logo

Genes within 1Mb (chr12:101528624:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 9.18e-01 0.00443 0.0429 0.286 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 5.32e-02 -0.144 0.0739 0.286 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0512 0.0452 0.286 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0186 0.0656 0.286 B L1
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 7.13e-01 0.0274 0.0745 0.286 B L1
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 8.90e-01 0.00891 0.0641 0.286 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 5.18e-01 0.0332 0.0513 0.286 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0794 0.0579 0.286 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0607 0.0924 0.286 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 4.31e-01 0.0697 0.0884 0.286 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0641 0.0825 0.286 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0717 0.0681 0.286 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 4.75e-01 0.0659 0.0921 0.286 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0822 0.0637 0.286 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 8.57e-01 0.0128 0.0707 0.286 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0155 0.0691 0.286 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0613 0.0482 0.286 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 7.50e-01 0.0271 0.0847 0.286 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 4.11e-01 0.0755 0.0917 0.286 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0406 0.0602 0.286 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0229 0.076 0.286 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0439 0.0839 0.286 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0173 0.0596 0.286 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 6.19e-01 0.0425 0.0854 0.286 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0102 0.0932 0.288 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 7.47e-01 0.0276 0.0852 0.288 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 4.16e-02 -0.19 0.0927 0.288 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 7.88e-01 -0.027 0.1 0.288 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 9.98e-01 0.000232 0.104 0.288 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 1.56e-01 0.127 0.089 0.288 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 1.25e-01 -0.113 0.0734 0.288 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 9.22e-01 0.00907 0.0928 0.288 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 7.45e-01 0.0317 0.0973 0.288 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0828 0.0798 0.286 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0203 0.0678 0.286 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.72e-03 0.225 0.0835 0.286 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 3.70e-01 0.085 0.0946 0.286 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0178 0.0872 0.286 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 1.59e-01 0.108 0.0764 0.286 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0457 0.0625 0.286 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 9.73e-02 -0.113 0.0676 0.286 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 6.33e-01 0.0414 0.0866 0.288 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.60e-01 0.113 0.0801 0.288 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 1.68e-01 0.0803 0.0581 0.288 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 6.04e-01 0.0487 0.0938 0.288 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 7.91e-01 0.0229 0.0863 0.288 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 7.43e-01 0.0213 0.065 0.288 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00514 0.0925 0.288 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0067 0.109 0.288 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 4.15e-01 0.0266 0.0325 0.286 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 8.65e-01 0.0106 0.0621 0.286 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 4.56e-01 0.0677 0.0905 0.286 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0236 0.0654 0.286 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 6.95e-02 0.185 0.101 0.286 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 2.96e-01 0.0778 0.0743 0.286 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0453 0.0661 0.286 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 9.71e-01 0.00287 0.0794 0.286 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0303 0.0661 0.286 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 3.53e-01 0.0715 0.0768 0.286 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0109 0.0208 0.286 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0146 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.82e-01 -0.106 0.0794 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0199 0.113 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 5.00e-01 0.074 0.109 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 3.97e-01 -0.096 0.113 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 4.33e-01 0.0847 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 6.08e-01 0.0556 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 6.81e-01 0.0366 0.0889 0.286 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 1.09e-01 0.143 0.0889 0.286 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 4.01e-02 0.172 0.0831 0.286 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0159 0.0433 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 3.89e-01 -0.093 0.108 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.61e-01 -0.081 0.0576 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 4.91e-01 -0.059 0.0855 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 4.58e-01 0.0706 0.0949 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 2.24e-01 -0.13 0.107 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 8.59e-01 0.0157 0.0884 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0276 0.0948 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0944 0.0995 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 1.13e-01 0.166 0.104 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0176 0.1 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 8.23e-01 0.00871 0.0388 0.284 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 1.69e-02 -0.243 0.101 0.284 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00914 0.0669 0.284 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 3.27e-01 0.0898 0.0913 0.284 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 2.68e-01 -0.111 0.1 0.284 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0101 0.0999 0.284 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 3.09e-01 0.0909 0.0892 0.284 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0128 0.0937 0.284 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 1.02e-01 -0.157 0.0959 0.284 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0773 0.0986 0.284 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0449 0.0898 0.284 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 3.36e-01 0.052 0.0539 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 2.42e-01 -0.114 0.0975 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0499 0.0507 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 8.52e-01 0.0134 0.0719 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 1.73e-01 0.116 0.085 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 4.21e-01 0.0768 0.0951 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0318 0.0721 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0677 0.078 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 8.48e-01 0.0204 0.106 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 6.67e-01 0.0444 0.103 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 4.45e-01 -0.074 0.0966 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0283 0.0481 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0833 0.0984 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 2.38e-01 -0.0623 0.0526 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 8.80e-01 0.0123 0.0818 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 5.69e-02 -0.18 0.094 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 5.42e-01 0.0634 0.104 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 8.41e-02 0.156 0.09 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0838 0.0896 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 8.60e-01 0.0167 0.0945 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 6.35e-01 0.0518 0.109 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0491 0.0939 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 9.39e-02 -0.173 0.103 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 8.50e-01 0.0197 0.104 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 8.32e-03 -0.238 0.0893 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0133 0.0999 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 2.53e-01 0.121 0.106 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0962 0.101 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0415 0.0781 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 5.44e-01 0.0548 0.0901 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0791 0.0693 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 9.75e-01 0.0024 0.0757 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 9.53e-01 0.00483 0.082 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0348 0.0573 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 6.87e-01 0.0335 0.0831 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 7.14e-01 0.0352 0.0959 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000804 0.0742 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 2.90e-01 0.0983 0.0927 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 8.63e-01 -0.015 0.0869 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 5.07e-02 -0.111 0.0565 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 7.94e-02 -0.168 0.0954 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 2.97e-01 0.0964 0.0923 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0355 0.089 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 6.78e-01 0.0401 0.0963 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 1.27e-01 -0.139 0.0905 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0702 0.0814 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 4.03e-01 0.0747 0.0891 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.87e-01 0.121 0.0912 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0323 0.0732 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 8.06e-01 0.0244 0.099 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 1.02e-01 -0.16 0.0973 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 9.90e-01 0.00105 0.0835 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0214 0.104 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0595 0.0935 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 9.86e-01 0.00164 0.093 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.83e-01 0.023 0.0835 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0634 0.0887 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 3.86e-01 0.0835 0.0962 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00467 0.0635 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 9.01e-02 0.166 0.0973 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 1.00e+00 -6.15e-05 0.102 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 3.46e-02 0.192 0.0901 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 1.46e-01 -0.137 0.0938 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 7.52e-01 0.0326 0.103 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 7.17e-02 -0.182 0.1 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0375 0.0905 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0922 0.0984 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 8.68e-01 -0.017 0.102 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 6.70e-02 -0.176 0.0955 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 2.41e-01 -0.121 0.103 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0821 0.111 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 3.06e-01 -0.108 0.106 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0301 0.0925 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0143 0.102 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 6.54e-01 0.0157 0.0349 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0546 0.098 0.286 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0567 0.0955 0.286 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 5.18e-01 0.0548 0.0846 0.286 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 1.51e-02 0.245 0.1 0.286 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 4.05e-01 0.0863 0.103 0.286 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0107 0.0861 0.286 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0318 0.0977 0.286 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0148 0.0957 0.286 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0278 0.0847 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 1.75e-01 0.144 0.106 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 4.81e-02 0.151 0.076 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 3.17e-02 0.19 0.0877 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 2.44e-01 0.121 0.103 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 9.46e-01 0.00685 0.101 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 6.93e-01 0.0361 0.0915 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0823 0.0961 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0652 0.102 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 5.92e-01 0.0514 0.0959 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.87e-01 0.124 0.0934 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 4.62e-01 0.0522 0.0708 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 5.68e-01 0.0563 0.0984 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 8.54e-01 0.0175 0.0953 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 6.78e-01 0.0339 0.0816 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0498 0.099 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0212 0.112 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 4.24e-01 0.0786 0.0982 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.21e-01 0.156 0.1 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 1.99e-01 -0.104 0.0808 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 9.93e-01 0.000934 0.106 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 3.51e-01 0.101 0.108 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 2.26e-01 -0.122 0.1 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 4.04e-01 0.0864 0.103 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 2.88e-01 -0.108 0.101 0.295 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0438 0.0958 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 2.65e-01 0.1 0.0894 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0225 0.0681 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0686 0.0948 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0527 0.0955 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 4.15e-01 0.0614 0.0751 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 8.26e-01 0.0215 0.098 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 2.00e-01 0.135 0.105 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0617 0.0814 0.281 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0129 0.11 0.281 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 8.79e-01 -0.013 0.0852 0.281 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 3.47e-01 0.115 0.122 0.281 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 6.90e-01 0.0563 0.141 0.281 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0391 0.0864 0.281 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 1.85e-01 -0.132 0.099 0.281 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 4.08e-01 0.0839 0.101 0.281 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 1.31e-01 0.177 0.116 0.281 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 1.62e-01 0.15 0.107 0.281 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 4.90e-01 0.0689 0.0995 0.281 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0456 0.0353 0.283 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 2.21e-01 0.0873 0.0712 0.283 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 2.21e-01 0.116 0.0944 0.283 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0481 0.07 0.283 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0812 0.0999 0.283 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0587 0.0756 0.283 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0695 0.0821 0.283 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 6.02e-01 0.0369 0.0705 0.283 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 9.69e-01 0.00256 0.0653 0.283 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 7.24e-01 0.0253 0.0715 0.283 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 9.96e-01 0.000498 0.101 0.286 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 4.13e-01 0.0857 0.104 0.286 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0684 0.0912 0.286 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 2.31e-01 -0.119 0.0992 0.286 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0553 0.103 0.286 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 1.77e-01 -0.113 0.0832 0.286 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 8.06e-01 0.0225 0.0919 0.29 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 7.92e-01 0.0237 0.0896 0.29 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0812 0.115 0.29 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0311 0.105 0.29 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 6.40e-01 0.0508 0.109 0.29 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 1.53e-01 0.145 0.101 0.29 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 8.01e-01 0.0201 0.0795 0.29 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00474 0.0972 0.29 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 2.19e-01 0.111 0.0903 0.29 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0788 0.0897 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0332 0.0678 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 2.88e-02 0.196 0.0889 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 5.73e-02 0.192 0.1 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 7.06e-01 0.0342 0.0906 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 4.82e-01 0.055 0.0781 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 7.62e-01 0.0202 0.0666 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0842 0.0727 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 1.26e-01 -0.151 0.0983 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00826 0.0758 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 3.00e-01 0.0955 0.092 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 6.58e-01 0.0478 0.108 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 7.15e-02 -0.182 0.101 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 4.95e-01 0.064 0.0938 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0389 0.0731 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 7.42e-02 -0.163 0.091 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0396 0.128 0.3 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 7.22e-01 0.0429 0.12 0.3 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.92e-01 -0.024 0.0907 0.3 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 7.50e-02 0.213 0.119 0.3 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 5.08e-02 0.244 0.124 0.3 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 6.62e-01 0.0513 0.117 0.3 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 5.78e-01 0.0663 0.119 0.3 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0577 0.117 0.3 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 9.92e-02 0.176 0.106 0.3 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 9.65e-01 0.00439 0.0991 0.289 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 2.96e-01 0.0947 0.0904 0.289 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.06e-02 0.192 0.106 0.289 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 9.39e-01 0.00769 0.0997 0.289 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 3.75e-01 0.0916 0.103 0.289 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 7.37e-01 0.0335 0.0997 0.289 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 6.84e-01 0.0355 0.0871 0.289 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 2.34e-02 -0.217 0.0952 0.289 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0338 0.0987 0.287 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 7.16e-01 0.0332 0.0912 0.287 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0627 0.109 0.287 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0494 0.0954 0.287 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0795 0.0916 0.287 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 4.94e-01 0.0604 0.0881 0.287 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0565 0.0821 0.287 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 5.53e-01 0.0507 0.0853 0.287 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 3.37e-01 0.111 0.116 0.311 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.18e-01 -0.157 0.1 0.311 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0958 0.107 0.311 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 7.37e-01 0.0357 0.106 0.311 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0412 0.112 0.311 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 8.86e-01 -0.014 0.0976 0.311 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 1.84e-01 -0.1 0.075 0.311 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 2.62e-01 -0.101 0.0897 0.311 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.0998 0.311 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0188 0.0498 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 1.89e-02 -0.233 0.0987 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0703 0.0524 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 7.40e-01 0.0275 0.0826 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0025 0.0851 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 1.05e-01 -0.156 0.0957 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 6.40e-01 0.0337 0.0719 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0578 0.086 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 1.61e-01 -0.139 0.0988 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 8.30e-01 0.0224 0.104 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0364 0.103 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -953120 sc-eQTL 6.65e-01 0.0248 0.0571 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 1.86e-01 -0.124 0.0931 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0439 0.0461 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 8.74e-01 0.0105 0.0661 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 8.90e-01 0.0112 0.0809 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 1.10e-01 0.147 0.0917 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 5.28e-01 0.0437 0.0691 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0704 0.0723 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -210848 sc-eQTL 9.86e-01 0.00184 0.105 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 6.25e-01 0.0521 0.106 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -668961 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0959 0.0967 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0886 0.0838 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0389 0.0679 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 2.56e-02 0.194 0.0864 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 2.00e-01 0.132 0.103 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 4.69e-01 -0.064 0.0883 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 2.31e-01 0.0922 0.0767 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0353 0.0631 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 1.02e-01 -0.118 0.0721 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0109 0.0961 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 5.08e-01 0.0556 0.0839 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 1.05e-01 0.165 0.101 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 6.16e-01 -0.049 0.0977 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0344 0.0971 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 5.39e-01 0.0518 0.0842 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 7.01e-01 -0.028 0.0727 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 954941 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0853 0.0885 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -591496 sc-eQTL 9.60e-01 0.00465 0.0918 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -168323 sc-eQTL 2.23e-01 0.109 0.0893 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -302335 sc-eQTL 3.04e-01 0.0631 0.0612 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 248519 sc-eQTL 8.10e-01 0.0227 0.0941 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 120852 sc-eQTL 8.02e-01 0.0219 0.0873 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -533525 sc-eQTL 7.60e-01 0.0216 0.0707 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -348956 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0054 0.095 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -591561 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0107 0.112 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -396095 1.05e-06 8.78e-07 1.59e-07 3.71e-07 1.09e-07 3.24e-07 6.72e-07 2e-07 6.71e-07 3.1e-07 1.04e-06 5.22e-07 1.03e-06 1.98e-07 3.31e-07 3.57e-07 6.15e-07 4.31e-07 2.88e-07 1.89e-07 2.57e-07 5.34e-07 4.06e-07 2.71e-07 1.36e-06 2.54e-07 4.37e-07 3.24e-07 5.42e-07 7.92e-07 3.81e-07 3.31e-08 4.98e-08 1.77e-07 3.68e-07 1.54e-07 1.97e-07 1.18e-07 8.45e-08 8.15e-09 1.01e-07 7.38e-07 7.3e-08 2.67e-08 1.69e-07 1.52e-08 1.45e-07 5.79e-08 5.81e-08