logo

Genes within 1Mb (chr12:101450929:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 1.90e-01 0.0936 0.0711 0.244 B L1
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 7.34e-01 0.0148 0.0434 0.244 B L1
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0223 0.0628 0.244 B L1
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 5.10e-01 0.0471 0.0713 0.244 B L1
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 9.44e-01 0.00435 0.0614 0.244 B L1
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 7.00e-03 -0.132 0.0483 0.244 B L1
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0435 0.0557 0.244 B L1
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 6.65e-02 -0.162 0.0878 0.244 B L1
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0929 0.0846 0.244 B L1
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 2.66e-01 -0.088 0.0789 0.244 B L1
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 2.72e-01 0.0717 0.0651 0.244 CD4T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.86e-01 -0.116 0.0878 0.244 CD4T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 2.16e-01 0.0755 0.0609 0.244 CD4T L1
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 3.20e-01 0.0672 0.0674 0.244 CD4T L1
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0317 0.066 0.244 CD4T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 8.10e-02 -0.0805 0.0459 0.244 CD4T L1
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 4.62e-02 0.16 0.0797 0.244 CD8T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 7.72e-02 -0.154 0.0866 0.244 CD8T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 5.44e-01 0.0348 0.0572 0.244 CD8T L1
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 1.08e-01 0.116 0.0718 0.244 CD8T L1
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.23e-01 -0.051 0.0796 0.244 CD8T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 4.40e-03 -0.16 0.0555 0.244 CD8T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 5.07e-01 0.0539 0.081 0.244 CD8T L1
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 2.70e-02 0.201 0.0902 0.234 DC L1
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0786 0.0833 0.234 DC L1
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 3.04e-01 0.0944 0.0916 0.234 DC L1
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0232 0.0984 0.234 DC L1
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 2.00e-01 0.13 0.101 0.234 DC L1
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0403 0.0876 0.234 DC L1
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 5.69e-01 0.0413 0.0723 0.234 DC L1
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 7.50e-01 -0.029 0.0909 0.234 DC L1
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0155 0.0954 0.234 DC L1
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 1.41e-01 0.114 0.0769 0.244 Mono L1
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 8.72e-01 0.0105 0.0654 0.244 Mono L1
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 7.97e-01 0.0211 0.082 0.244 Mono L1
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 7.94e-01 0.0239 0.0914 0.244 Mono L1
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 7.51e-01 0.0268 0.0841 0.244 Mono L1
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0719 0.0739 0.244 Mono L1
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 5.69e-01 0.0344 0.0603 0.244 Mono L1
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 4.93e-01 0.0451 0.0656 0.244 Mono L1
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 6.37e-01 0.0393 0.0831 0.242 NK L1
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.90e-01 -0.101 0.0768 0.242 NK L1
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 2.30e-01 -0.067 0.0557 0.242 NK L1
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0736 0.0898 0.242 NK L1
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0557 0.0826 0.242 NK L1
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 1.41e-02 -0.152 0.0614 0.242 NK L1
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 1.43e-01 0.13 0.0882 0.242 NK L1
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 6.10e-01 0.0532 0.104 0.242 NK L1
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 8.57e-01 0.0105 0.0583 0.244 Other_T L1
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0637 0.0851 0.244 Other_T L1
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00622 0.0615 0.244 Other_T L1
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0481 0.0959 0.244 Other_T L1
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 6.51e-01 0.0317 0.07 0.244 Other_T L1
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000295 0.0622 0.244 Other_T L1
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 1.66e-01 -0.103 0.0743 0.244 Other_T L1
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0391 0.0621 0.244 Other_T L1
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0301 0.0722 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 1.00e+00 -2.26e-05 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 3.57e-02 0.157 0.074 0.253 B_Activated L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 1.63e-01 -0.148 0.106 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 8.21e-01 0.0234 0.103 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 1.69e-02 -0.252 0.105 0.253 B_Activated L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 9.55e-01 0.00579 0.101 0.253 B_Activated L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 2.62e-02 -0.225 0.1 0.253 B_Activated L2
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0877 0.0834 0.253 B_Activated L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 1.88e-01 -0.111 0.0838 0.253 B_Activated L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 5.03e-01 -0.053 0.079 0.253 B_Activated L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 2.42e-01 0.118 0.101 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 2.93e-01 0.0572 0.0542 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 5.05e-02 0.157 0.0797 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 5.71e-01 0.0506 0.0893 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 3.71e-02 0.209 0.0995 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.07e-01 -0.105 0.0827 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 2.18e-01 -0.11 0.0888 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0754 0.0936 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 8.15e-01 0.023 0.0983 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 9.87e-01 0.00155 0.0943 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 5.23e-01 0.0624 0.0977 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.07e-01 0.103 0.0634 0.246 B_Memory L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 9.52e-01 0.00529 0.0874 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 6.13e-01 0.0485 0.0959 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 9.36e-01 0.00772 0.0954 0.246 B_Memory L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 9.13e-02 -0.144 0.0848 0.246 B_Memory L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 6.59e-01 0.0395 0.0895 0.246 B_Memory L2
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 7.11e-01 0.0342 0.0921 0.246 B_Memory L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00735 0.0943 0.246 B_Memory L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0187 0.0858 0.246 B_Memory L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 4.33e-01 0.0744 0.0948 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 7.25e-01 0.0174 0.0493 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 4.43e-02 -0.14 0.0691 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 9.70e-01 0.00307 0.0828 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0871 0.0923 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 3.14e-02 -0.15 0.0692 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0445 0.0758 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 8.71e-02 -0.176 0.102 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 2.65e-01 -0.112 0.1 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 1.84e-01 -0.125 0.0935 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 8.99e-02 0.159 0.0931 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0361 0.0501 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0366 0.0777 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 1.40e-01 0.133 0.0897 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 1.89e-01 -0.13 0.0986 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 1.10e-02 -0.218 0.0849 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 4.15e-01 0.0697 0.0852 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0702 0.0898 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 9.83e-01 0.00216 0.104 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 1.79e-01 -0.12 0.089 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 1.29e-01 0.152 0.0994 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.83e-01 -0.133 0.0997 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 2.32e-02 0.198 0.0864 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0129 0.0963 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.35e-02 -0.196 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0557 0.0978 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0258 0.0753 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 2.32e-01 -0.104 0.0865 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 3.10e-01 0.0679 0.0668 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0506 0.0728 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0145 0.079 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 8.92e-02 -0.0936 0.0548 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 4.76e-02 0.158 0.0792 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.52e-01 -0.132 0.0917 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 4.75e-01 0.051 0.0713 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 2.06e-01 0.113 0.089 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.52e-01 0.0498 0.0835 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 1.98e-01 -0.0705 0.0546 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 1.28e-02 0.234 0.093 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.05e-02 -0.231 0.0894 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0406 0.0874 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 1.25e-01 0.145 0.0941 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0616 0.0893 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000752 0.0801 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0134 0.0869 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 7.59e-02 -0.158 0.0885 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 8.66e-01 -0.012 0.0713 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 7.62e-01 0.0292 0.0964 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 8.94e-01 0.0128 0.0953 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.54e-03 -0.243 0.0796 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0136 0.101 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 5.09e-02 0.177 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0864 0.09 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 5.11e-01 0.0532 0.0809 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 8.33e-02 0.149 0.0855 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 1.51e-01 -0.134 0.0931 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 8.08e-02 -0.107 0.0612 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 2.60e-01 0.107 0.0948 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 7.77e-01 0.0276 0.0974 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0539 0.0873 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 7.05e-01 0.0343 0.0903 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 1.01e-01 0.161 0.0979 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 2.53e-01 -0.111 0.0965 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.13e-01 -0.108 0.0864 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 6.49e-01 0.0431 0.0945 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 6.27e-02 0.181 0.0968 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0617 0.0923 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0798 0.0988 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 9.07e-01 0.0123 0.106 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 3.77e-01 0.0897 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.49e-01 0.102 0.0884 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 7.07e-01 0.0368 0.0978 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 8.49e-01 0.0182 0.0956 0.242 MAIT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 5.92e-01 0.05 0.0931 0.242 MAIT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0326 0.0826 0.242 MAIT L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 1.78e-01 -0.133 0.0986 0.242 MAIT L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.06e-01 0.0673 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 5.33e-01 0.0524 0.0839 0.242 MAIT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 2.59e-01 -0.108 0.095 0.242 MAIT L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 6.41e-01 0.0436 0.0933 0.242 MAIT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0934 0.0824 0.242 MAIT L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 3.58e-01 0.0931 0.101 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 8.37e-01 0.0151 0.0733 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0666 0.0846 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 7.08e-01 0.0371 0.0989 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0243 0.0966 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 5.42e-01 0.0533 0.0873 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 8.29e-01 0.0199 0.0919 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 1.95e-01 -0.126 0.0967 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00626 0.0916 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 2.44e-01 -0.104 0.0892 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0638 0.0675 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0337 0.0939 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0614 0.0907 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 5.21e-03 -0.216 0.0764 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 1.67e-01 0.131 0.0941 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 5.43e-01 0.0647 0.106 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 4.33e-01 0.0739 0.0941 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.86e-01 -0.128 0.0962 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 4.85e-02 -0.153 0.0769 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0388 0.102 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0805 0.104 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0317 0.0964 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 7.46e-01 0.0322 0.099 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 8.78e-01 -0.015 0.0974 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0327 0.0919 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0991 0.0858 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0387 0.0653 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0676 0.091 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 7.01e-01 0.0352 0.0916 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0617 0.0721 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 3.39e-01 0.0899 0.0938 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 3.24e-01 0.1 0.101 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0391 0.0976 0.256 PB L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.84e-01 0.1 0.0751 0.256 PB L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0737 0.109 0.256 PB L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 9.05e-01 0.015 0.125 0.256 PB L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 3.43e-01 0.0729 0.0765 0.256 PB L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0831 0.0883 0.256 PB L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 2.47e-02 -0.2 0.088 0.256 PB L2
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0188 0.104 0.256 PB L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 1.59e-01 -0.135 0.0949 0.256 PB L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 9.39e-03 0.227 0.086 0.256 PB L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 9.77e-02 -0.111 0.0665 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 9.51e-02 -0.148 0.0881 0.243 Pro_T L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 7.50e-02 0.117 0.0651 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 2.58e-01 0.106 0.0934 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 7.89e-01 0.019 0.0709 0.243 Pro_T L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 8.49e-01 0.0147 0.077 0.243 Pro_T L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 3.15e-01 0.0664 0.0659 0.243 Pro_T L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0816 0.061 0.243 Pro_T L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0294 0.0669 0.243 Pro_T L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 6.16e-01 -0.048 0.0957 0.244 Treg L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.71e-01 -0.136 0.0992 0.244 Treg L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 7.39e-01 0.0291 0.087 0.244 Treg L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 1.01e-01 0.155 0.0942 0.244 Treg L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0636 0.0979 0.244 Treg L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 8.28e-01 0.0173 0.0796 0.244 Treg L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 3.26e-01 0.0888 0.0902 0.229 cDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0994 0.0879 0.229 cDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 4.71e-01 0.0821 0.114 0.229 cDC L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 2.98e-01 -0.107 0.103 0.229 cDC L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 9.86e-01 0.00184 0.107 0.229 cDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0459 0.1 0.229 cDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0119 0.0783 0.229 cDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0459 0.0956 0.229 cDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00698 0.0892 0.229 cDC L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 2.53e-01 0.101 0.0881 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0426 0.0666 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 7.05e-01 0.0335 0.0884 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 9.58e-02 -0.165 0.0988 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 1.27e-01 0.136 0.0886 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0972 0.0765 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000495 0.0655 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 7.11e-01 0.0266 0.0717 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 3.81e-01 0.0838 0.0954 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00387 0.0733 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 1.30e-01 -0.135 0.0886 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 8.48e-01 -0.02 0.104 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 9.27e-01 0.00894 0.0981 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0427 0.0907 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 7.49e-01 0.0227 0.0707 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 8.18e-02 0.154 0.088 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 6.90e-01 0.0473 0.118 0.233 gdT L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0403 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0516 0.0836 0.233 gdT L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 7.91e-01 0.0294 0.111 0.233 gdT L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0325 0.116 0.233 gdT L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.03e-01 -0.137 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 6.99e-02 -0.198 0.109 0.233 gdT L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 3.27e-01 0.106 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 9.96e-02 0.162 0.0979 0.233 gdT L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 6.88e-01 -0.039 0.0971 0.238 intMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 6.21e-01 -0.044 0.0888 0.238 intMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 6.89e-01 0.0417 0.104 0.238 intMono L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00715 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 2.71e-01 0.111 0.101 0.238 intMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0194 0.0977 0.238 intMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0189 0.0854 0.238 intMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 5.86e-01 0.0516 0.0944 0.238 intMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 4.29e-01 0.0773 0.0976 0.242 ncMono L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 9.52e-01 0.00541 0.0902 0.242 ncMono L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 8.12e-02 0.188 0.107 0.242 ncMono L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 6.54e-05 0.37 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0548 0.0907 0.242 ncMono L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0937 0.0871 0.242 ncMono L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 9.13e-01 0.00893 0.0813 0.242 ncMono L2
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 2.28e-01 0.102 0.0842 0.242 ncMono L2
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 4.74e-01 0.0836 0.117 0.215 pDC L2
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.80e-01 -0.136 0.101 0.215 pDC L2
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 8.46e-01 0.0209 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 2.82e-01 0.115 0.107 0.215 pDC L2
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 4.43e-01 0.0865 0.112 0.215 pDC L2
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 7.09e-01 0.0367 0.0982 0.215 pDC L2
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0397 0.0759 0.215 pDC L2
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0484 0.0906 0.215 pDC L2
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00316 0.101 0.215 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 3.10e-01 0.0963 0.0946 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.71e-01 0.0683 0.0497 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 1.58e-01 0.111 0.0781 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 6.38e-01 0.038 0.0807 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 7.78e-02 0.161 0.0907 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 4.56e-02 -0.136 0.0676 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0533 0.0816 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0201 0.0941 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 7.27e-01 0.0344 0.0985 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00432 0.0977 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 2.10e-01 0.114 0.0909 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0209 0.045 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0673 0.0643 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 4.91e-01 0.0545 0.0789 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 1.70e-01 -0.124 0.0897 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.52e-03 -0.202 0.066 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0137 0.0707 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000139351 SYCP3 -288543 sc-eQTL 6.30e-02 -0.189 0.101 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 2.02e-01 -0.133 0.104 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000281344 HELLPAR -746656 sc-eQTL 9.81e-02 -0.156 0.094 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 1.09e-01 0.131 0.0813 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0314 0.0661 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0449 0.0851 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 2.78e-01 -0.109 0.1 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 3.03e-01 0.0886 0.0859 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0913 0.0747 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 7.75e-01 0.0176 0.0615 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 3.51e-01 0.0659 0.0705 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 7.52e-01 0.0299 0.0947 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 8.10e-01 0.0199 0.0828 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 2.28e-01 0.121 0.0999 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 7.44e-04 0.321 0.0938 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 9.66e-01 -0.0041 0.0957 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0683 0.083 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 7.53e-01 0.0226 0.0717 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000139354 GAS2L3 877246 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0187 0.0875 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000075188 NUP37 -669191 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000949 0.0875 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111666 CHPT1 -246018 sc-eQTL 1.50e-01 -0.123 0.085 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000111670 GNPTAB -380030 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0666 0.0583 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120800 UTP20 170824 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0917 0.0895 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120805 ARL1 43157 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0669 0.0831 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000120860 WASHC3 -611220 sc-eQTL 8.50e-03 -0.176 0.0663 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000136048 DRAM1 -426651 sc-eQTL 9.65e-02 0.15 0.09 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000185480 PARPBP -669256 sc-eQTL 3.38e-01 0.102 0.106 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000075188 \N -669191 2.95e-07 1.42e-07 6.15e-08 2.07e-07 1.02e-07 8.33e-08 1.9e-07 5.78e-08 1.54e-07 8.53e-08 1.62e-07 1.2e-07 1.95e-07 8.13e-08 5.43e-08 7.98e-08 4.31e-08 1.72e-07 7.09e-08 5.35e-08 1.18e-07 1.47e-07 1.62e-07 3.58e-08 1.85e-07 1.31e-07 1.19e-07 1.12e-07 1.34e-07 1.1e-07 1.06e-07 4.32e-08 3.38e-08 9.8e-08 3.51e-08 2.85e-08 4.62e-08 7.63e-08 6.41e-08 4.41e-08 6e-08 1.5e-07 4.83e-08 1.43e-08 3.36e-08 1.55e-08 7.83e-08 2.1e-09 4.94e-08