logo

Genes within 1Mb (chr12:101550418:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0626 0.0639 0.092 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 6.56e-01 0.0497 0.111 0.092 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 8.25e-03 0.178 0.0666 0.092 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 1.97e-01 -0.126 0.0977 0.092 B L1
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 1.91e-01 0.146 0.111 0.092 B L1
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.11e-01 0.0788 0.0956 0.092 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0287 0.0767 0.092 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 2.44e-01 -0.101 0.0867 0.092 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 6.37e-01 0.0653 0.138 0.092 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 6.93e-03 -0.355 0.13 0.092 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 4.61e-02 0.245 0.122 0.092 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 8.33e-02 0.174 0.1 0.092 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 2.70e-02 0.299 0.134 0.092 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0355 0.0942 0.092 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 3.67e-01 0.0941 0.104 0.092 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 1.92e-01 -0.133 0.101 0.092 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 6.64e-01 0.031 0.0713 0.092 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 1.34e-01 -0.187 0.124 0.092 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 5.05e-02 0.264 0.134 0.092 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 9.02e-01 0.011 0.0887 0.092 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 5.34e-01 0.0697 0.112 0.092 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 7.21e-01 0.0442 0.124 0.092 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 9.48e-01 0.00578 0.0878 0.092 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0749 0.126 0.092 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0947 0.141 0.09 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 6.25e-01 0.0631 0.129 0.09 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.76e-01 -0.101 0.142 0.09 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 8.54e-01 -0.028 0.152 0.09 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.62e-01 0.116 0.157 0.09 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 9.74e-01 0.00434 0.135 0.09 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 7.75e-01 -0.032 0.112 0.09 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 4.36e-01 0.109 0.14 0.09 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 4.88e-01 0.102 0.147 0.09 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 1.03e-02 -0.299 0.116 0.092 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 4.37e-02 0.2 0.0984 0.092 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0743 0.125 0.092 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 3.15e-01 -0.14 0.139 0.092 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0818 0.128 0.092 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 5.22e-01 -0.072 0.112 0.092 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.50e-01 0.0857 0.0915 0.092 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 9.01e-02 -0.169 0.0991 0.092 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 3.88e-01 -0.111 0.128 0.09 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 3.11e-02 0.256 0.118 0.09 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 3.55e-01 0.0801 0.0864 0.09 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 8.88e-01 0.0197 0.139 0.09 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.17e-01 -0.104 0.128 0.09 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 5.99e-01 0.0508 0.0964 0.09 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 8.11e-01 -0.033 0.137 0.09 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 1.75e-01 -0.218 0.16 0.09 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0372 0.0477 0.092 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 9.78e-01 0.00251 0.0911 0.092 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 5.27e-01 0.0843 0.133 0.092 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 2.86e-01 0.102 0.0957 0.092 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 2.00e-01 0.192 0.149 0.092 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 1.05e-01 -0.177 0.109 0.092 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000108 0.0971 0.092 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 1.58e-01 0.164 0.116 0.092 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 1.02e-01 -0.159 0.0964 0.092 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 4.05e-02 -0.23 0.112 0.092 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 3.04e-01 0.0314 0.0305 0.094 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 6.86e-01 0.0643 0.159 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 3.75e-01 0.104 0.117 0.094 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.47e-01 -0.127 0.166 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 2.59e-01 0.182 0.161 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 3.95e-01 0.142 0.166 0.094 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0907 0.158 0.094 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.96e-01 0.135 0.159 0.094 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 2.99e-01 -0.136 0.13 0.094 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 8.68e-01 0.0219 0.132 0.094 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 7.63e-02 -0.219 0.123 0.094 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 5.94e-01 0.0337 0.0631 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 5.36e-01 0.0975 0.157 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 8.63e-02 0.144 0.0839 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 3.21e-01 -0.124 0.125 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 9.68e-01 0.00557 0.139 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 5.05e-01 0.104 0.156 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 5.92e-01 0.0692 0.129 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 1.17e-01 -0.216 0.138 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 1.89e-02 0.34 0.144 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 4.73e-02 -0.302 0.151 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 2.51e-01 0.168 0.146 0.092 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 2.89e-01 0.0605 0.0569 0.093 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 7.57e-01 0.0466 0.151 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 3.30e-03 0.286 0.0964 0.093 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 6.26e-01 0.0657 0.135 0.093 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0294 0.148 0.093 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 5.90e-01 0.0794 0.147 0.093 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0655 0.131 0.093 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.36e-01 0.133 0.138 0.093 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 3.04e-02 0.306 0.14 0.093 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 7.31e-01 0.05 0.145 0.093 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 2.03e-01 0.168 0.132 0.093 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 1.61e-01 -0.112 0.0798 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 2.06e-01 0.183 0.144 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.76e-03 0.233 0.0736 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0982 0.106 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 5.09e-02 0.246 0.125 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0287 0.141 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 7.15e-01 0.0391 0.107 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0412 0.116 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 2.01e-01 -0.201 0.157 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 2.47e-01 -0.177 0.153 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 2.93e-01 0.151 0.143 0.092 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 4.22e-01 0.0567 0.0705 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 4.34e-01 0.113 0.144 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 3.80e-02 0.16 0.0766 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00672 0.12 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 5.83e-01 0.0764 0.139 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 5.37e-01 0.0944 0.153 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0544 0.133 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 7.25e-01 0.0463 0.132 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 2.99e-01 -0.144 0.138 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 1.14e-01 -0.252 0.159 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 4.56e-01 -0.103 0.138 0.092 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0414 0.153 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.75e-01 0.208 0.153 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0403 0.134 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 3.60e-01 -0.135 0.147 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 3.46e-01 -0.148 0.156 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 1.93e-01 0.195 0.15 0.095 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 5.98e-02 0.217 0.114 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.83e-02 0.312 0.131 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00302 0.103 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 9.04e-02 0.189 0.111 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 8.95e-01 -0.016 0.121 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 3.98e-01 0.0715 0.0845 0.092 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00226 0.122 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.24e-02 0.351 0.139 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.03e-02 -0.223 0.108 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 9.91e-01 0.00161 0.137 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0956 0.128 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 2.63e-01 0.0939 0.0837 0.092 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 4.12e-01 0.121 0.148 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 3.36e-01 0.137 0.142 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 8.73e-01 -0.022 0.137 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 1.49e-03 0.466 0.145 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 9.72e-01 0.00492 0.14 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 9.04e-01 0.0152 0.125 0.092 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 6.75e-01 0.0546 0.13 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 8.28e-01 0.0291 0.134 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 6.63e-01 0.0466 0.107 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 6.43e-01 -0.067 0.144 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 3.07e-01 0.146 0.143 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0288 0.122 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 7.12e-02 -0.273 0.15 0.092 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 2.57e-02 -0.314 0.14 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 4.64e-02 0.279 0.139 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0877 0.126 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 8.62e-01 0.0234 0.134 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 8.10e-01 0.0351 0.146 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0257 0.096 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.20e-01 0.147 0.148 0.092 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 9.56e-03 -0.387 0.148 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 7.96e-01 0.0349 0.135 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.42e-01 -0.107 0.139 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 2.66e-01 -0.169 0.152 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 5.26e-02 -0.289 0.148 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 3.55e-01 0.124 0.134 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 2.23e-01 -0.178 0.145 0.09 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 5.25e-01 0.0945 0.148 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 7.03e-01 0.0536 0.14 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.70e-01 0.109 0.15 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 3.67e-01 0.145 0.161 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.46e-02 0.308 0.153 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 1.43e-01 0.197 0.134 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.86e-01 0.129 0.148 0.094 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0353 0.0523 0.093 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 4.21e-01 -0.118 0.147 0.093 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 8.05e-01 0.0354 0.143 0.093 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 7.17e-01 0.046 0.127 0.093 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 9.75e-01 0.00477 0.152 0.093 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 3.75e-01 -0.138 0.155 0.093 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 6.10e-01 0.0659 0.129 0.093 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0675 0.146 0.093 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 1.64e-01 -0.199 0.143 0.093 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 9.83e-01 0.00266 0.127 0.093 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0679 0.161 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.04e-01 0.189 0.116 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0619 0.134 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 4.58e-01 -0.117 0.157 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.15e-01 -0.125 0.153 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 8.44e-01 0.0273 0.139 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.92e-01 0.125 0.146 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0469 0.154 0.091 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 1.33e-01 -0.213 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 4.75e-02 0.273 0.137 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 3.83e-01 0.0913 0.104 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 8.40e-02 0.25 0.144 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0284 0.141 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 2.13e-01 0.15 0.12 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0481 0.146 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 1.54e-01 -0.234 0.164 0.091 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0827 0.144 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 8.89e-01 0.0207 0.148 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 8.65e-01 0.0203 0.119 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 8.68e-01 0.0259 0.156 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0703 0.159 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 3.73e-01 0.132 0.147 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 1.95e-01 0.196 0.151 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 9.47e-01 0.00997 0.149 0.094 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 3.64e-01 0.13 0.143 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 9.78e-02 0.221 0.133 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 9.02e-01 0.0126 0.102 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0651 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.07e-01 -0.118 0.142 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0354 0.112 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0886 0.146 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0395 0.158 0.091 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 1.86e-01 0.14 0.105 0.104 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0631 0.143 0.104 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 4.65e-01 0.081 0.111 0.104 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0336 0.159 0.104 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 9.60e-01 0.00911 0.183 0.104 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 2.19e-02 -0.255 0.11 0.104 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0463 0.13 0.104 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0576 0.132 0.104 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0372 0.153 0.104 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 3.41e-01 -0.133 0.14 0.104 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0532 0.13 0.104 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0103 0.0518 0.093 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 4.54e-01 0.0782 0.104 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 6.65e-01 0.06 0.138 0.093 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 7.57e-02 0.181 0.102 0.093 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 3.55e-01 0.135 0.146 0.093 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.05e-01 0.0922 0.11 0.093 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 7.86e-01 0.0326 0.12 0.093 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00901 0.103 0.093 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0289 0.0955 0.093 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 6.09e-02 -0.195 0.104 0.093 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0411 0.149 0.092 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 9.79e-02 0.256 0.154 0.092 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0607 0.135 0.092 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 4.01e-01 -0.124 0.147 0.092 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 9.80e-01 0.00386 0.153 0.092 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 2.13e-01 -0.154 0.123 0.092 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 4.99e-01 0.0965 0.142 0.088 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 6.77e-01 0.0578 0.139 0.088 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.84e-01 0.125 0.179 0.088 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 5.38e-01 0.1 0.162 0.088 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 2.55e-01 0.191 0.168 0.088 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 4.14e-01 -0.129 0.158 0.088 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0875 0.123 0.088 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0476 0.151 0.088 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 3.52e-01 0.131 0.14 0.088 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 1.30e-01 -0.199 0.131 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 2.30e-02 0.224 0.098 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 6.74e-01 0.0554 0.132 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 4.98e-01 -0.1 0.148 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0287 0.133 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0537 0.114 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 1.81e-01 0.13 0.0971 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0328 0.107 0.092 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 1.57e-01 -0.207 0.145 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.08e-02 0.283 0.11 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.35e-02 -0.274 0.135 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 4.51e-01 -0.12 0.159 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0561 0.15 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0777 0.138 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 4.79e-01 0.0765 0.108 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 1.51e-01 -0.194 0.135 0.092 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0341 0.192 0.097 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.42e-01 0.264 0.179 0.097 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 7.13e-01 0.0499 0.136 0.097 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 9.39e-01 0.0136 0.179 0.097 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0911 0.188 0.097 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 6.17e-01 0.0879 0.175 0.097 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 8.96e-02 0.301 0.176 0.097 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 2.14e-01 -0.217 0.174 0.097 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0353 0.16 0.097 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 4.72e-01 -0.107 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 8.82e-01 0.0202 0.135 0.089 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 3.19e-01 -0.158 0.159 0.089 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 2.15e-01 -0.185 0.148 0.089 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0338 0.154 0.089 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 4.38e-01 -0.116 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 1.31e-01 -0.196 0.129 0.089 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 6.90e-01 0.0574 0.144 0.089 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 3.96e-01 -0.124 0.146 0.093 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 9.70e-01 0.00515 0.135 0.093 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 9.12e-01 0.0179 0.161 0.093 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0976 0.141 0.093 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 3.96e-01 -0.115 0.135 0.093 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 2.24e-01 -0.158 0.13 0.093 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.39e-02 0.257 0.12 0.093 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0832 0.126 0.093 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 2.44e-01 -0.204 0.175 0.082 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 7.33e-01 0.0523 0.153 0.082 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 3.09e-01 -0.165 0.161 0.082 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 8.56e-02 -0.276 0.16 0.082 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0428 0.17 0.082 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 4.15e-01 0.121 0.148 0.082 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 2.80e-01 -0.123 0.114 0.082 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 1.26e-01 0.209 0.136 0.082 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 3.08e-01 0.155 0.151 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 9.20e-02 0.124 0.0734 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 7.18e-01 0.0536 0.148 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 1.08e-02 0.198 0.0769 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0384 0.123 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 4.17e-01 0.103 0.126 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.21e-01 0.115 0.143 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 8.63e-01 0.0184 0.107 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 3.39e-01 -0.122 0.128 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 1.12e-02 0.371 0.145 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 1.92e-01 -0.201 0.154 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 2.11e-01 0.191 0.152 0.092 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -931326 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0386 0.0861 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 7.06e-01 0.0532 0.141 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 5.93e-03 0.19 0.0683 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 3.10e-01 -0.101 0.0994 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 1.21e-01 0.189 0.121 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0816 0.139 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00291 0.104 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0593 0.109 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -189054 sc-eQTL 1.88e-01 -0.207 0.157 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 1.77e-01 -0.216 0.16 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -647167 sc-eQTL 5.04e-01 0.0977 0.146 0.092 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 1.60e-02 -0.295 0.122 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 4.34e-03 0.282 0.0978 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0588 0.128 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 4.29e-01 -0.12 0.151 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0561 0.13 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0556 0.113 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 2.34e-01 0.11 0.0923 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 2.09e-01 -0.134 0.106 0.092 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0736 0.141 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 9.89e-01 0.00169 0.123 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0993 0.149 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 1.15e-01 -0.226 0.143 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0364 0.142 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 1.17e-01 -0.194 0.123 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 6.73e-01 0.0451 0.107 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 976735 sc-eQTL 2.73e-01 -0.143 0.13 0.091 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -569702 sc-eQTL 4.45e-01 -0.104 0.136 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -146529 sc-eQTL 4.36e-02 0.268 0.132 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -280541 sc-eQTL 4.87e-01 0.0635 0.0911 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 270313 sc-eQTL 5.31e-01 0.0877 0.14 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 142646 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0994 0.13 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -511731 sc-eQTL 5.31e-01 0.066 0.105 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -327162 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0212 0.141 0.091 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -569767 sc-eQTL 3.07e-01 -0.17 0.166 0.091 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000258230 AC063950.1 -223337 eQTL 0.00599 0.129 0.0466 0.0 0.0 0.0898

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina