 5.76e-01 0.105 0.187 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 4.32e-01 0.15 0.19 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -646174 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0605 0.173 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 3.76e-01 -0.13 0.146 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0106 0.119 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0956 0.153 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 1.91e-01 -0.236 0.18 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 1.00e-01 -0.253 0.153 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 5.27e-01 0.085 0.134 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0818 0.11 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 1.14e-01 0.2 0.126 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 1.64e-01 0.234 0.168 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 4.27e-01 0.117 0.147 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 9.08e-01 0.0205 0.178 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 4.82e-01 0.12 0.171 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 4.22e-01 0.137 0.17 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 5.52e-01 0.0878 0.147 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 7.36e-01 -0.043 0.127 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 977728 sc-eQTL 6.24e-01 0.0761 0.155 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -568709 sc-eQTL 7.35e-01 0.055 0.162 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 sc-eQTL 2.50e-02 0.353 0.156 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -279548 sc-eQTL 9.45e-01 0.00743 0.108 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 271306 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00939 0.166 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 143639 sc-eQTL 7.70e-01 0.045 0.154 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -510738 sc-eQTL 8.88e-01 0.0176 0.125 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -326169 sc-eQTL 2.81e-01 -0.181 0.167 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -568774 sc-eQTL 4.34e-01 0.154 0.197 0.065 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -145536 eQTL 6.02e-03 0.159 0.0579 0.0 0.0 0.0471

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina