logo

Genes within 1Mb (chr12:101453683:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 1.90e-01 0.0936 0.0711 0.244 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 7.34e-01 0.0148 0.0434 0.244 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0223 0.0628 0.244 B L1
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 5.10e-01 0.0471 0.0713 0.244 B L1
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 9.44e-01 0.00435 0.0614 0.244 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 7.00e-03 -0.132 0.0483 0.244 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0435 0.0557 0.244 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 6.65e-02 -0.162 0.0878 0.244 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0929 0.0846 0.244 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 2.66e-01 -0.088 0.0789 0.244 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 2.72e-01 0.0717 0.0651 0.244 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.86e-01 -0.116 0.0878 0.244 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 2.16e-01 0.0755 0.0609 0.244 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 3.20e-01 0.0672 0.0674 0.244 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0317 0.066 0.244 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 8.10e-02 -0.0805 0.0459 0.244 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 4.62e-02 0.16 0.0797 0.244 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 7.72e-02 -0.154 0.0866 0.244 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 5.44e-01 0.0348 0.0572 0.244 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 1.08e-01 0.116 0.0718 0.244 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.23e-01 -0.051 0.0796 0.244 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 4.40e-03 -0.16 0.0555 0.244 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 5.07e-01 0.0539 0.081 0.244 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 2.70e-02 0.201 0.0902 0.234 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0786 0.0833 0.234 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 3.04e-01 0.0944 0.0916 0.234 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0232 0.0984 0.234 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 2.00e-01 0.13 0.101 0.234 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0403 0.0876 0.234 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 5.69e-01 0.0413 0.0723 0.234 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 7.50e-01 -0.029 0.0909 0.234 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0155 0.0954 0.234 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 1.41e-01 0.114 0.0769 0.244 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 8.72e-01 0.0105 0.0654 0.244 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 7.97e-01 0.0211 0.082 0.244 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 7.94e-01 0.0239 0.0914 0.244 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 7.51e-01 0.0268 0.0841 0.244 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0719 0.0739 0.244 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 5.69e-01 0.0344 0.0603 0.244 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 4.93e-01 0.0451 0.0656 0.244 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 6.37e-01 0.0393 0.0831 0.242 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.90e-01 -0.101 0.0768 0.242 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 2.30e-01 -0.067 0.0557 0.242 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0736 0.0898 0.242 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0557 0.0826 0.242 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 1.41e-02 -0.152 0.0614 0.242 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 1.43e-01 0.13 0.0882 0.242 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 6.10e-01 0.0532 0.104 0.242 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 8.57e-01 0.0105 0.0583 0.244 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0637 0.0851 0.244 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00622 0.0615 0.244 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0481 0.0959 0.244 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 6.51e-01 0.0317 0.07 0.244 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000295 0.0622 0.244 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 1.66e-01 -0.103 0.0743 0.244 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0391 0.0621 0.244 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0301 0.0722 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 1.00e+00 -2.26e-05 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 3.57e-02 0.157 0.074 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 8.21e-01 0.0234 0.103 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 1.69e-02 -0.252 0.105 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 9.55e-01 0.00579 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 2.62e-02 -0.225 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0877 0.0834 0.253 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.0838 0.253 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 5.03e-01 -0.053 0.079 0.253 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 2.42e-01 0.118 0.101 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 2.93e-01 0.0572 0.0542 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 5.05e-02 0.157 0.0797 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 5.71e-01 0.0506 0.0893 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 3.71e-02 0.209 0.0995 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.07e-01 -0.105 0.0827 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 2.18e-01 -0.11 0.0888 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0754 0.0936 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 8.15e-01 0.023 0.0983 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 9.87e-01 0.00155 0.0943 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 5.23e-01 0.0624 0.0977 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.07e-01 0.103 0.0634 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 9.52e-01 0.00529 0.0874 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 6.13e-01 0.0485 0.0959 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 9.36e-01 0.00772 0.0954 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 9.13e-02 -0.144 0.0848 0.246 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 6.59e-01 0.0395 0.0895 0.246 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 7.11e-01 0.0342 0.0921 0.246 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00735 0.0943 0.246 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0858 0.246 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 4.33e-01 0.0744 0.0948 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 7.25e-01 0.0174 0.0493 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 4.43e-02 -0.14 0.0691 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 9.70e-01 0.00307 0.0828 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0871 0.0923 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 3.14e-02 -0.15 0.0692 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0445 0.0758 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 8.71e-02 -0.176 0.102 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.1 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 1.84e-01 -0.125 0.0935 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 8.99e-02 0.159 0.0931 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0361 0.0501 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0366 0.0777 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 1.40e-01 0.133 0.0897 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 1.89e-01 -0.13 0.0986 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 1.10e-02 -0.218 0.0849 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 4.15e-01 0.0697 0.0852 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0702 0.0898 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 9.83e-01 0.00216 0.104 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 1.79e-01 -0.12 0.089 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 1.29e-01 0.152 0.0994 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0997 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 2.32e-02 0.198 0.0864 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0129 0.0963 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.35e-02 -0.196 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0557 0.0978 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0258 0.0753 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 2.32e-01 -0.104 0.0865 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 3.10e-01 0.0679 0.0668 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0506 0.0728 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0145 0.079 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 8.92e-02 -0.0936 0.0548 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 4.76e-02 0.158 0.0792 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.52e-01 -0.132 0.0917 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 4.75e-01 0.051 0.0713 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 2.06e-01 0.113 0.089 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.52e-01 0.0498 0.0835 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0705 0.0546 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 1.28e-02 0.234 0.093 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.05e-02 -0.231 0.0894 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0406 0.0874 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 1.25e-01 0.145 0.0941 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0616 0.0893 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000752 0.0801 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.0869 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 7.59e-02 -0.158 0.0885 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 8.66e-01 -0.012 0.0713 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 7.62e-01 0.0292 0.0964 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 8.94e-01 0.0128 0.0953 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.54e-03 -0.243 0.0796 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0136 0.101 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 5.09e-02 0.177 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0864 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 5.11e-01 0.0532 0.0809 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 8.33e-02 0.149 0.0855 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 1.51e-01 -0.134 0.0931 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 8.08e-02 -0.107 0.0612 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 2.60e-01 0.107 0.0948 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 7.77e-01 0.0276 0.0974 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0539 0.0873 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 7.05e-01 0.0343 0.0903 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0979 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0965 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.13e-01 -0.108 0.0864 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 6.49e-01 0.0431 0.0945 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 6.27e-02 0.181 0.0968 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0617 0.0923 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0798 0.0988 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 3.77e-01 0.0897 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0884 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 7.07e-01 0.0368 0.0978 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 8.49e-01 0.0182 0.0956 0.242 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 5.92e-01 0.05 0.0931 0.242 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0326 0.0826 0.242 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0986 0.242 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.06e-01 0.0673 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 5.33e-01 0.0524 0.0839 0.242 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 2.59e-01 -0.108 0.095 0.242 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 6.41e-01 0.0436 0.0933 0.242 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0934 0.0824 0.242 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 3.58e-01 0.0931 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 8.37e-01 0.0151 0.0733 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0666 0.0846 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 7.08e-01 0.0371 0.0989 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0243 0.0966 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 5.42e-01 0.0533 0.0873 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 8.29e-01 0.0199 0.0919 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 1.95e-01 -0.126 0.0967 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00626 0.0916 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 2.44e-01 -0.104 0.0892 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0638 0.0675 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0337 0.0939 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0614 0.0907 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 5.21e-03 -0.216 0.0764 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 1.67e-01 0.131 0.0941 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 5.43e-01 0.0647 0.106 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 4.33e-01 0.0739 0.0941 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.86e-01 -0.128 0.0962 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 4.85e-02 -0.153 0.0769 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0388 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0805 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0317 0.0964 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 7.46e-01 0.0322 0.099 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 8.78e-01 -0.015 0.0974 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0327 0.0919 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0991 0.0858 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0387 0.0653 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0676 0.091 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 7.01e-01 0.0352 0.0916 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0617 0.0721 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 3.39e-01 0.0899 0.0938 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 3.24e-01 0.1 0.101 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0976 0.256 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.84e-01 0.1 0.0751 0.256 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0737 0.109 0.256 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 9.05e-01 0.015 0.125 0.256 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 3.43e-01 0.0729 0.0765 0.256 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0831 0.0883 0.256 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 2.47e-02 -0.2 0.088 0.256 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0188 0.104 0.256 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 1.59e-01 -0.135 0.0949 0.256 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 9.39e-03 0.227 0.086 0.256 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 9.77e-02 -0.111 0.0665 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 9.51e-02 -0.148 0.0881 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 7.50e-02 0.117 0.0651 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 2.58e-01 0.106 0.0934 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 7.89e-01 0.019 0.0709 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 8.49e-01 0.0147 0.077 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 3.15e-01 0.0664 0.0659 0.243 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0816 0.061 0.243 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0294 0.0669 0.243 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 6.16e-01 -0.048 0.0957 0.244 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.71e-01 -0.136 0.0992 0.244 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 7.39e-01 0.0291 0.087 0.244 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 1.01e-01 0.155 0.0942 0.244 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0636 0.0979 0.244 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 8.28e-01 0.0173 0.0796 0.244 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 3.26e-01 0.0888 0.0902 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0994 0.0879 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 4.71e-01 0.0821 0.114 0.229 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 2.98e-01 -0.107 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 9.86e-01 0.00184 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0459 0.1 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0119 0.0783 0.229 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0459 0.0956 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00698 0.0892 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 2.53e-01 0.101 0.0881 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0426 0.0666 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 7.05e-01 0.0335 0.0884 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 9.58e-02 -0.165 0.0988 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 1.27e-01 0.136 0.0886 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0972 0.0765 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000495 0.0655 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 7.11e-01 0.0266 0.0717 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 3.81e-01 0.0838 0.0954 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00387 0.0733 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 1.30e-01 -0.135 0.0886 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 8.48e-01 -0.02 0.104 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 9.27e-01 0.00894 0.0981 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0427 0.0907 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 7.49e-01 0.0227 0.0707 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 8.18e-02 0.154 0.088 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 6.90e-01 0.0473 0.118 0.233 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0403 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0516 0.0836 0.233 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 7.91e-01 0.0294 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0325 0.116 0.233 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.03e-01 -0.137 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 6.99e-02 -0.198 0.109 0.233 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 3.27e-01 0.106 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 9.96e-02 0.162 0.0979 0.233 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 6.88e-01 -0.039 0.0971 0.238 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 6.21e-01 -0.044 0.0888 0.238 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 6.89e-01 0.0417 0.104 0.238 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 2.71e-01 0.111 0.101 0.238 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0194 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0189 0.0854 0.238 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 5.86e-01 0.0516 0.0944 0.238 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0976 0.242 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 9.52e-01 0.00541 0.0902 0.242 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 8.12e-02 0.188 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 6.54e-05 0.37 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0548 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0937 0.0871 0.242 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 9.13e-01 0.00893 0.0813 0.242 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 2.28e-01 0.102 0.0842 0.242 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 4.74e-01 0.0836 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.80e-01 -0.136 0.101 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 8.46e-01 0.0209 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 2.82e-01 0.115 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 4.43e-01 0.0865 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 7.09e-01 0.0367 0.0982 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0397 0.0759 0.215 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0484 0.0906 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00316 0.101 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 3.10e-01 0.0963 0.0946 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.71e-01 0.0683 0.0497 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 1.58e-01 0.111 0.0781 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 6.38e-01 0.038 0.0807 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 7.78e-02 0.161 0.0907 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 4.56e-02 -0.136 0.0676 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0533 0.0816 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0201 0.0941 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 7.27e-01 0.0344 0.0985 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00432 0.0977 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0909 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0209 0.045 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0673 0.0643 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 4.91e-01 0.0545 0.0789 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0897 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.52e-03 -0.202 0.066 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0137 0.0707 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -285789 sc-eQTL 6.30e-02 -0.189 0.101 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 2.02e-01 -0.133 0.104 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -743902 sc-eQTL 9.81e-02 -0.156 0.094 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 1.09e-01 0.131 0.0813 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0314 0.0661 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0449 0.0851 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 2.78e-01 -0.109 0.1 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 3.03e-01 0.0886 0.0859 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0913 0.0747 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 7.75e-01 0.0176 0.0615 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 3.51e-01 0.0659 0.0705 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 7.52e-01 0.0299 0.0947 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 8.10e-01 0.0199 0.0828 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 2.28e-01 0.121 0.0999 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 7.44e-04 0.321 0.0938 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0041 0.0957 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0683 0.083 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 7.53e-01 0.0226 0.0717 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 880000 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0187 0.0875 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -666437 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000949 0.0875 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -243264 sc-eQTL 1.50e-01 -0.123 0.085 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -377276 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0666 0.0583 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 173578 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0917 0.0895 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 45911 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0669 0.0831 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -608466 sc-eQTL 8.50e-03 -0.176 0.0663 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -423897 sc-eQTL 9.65e-02 0.15 0.09 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -666502 sc-eQTL 3.38e-01 0.102 0.106 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -666437 3.14e-07 1.56e-07 6.15e-08 2.24e-07 9.94e-08 8.75e-08 2.24e-07 5.78e-08 1.66e-07 9.35e-08 1.69e-07 1.23e-07 2.38e-07 8.07e-08 5.43e-08 8.08e-08 4.35e-08 1.8e-07 7.39e-08 5.48e-08 1.26e-07 1.65e-07 1.64e-07 3.59e-08 2.28e-07 1.39e-07 1.2e-07 1.12e-07 1.32e-07 1.33e-07 1.26e-07 3.68e-08 4.37e-08 9.3e-08 4.78e-08 2.85e-08 4.06e-08 7.92e-08 6.21e-08 5.45e-08 6e-08 1.55e-07 3.99e-08 1.57e-08 3.36e-08 6.68e-09 7.83e-08 2.07e-09 4.94e-08