logo

Genes within 1Mb (chr12:101471030:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 8.17e-02 0.26 0.149 0.051 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 6.94e-02 -0.165 0.0904 0.051 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 3.29e-01 0.129 0.131 0.051 B L1
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 3.59e-01 0.137 0.15 0.051 B L1
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 8.99e-01 0.0163 0.129 0.051 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 2.49e-01 -0.119 0.103 0.051 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 3.45e-01 -0.11 0.117 0.051 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 1.38e-01 -0.275 0.185 0.051 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 7.91e-01 0.0472 0.178 0.051 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 6.71e-01 0.0706 0.166 0.051 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 9.65e-01 0.00584 0.135 0.051 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.64e-02 -0.434 0.179 0.051 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 5.94e-02 0.237 0.125 0.051 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 7.75e-01 0.0399 0.139 0.051 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0324 0.136 0.051 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0734 0.0954 0.051 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0252 0.167 0.051 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 4.60e-02 -0.36 0.179 0.051 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 9.08e-01 0.0137 0.119 0.051 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 1.47e-01 0.217 0.149 0.051 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 3.58e-01 0.152 0.165 0.051 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 1.52e-01 -0.168 0.117 0.051 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 9.63e-01 0.00784 0.168 0.051 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 2.71e-01 0.209 0.19 0.052 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 2.12e-01 -0.217 0.173 0.052 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 2.57e-01 0.217 0.191 0.052 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 6.75e-01 0.0861 0.205 0.052 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.65e-01 0.0921 0.212 0.052 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 4.21e-01 -0.147 0.182 0.052 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00911 0.151 0.052 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 897347 sc-eQTL 7.29e-01 0.0656 0.19 0.052 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 9.48e-01 0.013 0.199 0.052 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 4.42e-01 -0.122 0.158 0.051 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0917 0.134 0.051 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 7.03e-01 0.0641 0.168 0.051 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 3.25e-02 0.399 0.185 0.051 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 5.02e-01 -0.116 0.172 0.051 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 2.48e-01 -0.175 0.151 0.051 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 8.10e-02 0.215 0.123 0.051 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 897347 sc-eQTL 4.34e-01 -0.105 0.134 0.051 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 9.44e-01 0.012 0.17 0.052 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 4.41e-02 -0.316 0.156 0.052 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 2.64e-01 -0.127 0.114 0.052 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 9.00e-01 0.023 0.184 0.052 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 3.75e-01 0.15 0.168 0.052 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.45e-01 0.077 0.127 0.052 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 3.32e-01 0.176 0.181 0.052 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 1.53e-01 -0.303 0.211 0.052 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0624 0.124 0.051 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 8.07e-02 -0.316 0.18 0.051 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 6.31e-01 0.0628 0.131 0.051 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 2.16e-01 -0.253 0.203 0.051 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.12e-01 0.0756 0.149 0.051 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0754 0.132 0.051 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 3.55e-01 -0.147 0.158 0.051 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 2.23e-01 0.161 0.132 0.051 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 5.56e-01 0.0905 0.154 0.051 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 1.31e-02 0.525 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 3.44e-01 0.149 0.157 0.054 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 4.51e-01 -0.169 0.224 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 8.69e-01 0.0358 0.217 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 2.96e-06 -1.02 0.21 0.054 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 3.42e-01 0.203 0.213 0.054 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0597 0.214 0.054 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 1.91e-01 -0.23 0.175 0.054 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 5.00e-01 -0.12 0.177 0.054 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 4.42e-02 -0.333 0.164 0.054 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 3.11e-01 0.209 0.206 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 9.16e-01 0.0143 0.135 0.052 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00634 0.185 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 3.17e-01 0.203 0.202 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.41e-01 0.0941 0.201 0.052 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.29e-02 -0.348 0.179 0.052 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 2.57e-01 0.214 0.188 0.052 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00403 0.195 0.052 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 2.50e-01 0.229 0.198 0.052 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 6.62e-01 0.0792 0.181 0.052 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 7.95e-02 0.345 0.196 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0707 0.102 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 1.64e-01 -0.202 0.144 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 3.49e-01 0.161 0.172 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 5.45e-01 0.116 0.192 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0576 0.145 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 4.25e-01 -0.126 0.157 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 4.05e-01 -0.178 0.213 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0932 0.208 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0715 0.195 0.051 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 8.54e-02 0.342 0.198 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.79e-01 -0.143 0.106 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 1.20e-01 0.256 0.164 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 9.00e-01 0.0241 0.192 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 1.42e-01 -0.309 0.209 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.39e-01 -0.112 0.183 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 8.87e-01 0.0257 0.181 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 4.93e-01 0.131 0.191 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 6.48e-01 0.101 0.22 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 9.70e-01 0.00703 0.19 0.052 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 4.84e-01 -0.142 0.202 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.95e-01 -0.263 0.202 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 8.69e-01 0.0292 0.177 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 4.61e-01 -0.144 0.195 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0873 0.206 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 6.77e-01 0.0827 0.198 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00285 0.155 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 3.07e-02 -0.386 0.177 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 6.21e-01 0.0685 0.138 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 7.12e-01 0.0556 0.151 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0935 0.163 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0483 0.114 0.051 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 6.03e-01 0.0854 0.164 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 6.59e-03 -0.51 0.186 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 7.14e-01 0.0538 0.146 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 5.57e-01 -0.108 0.183 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 1.78e-01 0.231 0.171 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 8.02e-01 0.0282 0.113 0.051 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 5.18e-01 0.126 0.195 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 8.98e-02 -0.318 0.187 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0231 0.181 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 4.46e-01 0.149 0.195 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 3.96e-01 -0.157 0.185 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 9.34e-01 0.0137 0.166 0.051 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0511 0.178 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 4.72e-02 -0.362 0.181 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 1.69e-01 -0.201 0.146 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 6.92e-01 0.0785 0.198 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 3.92e-01 0.168 0.195 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 3.15e-02 -0.357 0.165 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 2.69e-01 -0.229 0.207 0.051 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 9.15e-01 -0.02 0.188 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.96e-01 -0.241 0.186 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 3.50e-01 0.157 0.167 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 4.38e-01 0.138 0.178 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 7.35e-01 0.0655 0.194 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0673 0.127 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 5.53e-02 0.376 0.195 0.051 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 8.20e-01 0.0448 0.197 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.66e-01 -0.244 0.176 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 3.82e-01 -0.16 0.182 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 4.61e-01 0.147 0.199 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 5.08e-01 -0.13 0.195 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 3.24e-01 -0.173 0.175 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0989 0.191 0.056 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0642 0.197 0.052 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 4.65e-01 -0.141 0.192 0.052 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 8.92e-01 0.0233 0.17 0.052 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 5.19e-01 -0.132 0.204 0.052 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.20e-01 0.103 0.208 0.052 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00237 0.173 0.052 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0583 0.197 0.052 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 9.17e-03 0.498 0.189 0.052 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0936 0.17 0.052 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 5.95e-02 0.408 0.215 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.67e-01 -0.217 0.156 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 8.86e-01 -0.026 0.182 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0555 0.212 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 5.07e-01 0.137 0.207 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 3.68e-02 0.389 0.185 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 8.87e-01 0.0281 0.197 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 1.97e-03 -0.637 0.203 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 4.43e-02 -0.376 0.186 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.89e-01 -0.241 0.183 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 3.21e-01 -0.137 0.138 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0492 0.192 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 2.81e-01 0.201 0.186 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.98e-01 0.0841 0.159 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 1.83e-01 0.257 0.193 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 5.73e-01 -0.123 0.218 0.052 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0661 0.198 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 5.80e-02 -0.384 0.201 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 4.84e-01 -0.114 0.163 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000601 0.214 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0994 0.218 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 4.76e-01 0.145 0.202 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 5.65e-01 0.12 0.208 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 7.92e-01 0.0541 0.205 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 3.18e-01 0.188 0.188 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 2.10e-03 -0.537 0.173 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 7.32e-02 -0.239 0.133 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 5.94e-01 0.0996 0.187 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 9.43e-01 -0.0135 0.188 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 1.53e-01 -0.211 0.147 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0713 0.193 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 3.85e-01 -0.181 0.208 0.052 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 1.67e-01 -0.282 0.203 0.052 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 5.40e-01 0.0973 0.158 0.052 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 8.29e-01 0.0494 0.228 0.052 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 9.66e-02 -0.433 0.259 0.052 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 3.55e-01 0.149 0.16 0.052 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 8.36e-01 0.0386 0.186 0.052 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0691 0.188 0.052 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 6.65e-02 -0.399 0.216 0.052 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 4.60e-01 -0.148 0.2 0.052 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 1.57e-01 0.262 0.184 0.052 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 8.55e-01 0.0259 0.142 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 2.52e-01 -0.215 0.188 0.052 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 1.28e-02 0.344 0.137 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 8.57e-01 0.0358 0.199 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 7.81e-01 0.0419 0.15 0.052 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 4.83e-01 0.115 0.163 0.052 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 7.10e-01 0.0521 0.14 0.052 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0231 0.13 0.052 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 7.04e-01 -0.054 0.142 0.052 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 7.00e-01 0.0765 0.198 0.051 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 9.75e-02 -0.341 0.205 0.051 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 6.66e-01 0.0777 0.18 0.051 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 5.98e-01 -0.104 0.196 0.051 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 7.86e-01 0.0552 0.203 0.051 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 1.26e-01 -0.252 0.164 0.051 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 4.28e-01 -0.142 0.178 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 2.18e-01 -0.166 0.134 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 4.47e-01 0.136 0.178 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 5.15e-01 0.131 0.201 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0539 0.18 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 1.16e-01 -0.243 0.154 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 3.17e-01 0.132 0.132 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 897347 sc-eQTL 1.01e-01 -0.237 0.144 0.051 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 4.80e-01 0.136 0.193 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0273 0.148 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 2.81e-01 -0.194 0.18 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 2.46e-01 0.244 0.21 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 8.74e-01 0.0314 0.198 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 3.94e-01 -0.156 0.183 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 5.32e-02 0.275 0.142 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 897347 sc-eQTL 2.77e-01 0.194 0.178 0.051 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 3.72e-01 -0.216 0.241 0.058 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0361 0.227 0.058 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0669 0.171 0.058 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 3.07e-01 -0.23 0.225 0.058 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.46e-01 -0.109 0.236 0.058 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 4.35e-02 -0.443 0.217 0.058 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 1.29e-01 -0.339 0.222 0.058 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 4.49e-01 0.167 0.22 0.058 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 6.71e-05 0.783 0.191 0.058 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 6.06e-01 0.101 0.196 0.053 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 9.87e-02 -0.295 0.178 0.053 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0346 0.21 0.053 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 2.60e-01 -0.221 0.196 0.053 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 4.63e-01 -0.149 0.203 0.053 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.85e-01 0.108 0.197 0.053 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 3.18e-01 -0.172 0.172 0.053 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 897347 sc-eQTL 9.45e-01 -0.013 0.19 0.053 intMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 3.14e-01 0.202 0.2 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0168 0.106 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 7.88e-01 0.0446 0.166 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 1.38e-01 0.253 0.17 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 8.56e-01 -0.035 0.193 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 1.61e-02 -0.345 0.142 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0443 0.173 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0459 0.199 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 2.20e-01 0.255 0.208 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00169 0.207 0.051 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 2.83e-02 0.413 0.187 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.08e-01 -0.15 0.0929 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 5.51e-01 0.0798 0.134 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 5.10e-01 0.108 0.164 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 9.24e-01 0.0178 0.187 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0813 0.14 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 4.75e-01 -0.105 0.147 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -268442 sc-eQTL 3.70e-01 -0.19 0.211 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 9.53e-01 -0.0126 0.216 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -726555 sc-eQTL 8.12e-01 0.0467 0.196 0.051 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0297 0.164 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 3.05e-01 -0.136 0.132 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 8.81e-01 0.0256 0.171 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 1.52e-01 0.289 0.201 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0513 0.173 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 1.11e-01 -0.239 0.149 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 4.90e-02 0.242 0.122 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 897347 sc-eQTL 4.04e-01 -0.118 0.141 0.051 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 5.51e-01 0.117 0.196 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.23e-01 -0.264 0.171 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 5.22e-01 0.133 0.208 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 1.68e-01 0.275 0.199 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 8.08e-01 0.0484 0.199 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 9.46e-01 0.0118 0.172 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 8.98e-01 0.019 0.149 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 897347 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0891 0.181 0.052 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -649090 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0919 0.179 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -225917 sc-eQTL 1.91e-02 -0.407 0.172 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -359929 sc-eQTL 2.04e-01 -0.152 0.119 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 190925 sc-eQTL 6.31e-01 0.0884 0.183 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 63258 sc-eQTL 6.92e-01 0.0676 0.17 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -591119 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0141 0.138 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -406550 sc-eQTL 3.89e-01 0.16 0.185 0.052 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -649155 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0961 0.218 0.052 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000120805 ARL1 63258 eQTL 0.0325 0.08 0.0373 0.00103 0.0 0.0427
ENSG00000196091 MYBPC1 -97323 pQTL 0.0486 0.0878 0.0445 0.00108 0.0 0.0412

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000120860 \N -591119 4.21e-07 1.78e-07 6.57e-08 2.22e-07 9.82e-08 8.4e-08 2.5e-07 5.68e-08 1.66e-07 9.72e-08 1.76e-07 1.48e-07 2.38e-07 8.15e-08 6.12e-08 9.6e-08 5.42e-08 1.91e-07 7.42e-08 6.03e-08 1.18e-07 1.7e-07 1.69e-07 4.17e-08 2.09e-07 1.39e-07 1.22e-07 1.17e-07 1.37e-07 1.36e-07 1.26e-07 4.69e-08 3.74e-08 9.76e-08 3.51e-08 2.74e-08 4.47e-08 8.2e-08 6.33e-08 5.56e-08 5.94e-08 1.62e-07 3.53e-08 7.39e-09 3.34e-08 1.68e-08 7e-08 2.05e-09 4.98e-08