logo

Genes within 1Mb (chr12:101525041:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 9.33e-01 0.00357 0.0423 0.286 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 4.87e-02 -0.144 0.0728 0.286 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0564 0.0445 0.286 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00813 0.0646 0.286 B L1
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 8.31e-01 0.0157 0.0735 0.286 B L1
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00276 0.0632 0.286 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 5.22e-01 0.0324 0.0505 0.286 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0756 0.0571 0.286 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0527 0.0911 0.286 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 5.03e-01 0.0585 0.0872 0.286 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0699 0.0813 0.286 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0641 0.0674 0.286 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 4.01e-01 0.0766 0.0911 0.286 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0943 0.0629 0.286 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 8.94e-01 0.00934 0.07 0.286 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0169 0.0684 0.286 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0625 0.0477 0.286 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 8.61e-01 0.0147 0.0839 0.286 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.93e-01 0.0955 0.0906 0.286 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0307 0.0596 0.286 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0223 0.0753 0.286 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0538 0.083 0.286 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0213 0.059 0.286 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 5.24e-01 0.0539 0.0845 0.286 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0354 0.0923 0.288 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 5.47e-01 0.0509 0.0843 0.288 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 3.89e-02 -0.191 0.0918 0.288 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0772 0.0993 0.288 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.56e-01 0.00569 0.103 0.288 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 7.56e-02 0.157 0.0879 0.288 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0617 0.073 0.288 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 8.15e-01 0.0215 0.0919 0.288 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 7.13e-01 0.0355 0.0964 0.288 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0868 0.0791 0.286 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0141 0.0671 0.286 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 5.34e-03 0.233 0.0826 0.286 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 3.81e-01 0.0823 0.0937 0.286 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.67e-01 0.00356 0.0864 0.286 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 1.79e-01 0.102 0.0757 0.286 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 4.39e-01 -0.048 0.0619 0.286 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 1.04e-01 -0.109 0.067 0.286 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 5.71e-01 0.0489 0.0861 0.288 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.16e-01 0.125 0.0795 0.288 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 1.40e-01 0.0853 0.0577 0.288 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 6.01e-01 0.0489 0.0932 0.288 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.85e-01 0.00164 0.0857 0.288 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 7.57e-01 0.02 0.0646 0.288 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00947 0.092 0.288 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 8.56e-01 0.0196 0.108 0.288 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 3.62e-01 0.0293 0.0321 0.286 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 6.89e-01 0.0245 0.0612 0.286 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 5.61e-01 0.0519 0.0893 0.286 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0422 0.0644 0.286 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 9.85e-02 0.166 0.1 0.286 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 3.03e-01 0.0757 0.0733 0.286 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0508 0.0652 0.286 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0151 0.0783 0.286 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 4.81e-01 -0.046 0.0651 0.286 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 4.89e-01 0.0525 0.0758 0.286 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 6.41e-01 -0.00955 0.0205 0.286 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0202 0.106 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.00e-01 -0.1 0.0781 0.286 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0223 0.111 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 5.26e-01 0.0684 0.108 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0882 0.111 0.286 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 4.60e-01 0.0784 0.106 0.286 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 7.45e-01 0.0347 0.107 0.286 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 5.32e-01 0.0547 0.0874 0.286 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 7.66e-02 0.155 0.0873 0.286 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 3.73e-02 0.171 0.0817 0.286 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0205 0.0427 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 3.31e-01 -0.103 0.106 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0765 0.0568 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0393 0.0843 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 4.91e-01 0.0646 0.0936 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 2.63e-01 -0.118 0.105 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 8.90e-01 0.0121 0.0872 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0411 0.0935 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0925 0.0981 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 1.06e-01 0.166 0.103 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0132 0.0989 0.288 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 8.12e-01 0.00913 0.0383 0.284 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 1.68e-02 -0.24 0.0997 0.284 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0123 0.066 0.284 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 3.44e-01 0.0855 0.0902 0.284 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 2.10e-01 -0.124 0.0988 0.284 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0267 0.0986 0.284 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 3.35e-01 0.0851 0.0881 0.284 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00396 0.0925 0.284 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 1.42e-01 -0.14 0.0948 0.284 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0755 0.0973 0.284 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0616 0.0886 0.284 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 2.92e-01 0.0563 0.0533 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0963 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0547 0.0501 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 7.67e-01 0.0211 0.071 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 2.15e-01 0.105 0.0841 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 4.58e-01 0.07 0.094 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0334 0.0712 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0534 0.0772 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 8.55e-01 0.0192 0.105 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 7.50e-01 0.0326 0.102 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 4.15e-01 -0.078 0.0955 0.286 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0214 0.0474 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0808 0.097 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.47e-01 -0.0754 0.0517 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 6.78e-01 0.0335 0.0805 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 6.25e-02 -0.174 0.0927 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 5.74e-01 0.0577 0.102 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 8.38e-02 0.154 0.0887 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0872 0.0883 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 8.17e-01 0.0216 0.0931 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 7.25e-01 0.0378 0.107 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0623 0.0925 0.285 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 1.00e-01 -0.168 0.102 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 8.37e-01 0.0211 0.103 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 9.53e-03 -0.231 0.0883 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0239 0.0988 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 2.59e-01 0.118 0.104 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 2.26e-01 -0.122 0.1 0.284 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0458 0.0772 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 4.59e-01 0.0661 0.089 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0868 0.0685 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 9.26e-01 -0.007 0.0749 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00204 0.0811 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0342 0.0566 0.286 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 6.52e-01 0.0371 0.0822 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 5.64e-01 0.0547 0.0948 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0223 0.0734 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 2.93e-01 0.0965 0.0916 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00953 0.086 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 4.84e-02 -0.111 0.0559 0.286 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 6.74e-02 -0.173 0.0942 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.86e-01 0.0975 0.0912 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0341 0.088 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 5.46e-01 0.0575 0.0952 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 1.45e-01 -0.131 0.0895 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0527 0.0805 0.286 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 5.81e-01 0.0488 0.0883 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.31e-01 0.137 0.0902 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0253 0.0725 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 6.36e-01 0.0465 0.098 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 1.21e-01 -0.15 0.0964 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 9.35e-01 0.00679 0.0827 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 8.78e-01 0.0158 0.103 0.286 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0775 0.0925 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 9.34e-01 0.00758 0.0921 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 8.41e-01 0.0166 0.0827 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0716 0.0878 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 4.28e-01 0.0757 0.0953 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00176 0.0629 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 1.30e-01 0.147 0.0965 0.286 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 8.16e-01 0.0235 0.1 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.03e-02 0.208 0.0888 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 1.99e-01 -0.12 0.0928 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 5.90e-01 0.0548 0.102 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 6.89e-02 -0.181 0.099 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0446 0.0894 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0949 0.0972 0.289 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0217 0.1 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 8.93e-02 -0.161 0.0943 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 2.52e-01 -0.116 0.101 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0784 0.109 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 2.63e-01 -0.117 0.104 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0417 0.0912 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 9.76e-01 0.00308 0.101 0.29 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 6.64e-01 0.015 0.0345 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0351 0.0968 0.286 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0649 0.0943 0.286 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 7.30e-01 0.0289 0.0837 0.286 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 1.76e-02 0.237 0.099 0.286 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 4.29e-01 0.081 0.102 0.286 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0113 0.0851 0.286 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0481 0.0965 0.286 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0106 0.0945 0.286 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0508 0.0836 0.286 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 1.70e-01 0.144 0.105 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 6.13e-02 0.142 0.0753 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 3.16e-02 0.188 0.0868 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 3.12e-01 0.104 0.102 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.20e-01 -0.01 0.1 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 5.95e-01 0.0482 0.0905 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 4.44e-01 -0.073 0.0952 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0559 0.101 0.293 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 6.37e-01 0.0451 0.0954 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.24e-01 0.143 0.0927 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 4.31e-01 0.0555 0.0704 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 5.28e-01 0.0618 0.0978 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.77e-01 0.00272 0.0947 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 8.99e-01 0.0103 0.0811 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0271 0.0985 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 8.93e-01 0.0149 0.111 0.289 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 4.54e-01 0.0729 0.097 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.17e-01 0.156 0.0991 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0993 0.0798 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 8.97e-01 0.0136 0.105 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 3.50e-01 0.1 0.107 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 2.06e-01 -0.126 0.099 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 4.76e-01 0.0728 0.102 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 3.12e-01 -0.102 0.1 0.297 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0266 0.0948 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.48e-01 0.102 0.0885 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0328 0.0673 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0697 0.0938 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0745 0.0944 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 2.74e-01 0.0814 0.0743 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 9.72e-01 0.00346 0.097 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 2.07e-01 0.132 0.104 0.289 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0417 0.0795 0.281 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00207 0.107 0.281 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00101 0.0831 0.281 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 4.58e-01 0.0887 0.119 0.281 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 8.08e-01 0.0335 0.137 0.281 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0183 0.0843 0.281 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 1.63e-01 -0.135 0.0965 0.281 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.46e-01 0.0455 0.0987 0.281 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 2.04e-01 0.145 0.114 0.281 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 2.94e-01 0.11 0.105 0.281 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 3.54e-01 0.0902 0.0969 0.281 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0404 0.0348 0.283 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 2.08e-01 0.0886 0.0702 0.283 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.54e-01 0.133 0.0929 0.283 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0471 0.069 0.283 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 2.60e-01 -0.111 0.0983 0.283 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0535 0.0745 0.283 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0704 0.0809 0.283 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.94e-01 0.0273 0.0695 0.283 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0163 0.0644 0.283 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 6.79e-01 0.0292 0.0704 0.283 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 7.19e-01 0.0357 0.0993 0.286 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 3.25e-01 0.102 0.103 0.286 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0567 0.0901 0.286 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 2.46e-01 -0.114 0.098 0.286 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0642 0.102 0.286 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 9.41e-02 -0.138 0.082 0.286 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 8.19e-01 0.0211 0.0921 0.288 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 6.77e-01 0.0375 0.0898 0.288 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0875 0.116 0.288 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0563 0.105 0.288 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 6.88e-01 0.0439 0.109 0.288 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 9.14e-02 0.172 0.101 0.288 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 4.94e-01 0.0546 0.0796 0.288 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00891 0.0974 0.288 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 4.05e-01 0.0756 0.0907 0.288 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0819 0.0899 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0265 0.0679 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 3.53e-02 0.189 0.0892 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 5.09e-02 0.197 0.1 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 6.81e-01 0.0373 0.0908 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 4.45e-01 0.0598 0.0782 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 7.14e-01 0.0245 0.0667 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0803 0.0729 0.286 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 1.13e-01 -0.157 0.0984 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0137 0.0759 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 2.99e-01 0.0959 0.092 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 7.12e-01 0.0399 0.108 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 7.28e-02 -0.182 0.101 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 6.38e-01 0.0442 0.0939 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0363 0.0732 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 5.66e-02 -0.174 0.0909 0.286 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0138 0.127 0.3 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 9.42e-01 0.00864 0.119 0.3 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0279 0.0897 0.3 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 6.23e-02 0.22 0.117 0.3 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 8.26e-02 0.215 0.123 0.3 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 7.95e-01 0.0302 0.116 0.3 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.42e-01 0.0548 0.118 0.3 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0752 0.115 0.3 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 9.53e-02 0.176 0.105 0.3 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 8.14e-01 0.0234 0.0994 0.287 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.99e-01 0.0943 0.0906 0.287 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 5.64e-02 0.203 0.106 0.287 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0179 0.0999 0.287 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 3.49e-01 0.0969 0.103 0.287 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 6.29e-01 0.0484 0.0999 0.287 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.10e-01 0.0446 0.0873 0.287 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 3.41e-02 -0.204 0.0956 0.287 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0386 0.0974 0.29 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 7.74e-01 0.0258 0.0899 0.29 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0822 0.108 0.29 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0495 0.0941 0.29 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0957 0.0903 0.29 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 4.50e-01 0.0658 0.0869 0.29 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0526 0.081 0.29 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 4.69e-01 0.061 0.0841 0.29 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 3.17e-01 0.114 0.114 0.314 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.02e-01 -0.162 0.0986 0.314 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0965 0.105 0.314 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 8.72e-01 0.017 0.105 0.314 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 7.72e-01 -0.032 0.11 0.314 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0139 0.0962 0.314 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 1.71e-01 -0.102 0.0739 0.314 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0959 0.0885 0.314 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 2.44e-01 -0.115 0.0983 0.314 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0229 0.0491 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 1.49e-02 -0.239 0.0973 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0653 0.0517 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 6.19e-01 0.0405 0.0815 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00953 0.084 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 1.16e-01 -0.149 0.0944 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 6.84e-01 0.0289 0.0709 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0639 0.0848 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 1.90e-01 -0.128 0.0975 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 7.52e-01 0.0325 0.102 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0383 0.102 0.286 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -956703 sc-eQTL 5.88e-01 0.0306 0.0564 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 1.92e-01 -0.12 0.092 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0497 0.0455 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 7.03e-01 0.0249 0.0653 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 9.38e-01 0.00626 0.0799 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 1.24e-01 0.14 0.0906 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 5.33e-01 0.0426 0.0682 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0601 0.0715 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -214431 sc-eQTL 9.66e-01 0.00443 0.103 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 7.43e-01 0.0346 0.105 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -672544 sc-eQTL 2.72e-01 -0.105 0.0955 0.286 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0986 0.0837 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0341 0.0679 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 2.47e-02 0.195 0.0864 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 1.96e-01 0.134 0.103 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0597 0.0883 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 2.56e-01 0.0874 0.0767 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 6.35e-01 -0.03 0.0631 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 9.18e-02 -0.122 0.072 0.286 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 9.65e-01 0.00415 0.0952 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 5.89e-01 0.045 0.0831 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 8.95e-02 0.171 0.1 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0813 0.0967 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0598 0.0961 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 3.06e-01 0.0855 0.0833 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0202 0.072 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 951358 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0663 0.0878 0.289 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -595079 sc-eQTL 9.02e-01 0.0113 0.0912 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -171906 sc-eQTL 1.59e-01 0.125 0.0886 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -305918 sc-eQTL 2.69e-01 0.0674 0.0608 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 244936 sc-eQTL 7.82e-01 0.0259 0.0935 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 117269 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00444 0.0868 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -537108 sc-eQTL 8.00e-01 0.0178 0.0703 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -352539 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0169 0.0944 0.289 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -595144 sc-eQTL 8.94e-01 0.0148 0.111 0.289 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000257202 \N -399678 1.34e-06 9.01e-07 3.28e-07 3.43e-07 2.71e-07 4.39e-07 1.13e-06 3.44e-07 1.38e-06 4.19e-07 1.35e-06 6.02e-07 1.58e-06 2.72e-07 4.19e-07 8.25e-07 7.91e-07 5.45e-07 7.52e-07 6.97e-07 5.66e-07 1.24e-06 8.27e-07 5.79e-07 1.85e-06 6.16e-07 7.33e-07 5.61e-07 1.12e-06 9.22e-07 5.23e-07 9.48e-08 2.29e-07 7.11e-07 3.6e-07 4.81e-07 5.17e-07 1.24e-07 2.92e-07 8.93e-08 3.02e-07 1.15e-06 7.72e-08 1.06e-08 1.74e-07 7.7e-08 2.22e-07 7.75e-08 1.04e-07