logo

Genes within 1Mb (chr12:101452421:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 1.90e-01 0.0936 0.0711 0.244 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 7.34e-01 0.0148 0.0434 0.244 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0223 0.0628 0.244 B L1
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 5.10e-01 0.0471 0.0713 0.244 B L1
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 9.44e-01 0.00435 0.0614 0.244 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 7.00e-03 -0.132 0.0483 0.244 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0435 0.0557 0.244 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 6.65e-02 -0.162 0.0878 0.244 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0929 0.0846 0.244 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 2.66e-01 -0.088 0.0789 0.244 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 2.72e-01 0.0717 0.0651 0.244 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.86e-01 -0.116 0.0878 0.244 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 2.16e-01 0.0755 0.0609 0.244 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 3.20e-01 0.0672 0.0674 0.244 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0317 0.066 0.244 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 8.10e-02 -0.0805 0.0459 0.244 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 4.62e-02 0.16 0.0797 0.244 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 7.72e-02 -0.154 0.0866 0.244 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 5.44e-01 0.0348 0.0572 0.244 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 1.08e-01 0.116 0.0718 0.244 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.23e-01 -0.051 0.0796 0.244 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 4.40e-03 -0.16 0.0555 0.244 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 5.07e-01 0.0539 0.081 0.244 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 2.70e-02 0.201 0.0902 0.234 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0786 0.0833 0.234 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 3.04e-01 0.0944 0.0916 0.234 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0232 0.0984 0.234 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 2.00e-01 0.13 0.101 0.234 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0403 0.0876 0.234 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 5.69e-01 0.0413 0.0723 0.234 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 7.50e-01 -0.029 0.0909 0.234 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0155 0.0954 0.234 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 1.41e-01 0.114 0.0769 0.244 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 8.72e-01 0.0105 0.0654 0.244 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 7.97e-01 0.0211 0.082 0.244 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 7.94e-01 0.0239 0.0914 0.244 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 7.51e-01 0.0268 0.0841 0.244 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0719 0.0739 0.244 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 5.69e-01 0.0344 0.0603 0.244 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 4.93e-01 0.0451 0.0656 0.244 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 6.37e-01 0.0393 0.0831 0.242 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.90e-01 -0.101 0.0768 0.242 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 2.30e-01 -0.067 0.0557 0.242 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0736 0.0898 0.242 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0557 0.0826 0.242 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 1.41e-02 -0.152 0.0614 0.242 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 1.43e-01 0.13 0.0882 0.242 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 6.10e-01 0.0532 0.104 0.242 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 8.57e-01 0.0105 0.0583 0.244 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0637 0.0851 0.244 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00622 0.0615 0.244 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0481 0.0959 0.244 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 6.51e-01 0.0317 0.07 0.244 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000295 0.0622 0.244 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 1.66e-01 -0.103 0.0743 0.244 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0391 0.0621 0.244 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0301 0.0722 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 1.00e+00 -2.26e-05 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 3.57e-02 0.157 0.074 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 8.21e-01 0.0234 0.103 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 1.69e-02 -0.252 0.105 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 9.55e-01 0.00579 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 2.62e-02 -0.225 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0877 0.0834 0.253 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.0838 0.253 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 5.03e-01 -0.053 0.079 0.253 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 2.42e-01 0.118 0.101 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 2.93e-01 0.0572 0.0542 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 5.05e-02 0.157 0.0797 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 5.71e-01 0.0506 0.0893 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 3.71e-02 0.209 0.0995 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.07e-01 -0.105 0.0827 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 2.18e-01 -0.11 0.0888 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0754 0.0936 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 8.15e-01 0.023 0.0983 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 9.87e-01 0.00155 0.0943 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 5.23e-01 0.0624 0.0977 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.07e-01 0.103 0.0634 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 9.52e-01 0.00529 0.0874 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 6.13e-01 0.0485 0.0959 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 9.36e-01 0.00772 0.0954 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 9.13e-02 -0.144 0.0848 0.246 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 6.59e-01 0.0395 0.0895 0.246 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 7.11e-01 0.0342 0.0921 0.246 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00735 0.0943 0.246 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0858 0.246 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 4.33e-01 0.0744 0.0948 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 7.25e-01 0.0174 0.0493 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 4.43e-02 -0.14 0.0691 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 9.70e-01 0.00307 0.0828 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0871 0.0923 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 3.14e-02 -0.15 0.0692 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0445 0.0758 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 8.71e-02 -0.176 0.102 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.1 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 1.84e-01 -0.125 0.0935 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 8.99e-02 0.159 0.0931 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0361 0.0501 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0366 0.0777 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 1.40e-01 0.133 0.0897 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 1.89e-01 -0.13 0.0986 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 1.10e-02 -0.218 0.0849 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 4.15e-01 0.0697 0.0852 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0702 0.0898 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 9.83e-01 0.00216 0.104 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 1.79e-01 -0.12 0.089 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 1.29e-01 0.152 0.0994 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0997 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 2.32e-02 0.198 0.0864 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0129 0.0963 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.35e-02 -0.196 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0557 0.0978 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0258 0.0753 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 2.32e-01 -0.104 0.0865 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 3.10e-01 0.0679 0.0668 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0506 0.0728 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0145 0.079 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 8.92e-02 -0.0936 0.0548 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 4.76e-02 0.158 0.0792 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.52e-01 -0.132 0.0917 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 4.75e-01 0.051 0.0713 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 2.06e-01 0.113 0.089 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.52e-01 0.0498 0.0835 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0705 0.0546 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 1.28e-02 0.234 0.093 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.05e-02 -0.231 0.0894 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0406 0.0874 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 1.25e-01 0.145 0.0941 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0616 0.0893 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000752 0.0801 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.0869 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 7.59e-02 -0.158 0.0885 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 8.66e-01 -0.012 0.0713 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 7.62e-01 0.0292 0.0964 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 8.94e-01 0.0128 0.0953 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.54e-03 -0.243 0.0796 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0136 0.101 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 5.09e-02 0.177 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0864 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 5.11e-01 0.0532 0.0809 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 8.33e-02 0.149 0.0855 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 1.51e-01 -0.134 0.0931 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 8.08e-02 -0.107 0.0612 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 2.60e-01 0.107 0.0948 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 7.77e-01 0.0276 0.0974 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0539 0.0873 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 7.05e-01 0.0343 0.0903 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0979 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0965 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.13e-01 -0.108 0.0864 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 6.49e-01 0.0431 0.0945 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 6.27e-02 0.181 0.0968 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0617 0.0923 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0798 0.0988 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 3.77e-01 0.0897 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0884 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 7.07e-01 0.0368 0.0978 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 8.49e-01 0.0182 0.0956 0.242 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 5.92e-01 0.05 0.0931 0.242 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0326 0.0826 0.242 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0986 0.242 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.06e-01 0.0673 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 5.33e-01 0.0524 0.0839 0.242 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 2.59e-01 -0.108 0.095 0.242 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 6.41e-01 0.0436 0.0933 0.242 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0934 0.0824 0.242 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 3.58e-01 0.0931 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 8.37e-01 0.0151 0.0733 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0666 0.0846 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 7.08e-01 0.0371 0.0989 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0243 0.0966 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 5.42e-01 0.0533 0.0873 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 8.29e-01 0.0199 0.0919 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 1.95e-01 -0.126 0.0967 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00626 0.0916 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 2.44e-01 -0.104 0.0892 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0638 0.0675 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0337 0.0939 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0614 0.0907 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 5.21e-03 -0.216 0.0764 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 1.67e-01 0.131 0.0941 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 5.43e-01 0.0647 0.106 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 4.33e-01 0.0739 0.0941 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.86e-01 -0.128 0.0962 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 4.85e-02 -0.153 0.0769 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0388 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0805 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0317 0.0964 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 7.46e-01 0.0322 0.099 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 8.78e-01 -0.015 0.0974 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0327 0.0919 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0991 0.0858 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0387 0.0653 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0676 0.091 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 7.01e-01 0.0352 0.0916 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0617 0.0721 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 3.39e-01 0.0899 0.0938 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 3.24e-01 0.1 0.101 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0976 0.256 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.84e-01 0.1 0.0751 0.256 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0737 0.109 0.256 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 9.05e-01 0.015 0.125 0.256 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 3.43e-01 0.0729 0.0765 0.256 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0831 0.0883 0.256 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 2.47e-02 -0.2 0.088 0.256 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0188 0.104 0.256 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 1.59e-01 -0.135 0.0949 0.256 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 9.39e-03 0.227 0.086 0.256 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 9.77e-02 -0.111 0.0665 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 9.51e-02 -0.148 0.0881 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 7.50e-02 0.117 0.0651 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 2.58e-01 0.106 0.0934 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 7.89e-01 0.019 0.0709 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 8.49e-01 0.0147 0.077 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 3.15e-01 0.0664 0.0659 0.243 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0816 0.061 0.243 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0294 0.0669 0.243 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 6.16e-01 -0.048 0.0957 0.244 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.71e-01 -0.136 0.0992 0.244 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 7.39e-01 0.0291 0.087 0.244 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 1.01e-01 0.155 0.0942 0.244 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0636 0.0979 0.244 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 8.28e-01 0.0173 0.0796 0.244 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 3.26e-01 0.0888 0.0902 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0994 0.0879 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 4.71e-01 0.0821 0.114 0.229 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 2.98e-01 -0.107 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 9.86e-01 0.00184 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0459 0.1 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0119 0.0783 0.229 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0459 0.0956 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00698 0.0892 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 2.53e-01 0.101 0.0881 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0426 0.0666 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 7.05e-01 0.0335 0.0884 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 9.58e-02 -0.165 0.0988 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 1.27e-01 0.136 0.0886 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0972 0.0765 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000495 0.0655 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 7.11e-01 0.0266 0.0717 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 3.81e-01 0.0838 0.0954 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00387 0.0733 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 1.30e-01 -0.135 0.0886 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 8.48e-01 -0.02 0.104 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 9.27e-01 0.00894 0.0981 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0427 0.0907 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 7.49e-01 0.0227 0.0707 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 8.18e-02 0.154 0.088 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 6.90e-01 0.0473 0.118 0.233 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0403 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0516 0.0836 0.233 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 7.91e-01 0.0294 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0325 0.116 0.233 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.03e-01 -0.137 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 6.99e-02 -0.198 0.109 0.233 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 3.27e-01 0.106 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 9.96e-02 0.162 0.0979 0.233 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 6.88e-01 -0.039 0.0971 0.238 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 6.21e-01 -0.044 0.0888 0.238 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 6.89e-01 0.0417 0.104 0.238 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 2.71e-01 0.111 0.101 0.238 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0194 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0189 0.0854 0.238 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 5.86e-01 0.0516 0.0944 0.238 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0976 0.242 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 9.52e-01 0.00541 0.0902 0.242 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 8.12e-02 0.188 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 6.54e-05 0.37 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0548 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0937 0.0871 0.242 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 9.13e-01 0.00893 0.0813 0.242 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 2.28e-01 0.102 0.0842 0.242 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 4.74e-01 0.0836 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.80e-01 -0.136 0.101 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 8.46e-01 0.0209 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 2.82e-01 0.115 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 4.43e-01 0.0865 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 7.09e-01 0.0367 0.0982 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0397 0.0759 0.215 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0484 0.0906 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00316 0.101 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 3.10e-01 0.0963 0.0946 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.71e-01 0.0683 0.0497 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 1.58e-01 0.111 0.0781 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 6.38e-01 0.038 0.0807 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 7.78e-02 0.161 0.0907 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 4.56e-02 -0.136 0.0676 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0533 0.0816 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0201 0.0941 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 7.27e-01 0.0344 0.0985 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00432 0.0977 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0909 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0209 0.045 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0673 0.0643 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 4.91e-01 0.0545 0.0789 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0897 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.52e-03 -0.202 0.066 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0137 0.0707 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -287051 sc-eQTL 6.30e-02 -0.189 0.101 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 2.02e-01 -0.133 0.104 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -745164 sc-eQTL 9.81e-02 -0.156 0.094 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 1.09e-01 0.131 0.0813 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0314 0.0661 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0449 0.0851 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 2.78e-01 -0.109 0.1 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 3.03e-01 0.0886 0.0859 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0913 0.0747 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 7.75e-01 0.0176 0.0615 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 3.51e-01 0.0659 0.0705 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 7.52e-01 0.0299 0.0947 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 8.10e-01 0.0199 0.0828 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 2.28e-01 0.121 0.0999 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 7.44e-04 0.321 0.0938 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0041 0.0957 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0683 0.083 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 7.53e-01 0.0226 0.0717 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 878738 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0187 0.0875 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -667699 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000949 0.0875 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -244526 sc-eQTL 1.50e-01 -0.123 0.085 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -378538 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0666 0.0583 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 172316 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0917 0.0895 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 44649 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0669 0.0831 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -609728 sc-eQTL 8.50e-03 -0.176 0.0663 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -425159 sc-eQTL 9.65e-02 0.15 0.09 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -667764 sc-eQTL 3.38e-01 0.102 0.106 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -667699 4.37e-07 2.67e-07 8.83e-08 2.58e-07 1.13e-07 1.25e-07 3.57e-07 8.37e-08 2.76e-07 1.65e-07 3.32e-07 2.22e-07 4.27e-07 8.85e-08 1.32e-07 1.61e-07 8.53e-08 2.93e-07 1.5e-07 1.08e-07 1.61e-07 2.48e-07 2.26e-07 9.01e-08 4.11e-07 2.29e-07 1.97e-07 2.13e-07 2.13e-07 2.01e-07 1.86e-07 8.48e-08 5.55e-08 1.21e-07 1.56e-07 6.94e-08 7.97e-08 6.46e-08 5.77e-08 3.01e-08 9.84e-08 2.8e-07 3.2e-08 2.07e-08 1.1e-07 1.37e-08 9.19e-08 2.75e-09 5.54e-08