logo

Genes within 1Mb (chr12:101548879:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 9.75e-01 0.00129 0.0405 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 1.33e-01 0.106 0.0701 0.284 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.71e-03 0.127 0.0419 0.284 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0696 0.0618 0.284 B L1
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 2.58e-01 0.0797 0.0703 0.284 B L1
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0182 0.0605 0.284 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 6.85e-01 0.0197 0.0485 0.284 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0334 0.0549 0.284 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0166 0.0874 0.284 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 1.40e-01 -0.123 0.0832 0.284 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 5.34e-01 0.0485 0.078 0.284 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.79e-01 0.0704 0.0649 0.284 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.40e-01 0.13 0.0874 0.284 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 3.34e-01 0.0588 0.0608 0.284 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0146 0.0674 0.284 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0431 0.0658 0.284 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0111 0.0461 0.284 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 6.05e-01 0.0417 0.0806 0.284 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.76e-01 0.118 0.087 0.284 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 8.35e-01 -0.012 0.0574 0.284 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.19e-01 0.0722 0.0722 0.284 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 5.23e-01 0.0511 0.0798 0.284 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 1.01e-01 0.093 0.0564 0.284 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0365 0.0813 0.284 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.72e-01 0.0515 0.091 0.286 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 7.68e-01 0.0247 0.0833 0.286 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 6.63e-01 -0.04 0.0916 0.286 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 5.24e-01 0.0627 0.0981 0.286 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 6.38e-01 0.0478 0.102 0.286 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 8.19e-01 -0.02 0.0875 0.286 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0661 0.0721 0.286 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 8.74e-01 0.0144 0.0907 0.286 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 7.87e-01 0.0257 0.0952 0.286 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0992 0.0749 0.284 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 3.12e-02 0.137 0.063 0.284 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0641 0.0797 0.284 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 2.17e-01 -0.11 0.0887 0.284 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0521 0.0819 0.284 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0953 0.0718 0.284 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 3.88e-01 0.0507 0.0587 0.284 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0279 0.0639 0.284 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.19e-01 -0.102 0.0828 0.281 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 6.32e-02 0.143 0.0765 0.281 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 1.49e-01 -0.0807 0.0557 0.281 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0392 0.09 0.281 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0303 0.0827 0.281 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 9.63e-01 0.00293 0.0624 0.281 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 8.36e-01 0.0184 0.0887 0.281 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 2.53e-01 -0.119 0.104 0.281 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 8.43e-01 0.00605 0.0305 0.284 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 7.05e-01 0.022 0.058 0.284 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 3.22e-01 0.084 0.0846 0.284 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.48e-01 0.0465 0.0611 0.284 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.81e-01 0.0837 0.0954 0.284 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 9.38e-02 -0.116 0.0692 0.284 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0165 0.0619 0.284 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 7.05e-01 0.0281 0.0742 0.284 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 7.47e-01 0.02 0.0619 0.284 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 1.40e-02 -0.176 0.0709 0.284 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 4.67e-01 0.0144 0.0197 0.291 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 8.87e-01 0.0146 0.103 0.291 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.60e-02 0.181 0.0745 0.291 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 1.71e-01 -0.147 0.107 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.55e-01 0.0964 0.104 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 6.59e-01 0.0475 0.107 0.291 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0927 0.102 0.291 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0129 0.103 0.291 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 6.94e-02 -0.153 0.0837 0.291 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0895 0.0848 0.291 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 1.38e-02 -0.195 0.0785 0.291 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 8.49e-01 -0.00766 0.0403 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.83e-02 0.189 0.0995 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.49e-02 0.12 0.0532 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000321 0.0796 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0437 0.0884 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 8.05e-01 0.0247 0.0996 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 9.84e-01 0.00168 0.0823 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0351 0.0882 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 6.81e-01 0.0382 0.0928 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 2.04e-01 -0.124 0.097 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 5.50e-01 0.0559 0.0933 0.283 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 6.59e-01 0.0161 0.0364 0.287 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.55e-01 0.0568 0.0961 0.287 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 8.91e-03 0.163 0.0618 0.287 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0696 0.0858 0.287 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0311 0.0943 0.287 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 4.16e-01 0.0764 0.0937 0.287 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 1.07e-01 -0.135 0.0834 0.287 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00887 0.088 0.287 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 9.21e-01 0.00902 0.0906 0.287 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 3.05e-01 0.0951 0.0924 0.287 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 7.28e-01 0.0294 0.0843 0.287 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0548 0.051 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 8.40e-02 0.16 0.0919 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.13e-04 0.175 0.0466 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0472 0.068 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 1.76e-01 0.109 0.0805 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0381 0.0901 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 8.90e-01 0.00945 0.0682 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 9.49e-01 0.00475 0.074 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0684 0.1 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 8.84e-01 0.0143 0.0978 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 3.84e-01 0.0798 0.0914 0.284 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 5.00e-01 0.0305 0.0452 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 3.39e-01 0.0886 0.0924 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.38e-01 0.0734 0.0493 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 7.86e-01 0.0209 0.0768 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 4.04e-01 0.0744 0.089 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0806 0.0976 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 8.44e-02 0.147 0.0846 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 1.54e-01 0.12 0.084 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0486 0.0888 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0578 0.102 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0307 0.0883 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.56e-01 0.0574 0.0974 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 6.69e-01 0.0417 0.0976 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.74e-02 0.169 0.0845 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 2.70e-01 -0.104 0.0936 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 3.04e-01 -0.102 0.0992 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 5.23e-01 -0.061 0.0953 0.295 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.61e-01 0.0436 0.0748 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.07e-01 0.139 0.0859 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 7.64e-01 0.02 0.0666 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 8.58e-01 0.013 0.0725 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 6.23e-01 0.0386 0.0786 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 6.65e-01 0.0238 0.0549 0.284 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.63e-01 0.0453 0.0781 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 6.27e-02 0.167 0.0894 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0696 0.0696 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0405 0.0872 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00684 0.0817 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00895 0.0536 0.284 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 9.92e-01 0.000914 0.0931 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 9.25e-01 0.00841 0.0896 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0303 0.0862 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.94e-02 0.192 0.0924 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00211 0.0882 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 6.42e-01 0.0368 0.0789 0.284 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 3.19e-01 0.0846 0.0846 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0198 0.087 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0539 0.0695 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0619 0.094 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 8.80e-02 0.158 0.0924 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 6.28e-01 0.0385 0.0793 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0751 0.0986 0.284 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.45e-01 0.0547 0.0901 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.32e-01 0.135 0.0892 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0154 0.0805 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 2.80e-01 0.0924 0.0854 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0949 0.0927 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 3.89e-01 0.0528 0.0611 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0288 0.0945 0.284 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 7.71e-02 -0.171 0.0963 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0809 0.0869 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 2.71e-01 0.0991 0.0898 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 2.28e-01 -0.118 0.0979 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.65e-01 0.0289 0.0965 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 3.91e-01 0.0742 0.0863 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 7.93e-01 0.0248 0.0942 0.287 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 4.77e-01 0.0664 0.0932 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 7.54e-01 0.0277 0.0883 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 3.19e-01 0.0943 0.0943 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.60e-01 0.0928 0.101 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0967 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 1.36e-01 0.126 0.0843 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0258 0.0935 0.292 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 8.90e-01 0.0046 0.0333 0.288 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0258 0.0933 0.288 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.84e-01 0.0973 0.0907 0.288 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.18e-01 0.0653 0.0805 0.288 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 6.12e-01 -0.049 0.0966 0.288 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0772 0.0985 0.288 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 6.68e-01 0.0352 0.0819 0.288 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 2.30e-01 -0.112 0.0927 0.288 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 1.15e-01 -0.143 0.0905 0.288 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0204 0.0806 0.288 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.79e-01 0.0568 0.102 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 6.72e-02 0.135 0.0735 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0961 0.0854 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 9.76e-01 0.00303 0.1 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 9.33e-02 -0.164 0.097 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 6.41e-01 0.0412 0.0883 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 2.25e-01 0.113 0.0926 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 1.75e-02 -0.232 0.0967 0.287 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 4.74e-01 -0.066 0.0921 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.70e-01 0.0993 0.0899 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0766 0.0679 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0484 0.0946 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0287 0.0915 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 8.72e-01 0.0126 0.0784 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 9.27e-01 0.00871 0.0952 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 9.78e-01 0.003 0.107 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.46e-01 -0.112 0.0959 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 3.97e-01 0.0837 0.0986 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0669 0.0792 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0765 0.104 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0557 0.106 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 1.70e-01 0.135 0.098 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 7.14e-01 0.0371 0.101 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00621 0.0995 0.279 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0125 0.0928 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.24e-01 0.133 0.0864 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0642 0.0658 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0267 0.092 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 2.67e-01 0.103 0.0923 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0587 0.0728 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 6.06e-01 -0.049 0.0949 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0458 0.102 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 2.84e-01 0.0802 0.0745 0.285 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 4.88e-01 0.07 0.101 0.285 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.60e-02 0.173 0.0765 0.285 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 2.59e-01 -0.127 0.112 0.285 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 9.52e-01 0.00773 0.129 0.285 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0324 0.0793 0.285 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 5.88e-01 0.0496 0.0914 0.285 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0189 0.0929 0.285 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0313 0.108 0.285 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0869 0.0985 0.285 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 5.72e-01 0.0518 0.0913 0.285 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 3.72e-01 0.0297 0.0332 0.289 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.48e-01 0.0774 0.0668 0.289 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 8.44e-01 0.0175 0.0889 0.289 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 1.12e-01 0.104 0.0653 0.289 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.99e-02 0.192 0.0929 0.289 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.04e-01 0.027 0.071 0.289 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0379 0.0771 0.289 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 1.74e-01 0.0898 0.0659 0.289 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 5.57e-01 0.036 0.0613 0.289 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 3.38e-03 -0.195 0.0657 0.289 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.59e-01 -0.108 0.0956 0.284 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.62e-01 0.112 0.0994 0.284 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 5.81e-01 0.048 0.087 0.284 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 9.90e-01 -0.0012 0.0949 0.284 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 1.23e-01 -0.151 0.0975 0.284 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0434 0.0796 0.284 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.81e-01 0.0998 0.0923 0.278 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 7.50e-01 0.0288 0.0903 0.278 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 2.41e-01 0.137 0.116 0.278 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 7.55e-01 0.033 0.106 0.278 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0966 0.109 0.278 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 2.83e-01 -0.11 0.102 0.278 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 1.36e-01 -0.119 0.0796 0.278 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 2.83e-01 -0.105 0.0976 0.278 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 9.83e-01 0.00194 0.0914 0.278 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0918 0.0862 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 3.34e-02 0.138 0.0645 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 6.56e-01 0.0385 0.0864 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0951 0.0971 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0729 0.087 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 1.32e-01 -0.113 0.0747 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 3.20e-01 0.0638 0.0639 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 2.49e-01 0.0809 0.0699 0.284 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0569 0.0927 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.37e-03 0.214 0.0696 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 1.90e-01 -0.113 0.0861 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0113 0.101 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0279 0.0952 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 8.66e-01 0.0148 0.088 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0147 0.0686 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 1.81e-02 -0.202 0.0848 0.284 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 6.83e-01 0.0482 0.118 0.312 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 5.37e-01 0.0683 0.11 0.312 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0626 0.083 0.312 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 8.18e-02 -0.19 0.109 0.312 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 1.94e-01 -0.149 0.114 0.312 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 7.73e-01 0.031 0.107 0.312 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 7.63e-01 0.0329 0.109 0.312 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 7.40e-01 0.0356 0.107 0.312 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 7.07e-01 -0.037 0.0981 0.312 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 7.02e-01 0.0369 0.0962 0.278 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 6.61e-01 0.0387 0.088 0.278 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0867 0.103 0.278 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 1.17e-01 -0.152 0.0962 0.278 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.13e-01 0.0369 0.1 0.278 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 2.80e-01 -0.105 0.0966 0.278 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 1.49e-01 -0.122 0.0842 0.278 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 2.89e-01 0.0994 0.0934 0.278 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 8.92e-01 0.0129 0.0944 0.287 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 8.99e-01 0.011 0.0872 0.287 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0219 0.104 0.287 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 8.73e-01 0.0146 0.0912 0.287 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 9.76e-01 0.00267 0.0877 0.287 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0686 0.0842 0.287 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 1.97e-01 0.101 0.0782 0.287 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 9.25e-01 0.00766 0.0816 0.287 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 3.22e-01 -0.109 0.109 0.266 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 7.52e-01 0.0302 0.0955 0.266 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 2.11e-01 -0.126 0.101 0.266 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0495 0.101 0.266 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 6.28e-01 0.0513 0.106 0.266 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 2.92e-01 0.0973 0.0921 0.266 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 1.22e-01 -0.11 0.0709 0.266 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 8.64e-02 0.146 0.0845 0.266 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 3.14e-01 0.0956 0.0945 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 5.73e-01 0.0264 0.0468 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 1.08e-01 0.151 0.0934 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.82e-03 0.146 0.0484 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0611 0.0776 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 8.13e-01 0.019 0.08 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 2.29e-01 0.109 0.0902 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0736 0.0674 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 5.13e-01 -0.053 0.0809 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 7.48e-01 0.03 0.0932 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0459 0.0976 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 5.80e-01 0.0536 0.0967 0.284 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -932865 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0317 0.0541 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 2.24e-01 0.108 0.0883 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 2.48e-03 0.131 0.0428 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0534 0.0626 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 1.45e-01 0.112 0.0763 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 1.67e-01 -0.121 0.0871 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 3.20e-01 0.0651 0.0654 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 6.22e-01 0.0339 0.0687 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -190593 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0602 0.0991 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00979 0.101 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -648706 sc-eQTL 4.08e-01 0.0761 0.0918 0.284 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 1.68e-01 -0.109 0.0789 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 8.57e-03 0.167 0.063 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0749 0.0823 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0757 0.0974 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 4.95e-01 -0.057 0.0833 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0838 0.0723 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 4.71e-01 0.043 0.0595 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0446 0.0683 0.284 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 5.32e-01 0.057 0.091 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 5.73e-01 0.0449 0.0795 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0689 0.0962 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0917 0.0924 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.18e-01 0.0333 0.0919 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 1.06e-01 -0.129 0.0793 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 8.44e-01 0.0136 0.0689 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 975196 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0165 0.084 0.28 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -571241 sc-eQTL 1.97e-01 -0.113 0.0877 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 sc-eQTL 1.06e-01 0.139 0.0854 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -282080 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0835 0.0586 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 268774 sc-eQTL 5.07e-01 -0.06 0.0902 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 141107 sc-eQTL 7.56e-01 0.0261 0.0838 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -513270 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00178 0.0679 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -328701 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0911 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -571306 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0274 0.107 0.282 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000111666 CHPT1 -148068 eQTL 2.99e-02 0.06 0.0276 0.0 0.0 0.268

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000017427 \N -932865 2.95e-07 1.33e-07 6.41e-08 2.05e-07 1.01e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.62e-08 1.54e-07 7.6e-08 1.62e-07 1.19e-07 1.79e-07 7.95e-08 5.36e-08 8.08e-08 4.45e-08 1.72e-07 7.16e-08 5.35e-08 1.22e-07 1.42e-07 1.58e-07 3.4e-08 1.85e-07 1.31e-07 1.19e-07 1.1e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.06e-07 3.9e-08 3.38e-08 9.3e-08 3.4e-08 2.79e-08 5.51e-08 8.89e-08 6.3e-08 6.31e-08 4.42e-08 1.48e-07 5.22e-08 1.1e-08 3.34e-08 1.68e-08 9.29e-08 1.95e-09 4.98e-08