logo

Genes within 1Mb (chr12:101456702:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 1.99e-01 0.0907 0.0704 0.244 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 8.37e-01 0.00883 0.043 0.244 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0416 0.0621 0.244 B L1
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 4.69e-01 0.0512 0.0706 0.244 B L1
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 8.81e-01 0.00908 0.0608 0.244 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 5.97e-03 -0.133 0.0478 0.244 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0383 0.0551 0.244 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 6.52e-02 -0.161 0.087 0.244 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0704 0.0838 0.244 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0724 0.0781 0.244 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 1.97e-01 0.0832 0.0643 0.244 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.75e-01 -0.118 0.0867 0.244 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.09e-01 0.0759 0.0602 0.244 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 3.27e-01 0.0654 0.0666 0.244 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0138 0.0653 0.244 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 9.18e-02 -0.0769 0.0454 0.244 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 6.39e-02 0.147 0.0791 0.244 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 7.00e-02 -0.156 0.0858 0.244 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 6.45e-01 0.0261 0.0567 0.244 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.22e-01 0.11 0.0712 0.244 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0336 0.079 0.244 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 6.14e-03 -0.153 0.0551 0.244 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 6.36e-01 0.0381 0.0804 0.244 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 2.37e-02 0.204 0.0893 0.234 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0765 0.0825 0.234 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 4.86e-01 0.0634 0.0909 0.234 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0129 0.0975 0.234 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 2.11e-01 0.126 0.1 0.234 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0282 0.0868 0.234 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 5.96e-01 0.0381 0.0716 0.234 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0564 0.09 0.234 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0125 0.0945 0.234 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 9.38e-02 0.128 0.0759 0.244 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 9.76e-01 0.00194 0.0647 0.244 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 9.55e-01 0.00461 0.0811 0.244 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 8.52e-01 0.0169 0.0904 0.244 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 5.49e-01 0.05 0.0832 0.244 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0548 0.0731 0.244 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 6.29e-01 0.0288 0.0597 0.244 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 5.95e-01 0.0346 0.0649 0.244 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 7.82e-01 0.0227 0.0822 0.242 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.59e-01 -0.107 0.0759 0.242 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0642 0.0551 0.242 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 3.01e-01 -0.092 0.0888 0.242 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0316 0.0818 0.242 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 1.57e-02 -0.148 0.0608 0.242 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 1.88e-01 0.115 0.0874 0.242 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 4.99e-01 0.0696 0.103 0.242 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 7.18e-01 0.0209 0.0577 0.244 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0559 0.0843 0.244 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 9.97e-01 0.000264 0.0609 0.244 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0573 0.095 0.244 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 8.94e-01 0.00924 0.0693 0.244 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 8.92e-01 0.00834 0.0616 0.244 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0995 0.0735 0.244 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0225 0.0615 0.244 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0387 0.0715 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0104 0.1 0.255 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 4.76e-02 0.146 0.0732 0.255 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.22e-01 -0.128 0.105 0.255 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 7.31e-01 0.035 0.102 0.255 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 1.78e-02 -0.247 0.103 0.255 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 8.64e-01 0.0172 0.1 0.255 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 2.67e-02 -0.221 0.0991 0.255 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0891 0.0823 0.255 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 2.48e-01 -0.096 0.0828 0.255 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0557 0.0779 0.255 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 2.14e-01 0.125 0.1 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 3.21e-01 0.0535 0.0537 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 7.17e-02 0.143 0.079 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 5.56e-01 0.0522 0.0884 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 3.08e-02 0.214 0.0985 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0897 0.082 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 1.94e-01 -0.114 0.0879 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0527 0.0927 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 8.57e-01 0.0176 0.0974 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 9.18e-01 0.00962 0.0934 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 4.83e-01 0.0681 0.0968 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.36e-01 0.0942 0.0629 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00256 0.0866 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 5.02e-01 0.0639 0.095 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 9.04e-01 0.0115 0.0946 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 1.03e-01 -0.138 0.0841 0.246 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 6.64e-01 0.0386 0.0887 0.246 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 6.21e-01 0.0451 0.0913 0.246 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 8.71e-01 0.0151 0.0934 0.246 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0103 0.085 0.246 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 4.96e-01 0.0639 0.0938 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 8.32e-01 0.0103 0.0488 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.63e-02 -0.153 0.0683 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 9.52e-01 0.00499 0.082 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0937 0.0913 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 2.18e-02 -0.158 0.0684 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 6.80e-01 -0.031 0.075 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 7.03e-02 -0.184 0.101 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 2.90e-01 -0.105 0.099 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 1.80e-01 -0.124 0.0926 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 9.91e-02 0.153 0.0921 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0435 0.0496 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0545 0.0769 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.66e-01 0.124 0.0888 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0932 0.0977 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.48e-03 -0.226 0.0838 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 5.39e-01 0.052 0.0844 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0577 0.0889 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 8.52e-01 0.0192 0.103 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 1.72e-01 -0.121 0.088 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 8.33e-02 0.17 0.0977 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 2.09e-01 -0.124 0.0983 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.31e-02 0.195 0.0851 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 9.54e-01 0.00551 0.0949 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 7.40e-02 -0.179 0.0997 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0663 0.0963 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0176 0.0744 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 2.13e-01 -0.107 0.0855 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.88e-01 0.0704 0.066 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0491 0.072 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 9.36e-01 0.00623 0.0781 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 1.04e-01 -0.0885 0.0542 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 2.90e-02 0.172 0.0781 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.43e-01 -0.133 0.0906 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.33e-01 0.044 0.0705 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.97e-01 0.114 0.0879 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 4.97e-01 0.0561 0.0825 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 1.84e-01 -0.072 0.054 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 1.00e-02 0.239 0.0918 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.50e-02 -0.217 0.0886 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0317 0.0864 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.39e-01 0.138 0.0931 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.03e-01 -0.046 0.0883 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 9.06e-01 0.00936 0.0792 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0142 0.086 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 8.49e-02 -0.152 0.0876 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0307 0.0705 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 8.92e-01 0.013 0.0955 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.89e-01 0.0378 0.0944 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 4.70e-03 -0.226 0.079 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0237 0.1 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 8.51e-02 0.154 0.0892 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0945 0.089 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.13e-01 0.0524 0.0801 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 6.91e-02 0.155 0.0846 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 1.47e-01 -0.134 0.0921 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.82e-02 -0.107 0.0605 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 2.58e-01 0.106 0.0938 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 7.70e-01 0.0282 0.0962 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0787 0.0861 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.94e-01 0.0476 0.0892 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.18e-01 0.152 0.0967 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0959 0.0954 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 1.61e-01 -0.12 0.0852 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 8.17e-01 0.0216 0.0933 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 1.03e-01 0.157 0.0962 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0598 0.0915 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0573 0.0981 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 7.69e-01 0.0309 0.105 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 2.34e-01 0.12 0.1 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 3.73e-01 0.0784 0.0878 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 6.88e-01 0.039 0.097 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 7.63e-01 0.0286 0.0946 0.242 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 5.52e-01 0.0549 0.0922 0.242 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0336 0.0818 0.242 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.19e-01 -0.152 0.0975 0.242 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.65e-01 0.0433 0.1 0.242 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 4.58e-01 0.0618 0.083 0.242 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 2.67e-01 -0.105 0.0941 0.242 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 5.28e-01 0.0584 0.0923 0.242 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0912 0.0816 0.242 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 3.36e-01 0.0965 0.1 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 8.18e-01 0.0167 0.0726 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0546 0.0838 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 9.26e-01 0.00912 0.0979 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0138 0.0957 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 5.37e-01 0.0534 0.0864 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 9.37e-01 0.00723 0.091 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 2.16e-01 -0.119 0.0957 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0322 0.0906 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.85e-01 -0.117 0.0882 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0593 0.0668 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0429 0.0929 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0438 0.0899 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.43e-03 -0.205 0.0757 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 2.44e-01 0.109 0.0932 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 3.70e-01 0.0945 0.105 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 4.38e-01 0.0723 0.0931 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.49e-01 -0.138 0.0951 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.69e-02 -0.169 0.0759 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0567 0.1 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0942 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.38e-01 -0.032 0.0953 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 8.12e-01 0.0233 0.098 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00657 0.0964 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0527 0.0911 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0871 0.0851 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0298 0.0648 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 4.59e-01 -0.067 0.0902 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 4.99e-01 0.0615 0.0908 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0601 0.0715 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 3.11e-01 0.0945 0.093 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 4.07e-01 0.0835 0.101 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0327 0.0979 0.252 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 2.24e-01 0.0923 0.0754 0.252 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0932 0.109 0.252 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.125 0.252 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 3.57e-01 0.0709 0.0768 0.252 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0772 0.0886 0.252 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 1.69e-02 -0.213 0.088 0.252 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0176 0.105 0.252 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 2.36e-01 -0.114 0.0954 0.252 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 7.94e-03 0.233 0.0861 0.252 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0984 0.0658 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.27e-01 -0.134 0.0872 0.246 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 6.77e-02 0.118 0.0644 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 2.57e-01 0.105 0.0924 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 8.82e-01 0.0104 0.0701 0.246 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 8.64e-01 0.013 0.0762 0.246 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 2.19e-01 0.0802 0.0651 0.246 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0755 0.0603 0.246 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0288 0.0662 0.246 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0376 0.0949 0.244 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.83e-01 -0.131 0.0983 0.244 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 8.48e-01 0.0166 0.0863 0.244 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.33e-01 0.141 0.0935 0.244 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0638 0.0971 0.244 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.05e-01 0.03 0.0789 0.244 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 3.73e-01 0.08 0.0894 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 2.36e-01 -0.104 0.0871 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 6.68e-01 0.0484 0.113 0.229 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0843 0.102 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0157 0.106 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0382 0.0995 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0189 0.0776 0.229 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0718 0.0947 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00943 0.0884 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 1.30e-01 0.132 0.0872 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0506 0.066 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 7.96e-01 0.0227 0.0877 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.06e-01 -0.159 0.098 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 9.08e-02 0.149 0.0878 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0865 0.076 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00743 0.065 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 8.90e-01 0.00984 0.0711 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 2.98e-01 0.0984 0.0944 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00075 0.0725 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 1.16e-01 -0.138 0.0877 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0403 0.103 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 7.78e-01 0.0274 0.0971 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0206 0.0898 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 7.47e-01 0.0226 0.07 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 6.17e-02 0.163 0.087 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 7.10e-01 0.0435 0.117 0.233 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0302 0.109 0.233 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0452 0.0823 0.233 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 7.92e-01 0.0288 0.109 0.233 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0714 0.114 0.233 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 2.92e-01 -0.112 0.106 0.233 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 6.64e-02 -0.198 0.107 0.233 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 4.03e-01 0.0888 0.106 0.233 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 6.57e-02 0.178 0.0961 0.233 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0592 0.0962 0.238 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0341 0.088 0.238 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.103 0.238 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0241 0.0968 0.238 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 2.49e-01 0.116 0.0999 0.238 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0286 0.0968 0.238 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0264 0.0846 0.238 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 4.72e-01 0.0674 0.0936 0.238 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 4.43e-01 0.074 0.0963 0.244 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00325 0.089 0.244 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 9.30e-02 0.179 0.106 0.244 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 6.30e-05 0.366 0.0895 0.244 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0406 0.0896 0.244 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0836 0.086 0.244 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 9.15e-01 0.00855 0.0802 0.244 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 2.66e-01 0.0927 0.0831 0.244 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 4.22e-01 0.0926 0.115 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 2.12e-01 -0.125 0.0998 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00296 0.106 0.215 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 2.54e-01 0.12 0.105 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 3.98e-01 0.0939 0.111 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 6.22e-01 0.0479 0.0969 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0507 0.0749 0.215 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 5.62e-01 -0.052 0.0894 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 8.83e-01 0.0147 0.0995 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 2.69e-01 0.104 0.0938 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 2.09e-01 0.0621 0.0493 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.15e-01 0.0963 0.0775 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 5.63e-01 0.0463 0.08 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 6.44e-02 0.167 0.0898 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 7.95e-02 -0.118 0.0671 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0585 0.0809 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 9.71e-01 0.00334 0.0933 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 6.59e-01 0.0432 0.0976 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 9.75e-01 0.00303 0.0968 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 2.41e-01 0.106 0.09 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0258 0.0446 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0828 0.0636 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 4.69e-01 0.0566 0.0781 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 2.15e-01 -0.11 0.0888 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 1.36e-03 -0.212 0.0652 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00768 0.07 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -282770 sc-eQTL 5.39e-02 -0.194 0.1 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 2.39e-01 -0.121 0.103 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -740883 sc-eQTL 9.10e-02 -0.158 0.093 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 5.73e-02 0.154 0.0804 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0376 0.0655 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0559 0.0843 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 2.59e-01 -0.113 0.0994 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 2.05e-01 0.108 0.085 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0781 0.074 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 8.37e-01 0.0126 0.0609 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 4.71e-01 0.0504 0.0698 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 9.81e-01 0.00226 0.0941 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 7.52e-01 0.026 0.0821 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.95e-01 0.104 0.0992 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 1.69e-03 0.297 0.0934 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 8.79e-01 0.0145 0.095 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0665 0.0824 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 8.52e-01 0.0133 0.0712 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 883019 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00958 0.0868 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -663418 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0214 0.0866 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -240245 sc-eQTL 1.27e-01 -0.129 0.0841 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -374257 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0655 0.0577 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 176597 sc-eQTL 2.48e-01 -0.103 0.0885 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 48930 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0459 0.0824 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -605447 sc-eQTL 9.23e-03 -0.173 0.0657 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -420878 sc-eQTL 1.29e-01 0.136 0.0892 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -663483 sc-eQTL 2.61e-01 0.118 0.105 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -663418 3.92e-07 1.83e-07 6.45e-08 2.35e-07 1.01e-07 8.85e-08 2.86e-07 6.12e-08 1.86e-07 1.03e-07 2.04e-07 1.52e-07 3.04e-07 8.55e-08 6.12e-08 9.35e-08 5.27e-08 2.21e-07 7.42e-08 6.16e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.81e-07 3.27e-08 2.59e-07 1.43e-07 1.29e-07 1.42e-07 1.4e-07 1.46e-07 1.27e-07 4.32e-08 4.23e-08 9.5e-08 5.65e-08 3.36e-08 5.1e-08 8.2e-08 6.33e-08 6.79e-08 4.83e-08 2e-07 3.55e-08 1.43e-08 4.06e-08 6.53e-09 7e-08 2e-09 4.91e-08