Genes within 1Mb (chr12:101498888:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 6.11e-01 0.0425 0.0834 0.056 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 2.53e-02 0.323 0.143 0.056 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 4.83e-02 -0.174 0.0875 0.056 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00418 0.128 0.056 B L1
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 1.23e-01 0.224 0.144 0.056 B L1
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 9.52e-01 0.00751 0.125 0.056 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.35e-01 -0.119 0.0996 0.056 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0626 0.113 0.056 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 1.78e-01 -0.242 0.179 0.056 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 6.68e-01 0.074 0.172 0.056 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 5.83e-01 0.0883 0.161 0.056 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 6.59e-01 0.0578 0.131 0.056 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.49e-02 -0.394 0.174 0.056 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 4.57e-02 0.244 0.121 0.056 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 6.58e-01 0.0599 0.135 0.056 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0448 0.132 0.056 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 4.82e-02 -0.182 0.0918 0.056 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 7.52e-01 0.0518 0.163 0.056 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.49e-02 -0.395 0.175 0.056 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 1.66e-01 0.161 0.116 0.056 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 1.09e-01 0.235 0.146 0.056 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 4.52e-01 0.122 0.162 0.056 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 4.29e-01 -0.091 0.115 0.056 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 8.22e-01 0.0372 0.165 0.056 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 2.99e-01 0.19 0.182 0.056 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.43e-01 -0.195 0.166 0.056 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 1.16e-01 0.288 0.183 0.056 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00954 0.197 0.056 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 9.81e-01 0.00494 0.204 0.056 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.27e-01 -0.212 0.175 0.056 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0321 0.145 0.056 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0257 0.182 0.056 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 9.89e-01 0.00258 0.191 0.056 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0533 0.153 0.056 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 4.36e-02 -0.26 0.128 0.056 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 4.10e-01 0.133 0.162 0.056 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 3.88e-02 0.372 0.179 0.056 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0832 0.166 0.056 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 1.64e-01 -0.203 0.146 0.056 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 4.09e-02 0.243 0.118 0.056 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0778 0.13 0.056 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0385 0.164 0.056 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 4.54e-02 -0.304 0.151 0.056 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0466 0.11 0.056 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 5.06e-01 0.118 0.178 0.056 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 9.25e-01 0.0155 0.163 0.056 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 8.55e-01 0.0225 0.123 0.056 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 3.32e-02 0.372 0.173 0.056 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 3.65e-01 -0.186 0.205 0.056 NK L1
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0326 0.0632 0.056 Other_T L1
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0633 0.12 0.056 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 1.11e-01 -0.28 0.175 0.056 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 5.63e-01 0.0735 0.127 0.056 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 4.68e-01 -0.144 0.198 0.056 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.04e-01 0.036 0.144 0.056 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0675 0.128 0.056 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 4.54e-01 -0.115 0.154 0.056 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 3.02e-01 0.132 0.128 0.056 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0284 0.149 0.056 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00287 0.0406 0.056 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 1.52e-02 0.507 0.207 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 3.09e-01 0.158 0.155 0.056 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 2.72e-01 -0.243 0.22 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00363 0.214 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 2.72e-05 -0.904 0.21 0.056 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.63e-01 0.235 0.21 0.056 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0383 0.211 0.056 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 3.13e-01 -0.175 0.173 0.056 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 3.02e-01 -0.18 0.174 0.056 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 1.33e-01 -0.246 0.163 0.056 B_Activated L2
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 8.58e-01 0.0149 0.0831 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 3.96e-01 0.176 0.207 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 6.78e-01 0.0461 0.111 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 3.69e-01 -0.148 0.164 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 8.81e-01 0.0273 0.183 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 2.78e-01 0.223 0.205 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.50e-01 -0.195 0.169 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 3.82e-01 -0.159 0.182 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 8.78e-01 0.0294 0.192 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 5.93e-01 0.107 0.201 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 7.48e-01 0.0619 0.193 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0879 0.0759 0.056 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 4.91e-01 0.139 0.201 0.056 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.52e-01 -0.15 0.131 0.056 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0297 0.18 0.056 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 1.69e-01 0.271 0.196 0.056 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 2.92e-01 0.207 0.196 0.056 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 1.61e-01 -0.245 0.175 0.056 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 2.66e-01 0.205 0.183 0.056 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 5.32e-01 0.118 0.189 0.056 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 5.02e-01 0.13 0.194 0.056 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 8.39e-01 0.036 0.176 0.056 B_Memory L2
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 6.08e-02 -0.196 0.104 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 7.01e-02 0.343 0.188 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0963 0.0984 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 4.20e-02 -0.283 0.138 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 2.11e-01 0.207 0.165 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 6.75e-01 0.0776 0.185 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 4.15e-01 -0.114 0.14 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 4.05e-01 -0.126 0.151 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 4.20e-01 -0.166 0.206 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0821 0.2 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0647 0.188 0.056 B_Naive1 L2
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0984 0.0934 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 8.37e-02 0.331 0.191 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 9.08e-02 -0.173 0.102 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 1.40e-01 0.235 0.158 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 7.67e-01 0.0547 0.185 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 7.89e-02 -0.355 0.201 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0873 0.176 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 6.26e-01 0.0853 0.175 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0391 0.184 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 3.99e-01 0.179 0.212 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0323 0.183 0.056 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 4.62e-01 -0.147 0.199 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 4.38e-01 -0.155 0.2 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 4.68e-01 0.127 0.175 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 2.49e-01 -0.221 0.192 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 5.21e-01 -0.131 0.204 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 5.23e-01 0.125 0.195 0.057 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 7.96e-01 0.0389 0.151 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 4.99e-02 -0.34 0.172 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 5.14e-01 0.0875 0.134 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 6.89e-01 0.0584 0.146 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0465 0.158 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.056 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 5.40e-01 0.0972 0.158 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 7.91e-03 -0.482 0.18 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 6.35e-01 0.0672 0.141 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 4.12e-01 -0.145 0.177 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 2.82e-01 0.178 0.165 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0663 0.109 0.056 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 4.60e-01 0.139 0.188 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 1.28e-01 -0.275 0.18 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 9.36e-01 0.014 0.174 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 2.85e-02 0.411 0.186 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 2.22e-01 -0.217 0.177 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0147 0.16 0.056 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 8.67e-01 -0.029 0.173 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 1.29e-02 -0.438 0.175 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0206 0.142 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 4.42e-01 0.148 0.192 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 2.13e-01 0.236 0.189 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.17e-01 -0.2 0.161 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 5.73e-01 -0.113 0.201 0.056 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 9.15e-01 0.0199 0.186 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 3.32e-01 -0.179 0.184 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 2.91e-01 0.175 0.166 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 3.29e-01 0.172 0.176 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 9.93e-01 0.00168 0.192 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0388 0.126 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 2.72e-01 0.214 0.194 0.056 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 6.39e-01 0.0911 0.194 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.26e-01 -0.211 0.174 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0783 0.18 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 5.89e-01 0.106 0.197 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 7.64e-01 -0.058 0.193 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 3.75e-01 -0.153 0.173 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 4.64e-01 -0.138 0.188 0.058 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 4.56e-01 0.151 0.202 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.05e-02 -0.44 0.188 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 8.55e-01 0.0373 0.204 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 3.15e-01 0.22 0.219 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0319 0.21 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.64e-01 0.205 0.183 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 4.33e-02 0.407 0.2 0.05 CD8_TEM L2
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0415 0.0676 0.056 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0502 0.19 0.056 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 5.54e-01 -0.11 0.185 0.056 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0628 0.164 0.056 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 3.91e-01 -0.168 0.196 0.056 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 9.93e-01 0.0017 0.201 0.056 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0712 0.167 0.056 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 4.91e-01 0.13 0.189 0.056 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 2.75e-02 0.406 0.183 0.056 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 5.40e-01 -0.101 0.164 0.056 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 3.69e-01 0.189 0.21 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 5.00e-02 -0.297 0.151 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 9.99e-01 0.000227 0.176 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 5.63e-01 0.119 0.205 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 6.80e-01 0.0828 0.2 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.93e-01 0.19 0.181 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 7.20e-01 0.0685 0.191 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 5.67e-03 -0.552 0.198 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 9.04e-02 -0.307 0.18 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.87e-01 -0.189 0.177 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0769 0.134 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 6.51e-01 0.0844 0.186 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 6.75e-01 0.0758 0.18 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 6.92e-01 0.0613 0.154 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 1.68e-01 0.258 0.187 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0113 0.211 0.056 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 9.81e-01 0.00465 0.197 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 7.50e-02 -0.358 0.2 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 6.58e-01 0.0718 0.162 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 4.51e-01 -0.16 0.212 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0367 0.217 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 5.59e-01 0.118 0.201 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 3.30e-01 0.201 0.206 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 6.47e-01 0.0931 0.203 0.055 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 8.01e-01 0.0464 0.183 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 5.13e-03 -0.477 0.169 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 3.34e-01 -0.126 0.13 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 3.21e-01 0.181 0.181 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0913 0.183 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.76e-01 -0.157 0.144 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 1.39e-01 0.277 0.187 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 3.99e-01 -0.171 0.202 0.056 NK_cytokine L2
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 3.08e-01 0.148 0.145 0.056 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 5.29e-01 -0.123 0.195 0.056 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 9.97e-01 0.000548 0.152 0.056 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 4.00e-01 0.183 0.217 0.056 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 5.81e-01 -0.138 0.25 0.056 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.09e-01 0.0373 0.154 0.056 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0441 0.178 0.056 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000508 0.18 0.056 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 2.30e-02 -0.471 0.204 0.056 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0587 0.192 0.056 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 1.31e-01 0.267 0.176 0.056 PB L2
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 6.34e-01 0.0331 0.0695 0.054 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0229 0.14 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 9.83e-02 -0.307 0.185 0.054 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 8.37e-03 0.36 0.135 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 5.68e-01 0.112 0.196 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 9.43e-01 0.0106 0.149 0.054 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 3.30e-01 0.157 0.161 0.054 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 9.39e-01 0.0106 0.138 0.054 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0377 0.128 0.054 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 4.74e-01 -0.101 0.14 0.054 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 6.83e-01 0.0783 0.191 0.056 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 3.60e-02 -0.416 0.197 0.056 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0595 0.174 0.056 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0739 0.189 0.056 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0737 0.196 0.056 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 6.71e-02 -0.291 0.158 0.056 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0801 0.184 0.051 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0157 0.18 0.051 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 3.24e-01 0.228 0.231 0.051 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 1.75e-01 -0.284 0.209 0.051 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0537 0.218 0.051 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.19e-01 -0.251 0.204 0.051 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 5.50e-01 0.0953 0.159 0.051 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 4.89e-01 -0.135 0.194 0.051 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0526 0.182 0.051 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0569 0.173 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 4.12e-02 -0.266 0.129 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 2.47e-01 0.201 0.173 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 5.00e-01 0.132 0.195 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0295 0.175 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 1.08e-01 -0.242 0.15 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 9.91e-02 0.211 0.127 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 1.55e-01 -0.2 0.14 0.056 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 6.35e-01 0.0886 0.187 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 3.35e-01 -0.138 0.143 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 2.45e-01 -0.202 0.173 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 3.31e-01 0.198 0.203 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 6.48e-01 0.0875 0.191 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 2.50e-01 -0.204 0.177 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 1.17e-01 0.216 0.137 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 2.16e-01 0.214 0.172 0.056 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 3.60e-01 -0.22 0.24 0.058 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0435 0.226 0.058 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 7.92e-01 -0.045 0.17 0.058 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 4.20e-01 -0.181 0.224 0.058 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 6.32e-01 -0.113 0.235 0.058 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 3.51e-01 -0.205 0.219 0.058 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 6.42e-02 -0.411 0.22 0.058 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 3.13e-01 0.221 0.218 0.058 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 6.47e-04 0.672 0.193 0.058 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 8.47e-01 0.037 0.191 0.058 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 5.48e-02 -0.335 0.173 0.058 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0469 0.206 0.058 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 2.99e-01 -0.2 0.192 0.058 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 5.60e-01 -0.116 0.199 0.058 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 7.58e-01 0.0594 0.192 0.058 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0902 0.168 0.058 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0848 0.186 0.058 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 3.50e-01 0.181 0.193 0.054 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 5.50e-03 -0.492 0.175 0.054 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 2.47e-01 0.248 0.214 0.054 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 2.06e-02 0.431 0.185 0.054 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.78e-01 0.0276 0.18 0.054 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 5.33e-01 -0.108 0.173 0.054 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0201 0.161 0.054 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 2.92e-01 -0.177 0.167 0.054 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 6.20e-01 0.114 0.229 0.056 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 1.18e-02 -0.498 0.195 0.056 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 4.37e-01 0.164 0.211 0.056 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0829 0.21 0.056 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 1.03e-01 -0.36 0.219 0.056 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 8.46e-01 0.0377 0.193 0.056 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 3.11e-01 -0.151 0.149 0.056 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 2.80e-01 0.192 0.177 0.056 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0593 0.198 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0545 0.0966 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 2.37e-01 0.229 0.194 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0315 0.102 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 3.93e-01 -0.137 0.16 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 1.49e-01 0.238 0.165 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 7.20e-01 0.0671 0.187 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 1.33e-01 -0.21 0.139 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 8.53e-01 0.031 0.167 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 9.08e-01 0.0222 0.193 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 4.98e-01 0.137 0.202 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 9.76e-01 0.00595 0.2 0.056 B_Memory LOneK1K
ENSG00000017427 IGF1 -982856 sc-eQTL 2.27e-02 -0.251 0.11 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 1.50e-02 0.438 0.179 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 9.73e-02 -0.148 0.089 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0211 0.128 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 4.30e-01 0.124 0.157 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0243 0.179 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 3.61e-01 -0.123 0.134 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0856 0.141 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -240584 sc-eQTL 1.61e-01 -0.284 0.202 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 9.65e-01 0.00918 0.207 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -698697 sc-eQTL 9.75e-01 0.00592 0.188 0.056 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00346 0.159 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 6.13e-02 -0.24 0.127 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 6.05e-01 0.0857 0.165 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 1.79e-01 0.263 0.195 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 9.87e-01 0.00278 0.167 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 5.26e-02 -0.281 0.144 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 2.39e-02 0.268 0.118 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0817 0.137 0.056 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 4.30e-01 0.15 0.19 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 2.38e-03 -0.5 0.162 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 4.62e-01 0.148 0.201 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 2.25e-01 0.234 0.193 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 7.36e-01 0.0647 0.192 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00314 0.167 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0221 0.144 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 925205 sc-eQTL 4.32e-01 -0.138 0.175 0.056 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -621232 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0972 0.174 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -198059 sc-eQTL 3.74e-02 -0.352 0.168 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -332071 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0614 0.116 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 218783 sc-eQTL 4.40e-01 0.138 0.178 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 91116 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0226 0.166 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -563261 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0541 0.134 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -378692 sc-eQTL 5.63e-02 0.343 0.179 0.056 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -621297 sc-eQTL 9.30e-01 0.0186 0.212 0.056 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120805 ARL1 91116 eQTL 0.00508 0.0986 0.0351 0.0023 0.0 0.0486
ENSG00000196091 MYBPC1 -69465 pQTL 0.0333 0.0876 0.0411 0.00134 0.0 0.0484


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina